MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 plasmid pBsph

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010381	GAATC	2	10	39	48	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010381	AATTG	2	10	226	235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010381	GAATA	2	10	1871	1880	60 %	20 %	20 %	0 %	169825416
4	NC_010381	TTTTA	2	10	1952	1961	20 %	80 %	0 %	0 %	169825416
5	NC_010381	TTAGA	2	10	2260	2269	40 %	40 %	20 %	0 %	169825416
6	NC_010381	GTCTT	2	10	2653	2662	0 %	60 %	20 %	20 %	169825416
7	NC_010381	GCAAT	2	10	3717	3726	40 %	20 %	20 %	20 %	169825416
8	NC_010381	AAAAG	2	10	6767	6776	80 %	0 %	20 %	0 %	169825418
9	NC_010381	TCAAA	2	10	7202	7211	60 %	20 %	0 %	20 %	169825419
10	NC_010381	ATTCC	2	10	7920	7929	20 %	40 %	0 %	40 %	169825419
11	NC_010381	ATTAA	2	10	8260	8269	60 %	40 %	0 %	0 %	169825420
12	NC_010381	AAATC	2	10	8404	8413	60 %	20 %	0 %	20 %	169825421
13	NC_010381	ATGAA	2	10	9613	9622	60 %	20 %	20 %	0 %	169825423
14	NC_010381	TTAGA	2	10	10060	10069	40 %	40 %	20 %	0 %	169825423
15	NC_010381	TATTG	2	10	10243	10252	20 %	60 %	20 %	0 %	169825424
16	NC_010381	AGTGT	2	10	11984	11993	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010381	ATTAT	2	10	12319	12328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010381	ATTTA	2	10	14861	14870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010381	GTACC	2	10	19726	19735	20 %	20 %	20 %	40 %	169825434
20	NC_010381	AAAAG	2	10	20319	20328	80 %	0 %	20 %	0 %	169825435
21	NC_010381	CTAAA	2	10	26981	26990	60 %	20 %	0 %	20 %	169825442
22	NC_010381	TGCAA	2	10	28675	28684	40 %	20 %	20 %	20 %	169825443
23	NC_010381	TGGAA	2	10	30727	30736	40 %	20 %	40 %	0 %	169825447
24	NC_010381	AATCT	2	10	31935	31944	40 %	40 %	0 %	20 %	169825449
25	NC_010381	ATATT	2	10	32269	32278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010381	TTCTC	2	10	32513	32522	0 %	60 %	0 %	40 %	169825450
27	NC_010381	TAAAG	2	10	33196	33205	60 %	20 %	20 %	0 %	169825450
28	NC_010381	GGATA	2	10	33356	33365	40 %	20 %	40 %	0 %	169825450
29	NC_010381	TATAA	2	10	33444	33453	60 %	40 %	0 %	0 %	169825450
30	NC_010381	AAAAG	2	10	34886	34895	80 %	0 %	20 %	0 %	169825453
31	NC_010381	ATTTT	2	10	37098	37107	20 %	80 %	0 %	0 %	169825455
32	NC_010381	GAAAT	2	10	37307	37316	60 %	20 %	20 %	0 %	169825455
33	NC_010381	TTCAA	2	10	37446	37455	40 %	40 %	0 %	20 %	169825455
34	NC_010381	ATTAA	2	10	37687	37696	60 %	40 %	0 %	0 %	169825455
35	NC_010381	AGGAG	2	10	40227	40236	40 %	0 %	60 %	0 %	169825455
36	NC_010381	TAGGT	2	10	43515	43524	20 %	40 %	40 %	0 %	169825457
37	NC_010381	TGTAT	2	10	43615	43624	20 %	60 %	20 %	0 %	169825457
38	NC_010381	TAATT	2	10	43651	43660	40 %	60 %	0 %	0 %	169825458
39	NC_010381	ACGAT	2	10	44104	44113	40 %	20 %	20 %	20 %	169825458
40	NC_010381	AGAGA	2	10	45170	45179	60 %	0 %	40 %	0 %	169825458
41	NC_010381	AATTC	2	10	47008	47017	40 %	40 %	0 %	20 %	169825460
42	NC_010381	AAGAA	2	10	47875	47884	80 %	0 %	20 %	0 %	169825461
43	NC_010381	AGCTT	2	10	48436	48445	20 %	40 %	20 %	20 %	169825461
44	NC_010381	AAAGA	2	10	50130	50139	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010381	AAATC	2	10	50420	50429	60 %	20 %	0 %	20 %	169825465
46	NC_010381	ATCAA	2	10	50750	50759	60 %	20 %	0 %	20 %	169825465
47	NC_010381	TAGTG	2	10	52508	52517	20 %	40 %	40 %	0 %	169825466
48	NC_010381	AAAAG	3	15	52730	52744	80 %	0 %	20 %	0 %	169825466
49	NC_010381	CATTT	2	10	52969	52978	20 %	60 %	0 %	20 %	169825466
50	NC_010381	AAGAA	2	10	53481	53490	80 %	0 %	20 %	0 %	169825467
51	NC_010381	ATGAC	2	10	54191	54200	40 %	20 %	20 %	20 %	169825467
52	NC_010381	AATCT	2	10	55559	55568	40 %	40 %	0 %	20 %	169825467
53	NC_010381	ATGTT	2	10	60105	60114	20 %	60 %	20 %	0 %	169825470
54	NC_010381	TGTCA	2	10	60891	60900	20 %	40 %	20 %	20 %	169825471
55	NC_010381	AAAAT	2	10	61963	61972	80 %	20 %	0 %	0 %	169825473
56	NC_010381	AAAGA	2	10	62580	62589	80 %	0 %	20 %	0 %	169825474
57	NC_010381	AAGAA	2	10	64375	64384	80 %	0 %	20 %	0 %	169825476
58	NC_010381	TGGGT	2	10	65287	65296	0 %	40 %	60 %	0 %	169825478
59	NC_010381	TTTTA	2	10	66381	66390	20 %	80 %	0 %	0 %	169825480
60	NC_010381	ATTAA	2	10	69036	69045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010381	AGAGA	2	10	69506	69515	60 %	0 %	40 %	0 %	169825484
62	NC_010381	AAGTG	2	10	70586	70595	40 %	20 %	40 %	0 %	169825485
63	NC_010381	TAAAT	2	10	72236	72245	60 %	40 %	0 %	0 %	169825485
64	NC_010381	TTAAC	2	10	73223	73232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010381	ATAGT	2	10	74013	74022	40 %	40 %	20 %	0 %	169825487
66	NC_010381	AAGAA	2	10	74475	74484	80 %	0 %	20 %	0 %	169825488
67	NC_010381	ATTTT	2	10	75918	75927	20 %	80 %	0 %	0 %	169825491
68	NC_010381	TGAGG	2	10	77143	77152	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010381	GAAAA	2	10	81584	81593	80 %	0 %	20 %	0 %	169825501
70	NC_010381	CACAC	2	10	82024	82033	40 %	0 %	0 %	60 %	169825501
71	NC_010381	AAGAG	2	10	82384	82393	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010381	TCGTT	2	10	83858	83867	0 %	60 %	20 %	20 %	169825503
73	NC_010381	TGATA	2	10	84508	84517	40 %	40 %	20 %	0 %	169825504
74	NC_010381	CCCTT	2	10	84607	84616	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_010381	CCTTA	2	10	86553	86562	20 %	40 %	0 %	40 %	169825506
76	NC_010381	TCAAA	2	10	86981	86990	60 %	20 %	0 %	20 %	169825506
77	NC_010381	GAATC	2	10	87889	87898	40 %	20 %	20 %	20 %	169825508
78	NC_010381	ATTGT	2	10	87984	87993	20 %	60 %	20 %	0 %	169825508
79	NC_010381	TATAA	2	10	88530	88539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010381	ATAGG	2	10	90057	90066	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010381	TCAGG	2	10	90307	90316	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010381	TTGTT	2	10	91336	91345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010381	TGAAT	2	10	92554	92563	40 %	40 %	20 %	0 %	169825515
84	NC_010381	AGGTT	2	10	93001	93010	20 %	40 %	40 %	0 %	169825515
85	NC_010381	ATTCT	2	10	93644	93653	20 %	60 %	0 %	20 %	169825517
86	NC_010381	ATAGT	2	10	93720	93729	40 %	40 %	20 %	0 %	169825517
87	NC_010381	TTCTT	2	10	94012	94021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010381	ATAAA	2	10	94146	94155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010381	ATTTT	2	10	94303	94312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010381	AACTT	2	10	95883	95892	40 %	40 %	0 %	20 %	169825518
91	NC_010381	TTTTA	2	10	97747	97756	20 %	80 %	0 %	0 %	169825521
92	NC_010381	ATTGT	2	10	98123	98132	20 %	60 %	20 %	0 %	169825522
93	NC_010381	CTTTA	2	10	98708	98717	20 %	60 %	0 %	20 %	169825524
94	NC_010381	AATAA	2	10	100208	100217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010381	AGATA	2	10	100356	100365	60 %	20 %	20 %	0 %	169825525
96	NC_010381	CACGA	2	10	100887	100896	40 %	0 %	20 %	40 %	169825527
97	NC_010381	CAATA	2	10	102489	102498	60 %	20 %	0 %	20 %	169825529
98	NC_010381	GATAT	2	10	103075	103084	40 %	40 %	20 %	0 %	169825529
99	NC_010381	TGTCT	2	10	103732	103741	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010381	AATTT	2	10	104085	104094	40 %	60 %	0 %	0 %	169825530
101	NC_010381	TTCCG	2	10	104314	104323	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_010381	AGTTA	2	10	107016	107025	40 %	40 %	20 %	0 %	169825532
103	NC_010381	TTGAT	2	10	107859	107868	20 %	60 %	20 %	0 %	169825532
104	NC_010381	TTTTC	2	10	113394	113403	0 %	80 %	0 %	20 %	169825540
105	NC_010381	AACAA	2	10	113571	113580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010381	CAAAA	2	10	113644	113653	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010381	AATAA	2	10	113765	113774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010381	TCCAG	2	10	114266	114275	20 %	20 %	20 %	40 %	169825542
109	NC_010381	CAAGT	2	10	115772	115781	40 %	20 %	20 %	20 %	169825544
110	NC_010381	GAAAG	2	10	116093	116102	60 %	0 %	40 %	0 %	169825544
111	NC_010381	TAACA	2	10	117950	117959	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010381	ATTTT	2	10	118064	118073	20 %	80 %	0 %	0 %	169825546
113	NC_010381	TCGTC	2	10	118724	118733	0 %	40 %	20 %	40 %	169825547
114	NC_010381	TTTCA	2	10	118946	118955	20 %	60 %	0 %	20 %	169825547
115	NC_010381	CAATA	2	10	122614	122623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010381	TAAAA	2	10	122714	122723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010381	TTGTT	2	10	123087	123096	0 %	80 %	20 %	0 %	169825554
118	NC_010381	TTTTC	2	10	123609	123618	0 %	80 %	0 %	20 %	169825555
119	NC_010381	AAATG	2	10	124387	124396	60 %	20 %	20 %	0 %	169825556
120	NC_010381	CTCCC	2	10	124988	124997	0 %	20 %	0 %	80 %	169825558
121	NC_010381	AAATT	2	10	126234	126243	60 %	40 %	0 %	0 %	169825558
122	NC_010381	AAAGT	2	10	127730	127739	60 %	20 %	20 %	0 %	169825559
123	NC_010381	TTCGT	2	10	129404	129413	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010381	TTAAT	2	10	130023	130032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010381	GTATT	2	10	130214	130223	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010381	TTATT	2	10	131114	131123	20 %	80 %	0 %	0 %	169825561
127	NC_010381	AAAGG	2	10	131398	131407	60 %	0 %	40 %	0 %	169825561
128	NC_010381	TAGTT	2	10	131949	131958	20 %	60 %	20 %	0 %	169825562
129	NC_010381	ATGAA	2	10	132092	132101	60 %	20 %	20 %	0 %	169825562
130	NC_010381	TAAAA	2	10	133215	133224	80 %	20 %	0 %	0 %	169825562
131	NC_010381	AATTC	2	10	134085	134094	40 %	40 %	0 %	20 %	169825563
132	NC_010381	TAAAT	2	10	134300	134309	60 %	40 %	0 %	0 %	169825563
133	NC_010381	ATATT	2	10	135623	135632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010381	ATTAA	2	10	135711	135720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010381	AATAA	2	10	136000	136009	80 %	20 %	0 %	0 %	169825566
136	NC_010381	AAATA	2	10	136822	136831	80 %	20 %	0 %	0 %	169825567
137	NC_010381	ATCTT	2	10	137021	137030	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010381	AATAA	2	10	137096	137105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010381	TAGTG	2	10	137342	137351	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_010381	CCATA	2	10	149708	149717	40 %	20 %	0 %	40 %	169825572
149	NC_010381	TAGGA	2	10	150592	150601	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010381	ATTTG	2	10	150804	150813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_010381	TCAAG	2	10	151171	151180	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_010381	ATTAG	2	10	151643	151652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_010381	TTTAA	2	10	175413	175422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_010381	TATTT	2	10	176991	177000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_010381	TTAAG	2	10	177004	177013	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.