MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 plasmid pBsph

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010381	GAATC	2	10	39	48	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010381	AATTG	2	10	226	235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010381	AGTGT	2	10	11984	11993	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010381	ATTAT	2	10	12319	12328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010381	ATTTA	2	10	14861	14870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010381	ATATT	2	10	32269	32278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010381	AAAGA	2	10	50130	50139	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010381	ATTAA	2	10	69036	69045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010381	TTAAC	2	10	73223	73232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010381	TGAGG	2	10	77143	77152	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010381	AAGAG	2	10	82384	82393	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010381	CCCTT	2	10	84607	84616	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_010381	TATAA	2	10	88530	88539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010381	ATAGG	2	10	90057	90066	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010381	TCAGG	2	10	90307	90316	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010381	TTGTT	2	10	91336	91345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010381	TTCTT	2	10	94012	94021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010381	ATAAA	2	10	94146	94155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010381	ATTTT	2	10	94303	94312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010381	AATAA	2	10	100208	100217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010381	TGTCT	2	10	103732	103741	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010381	TTCCG	2	10	104314	104323	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010381	AACAA	2	10	113571	113580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010381	CAAAA	2	10	113644	113653	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010381	AATAA	2	10	113765	113774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010381	TAACA	2	10	117950	117959	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010381	CAATA	2	10	122614	122623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010381	TAAAA	2	10	122714	122723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010381	TTCGT	2	10	129404	129413	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010381	TTAAT	2	10	130023	130032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010381	GTATT	2	10	130214	130223	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010381	ATATT	2	10	135623	135632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010381	ATTAA	2	10	135711	135720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010381	ATCTT	2	10	137021	137030	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010381	AATAA	2	10	137096	137105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010381	TAGTG	2	10	137342	137351	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010381	ATTAT	2	10	140176	140185	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010381	TAGGA	2	10	150592	150601	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010381	ATTTG	2	10	150804	150813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010381	AATAT	2	10	151102	151111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010381	TCAAG	2	10	151171	151180	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010381	ATTAG	2	10	151643	151652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010381	TAAAT	2	10	154518	154527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010381	GTACT	2	10	162915	162924	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010381	TTTAA	2	10	175413	175422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010381	TATTT	2	10	176991	177000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010381	TTAAG	2	10	177004	177013	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.