MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 plasmid pBsph

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010381	TAAT	2	8	84	91	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010381	CTTA	2	8	296	303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010381	ATAA	2	8	5660	5667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010381	CTTT	2	8	9448	9455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010381	ATGT	2	8	12338	12345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010381	AGAA	2	8	12459	12466	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010381	TTGA	2	8	13173	13180	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010381	TACA	2	8	13320	13327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010381	TTTC	2	8	14802	14809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010381	TCTA	2	8	14820	14827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010381	TATT	2	8	21863	21870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010381	TAAA	2	8	21997	22004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010381	GATT	2	8	22096	22103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010381	AGGG	2	8	24223	24230	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010381	CAAA	2	8	25005	25012	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010381	CTAA	2	8	25399	25406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010381	AGGG	2	8	25520	25527	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010381	ATTT	2	8	25593	25600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010381	TCGT	2	8	30286	30293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010381	AATT	2	8	30337	30344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010381	AATT	2	8	30362	30369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010381	ATTT	2	8	30959	30966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010381	ATTG	2	8	32187	32194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010381	TTTC	2	8	48466	48473	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010381	TTTC	2	8	51226	51233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010381	ATAA	2	8	61234	61241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010381	TAAA	2	8	62965	62972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010381	AGAT	2	8	63689	63696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010381	AACA	2	8	63717	63724	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010381	AGGA	2	8	63866	63873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010381	GATT	2	8	63881	63888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010381	AAGT	2	8	63914	63921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010381	GATT	2	8	63941	63948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010381	CAAT	2	8	64091	64098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010381	CAAA	2	8	66743	66750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010381	TAGG	2	8	67401	67408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010381	ATCG	2	8	67492	67499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010381	AGAA	2	8	73134	73141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010381	TACC	2	8	74306	74313	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010381	GTTT	2	8	74693	74700	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010381	TTAA	2	8	76095	76102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010381	GAAA	2	8	76738	76745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010381	AATG	2	8	77889	77896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010381	TGTT	2	8	78074	78081	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010381	ATAC	2	8	78537	78544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010381	TATT	2	8	78812	78819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010381	TTTA	2	8	78978	78985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010381	GCAA	2	8	79141	79148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010381	TATT	2	8	79286	79293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010381	ATTT	2	8	79397	79404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010381	CTTT	2	8	80674	80681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010381	AATA	2	8	82676	82683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010381	AAAT	2	8	82745	82752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010381	AAAC	2	8	82812	82819	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010381	AAAG	2	8	83015	83022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010381	TTAA	2	8	83078	83085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010381	AAAG	2	8	83093	83100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010381	TTCA	2	8	83740	83747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010381	TTAT	2	8	83827	83834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010381	AATT	2	8	84142	84149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010381	ATTT	2	8	85759	85766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010381	TAAA	2	8	87782	87789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010381	CTTT	2	8	89715	89722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010381	CATT	2	8	89960	89967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010381	ATTT	2	8	90025	90032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010381	TCAG	2	8	90139	90146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010381	ATTT	2	8	90175	90182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010381	CGAC	2	8	90692	90699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010381	TAAT	2	8	91080	91087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010381	TATG	2	8	94060	94067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010381	ATTA	2	8	94271	94278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010381	TAAA	2	8	94729	94736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010381	TTAT	2	8	95051	95058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010381	TATT	2	8	96797	96804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010381	AATT	2	8	99778	99785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010381	TAAT	2	8	100224	100231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010381	TGCT	2	8	103464	103471	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010381	CATG	2	8	103752	103759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010381	TTTC	2	8	103898	103905	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010381	CTAG	2	8	104159	104166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010381	CTAG	2	8	104190	104197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010381	AATA	2	8	104238	104245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010381	TAAG	2	8	105231	105238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010381	TTAC	2	8	105251	105258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010381	ACAA	2	8	108887	108894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010381	ATAA	2	8	113670	113677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010381	TTTC	2	8	113832	113839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010381	ACCA	2	8	113892	113899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010381	ATAG	2	8	115587	115594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010381	TTCA	2	8	115595	115602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010381	TTAT	2	8	115631	115638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010381	AATT	2	8	118040	118047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010381	GAAA	2	8	122036	122043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010381	TCAA	2	8	122081	122088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010381	TATT	2	8	122211	122218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010381	AATT	2	8	122240	122247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010381	TGGC	2	8	122368	122375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010381	ACAT	2	8	122782	122789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010381	TATT	2	8	124832	124839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010381	TTTA	2	8	124853	124860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010381	GTAA	2	8	128541	128548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010381	CAAA	2	8	128588	128595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010381	CTTT	2	8	130283	130290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010381	ATGT	2	8	130510	130517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010381	CTGC	2	8	135473	135480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010381	TTTA	2	8	135943	135950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010381	TGAA	2	8	136473	136480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010381	TAAA	2	8	136634	136641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010381	CTAT	2	8	137356	137363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010381	TATT	2	8	138728	138735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010381	ATCT	2	8	138738	138745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010381	AATT	2	8	140308	140315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010381	ATTT	2	8	141330	141337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010381	ACTT	2	8	141570	141577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010381	TAGG	2	8	141587	141594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010381	AATT	2	8	141632	141639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010381	ATTT	2	8	142726	142733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010381	AAAT	2	8	142959	142966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010381	CTAA	2	8	143230	143237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010381	TTTC	2	8	150637	150644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010381	TCCA	2	8	150861	150868	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010381	TTAC	2	8	151220	151227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010381	GAAA	2	8	151462	151469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010381	AAAG	2	8	151484	151491	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010381	TTAA	2	8	151580	151587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010381	AAAT	2	8	151722	151729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010381	CCTT	2	8	153073	153080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010381	GAAA	2	8	153588	153595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010381	TTTA	2	8	154402	154409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010381	AATT	2	8	155340	155347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010381	ATTA	2	8	155456	155463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010381	TAAT	2	8	156443	156450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010381	TTTG	2	8	162048	162055	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010381	ATTG	2	8	162097	162104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010381	TAGT	2	8	162310	162317	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010381	AATC	2	8	163100	163107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010381	TTTA	2	8	175507	175514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010381	ATTT	2	8	175520	175527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010381	ACTA	2	8	177616	177623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.