MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 plasmid pBsph

Total Repeats: 406

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010381	ATTT	2	8	655	662	25 %	75 %	0 %	0 %	169825415
2	NC_010381	CAAA	2	8	1106	1113	75 %	0 %	0 %	25 %	169825415
3	NC_010381	TATG	2	8	1975	1982	25 %	50 %	25 %	0 %	169825416
4	NC_010381	AGCA	2	8	2252	2259	50 %	0 %	25 %	25 %	169825416
5	NC_010381	TAAT	2	8	2620	2627	50 %	50 %	0 %	0 %	169825416
6	NC_010381	TGAT	2	8	2743	2750	25 %	50 %	25 %	0 %	169825416
7	NC_010381	CAAC	2	8	3013	3020	50 %	0 %	0 %	50 %	169825416
8	NC_010381	AAGA	2	8	3366	3373	75 %	0 %	25 %	0 %	169825416
9	NC_010381	GAAA	2	8	3854	3861	75 %	0 %	25 %	0 %	169825416
10	NC_010381	AAAG	2	8	3944	3951	75 %	0 %	25 %	0 %	169825416
11	NC_010381	AAAC	2	8	4556	4563	75 %	0 %	0 %	25 %	169825416
12	NC_010381	CTTA	2	8	4657	4664	25 %	50 %	0 %	25 %	169825416
13	NC_010381	ATAA	2	8	4692	4699	75 %	25 %	0 %	0 %	169825416
14	NC_010381	AAAT	2	8	4702	4709	75 %	25 %	0 %	0 %	169825416
15	NC_010381	CAAA	2	8	4716	4723	75 %	0 %	0 %	25 %	169825416
16	NC_010381	GTTA	2	8	4843	4850	25 %	50 %	25 %	0 %	169825417
17	NC_010381	AAAC	2	8	6282	6289	75 %	0 %	0 %	25 %	169825418
18	NC_010381	GAAT	2	8	6457	6464	50 %	25 %	25 %	0 %	169825418
19	NC_010381	CCAT	2	8	6738	6745	25 %	25 %	0 %	50 %	169825418
20	NC_010381	AAGC	2	8	7099	7106	50 %	0 %	25 %	25 %	169825419
21	NC_010381	CATT	2	8	7873	7880	25 %	50 %	0 %	25 %	169825419
22	NC_010381	TGGT	2	8	8727	8734	0 %	50 %	50 %	0 %	169825421
23	NC_010381	GATG	2	8	9074	9081	25 %	25 %	50 %	0 %	169825422
24	NC_010381	TGGT	2	8	10891	10898	0 %	50 %	50 %	0 %	169825424
25	NC_010381	TCCT	2	8	15417	15424	0 %	50 %	0 %	50 %	169825429
26	NC_010381	ATAA	2	8	15626	15633	75 %	25 %	0 %	0 %	169825429
27	NC_010381	ACAG	2	8	15997	16004	50 %	0 %	25 %	25 %	169825429
28	NC_010381	TCAA	2	8	16322	16329	50 %	25 %	0 %	25 %	169825429
29	NC_010381	ATTT	2	8	16350	16357	25 %	75 %	0 %	0 %	169825429
30	NC_010381	AATA	2	8	16849	16856	75 %	25 %	0 %	0 %	169825431
31	NC_010381	TTCT	2	8	17854	17861	0 %	75 %	0 %	25 %	169825432
32	NC_010381	ACTT	2	8	17914	17921	25 %	50 %	0 %	25 %	169825432
33	NC_010381	GATG	2	8	18914	18921	25 %	25 %	50 %	0 %	169825433
34	NC_010381	GTAA	2	8	19024	19031	50 %	25 %	25 %	0 %	169825433
35	NC_010381	TTAC	2	8	19335	19342	25 %	50 %	0 %	25 %	169825434
36	NC_010381	TCCT	2	8	19839	19846	0 %	50 %	0 %	50 %	169825434
37	NC_010381	AAGG	2	8	20198	20205	50 %	0 %	50 %	0 %	169825435
38	NC_010381	ATCA	2	8	20404	20411	50 %	25 %	0 %	25 %	169825435
39	NC_010381	GATT	2	8	20973	20980	25 %	50 %	25 %	0 %	169825436
40	NC_010381	ATTC	2	8	21731	21738	25 %	50 %	0 %	25 %	169825436
41	NC_010381	TTAT	2	8	21796	21803	25 %	75 %	0 %	0 %	169825436
42	NC_010381	TTGG	2	8	22200	22207	0 %	50 %	50 %	0 %	169825437
43	NC_010381	ACTA	2	8	22557	22564	50 %	25 %	0 %	25 %	169825437
44	NC_010381	AAAT	2	8	22703	22710	75 %	25 %	0 %	0 %	169825437
45	NC_010381	TATC	2	8	22896	22903	25 %	50 %	0 %	25 %	169825437
46	NC_010381	AGAT	2	8	22965	22972	50 %	25 %	25 %	0 %	169825437
47	NC_010381	ATGA	2	8	23096	23103	50 %	25 %	25 %	0 %	169825437
48	NC_010381	GTAT	2	8	23204	23211	25 %	50 %	25 %	0 %	169825438
49	NC_010381	AAGG	2	8	23267	23274	50 %	0 %	50 %	0 %	169825438
50	NC_010381	AATG	2	8	25183	25190	50 %	25 %	25 %	0 %	169825440
51	NC_010381	TAAA	2	8	25240	25247	75 %	25 %	0 %	0 %	169825440
52	NC_010381	ACTT	2	8	25683	25690	25 %	50 %	0 %	25 %	169825441
53	NC_010381	TTGT	2	8	25750	25757	0 %	75 %	25 %	0 %	169825441
54	NC_010381	TTTA	2	8	25758	25765	25 %	75 %	0 %	0 %	169825441
55	NC_010381	AATA	2	8	25783	25790	75 %	25 %	0 %	0 %	169825441
56	NC_010381	TTGG	2	8	26349	26356	0 %	50 %	50 %	0 %	169825441
57	NC_010381	TAAA	2	8	26577	26584	75 %	25 %	0 %	0 %	169825441
58	NC_010381	GTGG	2	8	26651	26658	0 %	25 %	75 %	0 %	169825441
59	NC_010381	AAAG	2	8	27527	27534	75 %	0 %	25 %	0 %	169825443
60	NC_010381	TCTT	2	8	27818	27825	0 %	75 %	0 %	25 %	169825443
61	NC_010381	ACAA	2	8	28046	28053	75 %	0 %	0 %	25 %	169825443
62	NC_010381	TATG	2	8	28762	28769	25 %	50 %	25 %	0 %	169825443
63	NC_010381	TTTA	2	8	28788	28795	25 %	75 %	0 %	0 %	169825443
64	NC_010381	GAAT	2	8	29442	29449	50 %	25 %	25 %	0 %	169825445
65	NC_010381	CTTG	2	8	30505	30512	0 %	50 %	25 %	25 %	169825447
66	NC_010381	GATA	2	8	30581	30588	50 %	25 %	25 %	0 %	169825447
67	NC_010381	ATGG	2	8	30665	30672	25 %	25 %	50 %	0 %	169825447
68	NC_010381	TTCA	2	8	30794	30801	25 %	50 %	0 %	25 %	169825447
69	NC_010381	TAGT	2	8	31224	31231	25 %	50 %	25 %	0 %	169825448
70	NC_010381	GTGG	2	8	31235	31242	0 %	25 %	75 %	0 %	169825448
71	NC_010381	ACTT	2	8	31343	31350	25 %	50 %	0 %	25 %	169825448
72	NC_010381	GAAA	2	8	31609	31616	75 %	0 %	25 %	0 %	169825448
73	NC_010381	AGAA	2	8	31861	31868	75 %	0 %	25 %	0 %	169825449
74	NC_010381	AGAA	2	8	32074	32081	75 %	0 %	25 %	0 %	169825449
75	NC_010381	TTAT	2	8	32920	32927	25 %	75 %	0 %	0 %	169825450
76	NC_010381	TTCT	2	8	34023	34030	0 %	75 %	0 %	25 %	169825451
77	NC_010381	AGTT	2	8	34050	34057	25 %	50 %	25 %	0 %	169825451
78	NC_010381	TTCT	2	8	34446	34453	0 %	75 %	0 %	25 %	169825451
79	NC_010381	AATG	2	8	34873	34880	50 %	25 %	25 %	0 %	169825453
80	NC_010381	AGAT	2	8	34978	34985	50 %	25 %	25 %	0 %	169825453
81	NC_010381	GGAA	2	8	35176	35183	50 %	0 %	50 %	0 %	169825453
82	NC_010381	ATTC	2	8	35308	35315	25 %	50 %	0 %	25 %	169825453
83	NC_010381	TTGG	2	8	35683	35690	0 %	50 %	50 %	0 %	169825454
84	NC_010381	ATTT	2	8	35772	35779	25 %	75 %	0 %	0 %	169825454
85	NC_010381	TCTA	2	8	36499	36506	25 %	50 %	0 %	25 %	169825454
86	NC_010381	TATT	2	8	37386	37393	25 %	75 %	0 %	0 %	169825455
87	NC_010381	CTTG	2	8	37407	37414	0 %	50 %	25 %	25 %	169825455
88	NC_010381	AATT	2	8	37595	37602	50 %	50 %	0 %	0 %	169825455
89	NC_010381	AAGC	2	8	38503	38510	50 %	0 %	25 %	25 %	169825455
90	NC_010381	ATCC	2	8	39240	39247	25 %	25 %	0 %	50 %	169825455
91	NC_010381	AAAC	2	8	39505	39512	75 %	0 %	0 %	25 %	169825455
92	NC_010381	CAAC	2	8	39925	39932	50 %	0 %	0 %	50 %	169825455
93	NC_010381	CATC	2	8	40270	40277	25 %	25 %	0 %	50 %	169825455
94	NC_010381	GCAT	2	8	40641	40648	25 %	25 %	25 %	25 %	169825455
95	NC_010381	TTCT	2	8	40737	40744	0 %	75 %	0 %	25 %	169825455
96	NC_010381	AAAT	2	8	41226	41233	75 %	25 %	0 %	0 %	169825455
97	NC_010381	ATTT	2	8	41303	41310	25 %	75 %	0 %	0 %	169825455
98	NC_010381	AGAA	2	8	41769	41776	75 %	0 %	25 %	0 %	169825456
99	NC_010381	AATG	2	8	41846	41853	50 %	25 %	25 %	0 %	169825456
100	NC_010381	CATT	2	8	42174	42181	25 %	50 %	0 %	25 %	169825456
101	NC_010381	TTAC	2	8	42304	42311	25 %	50 %	0 %	25 %	169825456
102	NC_010381	TTAT	2	8	43175	43182	25 %	75 %	0 %	0 %	169825457
103	NC_010381	GATG	2	8	43867	43874	25 %	25 %	50 %	0 %	169825458
104	NC_010381	AAGA	2	8	44329	44336	75 %	0 %	25 %	0 %	169825458
105	NC_010381	CAAC	2	8	45119	45126	50 %	0 %	0 %	50 %	169825458
106	NC_010381	TATC	2	8	45158	45165	25 %	50 %	0 %	25 %	169825458
107	NC_010381	AAAT	2	8	45385	45392	75 %	25 %	0 %	0 %	169825458
108	NC_010381	ATGA	2	8	45842	45849	50 %	25 %	25 %	0 %	169825459
109	NC_010381	AGGG	2	8	46608	46615	25 %	0 %	75 %	0 %	169825460
110	NC_010381	TTGT	2	8	46765	46772	0 %	75 %	25 %	0 %	169825460
111	NC_010381	TTAG	2	8	46927	46934	25 %	50 %	25 %	0 %	169825460
112	NC_010381	TATG	2	8	47229	47236	25 %	50 %	25 %	0 %	169825460
113	NC_010381	TCTT	2	8	47352	47359	0 %	75 %	0 %	25 %	169825460
114	NC_010381	CCAG	2	8	47370	47377	25 %	0 %	25 %	50 %	169825460
115	NC_010381	CTAT	2	8	47660	47667	25 %	50 %	0 %	25 %	169825460
116	NC_010381	ATGC	2	8	47730	47737	25 %	25 %	25 %	25 %	169825460
117	NC_010381	TTAC	2	8	48086	48093	25 %	50 %	0 %	25 %	169825461
118	NC_010381	AATG	2	8	48895	48902	50 %	25 %	25 %	0 %	169825462
119	NC_010381	GAAA	2	8	48913	48920	75 %	0 %	25 %	0 %	169825462
120	NC_010381	CCTA	2	8	49008	49015	25 %	25 %	0 %	50 %	169825462
121	NC_010381	TTGG	2	8	49926	49933	0 %	50 %	50 %	0 %	169825464
122	NC_010381	TGGA	2	8	50332	50339	25 %	25 %	50 %	0 %	169825465
123	NC_010381	GGAA	2	8	50442	50449	50 %	0 %	50 %	0 %	169825465
124	NC_010381	TTGG	2	8	51373	51380	0 %	50 %	50 %	0 %	169825466
125	NC_010381	TTAT	2	8	53839	53846	25 %	75 %	0 %	0 %	169825467
126	NC_010381	TGGT	2	8	54836	54843	0 %	50 %	50 %	0 %	169825467
127	NC_010381	ATTC	2	8	55014	55021	25 %	50 %	0 %	25 %	169825467
128	NC_010381	CTTG	2	8	56047	56054	0 %	50 %	25 %	25 %	169825468
129	NC_010381	GAAA	2	8	56086	56093	75 %	0 %	25 %	0 %	169825468
130	NC_010381	TTTA	2	8	56518	56525	25 %	75 %	0 %	0 %	169825468
131	NC_010381	ATTT	2	8	56678	56685	25 %	75 %	0 %	0 %	169825468
132	NC_010381	GTAT	2	8	57156	57163	25 %	50 %	25 %	0 %	169825468
133	NC_010381	CAAA	3	12	57547	57558	75 %	0 %	0 %	25 %	169825468
134	NC_010381	AGTG	2	8	57580	57587	25 %	25 %	50 %	0 %	169825468
135	NC_010381	GAAC	2	8	57725	57732	50 %	0 %	25 %	25 %	169825468
136	NC_010381	GAAT	2	8	57816	57823	50 %	25 %	25 %	0 %	169825468
137	NC_010381	TTTC	2	8	58162	58169	0 %	75 %	0 %	25 %	169825469
138	NC_010381	GGTT	2	8	58769	58776	0 %	50 %	50 %	0 %	169825469
139	NC_010381	GATT	2	8	59203	59210	25 %	50 %	25 %	0 %	169825469
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.