MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 plasmid pBsph

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010381	AT	3	6	325	330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010381	CA	3	6	718	723	50 %	0 %	0 %	50 %	169825415
3	NC_010381	CT	3	6	1557	1562	0 %	50 %	0 %	50 %	169825415
4	NC_010381	TA	3	6	2124	2129	50 %	50 %	0 %	0 %	169825416
5	NC_010381	AT	3	6	2935	2940	50 %	50 %	0 %	0 %	169825416
6	NC_010381	TC	3	6	3543	3548	0 %	50 %	0 %	50 %	169825416
7	NC_010381	TA	3	6	6502	6507	50 %	50 %	0 %	0 %	169825418
8	NC_010381	TA	3	6	10671	10676	50 %	50 %	0 %	0 %	169825424
9	NC_010381	AT	3	6	11256	11261	50 %	50 %	0 %	0 %	169825425
10	NC_010381	AT	3	6	12503	12508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010381	TA	4	8	12526	12533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010381	GT	3	6	13086	13091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010381	CT	3	6	14757	14762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010381	TA	3	6	14937	14942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010381	AG	3	6	15132	15137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010381	CA	3	6	15275	15280	50 %	0 %	0 %	50 %	169825429
17	NC_010381	TA	3	6	15864	15869	50 %	50 %	0 %	0 %	169825429
18	NC_010381	AT	3	6	15967	15972	50 %	50 %	0 %	0 %	169825429
19	NC_010381	TA	3	6	16019	16024	50 %	50 %	0 %	0 %	169825429
20	NC_010381	TA	3	6	16458	16463	50 %	50 %	0 %	0 %	169825429
21	NC_010381	TA	3	6	16747	16752	50 %	50 %	0 %	0 %	169825430
22	NC_010381	GT	3	6	17526	17531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010381	GA	3	6	18534	18539	50 %	0 %	50 %	0 %	169825432
24	NC_010381	TG	3	6	18696	18701	0 %	50 %	50 %	0 %	169825432
25	NC_010381	TA	3	6	18899	18904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010381	AG	3	6	19202	19207	50 %	0 %	50 %	0 %	169825433
27	NC_010381	TA	3	6	20903	20908	50 %	50 %	0 %	0 %	169825436
28	NC_010381	TA	3	6	21400	21405	50 %	50 %	0 %	0 %	169825436
29	NC_010381	AT	3	6	21420	21425	50 %	50 %	0 %	0 %	169825436
30	NC_010381	AT	4	8	23385	23392	50 %	50 %	0 %	0 %	169825438
31	NC_010381	TA	3	6	23619	23624	50 %	50 %	0 %	0 %	169825438
32	NC_010381	TG	3	6	24329	24334	0 %	50 %	50 %	0 %	169825439
33	NC_010381	AT	3	6	24368	24373	50 %	50 %	0 %	0 %	169825439
34	NC_010381	AT	3	6	25089	25094	50 %	50 %	0 %	0 %	169825440
35	NC_010381	AC	3	6	25269	25274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010381	AG	3	6	25648	25653	50 %	0 %	50 %	0 %	169825441
37	NC_010381	GA	3	6	26177	26182	50 %	0 %	50 %	0 %	169825441
38	NC_010381	GA	3	6	26528	26533	50 %	0 %	50 %	0 %	169825441
39	NC_010381	GA	3	6	26678	26683	50 %	0 %	50 %	0 %	169825442
40	NC_010381	AG	3	6	27156	27161	50 %	0 %	50 %	0 %	169825442
41	NC_010381	AT	5	10	27733	27742	50 %	50 %	0 %	0 %	169825443
42	NC_010381	GA	3	6	28459	28464	50 %	0 %	50 %	0 %	169825443
43	NC_010381	GA	3	6	28827	28832	50 %	0 %	50 %	0 %	169825444
44	NC_010381	CA	3	6	28845	28850	50 %	0 %	0 %	50 %	169825444
45	NC_010381	AC	3	6	29475	29480	50 %	0 %	0 %	50 %	169825445
46	NC_010381	TA	3	6	30212	30217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010381	TA	3	6	30328	30333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010381	AT	3	6	30483	30488	50 %	50 %	0 %	0 %	169825447
49	NC_010381	AT	3	6	30752	30757	50 %	50 %	0 %	0 %	169825447
50	NC_010381	TC	3	6	32581	32586	0 %	50 %	0 %	50 %	169825450
51	NC_010381	AT	3	6	32589	32594	50 %	50 %	0 %	0 %	169825450
52	NC_010381	AT	3	6	34618	34623	50 %	50 %	0 %	0 %	169825452
53	NC_010381	AT	4	8	35612	35619	50 %	50 %	0 %	0 %	169825454
54	NC_010381	CA	3	6	35800	35805	50 %	0 %	0 %	50 %	169825454
55	NC_010381	TA	3	6	35907	35912	50 %	50 %	0 %	0 %	169825454
56	NC_010381	AG	3	6	36836	36841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010381	AT	3	6	37875	37880	50 %	50 %	0 %	0 %	169825455
58	NC_010381	AC	3	6	40989	40994	50 %	0 %	0 %	50 %	169825455
59	NC_010381	AT	3	6	42403	42408	50 %	50 %	0 %	0 %	169825456
60	NC_010381	AT	3	6	42675	42680	50 %	50 %	0 %	0 %	169825456
61	NC_010381	GT	3	6	43113	43118	0 %	50 %	50 %	0 %	169825457
62	NC_010381	TA	3	6	43540	43545	50 %	50 %	0 %	0 %	169825457
63	NC_010381	AT	3	6	43566	43571	50 %	50 %	0 %	0 %	169825457
64	NC_010381	CT	3	6	44740	44745	0 %	50 %	0 %	50 %	169825458
65	NC_010381	CA	3	6	45631	45636	50 %	0 %	0 %	50 %	169825459
66	NC_010381	TC	3	6	46128	46133	0 %	50 %	0 %	50 %	169825459
67	NC_010381	AT	3	6	46900	46905	50 %	50 %	0 %	0 %	169825460
68	NC_010381	AT	3	6	47362	47367	50 %	50 %	0 %	0 %	169825460
69	NC_010381	AC	3	6	47912	47917	50 %	0 %	0 %	50 %	169825461
70	NC_010381	TA	3	6	47918	47923	50 %	50 %	0 %	0 %	169825461
71	NC_010381	TA	3	6	48593	48598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010381	TA	4	8	48691	48698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010381	CA	3	6	48792	48797	50 %	0 %	0 %	50 %	169825462
74	NC_010381	AT	3	6	48819	48824	50 %	50 %	0 %	0 %	169825462
75	NC_010381	AT	3	6	50818	50823	50 %	50 %	0 %	0 %	169825465
76	NC_010381	AG	3	6	50855	50860	50 %	0 %	50 %	0 %	169825465
77	NC_010381	TA	3	6	51336	51341	50 %	50 %	0 %	0 %	169825466
78	NC_010381	TA	3	6	51874	51879	50 %	50 %	0 %	0 %	169825466
79	NC_010381	TA	4	8	51888	51895	50 %	50 %	0 %	0 %	169825466
80	NC_010381	GA	3	6	52892	52897	50 %	0 %	50 %	0 %	169825466
81	NC_010381	AT	3	6	53090	53095	50 %	50 %	0 %	0 %	169825466
82	NC_010381	CA	3	6	53523	53528	50 %	0 %	0 %	50 %	169825467
83	NC_010381	AT	3	6	56193	56198	50 %	50 %	0 %	0 %	169825468
84	NC_010381	AG	3	6	56755	56760	50 %	0 %	50 %	0 %	169825468
85	NC_010381	TC	3	6	58059	58064	0 %	50 %	0 %	50 %	169825469
86	NC_010381	GA	3	6	58181	58186	50 %	0 %	50 %	0 %	169825469
87	NC_010381	GA	4	8	58336	58343	50 %	0 %	50 %	0 %	169825469
88	NC_010381	TG	3	6	58637	58642	0 %	50 %	50 %	0 %	169825469
89	NC_010381	TA	3	6	59175	59180	50 %	50 %	0 %	0 %	169825469
90	NC_010381	GA	3	6	59911	59916	50 %	0 %	50 %	0 %	169825469
91	NC_010381	AG	3	6	60523	60528	50 %	0 %	50 %	0 %	169825470
92	NC_010381	TA	4	8	61200	61207	50 %	50 %	0 %	0 %	169825471
93	NC_010381	AT	3	6	62047	62052	50 %	50 %	0 %	0 %	169825473
94	NC_010381	AT	3	6	62063	62068	50 %	50 %	0 %	0 %	169825473
95	NC_010381	AT	3	6	62130	62135	50 %	50 %	0 %	0 %	169825473
96	NC_010381	TG	3	6	62699	62704	0 %	50 %	50 %	0 %	169825474
97	NC_010381	AG	3	6	63284	63289	50 %	0 %	50 %	0 %	169825475
98	NC_010381	AT	3	6	65045	65050	50 %	50 %	0 %	0 %	169825478
99	NC_010381	GT	4	8	65979	65986	0 %	50 %	50 %	0 %	169825479
100	NC_010381	TA	3	6	66288	66293	50 %	50 %	0 %	0 %	169825480
101	NC_010381	AT	3	6	66609	66614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010381	TA	3	6	66670	66675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010381	TA	3	6	66974	66979	50 %	50 %	0 %	0 %	169825481
104	NC_010381	AT	4	8	66999	67006	50 %	50 %	0 %	0 %	169825481
105	NC_010381	AT	3	6	67948	67953	50 %	50 %	0 %	0 %	169825482
106	NC_010381	TA	3	6	68266	68271	50 %	50 %	0 %	0 %	169825483
107	NC_010381	AT	3	6	69525	69530	50 %	50 %	0 %	0 %	169825484
108	NC_010381	TA	3	6	72651	72656	50 %	50 %	0 %	0 %	169825485
109	NC_010381	AT	3	6	73100	73105	50 %	50 %	0 %	0 %	169825485
110	NC_010381	AT	3	6	73588	73593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010381	TA	3	6	73633	73638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010381	GA	3	6	74143	74148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010381	AT	3	6	75133	75138	50 %	50 %	0 %	0 %	169825489
114	NC_010381	GA	4	8	75452	75459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010381	TA	5	10	75691	75700	50 %	50 %	0 %	0 %	169825490
116	NC_010381	TA	4	8	76074	76081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010381	AG	3	6	76573	76578	50 %	0 %	50 %	0 %	169825493
118	NC_010381	AG	3	6	76860	76865	50 %	0 %	50 %	0 %	169825494
119	NC_010381	TA	3	6	77794	77799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010381	AT	3	6	78128	78133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010381	AT	3	6	78154	78159	50 %	50 %	0 %	0 %	169825498
122	NC_010381	TA	3	6	79047	79052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010381	CT	3	6	79387	79392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010381	CT	3	6	80054	80059	0 %	50 %	0 %	50 %	169825499
125	NC_010381	TA	3	6	80251	80256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010381	AT	4	8	80337	80344	50 %	50 %	0 %	0 %	169825500
127	NC_010381	TA	3	6	80400	80405	50 %	50 %	0 %	0 %	169825500
128	NC_010381	TA	3	6	81894	81899	50 %	50 %	0 %	0 %	169825501
129	NC_010381	AT	3	6	82253	82258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010381	AT	3	6	82639	82644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010381	TA	3	6	82670	82675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010381	AT	3	6	83879	83884	50 %	50 %	0 %	0 %	169825503
133	NC_010381	AT	3	6	84067	84072	50 %	50 %	0 %	0 %	169825503
134	NC_010381	AT	3	6	84992	84997	50 %	50 %	0 %	0 %	169825505
135	NC_010381	AG	3	6	86638	86643	50 %	0 %	50 %	0 %	169825506
136	NC_010381	AT	3	6	86720	86725	50 %	50 %	0 %	0 %	169825506
137	NC_010381	TA	4	8	87038	87045	50 %	50 %	0 %	0 %	169825506
138	NC_010381	AT	3	6	87228	87233	50 %	50 %	0 %	0 %	169825506
139	NC_010381	CA	3	6	87405	87410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010381	CA	3	6	87741	87746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010381	GA	3	6	87757	87762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010381	TA	3	6	88052	88057	50 %	50 %	0 %	0 %	169825508
143	NC_010381	TC	3	6	88176	88181	0 %	50 %	0 %	50 %	169825508
144	NC_010381	TA	3	6	88660	88665	50 %	50 %	0 %	0 %	169825509
145	NC_010381	AT	3	6	89397	89402	50 %	50 %	0 %	0 %	169825511
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.