MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010380	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010380	TCGTG	2	10	16421	16430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010380	GTTAA	2	10	17142	17151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010380	GGGAG	2	10	17660	17669	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010380	AGGGA	2	10	19871	19880	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010380	AAGCT	2	10	20429	20438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010380	CTTTT	2	10	23345	23354	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010380	TTTTG	2	10	57858	57867	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010380	ATTAT	2	10	57999	58008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010380	TTTTA	2	10	58136	58145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010380	TATCG	2	10	99195	99204	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010380	AATCA	2	10	105558	105567	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010380	TCATA	2	10	114909	114918	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010380	AGAGG	2	10	122218	122227	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010380	TTTAT	2	10	142681	142690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010380	ATTCA	2	10	148556	148565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010380	TTATC	2	10	151078	151087	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010380	TATCA	2	10	154323	154332	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010380	GAAAG	2	10	156134	156143	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010380	GCGGT	2	10	157330	157339	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010380	ATAAA	2	10	165327	165336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010380	TAACC	2	10	165425	165434	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010380	GGCTT	2	10	181368	181377	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010380	AAATG	2	10	184251	184260	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010380	GCTTT	2	10	193764	193773	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010380	TAAAA	2	10	199720	199729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010380	ATTAA	2	10	203331	203340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010380	ACATG	2	10	210264	210273	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010380	GAAAA	2	10	210856	210865	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010380	TTTTC	2	10	223452	223461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010380	CTAAG	2	10	239871	239880	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010380	TGAAA	2	10	240074	240083	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010380	ATTTC	2	10	241600	241609	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010380	CCCTG	2	10	248850	248859	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_010380	ACAAA	2	10	264869	264878	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010380	ATGAT	2	10	277090	277099	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010380	AAGGA	2	10	289332	289341	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010380	GTTCA	2	10	290966	290975	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010380	AAAAT	2	10	294773	294782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010380	ATCGA	2	10	295521	295530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010380	TTTTA	2	10	300191	300200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010380	ATTCT	2	10	304968	304977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010380	GATAA	2	10	305627	305636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010380	CTATC	2	10	307389	307398	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_010380	CTTTT	2	10	321194	321203	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010380	CTTAA	2	10	323551	323560	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010380	AAGCC	2	10	337368	337377	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_010380	AATAG	2	10	338914	338923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010380	AATTG	2	10	347623	347632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010380	TATAC	2	10	348668	348677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010380	CTATT	2	10	367541	367550	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010380	CTTTT	2	10	375389	375398	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010380	TAATT	2	10	375509	375518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010380	AGAAC	2	10	379657	379666	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010380	AAATA	2	10	390416	390425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010380	TCCAC	2	10	416275	416284	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_010380	TCTAT	2	10	421000	421009	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010380	CCTTT	2	10	421754	421763	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_010380	CATTT	2	10	422263	422272	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010380	TAAGG	2	10	422414	422423	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010380	ATAAA	2	10	437171	437180	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010380	TTTTC	2	10	450082	450091	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010380	TTAAA	2	10	451757	451766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010380	TTTTA	2	10	464596	464605	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010380	GACTG	2	10	502167	502176	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010380	CTGAC	2	10	509853	509862	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_010380	TCCAG	2	10	509878	509887	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_010380	ATATA	2	10	510986	510995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010380	AAATA	2	10	513318	513327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010380	AGAAA	2	10	513339	513348	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010380	TTGTC	2	10	518952	518961	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010380	ATACT	3	15	519176	519190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010380	CTGGT	2	10	525626	525635	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010380	GAAAG	2	10	528420	528429	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010380	TCTTT	2	10	528662	528671	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010380	TTTGT	2	10	531120	531129	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010380	TTTAT	2	10	533024	533033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010380	ATTTA	2	10	533138	533147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010380	AAGAG	2	10	544925	544934	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010380	CAGGG	2	10	548253	548262	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010380	TGAAA	2	10	553585	553594	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010380	CTATT	2	10	555637	555646	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010380	AATAA	2	10	560867	560876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010380	CTTTT	2	10	562135	562144	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010380	TAAAA	2	10	562148	562157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010380	TGTTT	2	10	565014	565023	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010380	CTTTC	2	10	571077	571086	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_010380	ATAAA	2	10	573457	573466	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010380	AGCGA	2	10	576592	576601	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010380	ATTCA	2	10	580754	580763	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010380	TACTG	2	10	581527	581536	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010380	ATATA	2	10	581544	581553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010380	TTCTT	2	10	584108	584117	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010380	GATAA	2	10	586782	586791	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010380	ATTAT	2	10	590943	590952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010380	ATAGT	2	10	591065	591074	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010380	ATTCT	2	10	591583	591592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010380	CAATA	2	10	592101	592110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010380	TATAA	2	10	603923	603932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010380	TTTTA	2	10	606647	606656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010380	CTTTT	2	10	606738	606747	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010380	TTTTA	2	10	606819	606828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010380	GGGTT	2	10	611141	611150	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010380	ATTTT	2	10	614402	614411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010380	TAATT	2	10	615273	615282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010380	TCCTT	2	10	615283	615292	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010380	GATTG	2	10	616386	616395	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010380	AGATG	2	10	617188	617197	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010380	TTTTA	2	10	617534	617543	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010380	AGGAA	2	10	623853	623862	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010380	ATAAA	2	10	631892	631901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010380	ATATA	2	10	643858	643867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010380	TAGTA	2	10	647088	647097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010380	ATAAC	2	10	647154	647163	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010380	CATTT	2	10	648541	648550	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010380	ATTTC	2	10	685512	685521	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010380	TTTCC	2	10	686809	686818	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_010380	TCTAT	2	10	686870	686879	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010380	AAACA	2	10	687220	687229	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010380	ATATA	2	10	690004	690013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010380	CCAAT	2	10	701152	701161	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_010380	CTTAT	2	10	728284	728293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010380	GAAAA	2	10	728326	728335	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010380	GTTAT	2	10	728365	728374	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010380	TCCTT	2	10	731926	731935	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_010380	GTTTG	2	10	743843	743852	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010380	GCAAA	2	10	744133	744142	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010380	AGCCA	2	10	745029	745038	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_010380	CAACC	2	10	749609	749618	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_010380	TGAAA	2	10	749732	749741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010380	TTTAG	2	10	766420	766429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010380	AGGAA	2	10	767401	767410	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010380	AGTAA	2	10	767554	767563	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010380	GTTTA	2	10	767952	767961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010380	ATTTA	2	10	777651	777660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010380	AATAG	2	10	777672	777681	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010380	TAGTA	2	10	778064	778073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010380	ATGGA	2	10	801742	801751	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010380	TTATT	2	10	804037	804046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010380	ATAAA	2	10	811642	811651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010380	GGAAA	2	10	820562	820571	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010380	TAAAA	2	10	831989	831998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010380	TAAAA	2	10	844878	844887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010380	GACTC	2	10	845308	845317	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_010380	GTGTA	2	10	846693	846702	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010380	ATTTT	2	10	848662	848671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010380	CAAGA	2	10	854605	854614	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010380	CAAAT	2	10	856734	856743	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_010380	GAAAA	2	10	856778	856787	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010380	TCTGA	2	10	860307	860316	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_010380	CTGAA	2	10	862505	862514	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_010380	ATAAA	2	10	862675	862684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010380	TTTGA	2	10	862703	862712	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010380	AAATA	2	10	870340	870349	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010380	TATTT	2	10	885904	885913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010380	TCTTT	2	10	887488	887497	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_010380	TTTTG	2	10	912444	912453	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010380	TATAT	2	10	925273	925282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010380	ATCTA	2	10	931766	931775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_010380	TATGA	2	10	933814	933823	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010380	TGTTT	2	10	934313	934322	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010380	AAATC	2	10	941371	941380	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_010380	AGGTT	2	10	941450	941459	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010380	CATTT	2	10	941607	941616	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_010380	AGAAC	2	10	946266	946275	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_010380	ATATA	2	10	949196	949205	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010380	CTTTT	2	10	954597	954606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_010380	TAATA	2	10	955609	955618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010380	ATAGA	2	10	964484	964493	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010380	ATTAG	2	10	972441	972450	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_010380	TCTTT	2	10	980282	980291	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_010380	AATAA	2	10	982141	982150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010380	AGGCT	2	10	1000515	1000524	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
174	NC_010380	ATAGT	2	10	1007102	1007111	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_010380	AGCTC	2	10	1010503	1010512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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179	NC_010380	TCCTT	2	10	1021663	1021672	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_010380	GCGAA	2	10	1023017	1023026	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
182	NC_010380	ATAAA	2	10	1025168	1025177	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_010380	ATTAT	2	10	1043506	1043515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_010380	CAAGA	2	10	1048857	1048866	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_010380	TTAAA	2	10	1049369	1049378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_010380	ATACA	2	10	1059420	1059429	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_010380	AGTAA	2	10	1081340	1081349	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_010380	TTTAT	2	10	1102571	1102580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_010380	ATTTC	2	10	1113374	1113383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
194	NC_010380	TAATA	2	10	1133252	1133261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_010380	ATATA	2	10	1140705	1140714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_010380	TAAAA	2	10	1140791	1140800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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211	NC_010380	TAAAA	2	10	1180976	1180985	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
212	NC_010380	ACATA	2	10	1184220	1184229	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
213	NC_010380	TGAAA	2	10	1184460	1184469	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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216	NC_010380	ATAAA	2	10	1185870	1185879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_010380	CTATA	2	10	1297445	1297454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
232	NC_010380	TATAA	2	10	1297852	1297861	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_010380	TCCTT	2	10	1303436	1303445	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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253	NC_010380	GAAAA	2	10	1452649	1452658	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_010380	TCTAT	2	10	1628603	1628612	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.