MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

Total Repeats: 1180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010380	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010380	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010380	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010380	TGAG	2	8	15329	15336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010380	GCTT	2	8	15426	15433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010380	CCTG	2	8	15474	15481	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010380	GTGA	2	8	15754	15761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010380	AGCG	2	8	15925	15932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010380	AGCC	2	8	16806	16813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010380	GTAA	2	8	17228	17235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010380	GCGA	2	8	17384	17391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010380	ATTC	2	8	18250	18257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010380	CTAA	2	8	18604	18611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010380	GTCT	2	8	18629	18636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010380	TAGG	2	8	19260	19267	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010380	CTTT	2	8	20460	20467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010380	GAAC	2	8	26902	26909	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010380	AAAT	2	8	33815	33822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010380	ATTG	2	8	57719	57726	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010380	TTTG	2	8	58884	58891	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010380	AGAA	2	8	62497	62504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010380	ACTA	2	8	63006	63013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010380	AATA	2	8	63033	63040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010380	CTAA	2	8	63041	63048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010380	GACA	2	8	69334	69341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010380	AGGG	2	8	69420	69427	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010380	GGGC	2	8	82061	82068	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010380	TAAT	2	8	97001	97008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010380	CTCA	2	8	98131	98138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010380	AACC	2	8	98471	98478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010380	GTAC	2	8	98614	98621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010380	CGGA	2	8	98916	98923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010380	TAAA	2	8	99007	99014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010380	AATA	2	8	99244	99251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010380	AGAA	2	8	102213	102220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010380	TTGA	2	8	103093	103100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010380	AATA	2	8	104196	104203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010380	TTCT	2	8	104570	104577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010380	AATT	2	8	105663	105670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010380	CTAT	2	8	105767	105774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010380	ATTT	2	8	114858	114865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010380	TGTT	2	8	114935	114942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010380	TCTA	2	8	116283	116290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010380	TTTA	2	8	116438	116445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010380	ATTT	2	8	116567	116574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010380	ACAT	2	8	116667	116674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010380	GGGA	2	8	119810	119817	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010380	GAAG	2	8	119833	119840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010380	TGAC	2	8	119947	119954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010380	TATT	2	8	123667	123674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010380	ATAG	2	8	128398	128405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010380	TTTC	2	8	133705	133712	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010380	TAAT	2	8	143949	143956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010380	GTTT	2	8	149907	149914	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010380	GAAG	2	8	156917	156924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010380	TAGC	2	8	157273	157280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010380	AAAT	2	8	157316	157323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010380	AAGG	2	8	157500	157507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010380	TAAT	2	8	158132	158139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010380	AAAG	2	8	158229	158236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010380	AAAT	2	8	161294	161301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010380	CTTT	2	8	161355	161362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010380	AATT	2	8	164396	164403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010380	TTTG	2	8	165353	165360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010380	ATTC	2	8	169146	169153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010380	AAAT	2	8	169304	169311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010380	ATAA	2	8	169347	169354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010380	GTTT	2	8	170437	170444	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010380	TGTA	2	8	170473	170480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010380	TTAG	2	8	172582	172589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010380	ACAT	2	8	174490	174497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010380	AAAG	2	8	174508	174515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010380	GTAT	2	8	178963	178970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010380	AGAA	2	8	181537	181544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010380	GAAG	2	8	184266	184273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010380	AAAT	2	8	184350	184357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010380	TCCC	2	8	184643	184650	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_010380	TTCA	2	8	187436	187443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010380	TAGA	2	8	191603	191610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010380	GTAG	2	8	191963	191970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010380	GTAT	2	8	192021	192028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010380	TGCT	2	8	192158	192165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010380	AGGA	2	8	192354	192361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010380	TCTA	2	8	193147	193154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010380	TGAA	2	8	193239	193246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010380	TTTA	2	8	193260	193267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010380	AAGC	2	8	193345	193352	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010380	TTAT	2	8	195033	195040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010380	ATAA	2	8	195066	195073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010380	GTAT	2	8	196241	196248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010380	TTTA	2	8	196293	196300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010380	ATTT	2	8	199558	199565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010380	AATT	2	8	200153	200160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010380	AAGA	2	8	200450	200457	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010380	TTAT	2	8	203510	203517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010380	TGAA	2	8	203528	203535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010380	AAAG	2	8	207511	207518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010380	TAGA	2	8	207634	207641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010380	TCAA	2	8	213401	213408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010380	GGAT	2	8	213923	213930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010380	AGTT	2	8	214475	214482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010380	TAGG	2	8	214910	214917	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010380	GTAG	2	8	215008	215015	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010380	AAGC	2	8	215029	215036	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010380	GGGA	2	8	219513	219520	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010380	ATTT	2	8	219897	219904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010380	TTTA	2	8	220096	220103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010380	GGCT	2	8	222443	222450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010380	AATT	2	8	226062	226069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010380	GAAA	2	8	226512	226519	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010380	GCAG	2	8	226539	226546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010380	AGAT	2	8	227546	227553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010380	CAAA	2	8	228555	228562	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010380	CTTT	2	8	239770	239777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010380	TTTC	2	8	241650	241657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010380	TTCT	2	8	242863	242870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010380	TAAT	2	8	242891	242898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010380	CAAT	2	8	256862	256869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010380	TTAG	2	8	256912	256919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010380	TCGG	2	8	259025	259032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010380	TTAA	2	8	264934	264941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010380	GGAA	2	8	265618	265625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010380	TTGC	2	8	265874	265881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010380	AGAA	2	8	266950	266957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010380	GGTA	2	8	270971	270978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010380	AGAA	2	8	271429	271436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010380	AAAT	2	8	272021	272028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010380	ATTG	2	8	273493	273500	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010380	AGAA	2	8	277045	277052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010380	CTAA	2	8	277071	277078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010380	AGAA	2	8	278876	278883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010380	GCAT	2	8	278898	278905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010380	AGAA	2	8	283053	283060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010380	GTTT	2	8	290915	290922	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010380	ACAA	2	8	290923	290930	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010380	TAAA	2	8	300006	300013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010380	TTTA	2	8	300080	300087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010380	TCAT	2	8	300201	300208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010380	CTTG	2	8	300942	300949	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010380	GAAG	2	8	301485	301492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010380	TAGG	2	8	301590	301597	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010380	AGCT	2	8	301686	301693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010380	TGGA	2	8	301857	301864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010380	CAAG	2	8	302069	302076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010380	CATA	2	8	302422	302429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010380	AAAG	2	8	302534	302541	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010380	AAGA	2	8	302633	302640	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010380	AGTG	2	8	303867	303874	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010380	AATT	2	8	305030	305037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010380	AAGA	2	8	305646	305653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010380	GTAT	2	8	306532	306539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010380	GAAA	2	8	307407	307414	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_010380	GAAA	2	8	311544	311551	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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