MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	ATATA	2	10	903	912	60 %	40 %	0 %	0 %	169834666
2	NC_010379	ATATT	2	10	1755	1764	40 %	60 %	0 %	0 %	169834598
3	NC_010379	ATTAA	2	10	2708	2717	60 %	40 %	0 %	0 %	169834657
4	NC_010379	TTATA	2	10	6591	6600	40 %	60 %	0 %	0 %	169834715
5	NC_010379	TATAA	2	10	8354	8363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010379	AAATC	2	10	9330	9339	60 %	20 %	0 %	20 %	169834551
7	NC_010379	ATTTC	2	10	11384	11393	20 %	60 %	0 %	20 %	169834584
8	NC_010379	ATATT	2	10	11510	11519	40 %	60 %	0 %	0 %	169834584
9	NC_010379	TTCCA	2	10	12609	12618	20 %	40 %	0 %	40 %	169834726
10	NC_010379	TTATA	2	10	12999	13008	40 %	60 %	0 %	0 %	169834649
11	NC_010379	ATTTT	2	10	14162	14171	20 %	80 %	0 %	0 %	169834535
12	NC_010379	ATATA	2	10	14194	14203	60 %	40 %	0 %	0 %	169834535
13	NC_010379	TTCAA	2	10	14615	14624	40 %	40 %	0 %	20 %	169834648
14	NC_010379	TTAAA	2	10	15101	15110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010379	AAATA	2	10	15166	15175	80 %	20 %	0 %	0 %	169834603
16	NC_010379	TCTTT	2	10	16813	16822	0 %	80 %	0 %	20 %	169834718
17	NC_010379	TTTGT	2	10	16895	16904	0 %	80 %	20 %	0 %	169834718
18	NC_010379	ATTAA	2	10	17537	17546	60 %	40 %	0 %	0 %	169834704
19	NC_010379	ATTTA	2	10	17977	17986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010379	ATCTT	2	10	19047	19056	20 %	60 %	0 %	20 %	169834577
21	NC_010379	TAAAT	2	10	19340	19349	60 %	40 %	0 %	0 %	169834577
22	NC_010379	TTCTC	2	10	19400	19409	0 %	60 %	0 %	40 %	169834577
23	NC_010379	CATTT	2	10	20437	20446	20 %	60 %	0 %	20 %	169834636
24	NC_010379	TTTTA	2	10	21187	21196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010379	TATTT	2	10	24078	24087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010379	ATTTT	2	10	24794	24803	20 %	80 %	0 %	0 %	169834700
27	NC_010379	AAAAT	2	10	25819	25828	80 %	20 %	0 %	0 %	169834708
28	NC_010379	AATTG	2	10	26228	26237	40 %	40 %	20 %	0 %	169834708
29	NC_010379	ATTTA	2	10	27066	27075	40 %	60 %	0 %	0 %	169834651
30	NC_010379	ATTTT	2	10	27085	27094	20 %	80 %	0 %	0 %	169834651
31	NC_010379	ATAAA	2	10	27331	27340	80 %	20 %	0 %	0 %	169834695
32	NC_010379	AATTA	2	10	27612	27621	60 %	40 %	0 %	0 %	169834599
33	NC_010379	TAATC	2	10	28631	28640	40 %	40 %	0 %	20 %	169834570
34	NC_010379	GTAAT	2	10	28841	28850	40 %	40 %	20 %	0 %	169834570
35	NC_010379	TAGTC	2	10	31386	31395	20 %	40 %	20 %	20 %	169834667
36	NC_010379	TTGTA	2	10	34255	34264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010379	ACTTT	2	10	34964	34973	20 %	60 %	0 %	20 %	169834552
38	NC_010379	TCATT	2	10	35067	35076	20 %	60 %	0 %	20 %	169834552
39	NC_010379	AATCC	2	10	35491	35500	40 %	20 %	0 %	40 %	169834639
40	NC_010379	AATAA	2	10	35903	35912	80 %	20 %	0 %	0 %	169834650
41	NC_010379	TTGTA	2	10	36787	36796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010379	ATTTT	2	10	37336	37345	20 %	80 %	0 %	0 %	169834574
43	NC_010379	CTATC	2	10	38049	38058	20 %	40 %	0 %	40 %	169834688
44	NC_010379	AATTA	2	10	38282	38291	60 %	40 %	0 %	0 %	169834647
45	NC_010379	TCAAT	2	10	39725	39734	40 %	40 %	0 %	20 %	169834611
46	NC_010379	TAAAA	2	10	39915	39924	80 %	20 %	0 %	0 %	169834611
47	NC_010379	TCTTT	2	10	40621	40630	0 %	80 %	0 %	20 %	169834569
48	NC_010379	TATCA	2	10	41344	41353	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010379	GTTTT	2	10	41593	41602	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010379	GCTTC	2	10	41639	41648	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010379	TTCTT	2	10	41735	41744	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010379	CTTTT	2	10	43955	43964	0 %	80 %	0 %	20 %	169834607
53	NC_010379	ATTCT	2	10	44770	44779	20 %	60 %	0 %	20 %	169834607
54	NC_010379	TATAG	2	10	45011	45020	40 %	40 %	20 %	0 %	169834607
55	NC_010379	TTTTA	2	10	45089	45098	20 %	80 %	0 %	0 %	169834607
56	NC_010379	CTATA	2	10	45172	45181	40 %	40 %	0 %	20 %	169834607
57	NC_010379	TGATT	2	10	45890	45899	20 %	60 %	20 %	0 %	169834607
58	NC_010379	TAAAC	2	10	47203	47212	60 %	20 %	0 %	20 %	169834701
59	NC_010379	TGTAA	2	10	47284	47293	40 %	40 %	20 %	0 %	169834701
60	NC_010379	ATTTA	2	10	47409	47418	40 %	60 %	0 %	0 %	169834701
61	NC_010379	ATTTA	2	10	47652	47661	40 %	60 %	0 %	0 %	169834701
62	NC_010379	ACATT	2	10	48191	48200	40 %	40 %	0 %	20 %	169834701
63	NC_010379	CCATT	2	10	49226	49235	20 %	40 %	0 %	40 %	169834701
64	NC_010379	TAAAA	2	10	50918	50927	80 %	20 %	0 %	0 %	169834608
65	NC_010379	TCAAA	2	10	52091	52100	60 %	20 %	0 %	20 %	169834716
66	NC_010379	TAATA	2	10	53672	53681	60 %	40 %	0 %	0 %	169834594
67	NC_010379	TAATT	2	10	53870	53879	40 %	60 %	0 %	0 %	169834594
68	NC_010379	TATAA	2	10	53982	53991	60 %	40 %	0 %	0 %	169834594
69	NC_010379	CCATT	2	10	54459	54468	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_010379	TTACT	2	10	54642	54651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_010379	TAATA	2	10	55340	55349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010379	AAAAC	2	10	55778	55787	80 %	0 %	0 %	20 %	169834621
73	NC_010379	ATAAA	2	10	55806	55815	80 %	20 %	0 %	0 %	169834621
74	NC_010379	TAATT	2	10	56464	56473	40 %	60 %	0 %	0 %	169834621
75	NC_010379	ATAAA	2	10	56727	56736	80 %	20 %	0 %	0 %	169834621
76	NC_010379	TTATT	2	10	57504	57513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010379	TAAAT	2	10	58426	58435	60 %	40 %	0 %	0 %	169834558
78	NC_010379	CAATA	2	10	58438	58447	60 %	20 %	0 %	20 %	169834558
79	NC_010379	ATTAA	2	10	58577	58586	60 %	40 %	0 %	0 %	169834558
80	NC_010379	ATAAA	2	10	58719	58728	80 %	20 %	0 %	0 %	169834558
81	NC_010379	TAATA	2	10	59553	59562	60 %	40 %	0 %	0 %	169834672
82	NC_010379	AAAAG	2	10	61128	61137	80 %	0 %	20 %	0 %	169834592
83	NC_010379	TCTTT	2	10	61169	61178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010379	TTTTA	2	10	61382	61391	20 %	80 %	0 %	0 %	169834674
85	NC_010379	AAATA	2	10	62360	62369	80 %	20 %	0 %	0 %	169834565
86	NC_010379	GAATA	2	10	64198	64207	60 %	20 %	20 %	0 %	169834595
87	NC_010379	TTTTC	2	10	66189	66198	0 %	80 %	0 %	20 %	169834553
88	NC_010379	CATAT	2	10	67738	67747	40 %	40 %	0 %	20 %	169834557
89	NC_010379	AGCTT	2	10	67995	68004	20 %	40 %	20 %	20 %	169834717
90	NC_010379	TTTTA	2	10	68251	68260	20 %	80 %	0 %	0 %	169834717
91	NC_010379	ATTTT	2	10	68587	68596	20 %	80 %	0 %	0 %	169834691
92	NC_010379	TATTT	2	10	69014	69023	20 %	80 %	0 %	0 %	169834721
93	NC_010379	TTAAA	2	10	70838	70847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010379	TTTTA	2	10	71374	71383	20 %	80 %	0 %	0 %	169834671
95	NC_010379	ATTGA	2	10	71625	71634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010379	TATCT	2	10	72779	72788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010379	ACATA	2	10	72868	72877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010379	TTTTA	2	10	73742	73751	20 %	80 %	0 %	0 %	169834585
99	NC_010379	TTTTA	2	10	74135	74144	20 %	80 %	0 %	0 %	169834538
100	NC_010379	ATTTC	2	10	74323	74332	20 %	60 %	0 %	20 %	169834538
101	NC_010379	TTTTC	2	10	75154	75163	0 %	80 %	0 %	20 %	169834575
102	NC_010379	TAAAA	2	10	75232	75241	80 %	20 %	0 %	0 %	169834575
103	NC_010379	TTCTT	2	10	76081	76090	0 %	80 %	0 %	20 %	169834578
104	NC_010379	TCTTT	2	10	76091	76100	0 %	80 %	0 %	20 %	169834578
105	NC_010379	TCTTT	2	10	78772	78781	0 %	80 %	0 %	20 %	169834711
106	NC_010379	TAAAT	2	10	78889	78898	60 %	40 %	0 %	0 %	169834711
107	NC_010379	ATATT	2	10	79248	79257	40 %	60 %	0 %	0 %	169834625
108	NC_010379	AATTC	2	10	80086	80095	40 %	40 %	0 %	20 %	169834547
109	NC_010379	TTAAA	2	10	81642	81651	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010379	CCTTC	2	10	81894	81903	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_010379	CAAAA	2	10	81954	81963	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010379	CCTTT	2	10	82862	82871	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_010379	CTTTT	2	10	83101	83110	0 %	80 %	0 %	20 %	169834698
114	NC_010379	ATTTA	2	10	86905	86914	40 %	60 %	0 %	0 %	169834559
115	NC_010379	TTCTA	2	10	87000	87009	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010379	TTTTA	2	10	87054	87063	20 %	80 %	0 %	0 %	169834605
117	NC_010379	TAATT	2	10	87895	87904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010379	TCATT	2	10	88219	88228	20 %	60 %	0 %	20 %	169834543
119	NC_010379	TGTAT	2	10	88338	88347	20 %	60 %	20 %	0 %	169834543
120	NC_010379	ATTGT	2	10	88685	88694	20 %	60 %	20 %	0 %	169834543
121	NC_010379	TTTAT	2	10	88737	88746	20 %	80 %	0 %	0 %	169834543
122	NC_010379	TTGTA	2	10	89277	89286	20 %	60 %	20 %	0 %	169834543
123	NC_010379	AAATG	2	10	89813	89822	60 %	20 %	20 %	0 %	169834543
124	NC_010379	AAATT	2	10	89827	89836	60 %	40 %	0 %	0 %	169834543
125	NC_010379	TTTGT	2	10	89977	89986	0 %	80 %	20 %	0 %	169834543
126	NC_010379	TCTTT	2	10	90099	90108	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010379	TTTAA	2	10	91515	91524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010379	TAGAT	2	10	92185	92194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010379	TTTTA	2	10	92416	92425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010379	CTTTT	2	10	93762	93771	0 %	80 %	0 %	20 %	169834597
131	NC_010379	TTTAT	2	10	93796	93805	20 %	80 %	0 %	0 %	169834597
132	NC_010379	CATTT	2	10	93913	93922	20 %	60 %	0 %	20 %	169834597
133	NC_010379	TTTCT	2	10	94725	94734	0 %	80 %	0 %	20 %	169834542
134	NC_010379	TAGAA	2	10	94981	94990	60 %	20 %	20 %	0 %	169834624
135	NC_010379	AATTT	2	10	95602	95611	40 %	60 %	0 %	0 %	169834580
136	NC_010379	TTTAT	2	10	97827	97836	20 %	80 %	0 %	0 %	169834725
137	NC_010379	AAATG	2	10	97859	97868	60 %	20 %	20 %	0 %	169834725
138	NC_010379	ATTAT	2	10	97999	98008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010379	AATTA	2	10	98025	98034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010379	AGTTA	2	10	99016	99025	40 %	40 %	20 %	0 %	169834549
141	NC_010379	TTTTA	2	10	99498	99507	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010379	TAATA	2	10	99783	99792	60 %	40 %	0 %	0 %	169834638
143	NC_010379	CTTTC	2	10	100426	100435	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_010379	CATTT	2	10	102022	102031	20 %	60 %	0 %	20 %	169834662
145	NC_010379	GCATA	2	10	102423	102432	40 %	20 %	20 %	20 %	169834662
146	NC_010379	GTAAT	2	10	104143	104152	40 %	40 %	20 %	0 %	169834696
147	NC_010379	TCTTT	2	10	104282	104291	0 %	80 %	0 %	20 %	169834673
148	NC_010379	ATATG	2	10	104331	104340	40 %	40 %	20 %	0 %	169834673
149	NC_010379	ATTTT	2	10	104378	104387	20 %	80 %	0 %	0 %	169834673
150	NC_010379	AATTA	2	10	105882	105891	60 %	40 %	0 %	0 %	169834596
151	NC_010379	AATCC	2	10	105927	105936	40 %	20 %	0 %	40 %	169834596
152	NC_010379	TAAAA	2	10	106134	106143	80 %	20 %	0 %	0 %	169834596
153	NC_010379	ATTAT	2	10	107349	107358	40 %	60 %	0 %	0 %	169834653
154	NC_010379	GTAAT	2	10	107395	107404	40 %	40 %	20 %	0 %	169834653
155	NC_010379	ATATA	2	10	107596	107605	60 %	40 %	0 %	0 %	169834653
156	NC_010379	CCTAT	2	10	107685	107694	20 %	40 %	0 %	40 %	169834653
157	NC_010379	GATAT	2	10	107796	107805	40 %	40 %	20 %	0 %	169834653
158	NC_010379	TTTAT	2	10	108538	108547	20 %	80 %	0 %	0 %	169834579
159	NC_010379	TGGTT	2	10	108891	108900	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010379	CCATT	2	10	109992	110001	20 %	40 %	0 %	40 %	169834556
161	NC_010379	AAACA	2	10	111128	111137	80 %	0 %	0 %	20 %	169834563
162	NC_010379	AAATC	2	10	112575	112584	60 %	20 %	0 %	20 %	169834563
163	NC_010379	ATAAA	2	10	113308	113317	80 %	20 %	0 %	0 %	169834563
164	NC_010379	TAAAT	2	10	113816	113825	60 %	40 %	0 %	0 %	169834563
165	NC_010379	AATAC	2	10	113884	113893	60 %	20 %	0 %	20 %	169834563
166	NC_010379	TAGAA	2	10	114175	114184	60 %	20 %	20 %	0 %	169834563
167	NC_010379	ATTTT	2	10	116543	116552	20 %	80 %	0 %	0 %	169834613
168	NC_010379	TCAAT	2	10	116996	117005	40 %	40 %	0 %	20 %	169834613
169	NC_010379	CATCT	2	10	117861	117870	20 %	40 %	0 %	40 %	169834613
170	NC_010379	TTATT	2	10	118680	118689	20 %	80 %	0 %	0 %	169834545
171	NC_010379	TTTAT	2	10	119147	119156	20 %	80 %	0 %	0 %	169834545
172	NC_010379	TAATA	2	10	119485	119494	60 %	40 %	0 %	0 %	169834545
173	NC_010379	TATTT	2	10	119794	119803	20 %	80 %	0 %	0 %	169834545
174	NC_010379	TAATA	2	10	120439	120448	60 %	40 %	0 %	0 %	169834545
175	NC_010379	ACTTA	2	10	120931	120940	40 %	40 %	0 %	20 %	169834545
176	NC_010379	TAATC	2	10	122365	122374	40 %	40 %	0 %	20 %	169834600
177	NC_010379	TAGTA	2	10	125523	125532	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_010379	AAAGA	2	10	126653	126662	80 %	0 %	20 %	0 %	169834628
179	NC_010379	TAATT	2	10	128110	128119	40 %	60 %	0 %	0 %	169834628
180	NC_010379	ACAAA	2	10	128192	128201	80 %	0 %	0 %	20 %	169834628
181	NC_010379	TAAAT	2	10	130574	130583	60 %	40 %	0 %	0 %	169834573
182	NC_010379	TTCCT	2	10	131458	131467	0 %	60 %	0 %	40 %	169834536
183	NC_010379	ACTAT	2	10	131656	131665	40 %	40 %	0 %	20 %	169834678
184	NC_010379	ATTAC	2	10	132213	132222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
185	NC_010379	TTTTA	2	10	132681	132690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_010379	AAAAT	2	10	133721	133730	80 %	20 %	0 %	0 %	169834693
187	NC_010379	AATTA	2	10	133860	133869	60 %	40 %	0 %	0 %	169834693
188	NC_010379	TAATT	2	10	134247	134256	40 %	60 %	0 %	0 %	169834693
189	NC_010379	AAATA	2	10	137030	137039	80 %	20 %	0 %	0 %	169834631
190	NC_010379	CTTTT	2	10	137678	137687	0 %	80 %	0 %	20 %	169834631
191	NC_010379	TTTTC	2	10	137835	137844	0 %	80 %	0 %	20 %	169834631
192	NC_010379	TTTAT	2	10	137898	137907	20 %	80 %	0 %	0 %	169834631
193	NC_010379	AAATA	2	10	137974	137983	80 %	20 %	0 %	0 %	169834631
194	NC_010379	ATTTA	2	10	138433	138442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_010379	ATTTT	2	10	138525	138534	20 %	80 %	0 %	0 %	169834550
196	NC_010379	TTGCT	2	10	138701	138710	0 %	60 %	20 %	20 %	169834550
197	NC_010379	AATCT	2	10	139338	139347	40 %	40 %	0 %	20 %	169834659
198	NC_010379	TACAT	2	10	140765	140774	40 %	40 %	0 %	20 %	169834602
199	NC_010379	TATAT	2	10	141643	141652	40 %	60 %	0 %	0 %	169834660
200	NC_010379	TAAAA	2	10	142016	142025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_010379	AAATT	2	10	143428	143437	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_010379	GAAAG	2	10	143532	143541	60 %	0 %	40 %	0 %	169834723
203	NC_010379	CAAAT	2	10	143584	143593	60 %	20 %	0 %	20 %	169834723
204	NC_010379	ATTAC	2	10	145086	145095	40 %	40 %	0 %	20 %	169834609
205	NC_010379	TAATG	2	10	145459	145468	40 %	40 %	20 %	0 %	169834609
206	NC_010379	TAGGG	2	10	146666	146675	20 %	20 %	60 %	0 %	169834684
207	NC_010379	TACTT	2	10	147138	147147	20 %	60 %	0 %	20 %	169834722
208	NC_010379	TACAT	2	10	148507	148516	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.