MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	TATAA	2	10	8354	8363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010379	TTAAA	2	10	15101	15110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010379	ATTTA	2	10	17977	17986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010379	TTTTA	2	10	21187	21196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010379	TATTT	2	10	24078	24087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010379	TTGTA	2	10	34255	34264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010379	TTGTA	2	10	36787	36796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010379	TATCA	2	10	41344	41353	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010379	GTTTT	2	10	41593	41602	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010379	GCTTC	2	10	41639	41648	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_010379	TTCTT	2	10	41735	41744	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010379	CCATT	2	10	54459	54468	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010379	TTACT	2	10	54642	54651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010379	TAATA	2	10	55340	55349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010379	TTATT	2	10	57504	57513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010379	TCTTT	2	10	61169	61178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010379	TTAAA	2	10	70838	70847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010379	ATTGA	2	10	71625	71634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010379	TATCT	2	10	72779	72788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010379	ACATA	2	10	72868	72877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010379	TTAAA	2	10	81642	81651	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010379	CCTTC	2	10	81894	81903	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_010379	CAAAA	2	10	81954	81963	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010379	CCTTT	2	10	82862	82871	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010379	TTCTA	2	10	87000	87009	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010379	TAATT	2	10	87895	87904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010379	TCTTT	2	10	90099	90108	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010379	TTTAA	2	10	91515	91524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010379	TAGAT	2	10	92185	92194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010379	TTTTA	2	10	92416	92425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010379	ATTAT	2	10	97999	98008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010379	AATTA	2	10	98025	98034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010379	TTTTA	2	10	99498	99507	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010379	CTTTC	2	10	100426	100435	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_010379	TGGTT	2	10	108891	108900	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010379	TAGTA	2	10	125523	125532	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010379	ATTAC	2	10	132213	132222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010379	TTTTA	2	10	132681	132690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010379	ATTTA	2	10	138433	138442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010379	TAAAA	2	10	142016	142025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010379	AAATT	2	10	143428	143437	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010379	TACAT	2	10	148507	148516	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.