MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	ATATA	2	10	903	912	60 %	40 %	0 %	0 %	169834666
2	NC_010379	ATATT	2	10	1755	1764	40 %	60 %	0 %	0 %	169834598
3	NC_010379	ATTAA	2	10	2708	2717	60 %	40 %	0 %	0 %	169834657
4	NC_010379	TTATA	2	10	6591	6600	40 %	60 %	0 %	0 %	169834715
5	NC_010379	AAATC	2	10	9330	9339	60 %	20 %	0 %	20 %	169834551
6	NC_010379	ATTTC	2	10	11384	11393	20 %	60 %	0 %	20 %	169834584
7	NC_010379	ATATT	2	10	11510	11519	40 %	60 %	0 %	0 %	169834584
8	NC_010379	TTCCA	2	10	12609	12618	20 %	40 %	0 %	40 %	169834726
9	NC_010379	TTATA	2	10	12999	13008	40 %	60 %	0 %	0 %	169834649
10	NC_010379	ATTTT	2	10	14162	14171	20 %	80 %	0 %	0 %	169834535
11	NC_010379	ATATA	2	10	14194	14203	60 %	40 %	0 %	0 %	169834535
12	NC_010379	TTCAA	2	10	14615	14624	40 %	40 %	0 %	20 %	169834648
13	NC_010379	AAATA	2	10	15166	15175	80 %	20 %	0 %	0 %	169834603
14	NC_010379	TCTTT	2	10	16813	16822	0 %	80 %	0 %	20 %	169834718
15	NC_010379	TTTGT	2	10	16895	16904	0 %	80 %	20 %	0 %	169834718
16	NC_010379	ATTAA	2	10	17537	17546	60 %	40 %	0 %	0 %	169834704
17	NC_010379	ATCTT	2	10	19047	19056	20 %	60 %	0 %	20 %	169834577
18	NC_010379	TAAAT	2	10	19340	19349	60 %	40 %	0 %	0 %	169834577
19	NC_010379	TTCTC	2	10	19400	19409	0 %	60 %	0 %	40 %	169834577
20	NC_010379	CATTT	2	10	20437	20446	20 %	60 %	0 %	20 %	169834636
21	NC_010379	ATTTT	2	10	24794	24803	20 %	80 %	0 %	0 %	169834700
22	NC_010379	AAAAT	2	10	25819	25828	80 %	20 %	0 %	0 %	169834708
23	NC_010379	AATTG	2	10	26228	26237	40 %	40 %	20 %	0 %	169834708
24	NC_010379	ATTTA	2	10	27066	27075	40 %	60 %	0 %	0 %	169834651
25	NC_010379	ATTTT	2	10	27085	27094	20 %	80 %	0 %	0 %	169834651
26	NC_010379	ATAAA	2	10	27331	27340	80 %	20 %	0 %	0 %	169834695
27	NC_010379	AATTA	2	10	27612	27621	60 %	40 %	0 %	0 %	169834599
28	NC_010379	TAATC	2	10	28631	28640	40 %	40 %	0 %	20 %	169834570
29	NC_010379	GTAAT	2	10	28841	28850	40 %	40 %	20 %	0 %	169834570
30	NC_010379	TAGTC	2	10	31386	31395	20 %	40 %	20 %	20 %	169834667
31	NC_010379	ACTTT	2	10	34964	34973	20 %	60 %	0 %	20 %	169834552
32	NC_010379	TCATT	2	10	35067	35076	20 %	60 %	0 %	20 %	169834552
33	NC_010379	AATCC	2	10	35491	35500	40 %	20 %	0 %	40 %	169834639
34	NC_010379	AATAA	2	10	35903	35912	80 %	20 %	0 %	0 %	169834650
35	NC_010379	ATTTT	2	10	37336	37345	20 %	80 %	0 %	0 %	169834574
36	NC_010379	CTATC	2	10	38049	38058	20 %	40 %	0 %	40 %	169834688
37	NC_010379	AATTA	2	10	38282	38291	60 %	40 %	0 %	0 %	169834647
38	NC_010379	TCAAT	2	10	39725	39734	40 %	40 %	0 %	20 %	169834611
39	NC_010379	TAAAA	2	10	39915	39924	80 %	20 %	0 %	0 %	169834611
40	NC_010379	TCTTT	2	10	40621	40630	0 %	80 %	0 %	20 %	169834569
41	NC_010379	CTTTT	2	10	43955	43964	0 %	80 %	0 %	20 %	169834607
42	NC_010379	ATTCT	2	10	44770	44779	20 %	60 %	0 %	20 %	169834607
43	NC_010379	TATAG	2	10	45011	45020	40 %	40 %	20 %	0 %	169834607
44	NC_010379	TTTTA	2	10	45089	45098	20 %	80 %	0 %	0 %	169834607
45	NC_010379	CTATA	2	10	45172	45181	40 %	40 %	0 %	20 %	169834607
46	NC_010379	TGATT	2	10	45890	45899	20 %	60 %	20 %	0 %	169834607
47	NC_010379	TAAAC	2	10	47203	47212	60 %	20 %	0 %	20 %	169834701
48	NC_010379	TGTAA	2	10	47284	47293	40 %	40 %	20 %	0 %	169834701
49	NC_010379	ATTTA	2	10	47409	47418	40 %	60 %	0 %	0 %	169834701
50	NC_010379	ATTTA	2	10	47652	47661	40 %	60 %	0 %	0 %	169834701
51	NC_010379	ACATT	2	10	48191	48200	40 %	40 %	0 %	20 %	169834701
52	NC_010379	CCATT	2	10	49226	49235	20 %	40 %	0 %	40 %	169834701
53	NC_010379	TAAAA	2	10	50918	50927	80 %	20 %	0 %	0 %	169834608
54	NC_010379	TCAAA	2	10	52091	52100	60 %	20 %	0 %	20 %	169834716
55	NC_010379	TAATA	2	10	53672	53681	60 %	40 %	0 %	0 %	169834594
56	NC_010379	TAATT	2	10	53870	53879	40 %	60 %	0 %	0 %	169834594
57	NC_010379	TATAA	2	10	53982	53991	60 %	40 %	0 %	0 %	169834594
58	NC_010379	AAAAC	2	10	55778	55787	80 %	0 %	0 %	20 %	169834621
59	NC_010379	ATAAA	2	10	55806	55815	80 %	20 %	0 %	0 %	169834621
60	NC_010379	TAATT	2	10	56464	56473	40 %	60 %	0 %	0 %	169834621
61	NC_010379	ATAAA	2	10	56727	56736	80 %	20 %	0 %	0 %	169834621
62	NC_010379	TAAAT	2	10	58426	58435	60 %	40 %	0 %	0 %	169834558
63	NC_010379	CAATA	2	10	58438	58447	60 %	20 %	0 %	20 %	169834558
64	NC_010379	ATTAA	2	10	58577	58586	60 %	40 %	0 %	0 %	169834558
65	NC_010379	ATAAA	2	10	58719	58728	80 %	20 %	0 %	0 %	169834558
66	NC_010379	TAATA	2	10	59553	59562	60 %	40 %	0 %	0 %	169834672
67	NC_010379	AAAAG	2	10	61128	61137	80 %	0 %	20 %	0 %	169834592
68	NC_010379	TTTTA	2	10	61382	61391	20 %	80 %	0 %	0 %	169834674
69	NC_010379	AAATA	2	10	62360	62369	80 %	20 %	0 %	0 %	169834565
70	NC_010379	GAATA	2	10	64198	64207	60 %	20 %	20 %	0 %	169834595
71	NC_010379	TTTTC	2	10	66189	66198	0 %	80 %	0 %	20 %	169834553
72	NC_010379	CATAT	2	10	67738	67747	40 %	40 %	0 %	20 %	169834557
73	NC_010379	AGCTT	2	10	67995	68004	20 %	40 %	20 %	20 %	169834717
74	NC_010379	TTTTA	2	10	68251	68260	20 %	80 %	0 %	0 %	169834717
75	NC_010379	ATTTT	2	10	68587	68596	20 %	80 %	0 %	0 %	169834691
76	NC_010379	TATTT	2	10	69014	69023	20 %	80 %	0 %	0 %	169834721
77	NC_010379	TTTTA	2	10	71374	71383	20 %	80 %	0 %	0 %	169834671
78	NC_010379	TTTTA	2	10	73742	73751	20 %	80 %	0 %	0 %	169834585
79	NC_010379	TTTTA	2	10	74135	74144	20 %	80 %	0 %	0 %	169834538
80	NC_010379	ATTTC	2	10	74323	74332	20 %	60 %	0 %	20 %	169834538
81	NC_010379	TTTTC	2	10	75154	75163	0 %	80 %	0 %	20 %	169834575
82	NC_010379	TAAAA	2	10	75232	75241	80 %	20 %	0 %	0 %	169834575
83	NC_010379	TTCTT	2	10	76081	76090	0 %	80 %	0 %	20 %	169834578
84	NC_010379	TCTTT	2	10	76091	76100	0 %	80 %	0 %	20 %	169834578
85	NC_010379	TCTTT	2	10	78772	78781	0 %	80 %	0 %	20 %	169834711
86	NC_010379	TAAAT	2	10	78889	78898	60 %	40 %	0 %	0 %	169834711
87	NC_010379	ATATT	2	10	79248	79257	40 %	60 %	0 %	0 %	169834625
88	NC_010379	AATTC	2	10	80086	80095	40 %	40 %	0 %	20 %	169834547
89	NC_010379	CTTTT	2	10	83101	83110	0 %	80 %	0 %	20 %	169834698
90	NC_010379	ATTTA	2	10	86905	86914	40 %	60 %	0 %	0 %	169834559
91	NC_010379	TTTTA	2	10	87054	87063	20 %	80 %	0 %	0 %	169834605
92	NC_010379	TCATT	2	10	88219	88228	20 %	60 %	0 %	20 %	169834543
93	NC_010379	TGTAT	2	10	88338	88347	20 %	60 %	20 %	0 %	169834543
94	NC_010379	ATTGT	2	10	88685	88694	20 %	60 %	20 %	0 %	169834543
95	NC_010379	TTTAT	2	10	88737	88746	20 %	80 %	0 %	0 %	169834543
96	NC_010379	TTGTA	2	10	89277	89286	20 %	60 %	20 %	0 %	169834543
97	NC_010379	AAATG	2	10	89813	89822	60 %	20 %	20 %	0 %	169834543
98	NC_010379	AAATT	2	10	89827	89836	60 %	40 %	0 %	0 %	169834543
99	NC_010379	TTTGT	2	10	89977	89986	0 %	80 %	20 %	0 %	169834543
100	NC_010379	CTTTT	2	10	93762	93771	0 %	80 %	0 %	20 %	169834597
101	NC_010379	TTTAT	2	10	93796	93805	20 %	80 %	0 %	0 %	169834597
102	NC_010379	CATTT	2	10	93913	93922	20 %	60 %	0 %	20 %	169834597
103	NC_010379	TTTCT	2	10	94725	94734	0 %	80 %	0 %	20 %	169834542
104	NC_010379	TAGAA	2	10	94981	94990	60 %	20 %	20 %	0 %	169834624
105	NC_010379	AATTT	2	10	95602	95611	40 %	60 %	0 %	0 %	169834580
106	NC_010379	TTTAT	2	10	97827	97836	20 %	80 %	0 %	0 %	169834725
107	NC_010379	AAATG	2	10	97859	97868	60 %	20 %	20 %	0 %	169834725
108	NC_010379	AGTTA	2	10	99016	99025	40 %	40 %	20 %	0 %	169834549
109	NC_010379	TAATA	2	10	99783	99792	60 %	40 %	0 %	0 %	169834638
110	NC_010379	CATTT	2	10	102022	102031	20 %	60 %	0 %	20 %	169834662
111	NC_010379	GCATA	2	10	102423	102432	40 %	20 %	20 %	20 %	169834662
112	NC_010379	GTAAT	2	10	104143	104152	40 %	40 %	20 %	0 %	169834696
113	NC_010379	TCTTT	2	10	104282	104291	0 %	80 %	0 %	20 %	169834673
114	NC_010379	ATATG	2	10	104331	104340	40 %	40 %	20 %	0 %	169834673
115	NC_010379	ATTTT	2	10	104378	104387	20 %	80 %	0 %	0 %	169834673
116	NC_010379	AATTA	2	10	105882	105891	60 %	40 %	0 %	0 %	169834596
117	NC_010379	AATCC	2	10	105927	105936	40 %	20 %	0 %	40 %	169834596
118	NC_010379	TAAAA	2	10	106134	106143	80 %	20 %	0 %	0 %	169834596
119	NC_010379	ATTAT	2	10	107349	107358	40 %	60 %	0 %	0 %	169834653
120	NC_010379	GTAAT	2	10	107395	107404	40 %	40 %	20 %	0 %	169834653
121	NC_010379	ATATA	2	10	107596	107605	60 %	40 %	0 %	0 %	169834653
122	NC_010379	CCTAT	2	10	107685	107694	20 %	40 %	0 %	40 %	169834653
123	NC_010379	GATAT	2	10	107796	107805	40 %	40 %	20 %	0 %	169834653
124	NC_010379	TTTAT	2	10	108538	108547	20 %	80 %	0 %	0 %	169834579
125	NC_010379	CCATT	2	10	109992	110001	20 %	40 %	0 %	40 %	169834556
126	NC_010379	AAACA	2	10	111128	111137	80 %	0 %	0 %	20 %	169834563
127	NC_010379	AAATC	2	10	112575	112584	60 %	20 %	0 %	20 %	169834563
128	NC_010379	ATAAA	2	10	113308	113317	80 %	20 %	0 %	0 %	169834563
129	NC_010379	TAAAT	2	10	113816	113825	60 %	40 %	0 %	0 %	169834563
130	NC_010379	AATAC	2	10	113884	113893	60 %	20 %	0 %	20 %	169834563
131	NC_010379	TAGAA	2	10	114175	114184	60 %	20 %	20 %	0 %	169834563
132	NC_010379	ATTTT	2	10	116543	116552	20 %	80 %	0 %	0 %	169834613
133	NC_010379	TCAAT	2	10	116996	117005	40 %	40 %	0 %	20 %	169834613
134	NC_010379	CATCT	2	10	117861	117870	20 %	40 %	0 %	40 %	169834613
135	NC_010379	TTATT	2	10	118680	118689	20 %	80 %	0 %	0 %	169834545
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.