MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	ATTG	2	8	189	196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010379	TTTA	2	8	212	219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010379	TAAT	2	8	401	408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010379	TTTA	2	8	702	709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010379	TAAT	2	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010379	ATGT	2	8	1564	1571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010379	TTTA	2	8	3155	3162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010379	TAAA	2	8	3171	3178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010379	TGAA	2	8	5121	5128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010379	CTAT	2	8	6189	6196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010379	TCTA	2	8	8318	8325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010379	CTTT	2	8	10311	10318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010379	ACTA	2	8	12682	12689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010379	CTTT	2	8	13393	13400	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010379	TTAA	2	8	13418	13425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010379	TTAT	2	8	13479	13486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010379	TTAA	2	8	14828	14835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010379	TATT	2	8	15944	15951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010379	TAAT	2	8	15982	15989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010379	ATTA	2	8	16364	16371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010379	AAGA	2	8	16499	16506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010379	TAAT	2	8	17863	17870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010379	TCCA	2	8	17987	17994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010379	ATAA	2	8	21223	21230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010379	ATTT	2	8	21380	21387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010379	TAAA	2	8	22408	22415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010379	ATTA	2	8	22594	22601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010379	ATTT	2	8	22648	22655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010379	TTTA	2	8	23629	23636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010379	ATTA	2	8	23933	23940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010379	TAAT	2	8	24958	24965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010379	ATTC	2	8	26526	26533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010379	TCAT	2	8	27418	27425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010379	CCTT	2	8	27856	27863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010379	CAAA	2	8	27907	27914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010379	ATTT	2	8	27982	27989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010379	CCTT	2	8	28017	28024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010379	CTTT	2	8	29989	29996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010379	CTTC	2	8	30449	30456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010379	ATTT	2	8	30492	30499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010379	CTTT	2	8	30891	30898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010379	TAAT	2	8	30995	31002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010379	ATTT	2	8	31184	31191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010379	TTTA	2	8	31264	31271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010379	CTTT	2	8	31599	31606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010379	CATT	2	8	34097	34104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010379	TTTA	2	8	34214	34221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010379	TTTA	2	8	35665	35672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010379	ACTT	2	8	37075	37082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010379	TCAT	2	8	38252	38259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010379	ATTT	2	8	40409	40416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010379	TATT	2	8	40423	40430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010379	TAAT	2	8	40738	40745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010379	AAAT	2	8	41069	41076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010379	ATAC	2	8	41111	41118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010379	TACC	2	8	41430	41437	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010379	ATGA	2	8	41624	41631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010379	TAAA	2	8	41672	41679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010379	TTTA	2	8	42218	42225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010379	ATTT	2	8	49830	49837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010379	ATTA	2	8	50707	50714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010379	TAAA	2	8	50716	50723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010379	ATTA	2	8	54806	54813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010379	AAAT	2	8	55297	55304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010379	CCTA	2	8	57077	57084	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010379	TATT	2	8	58881	58888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010379	TAAA	2	8	58937	58944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010379	TATT	2	8	59136	59143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010379	CTTT	2	8	60064	60071	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010379	TCCT	2	8	60508	60515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010379	TAAA	2	8	60597	60604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010379	CTTT	2	8	63754	63761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010379	ATCC	2	8	64015	64022	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010379	ATAG	2	8	64146	64153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010379	TAAT	2	8	64872	64879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010379	TAGA	2	8	68491	68498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010379	TATT	2	8	71648	71655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010379	ATTA	2	8	71705	71712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010379	ATTT	2	8	73207	73214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010379	ATTA	3	12	75316	75327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010379	TAAT	2	8	76781	76788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010379	ATTT	2	8	78414	78421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010379	ATTA	2	8	79783	79790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010379	AACT	2	8	80919	80926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010379	ATCT	2	8	80933	80940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010379	TAAT	2	8	81938	81945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010379	ATTT	2	8	82885	82892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010379	ATTT	2	8	83724	83731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010379	CTTC	2	8	84600	84607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010379	ATTA	2	8	84646	84653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010379	TTAT	2	8	84942	84949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010379	TAAT	2	8	84988	84995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010379	TCTA	2	8	87782	87789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010379	AATA	2	8	87914	87921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010379	TCTT	2	8	90131	90138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010379	AATA	2	8	90218	90225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010379	TAAT	2	8	90412	90419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010379	ATCT	2	8	90543	90550	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010379	TAAT	2	8	91869	91876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010379	TTCA	2	8	92197	92204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010379	TATT	2	8	92788	92795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010379	TAAT	2	8	92907	92914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010379	TTAT	2	8	94377	94384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010379	TAAT	2	8	94815	94822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010379	TTAA	2	8	95487	95494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010379	CTTT	2	8	96143	96150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010379	TAAA	2	8	96177	96184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010379	CATT	2	8	96191	96198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010379	TATT	2	8	96256	96263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010379	AATC	2	8	96264	96271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010379	TAAT	2	8	97132	97139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010379	AATG	2	8	97189	97196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010379	CATT	2	8	97219	97226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010379	CTTT	2	8	98554	98561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010379	TAAT	2	8	99156	99163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010379	TTAT	2	8	99508	99515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010379	ATTT	2	8	99857	99864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010379	AACC	2	8	104564	104571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010379	TATT	2	8	106490	106497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010379	AATA	3	12	106560	106571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010379	TTTA	2	8	108699	108706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010379	TTAG	2	8	108739	108746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010379	AAAT	2	8	108758	108765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010379	TTCT	2	8	110601	110608	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010379	ATTA	2	8	110697	110704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010379	TTAC	2	8	117888	117895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010379	TAAT	2	8	121357	121364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010379	AATT	2	8	121378	121385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010379	TAAT	2	8	121419	121426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010379	TTAG	2	8	121514	121521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010379	TACA	2	8	125839	125846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010379	ATTA	2	8	128952	128959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010379	TAAT	2	8	129828	129835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010379	AATT	2	8	130412	130419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010379	CTAC	2	8	130690	130697	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010379	CTTC	2	8	131974	131981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010379	ATTA	2	8	131999	132006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010379	ATCT	2	8	132100	132107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010379	TAGT	2	8	135866	135873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010379	AAAT	2	8	138326	138333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010379	CTTT	2	8	140902	140909	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010379	TAAA	2	8	140974	140981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010379	CATA	2	8	142334	142341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010379	AATT	2	8	148069	148076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010379	AATT	2	8	148551	148558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.