MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	TGAT	2	8	1079	1086	25 %	50 %	25 %	0 %	169834641
2	NC_010379	AATT	2	8	1857	1864	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
3	NC_010379	AAAT	2	8	2019	2026	75 %	25 %	0 %	0 %	169834598
4	NC_010379	CTTT	2	8	2349	2356	0 %	75 %	0 %	25 %	169834657
5	NC_010379	TCTT	2	8	2996	3003	0 %	75 %	0 %	25 %	169834681
6	NC_010379	TTTA	2	8	3055	3062	25 %	75 %	0 %	0 %	169834681
7	NC_010379	TGCT	2	8	3481	3488	0 %	50 %	25 %	25 %	169834676
8	NC_010379	GTTA	2	8	4163	4170	25 %	50 %	25 %	0 %	169834692
9	NC_010379	ATAG	2	8	4400	4407	50 %	25 %	25 %	0 %	169834692
10	NC_010379	TTGC	2	8	5576	5583	0 %	50 %	25 %	25 %	169834615
11	NC_010379	TTTA	2	8	5599	5606	25 %	75 %	0 %	0 %	169834615
12	NC_010379	TTTA	2	8	5806	5813	25 %	75 %	0 %	0 %	169834615
13	NC_010379	ATTA	2	8	5977	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
14	NC_010379	AAAT	2	8	6371	6378	75 %	25 %	0 %	0 %	169834697
15	NC_010379	TTCT	2	8	7475	7482	0 %	75 %	0 %	25 %	169834616
16	NC_010379	AAAT	2	8	7519	7526	75 %	25 %	0 %	0 %	169834616
17	NC_010379	ATAA	2	8	7537	7544	75 %	25 %	0 %	0 %	169834616
18	NC_010379	TAAA	2	8	7929	7936	75 %	25 %	0 %	0 %	169834703
19	NC_010379	AACA	2	8	7948	7955	75 %	0 %	0 %	25 %	169834703
20	NC_010379	TTAA	2	8	8877	8884	50 %	50 %	0 %	0 %	169834551
21	NC_010379	TTTA	2	8	9050	9057	25 %	75 %	0 %	0 %	169834551
22	NC_010379	TCTT	2	8	9081	9088	0 %	75 %	0 %	25 %	169834551
23	NC_010379	ATAA	2	8	9721	9728	75 %	25 %	0 %	0 %	169834551
24	NC_010379	TTTA	2	8	10087	10094	25 %	75 %	0 %	0 %	169834709
25	NC_010379	TCTT	2	8	10670	10677	0 %	75 %	0 %	25 %	169834635
26	NC_010379	ATTT	2	8	11059	11066	25 %	75 %	0 %	0 %	169834635
27	NC_010379	TAAA	2	8	11085	11092	75 %	25 %	0 %	0 %	169834635
28	NC_010379	TATT	2	8	11139	11146	25 %	75 %	0 %	0 %	169834635
29	NC_010379	CTTT	2	8	11429	11436	0 %	75 %	0 %	25 %	169834584
30	NC_010379	AGCT	2	8	11467	11474	25 %	25 %	25 %	25 %	169834584
31	NC_010379	TAGG	2	8	11730	11737	25 %	25 %	50 %	0 %	169834584
32	NC_010379	TTTA	2	8	12066	12073	25 %	75 %	0 %	0 %	169834726
33	NC_010379	CATT	2	8	12166	12173	25 %	50 %	0 %	25 %	169834726
34	NC_010379	TAAT	2	8	12263	12270	50 %	50 %	0 %	0 %	169834726
35	NC_010379	TCTT	2	8	12282	12289	0 %	75 %	0 %	25 %	169834726
36	NC_010379	TAAT	2	8	12455	12462	50 %	50 %	0 %	0 %	169834726
37	NC_010379	TATC	2	8	13037	13044	25 %	50 %	0 %	25 %	169834649
38	NC_010379	TCTA	2	8	13102	13109	25 %	50 %	0 %	25 %	169834649
39	NC_010379	GGTT	2	8	13127	13134	0 %	50 %	50 %	0 %	169834649
40	NC_010379	TATG	2	8	13162	13169	25 %	50 %	25 %	0 %	169834649
41	NC_010379	ATTT	2	8	13504	13511	25 %	75 %	0 %	0 %	169834562
42	NC_010379	GTCA	2	8	13545	13552	25 %	25 %	25 %	25 %	169834562
43	NC_010379	TTAA	2	8	13808	13815	50 %	50 %	0 %	0 %	169834714
44	NC_010379	CATT	3	12	14335	14346	25 %	50 %	0 %	25 %	169834535
45	NC_010379	TACT	2	8	15650	15657	25 %	50 %	0 %	25 %	169834728
46	NC_010379	TTTA	2	8	15732	15739	25 %	75 %	0 %	0 %	169834728
47	NC_010379	CTAT	2	8	16155	16162	25 %	50 %	0 %	25 %	169834724
48	NC_010379	ATTA	2	8	16509	16516	50 %	50 %	0 %	0 %	169834620
49	NC_010379	CTTT	2	8	16522	16529	0 %	75 %	0 %	25 %	169834620
50	NC_010379	ATTT	2	8	17403	17410	25 %	75 %	0 %	0 %	169834704
51	NC_010379	TAAA	2	8	18299	18306	75 %	25 %	0 %	0 %	169834577
52	NC_010379	TTTA	2	8	18635	18642	25 %	75 %	0 %	0 %	169834577
53	NC_010379	CTTT	2	8	18840	18847	0 %	75 %	0 %	25 %	169834577
54	NC_010379	TTTG	2	8	18957	18964	0 %	75 %	25 %	0 %	169834577
55	NC_010379	TTCT	2	8	19276	19283	0 %	75 %	0 %	25 %	169834577
56	NC_010379	CTAT	2	8	19293	19300	25 %	50 %	0 %	25 %	169834577
57	NC_010379	TAAA	2	8	19381	19388	75 %	25 %	0 %	0 %	169834577
58	NC_010379	ATTT	2	8	19415	19422	25 %	75 %	0 %	0 %	169834577
59	NC_010379	GCCA	2	8	19592	19599	25 %	0 %	25 %	50 %	169834577
60	NC_010379	TTTC	2	8	19937	19944	0 %	75 %	0 %	25 %	169834636
61	NC_010379	TACA	2	8	20077	20084	50 %	25 %	0 %	25 %	169834636
62	NC_010379	TCTT	2	8	20242	20249	0 %	75 %	0 %	25 %	169834636
63	NC_010379	TGTT	2	8	20414	20421	0 %	75 %	25 %	0 %	169834636
64	NC_010379	TAAT	2	8	20631	20638	50 %	50 %	0 %	0 %	169834636
65	NC_010379	ACCA	2	8	20869	20876	50 %	0 %	0 %	50 %	169834636
66	NC_010379	TCTT	2	8	21586	21593	0 %	75 %	0 %	25 %	169834710
67	NC_010379	AGCA	2	8	21828	21835	50 %	0 %	25 %	25 %	169834710
68	NC_010379	TCCT	2	8	21979	21986	0 %	50 %	0 %	50 %	169834710
69	NC_010379	TTTC	2	8	22156	22163	0 %	75 %	0 %	25 %	169834591
70	NC_010379	ACCT	2	8	23247	23254	25 %	25 %	0 %	50 %	169834539
71	NC_010379	CATT	2	8	24228	24235	25 %	50 %	0 %	25 %	169834700
72	NC_010379	CTTT	2	8	24303	24310	0 %	75 %	0 %	25 %	169834700
73	NC_010379	TTCT	2	8	24756	24763	0 %	75 %	0 %	25 %	169834700
74	NC_010379	TAAT	2	8	24906	24913	50 %	50 %	0 %	0 %	169834700
75	NC_010379	TTTG	2	8	25093	25100	0 %	75 %	25 %	0 %	169834708
76	NC_010379	TTTG	2	8	25193	25200	0 %	75 %	25 %	0 %	169834708
77	NC_010379	GTAA	2	8	25251	25258	50 %	25 %	25 %	0 %	169834708
78	NC_010379	TTAT	2	8	25415	25422	25 %	75 %	0 %	0 %	169834708
79	NC_010379	ATTT	2	8	25866	25873	25 %	75 %	0 %	0 %	169834708
80	NC_010379	TCTT	2	8	25899	25906	0 %	75 %	0 %	25 %	169834708
81	NC_010379	TTTA	2	8	26023	26030	25 %	75 %	0 %	0 %	169834708
82	NC_010379	CTTT	2	8	26119	26126	0 %	75 %	0 %	25 %	169834708
83	NC_010379	CAAT	2	8	26755	26762	50 %	25 %	0 %	25 %	169834651
84	NC_010379	TAAA	2	8	26765	26772	75 %	25 %	0 %	0 %	169834651
85	NC_010379	TATT	2	8	26789	26796	25 %	75 %	0 %	0 %	169834651
86	NC_010379	AATT	2	8	27027	27034	50 %	50 %	0 %	0 %	169834651
87	NC_010379	CTAC	2	8	27754	27761	25 %	25 %	0 %	50 %	169834599
88	NC_010379	ATTT	2	8	28273	28280	25 %	75 %	0 %	0 %	169834566
89	NC_010379	ATAA	2	8	29154	29161	75 %	25 %	0 %	0 %	169834655
90	NC_010379	TTAA	2	8	29193	29200	50 %	50 %	0 %	0 %	169834655
91	NC_010379	ATTT	2	8	29455	29462	25 %	75 %	0 %	0 %	169834655
92	NC_010379	ATTA	2	8	29659	29666	50 %	50 %	0 %	0 %	169834626
93	NC_010379	AATA	2	8	29775	29782	75 %	25 %	0 %	0 %	169834626
94	NC_010379	TCAA	2	8	29926	29933	50 %	25 %	0 %	25 %	169834626
95	NC_010379	TAAT	2	8	30268	30275	50 %	50 %	0 %	0 %	169834707
96	NC_010379	AAAC	2	8	30812	30819	75 %	0 %	0 %	25 %	169834572
97	NC_010379	TAAT	2	8	32318	32325	50 %	50 %	0 %	0 %	169834658
98	NC_010379	TTAA	2	8	32974	32981	50 %	50 %	0 %	0 %	169834680
99	NC_010379	ATCT	2	8	33733	33740	25 %	50 %	0 %	25 %	169834680
100	NC_010379	CTAT	2	8	33954	33961	25 %	50 %	0 %	25 %	169834654
101	NC_010379	TTCT	2	8	34275	34282	0 %	75 %	0 %	25 %	169834552
102	NC_010379	ATAA	2	8	34834	34841	75 %	25 %	0 %	0 %	169834552
103	NC_010379	TAAA	2	8	35043	35050	75 %	25 %	0 %	0 %	169834552
104	NC_010379	CTTC	2	8	35470	35477	0 %	50 %	0 %	50 %	169834639
105	NC_010379	TAAA	2	8	35778	35785	75 %	25 %	0 %	0 %	169834650
106	NC_010379	TAAA	2	8	35888	35895	75 %	25 %	0 %	0 %	169834650
107	NC_010379	ATTG	2	8	36246	36253	25 %	50 %	25 %	0 %	169834650
108	NC_010379	TCTG	2	8	36301	36308	0 %	50 %	25 %	25 %	169834650
109	NC_010379	CATT	2	8	36326	36333	25 %	50 %	0 %	25 %	169834650
110	NC_010379	TTTA	2	8	37164	37171	25 %	75 %	0 %	0 %	169834574
111	NC_010379	ATTT	2	8	37202	37209	25 %	75 %	0 %	0 %	169834574
112	NC_010379	CAAT	2	8	37546	37553	50 %	25 %	0 %	25 %	169834623
113	NC_010379	CTTT	2	8	38069	38076	0 %	75 %	0 %	25 %	169834688
114	NC_010379	AATA	2	8	38164	38171	75 %	25 %	0 %	0 %	169834688
115	NC_010379	ATTC	2	8	38221	38228	25 %	50 %	0 %	25 %	169834688
116	NC_010379	TTCT	2	8	38359	38366	0 %	75 %	0 %	25 %	169834647
117	NC_010379	AGCA	2	8	38407	38414	50 %	0 %	25 %	25 %	169834647
118	NC_010379	TTAA	2	8	38468	38475	50 %	50 %	0 %	0 %	169834647
119	NC_010379	CATT	2	8	38930	38937	25 %	50 %	0 %	25 %	169834647
120	NC_010379	TAAA	2	8	39022	39029	75 %	25 %	0 %	0 %	169834647
121	NC_010379	ACAT	2	8	39511	39518	50 %	25 %	0 %	25 %	169834561
122	NC_010379	TTTG	2	8	39819	39826	0 %	75 %	25 %	0 %	169834611
123	NC_010379	TTGG	2	8	40105	40112	0 %	50 %	50 %	0 %	169834537
124	NC_010379	AAAG	2	8	40546	40553	75 %	0 %	25 %	0 %	169834569
125	NC_010379	CAAT	2	8	42478	42485	50 %	25 %	0 %	25 %	169834607
126	NC_010379	TCTT	2	8	42849	42856	0 %	75 %	0 %	25 %	169834607
127	NC_010379	TCTT	2	8	42971	42978	0 %	75 %	0 %	25 %	169834607
128	NC_010379	TTGA	2	8	42985	42992	25 %	50 %	25 %	0 %	169834607
129	NC_010379	AAAT	2	8	43030	43037	75 %	25 %	0 %	0 %	169834607
130	NC_010379	TCTA	2	8	43043	43050	25 %	50 %	0 %	25 %	169834607
131	NC_010379	AATT	2	8	43330	43337	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
132	NC_010379	TATT	2	8	43701	43708	25 %	75 %	0 %	0 %	169834607
133	NC_010379	ATTT	2	8	43750	43757	25 %	75 %	0 %	0 %	169834607
134	NC_010379	AATT	2	8	44717	44724	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
135	NC_010379	TTTA	2	8	44939	44946	25 %	75 %	0 %	0 %	169834607
136	NC_010379	ATTT	2	8	45223	45230	25 %	75 %	0 %	0 %	169834607
137	NC_010379	TTGT	2	8	45919	45926	0 %	75 %	25 %	0 %	169834607
138	NC_010379	TATT	2	8	46321	46328	25 %	75 %	0 %	0 %	169834701
139	NC_010379	AATA	2	8	46820	46827	75 %	25 %	0 %	0 %	169834701
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.