MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 2488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	CCT	2	6	16	21	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010379	CTA	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010379	TTA	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010379	TAA	2	6	568	573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010379	ATT	2	6	936	941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834666
6	NC_010379	TCT	2	6	978	983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834666
7	NC_010379	TCT	2	6	1041	1046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010379	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834641
9	NC_010379	TGC	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834641
10	NC_010379	ATT	2	6	1186	1191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834641
11	NC_010379	TTC	2	6	1207	1212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834641
12	NC_010379	CTC	2	6	1237	1242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834641
13	NC_010379	TCA	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010379	ATA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010379	TTA	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010379	ATT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010379	TTA	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010379	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010379	TAT	2	6	1518	1523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010379	TAA	3	9	1585	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010379	ATT	2	6	1624	1629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010379	ATA	2	6	1682	1687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
23	NC_010379	TAT	2	6	1791	1796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834598
24	NC_010379	TTA	2	6	1797	1802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834598
25	NC_010379	AAT	2	6	1811	1816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
26	NC_010379	TAA	2	6	1828	1833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
27	NC_010379	TGA	2	6	1843	1848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834598
28	NC_010379	TAA	2	6	1918	1923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
29	NC_010379	ATT	2	6	2084	2089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834598
30	NC_010379	GCA	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834657
31	NC_010379	ATG	2	6	2309	2314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834657
32	NC_010379	ACT	2	6	2449	2454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834657
33	NC_010379	AGA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834657
34	NC_010379	ATT	2	6	2530	2535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
35	NC_010379	TAT	2	6	2547	2552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
36	NC_010379	ATA	2	6	2699	2704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834657
37	NC_010379	TTA	3	9	2738	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
38	NC_010379	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834657
39	NC_010379	CAT	2	6	2812	2817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834657
40	NC_010379	ATC	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834681
41	NC_010379	TTA	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
42	NC_010379	TAT	2	6	2892	2897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
43	NC_010379	TAA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834681
44	NC_010379	ATA	2	6	2948	2953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834681
45	NC_010379	AAT	2	6	2965	2970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834681
46	NC_010379	TTA	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
47	NC_010379	ATT	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
48	NC_010379	TAT	3	9	3015	3023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
49	NC_010379	ATT	2	6	3088	3093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010379	ATT	3	9	3103	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010379	TTA	2	6	3184	3189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010379	CAT	2	6	3222	3227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834676
53	NC_010379	ATC	2	6	3241	3246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834676
54	NC_010379	ATT	2	6	3304	3309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834676
55	NC_010379	ATG	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834676
56	NC_010379	CTT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834676
57	NC_010379	CTT	2	6	3413	3418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834676
58	NC_010379	TAC	2	6	3496	3501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834676
59	NC_010379	TCT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834676
60	NC_010379	AAC	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834676
61	NC_010379	CTA	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010379	ACA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010379	ATC	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834692
64	NC_010379	AGC	2	6	4080	4085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834692
65	NC_010379	AGT	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834692
66	NC_010379	AAT	2	6	4185	4190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834692
67	NC_010379	GTT	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834692
68	NC_010379	CTA	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834692
69	NC_010379	TTA	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834692
70	NC_010379	AAG	2	6	4500	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834692
71	NC_010379	TAG	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834692
72	NC_010379	ATA	3	9	4799	4807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834692
73	NC_010379	ATT	3	9	4841	4849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834692
74	NC_010379	TAT	2	6	4900	4905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834692
75	NC_010379	TAG	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834692
76	NC_010379	TAT	2	6	4988	4993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010379	ATT	2	6	4995	5000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010379	TCC	2	6	5079	5084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010379	AGA	2	6	5094	5099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010379	TAC	2	6	5197	5202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834615
81	NC_010379	TGT	2	6	5336	5341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834615
82	NC_010379	AGT	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834615
83	NC_010379	TTG	2	6	5551	5556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834615
84	NC_010379	TAT	2	6	5560	5565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
85	NC_010379	ATT	2	6	5584	5589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
86	NC_010379	TTC	2	6	5608	5613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834615
87	NC_010379	ATC	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834615
88	NC_010379	AGA	2	6	5671	5676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834615
89	NC_010379	TAT	2	6	5728	5733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
90	NC_010379	ATT	2	6	5795	5800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
91	NC_010379	AGA	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834615
92	NC_010379	ATT	2	6	5866	5871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
93	NC_010379	TCT	2	6	5933	5938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834615
94	NC_010379	TAT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
95	NC_010379	CTG	2	6	6078	6083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834615
96	NC_010379	GAT	2	6	6102	6107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834615
97	NC_010379	ATA	2	6	6144	6149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834615
98	NC_010379	GAA	2	6	6258	6263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834697
99	NC_010379	ATT	2	6	6277	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834697
100	NC_010379	TAG	2	6	6299	6304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834697
101	NC_010379	TAC	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834697
102	NC_010379	AGA	2	6	6335	6340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834697
103	NC_010379	ATA	2	6	6379	6384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834697
104	NC_010379	AAT	2	6	6436	6441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834697
105	NC_010379	TAT	2	6	6464	6469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834715
106	NC_010379	ACC	2	6	6605	6610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834715
107	NC_010379	TAT	2	6	6684	6689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834715
108	NC_010379	GTT	2	6	6762	6767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834715
109	NC_010379	CAA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834715
110	NC_010379	TAA	2	6	6841	6846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834715
111	NC_010379	ATA	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834632
112	NC_010379	ATT	2	6	6910	6915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834632
113	NC_010379	TTA	2	6	6956	6961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834632
114	NC_010379	ATT	2	6	7052	7057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010379	AGG	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010379	ATT	3	9	7102	7110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834616
117	NC_010379	TCC	2	6	7302	7307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834616
118	NC_010379	TCA	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834616
119	NC_010379	ATA	2	6	7360	7365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834616
120	NC_010379	TAA	2	6	7413	7418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834616
121	NC_010379	ATT	2	6	7643	7648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010379	GAT	2	6	7696	7701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834703
123	NC_010379	AAT	3	9	7727	7735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834703
124	NC_010379	TAC	2	6	7761	7766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834703
125	NC_010379	ATT	2	6	7833	7838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834703
126	NC_010379	TAT	2	6	7844	7849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834703
127	NC_010379	ATA	2	6	7857	7862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834703
128	NC_010379	TTG	2	6	7886	7891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834703
129	NC_010379	CAG	2	6	7973	7978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834703
130	NC_010379	ACA	2	6	8008	8013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834703
131	NC_010379	ATT	2	6	8044	8049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834703
132	NC_010379	AGG	2	6	8074	8079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169834703
133	NC_010379	TAA	2	6	8158	8163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834703
134	NC_010379	AGA	2	6	8203	8208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834703
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