MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	TA	3	6	362	367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010379	TA	3	6	656	661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010379	AT	3	6	666	671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010379	AT	3	6	959	964	50 %	50 %	0 %	0 %	169834666
5	NC_010379	TA	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010379	CT	3	6	1305	1310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010379	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010379	TA	3	6	1508	1513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010379	TA	3	6	1527	1532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010379	TA	3	6	1597	1602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010379	CT	3	6	1712	1717	0 %	50 %	0 %	50 %	169834598
12	NC_010379	TA	3	6	1767	1772	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
13	NC_010379	TA	3	6	1930	1935	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
14	NC_010379	AT	3	6	2060	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
15	NC_010379	AT	3	6	2131	2136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010379	TA	3	6	2146	2151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010379	TA	4	8	2229	2236	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
18	NC_010379	TA	3	6	2280	2285	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
19	NC_010379	AT	4	8	2299	2306	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
20	NC_010379	TA	3	6	2497	2502	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
21	NC_010379	AT	4	8	3068	3075	50 %	50 %	0 %	0 %	169834681
22	NC_010379	TA	3	6	3379	3384	50 %	50 %	0 %	0 %	169834676
23	NC_010379	TC	3	6	3521	3526	0 %	50 %	0 %	50 %	169834676
24	NC_010379	TA	4	8	3672	3679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010379	AT	3	6	3876	3881	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
26	NC_010379	AT	3	6	4494	4499	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
27	NC_010379	AT	3	6	4627	4632	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
28	NC_010379	AT	3	6	4854	4859	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
29	NC_010379	AT	3	6	4864	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
30	NC_010379	AT	3	6	4934	4939	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
31	NC_010379	TG	4	8	5209	5216	0 %	50 %	50 %	0 %	169834615
32	NC_010379	TA	3	6	5224	5229	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
33	NC_010379	AT	4	8	5243	5250	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
34	NC_010379	TA	3	6	5881	5886	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
35	NC_010379	TC	3	6	5891	5896	0 %	50 %	0 %	50 %	169834615
36	NC_010379	AT	3	6	6195	6200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010379	AT	3	6	6691	6696	50 %	50 %	0 %	0 %	169834715
38	NC_010379	AT	4	8	6748	6755	50 %	50 %	0 %	0 %	169834715
39	NC_010379	TA	3	6	6817	6822	50 %	50 %	0 %	0 %	169834715
40	NC_010379	TA	3	6	7046	7051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010379	AT	3	6	7164	7169	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
42	NC_010379	AT	3	6	7202	7207	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
43	NC_010379	TA	3	6	7248	7253	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
44	NC_010379	AT	3	6	7263	7268	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
45	NC_010379	AT	3	6	7391	7396	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
46	NC_010379	TA	3	6	7505	7510	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
47	NC_010379	TA	4	8	7650	7657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010379	TA	3	6	8111	8116	50 %	50 %	0 %	0 %	169834703
49	NC_010379	AC	3	6	8277	8282	50 %	0 %	0 %	50 %	169834703
50	NC_010379	GT	3	6	8342	8347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010379	AT	3	6	8659	8664	50 %	50 %	0 %	0 %	169834551
52	NC_010379	TC	3	6	9207	9212	0 %	50 %	0 %	50 %	169834551
53	NC_010379	AT	3	6	9285	9290	50 %	50 %	0 %	0 %	169834551
54	NC_010379	AT	3	6	9304	9309	50 %	50 %	0 %	0 %	169834551
55	NC_010379	AT	3	6	9874	9879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_010379	TA	3	6	10996	11001	50 %	50 %	0 %	0 %	169834635
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63	NC_010379	TA	3	6	11442	11447	50 %	50 %	0 %	0 %	169834584
64	NC_010379	TC	3	6	11555	11560	0 %	50 %	0 %	50 %	169834584
65	NC_010379	TA	4	8	12010	12017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_010379	TA	4	8	12350	12357	50 %	50 %	0 %	0 %	169834726
68	NC_010379	AT	3	6	12376	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	169834726
69	NC_010379	TA	3	6	12518	12523	50 %	50 %	0 %	0 %	169834726
70	NC_010379	TA	3	6	12726	12731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010379	TA	3	6	12938	12943	50 %	50 %	0 %	0 %	169834649
72	NC_010379	AT	3	6	12971	12976	50 %	50 %	0 %	0 %	169834649
73	NC_010379	TA	3	6	14181	14186	50 %	50 %	0 %	0 %	169834535
74	NC_010379	AT	3	6	14401	14406	50 %	50 %	0 %	0 %	169834535
75	NC_010379	TC	4	8	14544	14551	0 %	50 %	0 %	50 %	169834648
76	NC_010379	AT	3	6	15398	15403	50 %	50 %	0 %	0 %	169834603
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78	NC_010379	AT	3	6	15808	15813	50 %	50 %	0 %	0 %	169834728
79	NC_010379	TA	3	6	15890	15895	50 %	50 %	0 %	0 %	169834728
80	NC_010379	TA	3	6	16081	16086	50 %	50 %	0 %	0 %	169834724
81	NC_010379	TA	3	6	16422	16427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_010379	AT	3	6	17816	17821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010379	TA	4	8	17929	17936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010379	TA	3	6	18056	18061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010379	TA	3	6	18181	18186	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
92	NC_010379	AT	3	6	18733	18738	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
93	NC_010379	TA	4	8	18791	18798	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
94	NC_010379	CT	3	6	18978	18983	0 %	50 %	0 %	50 %	169834577
95	NC_010379	AT	3	6	19237	19242	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
96	NC_010379	TA	3	6	19389	19394	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
97	NC_010379	TA	3	6	19440	19445	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
98	NC_010379	AT	3	6	20044	20049	50 %	50 %	0 %	0 %	169834636
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103	NC_010379	TA	3	6	21279	21284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010379	TA	4	8	21347	21354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010379	AT	3	6	21647	21652	50 %	50 %	0 %	0 %	169834710
106	NC_010379	TA	5	10	21763	21772	50 %	50 %	0 %	0 %	169834710
107	NC_010379	AT	3	6	21876	21881	50 %	50 %	0 %	0 %	169834710
108	NC_010379	CT	3	6	21924	21929	0 %	50 %	0 %	50 %	169834710
109	NC_010379	TA	3	6	21967	21972	50 %	50 %	0 %	0 %	169834710
110	NC_010379	TA	3	6	22072	22077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010379	TA	3	6	22548	22553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010379	AT	3	6	22713	22718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010379	AT	3	6	22787	22792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010379	AT	3	6	22963	22968	50 %	50 %	0 %	0 %	169834539
115	NC_010379	TA	3	6	22992	22997	50 %	50 %	0 %	0 %	169834539
116	NC_010379	TA	3	6	23104	23109	50 %	50 %	0 %	0 %	169834539
117	NC_010379	CT	3	6	23205	23210	0 %	50 %	0 %	50 %	169834539
118	NC_010379	TA	3	6	23657	23662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010379	AT	3	6	23921	23926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010379	TA	4	8	23989	23996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010379	TA	3	6	24327	24332	50 %	50 %	0 %	0 %	169834700
122	NC_010379	TA	3	6	24423	24428	50 %	50 %	0 %	0 %	169834700
123	NC_010379	TA	4	8	24988	24995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010379	AT	4	8	25150	25157	50 %	50 %	0 %	0 %	169834708
125	NC_010379	TA	3	6	25317	25322	50 %	50 %	0 %	0 %	169834708
126	NC_010379	AT	4	8	25358	25365	50 %	50 %	0 %	0 %	169834708
127	NC_010379	TA	4	8	25986	25993	50 %	50 %	0 %	0 %	169834708
128	NC_010379	AT	3	6	26078	26083	50 %	50 %	0 %	0 %	169834708
129	NC_010379	TA	3	6	26618	26623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010379	TA	3	6	26660	26665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010379	AT	3	6	26685	26690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010379	TA	3	6	26706	26711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010379	AT	3	6	26735	26740	50 %	50 %	0 %	0 %	169834651
134	NC_010379	TA	4	8	26958	26965	50 %	50 %	0 %	0 %	169834651
135	NC_010379	TA	3	6	27412	27417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010379	TA	4	8	27529	27536	50 %	50 %	0 %	0 %	169834599
137	NC_010379	AT	3	6	27745	27750	50 %	50 %	0 %	0 %	169834599
138	NC_010379	AT	3	6	27804	27809	50 %	50 %	0 %	0 %	169834599
139	NC_010379	AT	3	6	28088	28093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010379	TA	3	6	28698	28703	50 %	50 %	0 %	0 %	169834570
141	NC_010379	TA	3	6	28759	28764	50 %	50 %	0 %	0 %	169834570
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144	NC_010379	AT	3	6	30008	30013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_010379	TA	3	6	30324	30329	50 %	50 %	0 %	0 %	169834707
147	NC_010379	AT	3	6	30569	30574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010379	TA	3	6	30597	30602	50 %	50 %	0 %	0 %	169834572
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