MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	TA	3	6	362	367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010379	TA	3	6	656	661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010379	AT	3	6	666	671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010379	TA	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010379	CT	3	6	1305	1310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010379	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010379	TA	3	6	1508	1513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010379	TA	3	6	1527	1532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010379	TA	3	6	1597	1602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010379	AT	3	6	2131	2136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010379	TA	3	6	2146	2151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010379	TA	4	8	3672	3679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010379	AT	3	6	6195	6200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010379	TA	3	6	7046	7051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010379	TA	4	8	7650	7657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010379	GT	3	6	8342	8347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010379	AT	3	6	9874	9879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010379	TA	4	8	12010	12017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010379	TA	3	6	12726	12731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010379	TA	3	6	16422	16427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010379	AT	3	6	16436	16441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010379	AT	3	6	16714	16719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010379	AT	3	6	17816	17821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010379	TA	4	8	17929	17936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010379	TA	3	6	18056	18061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010379	TA	3	6	21279	21284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010379	TA	4	8	21347	21354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010379	TA	3	6	22072	22077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010379	TA	3	6	22548	22553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010379	AT	3	6	22713	22718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010379	AT	3	6	22787	22792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010379	TA	3	6	23657	23662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010379	AT	3	6	23921	23926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010379	TA	4	8	23989	23996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010379	TA	4	8	24988	24995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010379	TA	3	6	26618	26623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010379	TA	3	6	26660	26665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010379	AT	3	6	26685	26690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010379	TA	3	6	26706	26711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010379	TA	3	6	27412	27417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010379	AT	3	6	28088	28093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010379	AT	3	6	29960	29965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010379	AT	3	6	30008	30013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010379	AT	3	6	30569	30574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010379	TA	3	6	30949	30954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010379	TA	3	6	31309	31314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010379	TC	4	8	32358	32365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010379	TA	3	6	34053	34058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010379	CT	3	6	40655	40660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010379	AT	3	6	40861	40866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010379	CT	3	6	40894	40899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010379	AT	3	6	41151	41156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010379	CT	3	6	41906	41911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010379	AT	3	6	42150	42155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010379	AT	3	6	42176	42181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010379	TA	3	6	42283	42288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010379	TA	4	8	49916	49923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010379	AT	3	6	50647	50652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010379	AT	3	6	54124	54129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010379	TA	3	6	54155	54160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010379	AT	3	6	54522	54527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010379	AT	3	6	54741	54746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010379	AT	3	6	54760	54765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010379	CA	3	6	54773	54778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010379	AT	3	6	55254	55259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010379	TA	4	8	55323	55330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010379	AT	3	6	55504	55509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010379	AT	3	6	57259	57264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010379	TA	3	6	57538	57543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010379	AT	3	6	57700	57705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010379	TA	3	6	59019	59024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010379	TA	3	6	59169	59174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010379	TA	3	6	60131	60136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010379	TA	3	6	60140	60145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010379	AT	3	6	60561	60566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010379	TA	3	6	60858	60863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010379	AT	3	6	60871	60876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010379	AT	3	6	62728	62733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010379	TA	3	6	62740	62745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010379	TA	3	6	62865	62870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010379	TA	3	6	63822	63827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010379	TA	3	6	63951	63956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010379	TA	3	6	64167	64172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010379	TA	3	6	64895	64900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010379	AT	3	6	66542	66547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010379	TA	4	8	66556	66563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010379	TA	4	8	67399	67406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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93	NC_010379	CT	3	6	70696	70701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010379	TA	4	8	70729	70736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010379	TA	3	6	71503	71508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010379	TA	4	8	71514	71521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010379	AT	3	6	71566	71571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010379	TA	3	6	71606	71611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010379	AT	3	6	71680	71685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_010379	AT	3	6	72850	72855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010379	AT	3	6	73171	73176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010379	AT	3	6	75723	75728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_010379	AT	3	6	79769	79774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_010379	AT	3	6	81926	81931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010379	AT	3	6	83813	83818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010379	TA	3	6	83836	83841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010379	AT	3	6	84632	84637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010379	AT	3	6	84721	84726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010379	TC	3	6	84927	84932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010379	AT	5	10	84948	84957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010379	TA	4	8	85002	85009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010379	AT	3	6	87017	87022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010379	TA	3	6	87788	87793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010379	AT	3	6	90044	90049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010379	AT	3	6	90442	90447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010379	AT	3	6	90510	90515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010379	AT	3	6	90551	90556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010379	AT	3	6	90644	90649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010379	TA	3	6	92023	92028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010379	TA	3	6	92060	92065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010379	AT	3	6	92781	92786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010379	TA	3	6	92985	92990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010379	TA	3	6	94357	94362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010379	AT	3	6	94383	94388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010379	TA	3	6	94418	94423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010379	CT	3	6	95127	95132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010379	AT	3	6	95443	95448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010379	AT	4	8	97034	97041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010379	TA	3	6	101378	101383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010379	AT	3	6	103297	103302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010379	TA	3	6	104272	104277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010379	TA	3	6	107152	107157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_010379	TA	3	6	110703	110708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010379	AT	3	6	110712	110717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010379	TA	3	6	117935	117940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010379	CT	3	6	118134	118139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010379	TA	3	6	121453	121458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010379	TA	3	6	121490	121495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010379	TA	4	8	121498	121505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010379	GT	3	6	121581	121586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010379	TA	3	6	122515	122520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010379	TA	3	6	125389	125394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010379	TA	3	6	125470	125475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010379	GA	3	6	126054	126059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_010379	TA	4	8	129099	129106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010379	TA	3	6	129859	129864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010379	AT	3	6	130433	130438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010379	TA	3	6	130439	130444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010379	TA	4	8	130482	130489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010379	TA	3	6	130730	130735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010379	TA	4	8	130790	130797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010379	CT	3	6	131920	131925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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160	NC_010379	TA	3	6	132091	132096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.