MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 414

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	AT	3	6	959	964	50 %	50 %	0 %	0 %	169834666
2	NC_010379	CT	3	6	1712	1717	0 %	50 %	0 %	50 %	169834598
3	NC_010379	TA	3	6	1767	1772	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
4	NC_010379	TA	3	6	1930	1935	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
5	NC_010379	AT	3	6	2060	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
6	NC_010379	TA	4	8	2229	2236	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
7	NC_010379	TA	3	6	2280	2285	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
8	NC_010379	AT	4	8	2299	2306	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
9	NC_010379	TA	3	6	2497	2502	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
10	NC_010379	AT	4	8	3068	3075	50 %	50 %	0 %	0 %	169834681
11	NC_010379	TA	3	6	3379	3384	50 %	50 %	0 %	0 %	169834676
12	NC_010379	TC	3	6	3521	3526	0 %	50 %	0 %	50 %	169834676
13	NC_010379	AT	3	6	3876	3881	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
14	NC_010379	AT	3	6	4494	4499	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
15	NC_010379	AT	3	6	4627	4632	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
16	NC_010379	AT	3	6	4854	4859	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
17	NC_010379	AT	3	6	4864	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
18	NC_010379	AT	3	6	4934	4939	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
19	NC_010379	TG	4	8	5209	5216	0 %	50 %	50 %	0 %	169834615
20	NC_010379	TA	3	6	5224	5229	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
21	NC_010379	AT	4	8	5243	5250	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
22	NC_010379	TA	3	6	5881	5886	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
23	NC_010379	TC	3	6	5891	5896	0 %	50 %	0 %	50 %	169834615
24	NC_010379	AT	3	6	6691	6696	50 %	50 %	0 %	0 %	169834715
25	NC_010379	AT	4	8	6748	6755	50 %	50 %	0 %	0 %	169834715
26	NC_010379	TA	3	6	6817	6822	50 %	50 %	0 %	0 %	169834715
27	NC_010379	AT	3	6	7164	7169	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
28	NC_010379	AT	3	6	7202	7207	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
29	NC_010379	TA	3	6	7248	7253	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
30	NC_010379	AT	3	6	7263	7268	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
31	NC_010379	AT	3	6	7391	7396	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
32	NC_010379	TA	3	6	7505	7510	50 %	50 %	0 %	0 %	169834616
33	NC_010379	TA	3	6	8111	8116	50 %	50 %	0 %	0 %	169834703
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36	NC_010379	TC	3	6	9207	9212	0 %	50 %	0 %	50 %	169834551
37	NC_010379	AT	3	6	9285	9290	50 %	50 %	0 %	0 %	169834551
38	NC_010379	AT	3	6	9304	9309	50 %	50 %	0 %	0 %	169834551
39	NC_010379	TA	4	8	10009	10016	50 %	50 %	0 %	0 %	169834709
40	NC_010379	AT	3	6	10048	10053	50 %	50 %	0 %	0 %	169834709
41	NC_010379	AT	3	6	10078	10083	50 %	50 %	0 %	0 %	169834709
42	NC_010379	AT	3	6	10271	10276	50 %	50 %	0 %	0 %	169834590
43	NC_010379	TA	3	6	10996	11001	50 %	50 %	0 %	0 %	169834635
44	NC_010379	CT	3	6	11112	11117	0 %	50 %	0 %	50 %	169834635
45	NC_010379	TA	3	6	11365	11370	50 %	50 %	0 %	0 %	169834584
46	NC_010379	TA	3	6	11442	11447	50 %	50 %	0 %	0 %	169834584
47	NC_010379	TC	3	6	11555	11560	0 %	50 %	0 %	50 %	169834584
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49	NC_010379	TA	4	8	12350	12357	50 %	50 %	0 %	0 %	169834726
50	NC_010379	AT	3	6	12376	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	169834726
51	NC_010379	TA	3	6	12518	12523	50 %	50 %	0 %	0 %	169834726
52	NC_010379	TA	3	6	12938	12943	50 %	50 %	0 %	0 %	169834649
53	NC_010379	AT	3	6	12971	12976	50 %	50 %	0 %	0 %	169834649
54	NC_010379	TA	3	6	14181	14186	50 %	50 %	0 %	0 %	169834535
55	NC_010379	AT	3	6	14401	14406	50 %	50 %	0 %	0 %	169834535
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60	NC_010379	TA	3	6	15890	15895	50 %	50 %	0 %	0 %	169834728
61	NC_010379	TA	3	6	16081	16086	50 %	50 %	0 %	0 %	169834724
62	NC_010379	TA	4	8	16666	16673	50 %	50 %	0 %	0 %	169834620
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64	NC_010379	AT	3	6	17331	17336	50 %	50 %	0 %	0 %	169834704
65	NC_010379	AT	3	6	17716	17721	50 %	50 %	0 %	0 %	169834704
66	NC_010379	TA	3	6	18181	18186	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
67	NC_010379	AT	3	6	18733	18738	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
68	NC_010379	TA	4	8	18791	18798	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
69	NC_010379	CT	3	6	18978	18983	0 %	50 %	0 %	50 %	169834577
70	NC_010379	AT	3	6	19237	19242	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
71	NC_010379	TA	3	6	19389	19394	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
72	NC_010379	TA	3	6	19440	19445	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
73	NC_010379	AT	3	6	20044	20049	50 %	50 %	0 %	0 %	169834636
74	NC_010379	AT	3	6	20168	20173	50 %	50 %	0 %	0 %	169834636
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82	NC_010379	TA	3	6	21967	21972	50 %	50 %	0 %	0 %	169834710
83	NC_010379	AT	3	6	22963	22968	50 %	50 %	0 %	0 %	169834539
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91	NC_010379	AT	4	8	25358	25365	50 %	50 %	0 %	0 %	169834708
92	NC_010379	TA	4	8	25986	25993	50 %	50 %	0 %	0 %	169834708
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105	NC_010379	TA	3	6	30633	30638	50 %	50 %	0 %	0 %	169834572
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107	NC_010379	AT	3	6	31926	31931	50 %	50 %	0 %	0 %	169834593
108	NC_010379	AT	3	6	32099	32104	50 %	50 %	0 %	0 %	169834593
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111	NC_010379	TA	3	6	33914	33919	50 %	50 %	0 %	0 %	169834654
112	NC_010379	TA	3	6	34293	34298	50 %	50 %	0 %	0 %	169834552
113	NC_010379	AT	3	6	34745	34750	50 %	50 %	0 %	0 %	169834552
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.