MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium sp. 4-46 plasmid pM44602

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010374	TCGC	2	8	560	567	0 %	25 %	25 %	50 %	169825393
2	NC_010374	CGAC	2	8	1090	1097	25 %	0 %	25 %	50 %	169825394
3	NC_010374	GGCG	2	8	1227	1234	0 %	0 %	75 %	25 %	169825394
4	NC_010374	ACCT	2	8	1275	1282	25 %	25 %	0 %	50 %	169825394
5	NC_010374	GTTC	2	8	1463	1470	0 %	50 %	25 %	25 %	169825394
6	NC_010374	TTCA	2	8	1701	1708	25 %	50 %	0 %	25 %	169825395
7	NC_010374	TCGC	2	8	2200	2207	0 %	25 %	25 %	50 %	169825396
8	NC_010374	GTCA	2	8	2308	2315	25 %	25 %	25 %	25 %	169825397
9	NC_010374	GAGC	2	8	2654	2661	25 %	0 %	50 %	25 %	169825398
10	NC_010374	CGGC	2	8	2844	2851	0 %	0 %	50 %	50 %	169825398
11	NC_010374	CGAT	2	8	2998	3005	25 %	25 %	25 %	25 %	169825398
12	NC_010374	GATC	2	8	3272	3279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010374	GCGA	2	8	3592	3599	25 %	0 %	50 %	25 %	169825399
14	NC_010374	CTAT	2	8	3857	3864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010374	TAAC	2	8	3915	3922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010374	GTTT	2	8	4085	4092	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010374	CGCT	2	8	4363	4370	0 %	25 %	25 %	50 %	169825400
18	NC_010374	CGGC	2	8	4393	4400	0 %	0 %	50 %	50 %	169825400
19	NC_010374	CCAA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	0 %	50 %	169825401
20	NC_010374	TGGC	2	8	5742	5749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010374	TCGA	2	8	6674	6681	25 %	25 %	25 %	25 %	169825403
22	NC_010374	CGGC	2	8	7569	7576	0 %	0 %	50 %	50 %	169825405
23	NC_010374	GTCG	2	8	8072	8079	0 %	25 %	50 %	25 %	169825405
24	NC_010374	GACC	2	8	8281	8288	25 %	0 %	25 %	50 %	169825405
25	NC_010374	CCGG	2	8	8620	8627	0 %	0 %	50 %	50 %	169825405
26	NC_010374	GCCG	2	8	8707	8714	0 %	0 %	50 %	50 %	169825405
27	NC_010374	TGAG	2	8	8937	8944	25 %	25 %	50 %	0 %	169825405
28	NC_010374	CCGA	2	8	9035	9042	25 %	0 %	25 %	50 %	169825405
29	NC_010374	GCGA	2	8	9588	9595	25 %	0 %	50 %	25 %	169825406
30	NC_010374	GTCG	2	8	9709	9716	0 %	25 %	50 %	25 %	169825406
31	NC_010374	CGCT	2	8	9878	9885	0 %	25 %	25 %	50 %	169825406
32	NC_010374	CGGC	2	8	9973	9980	0 %	0 %	50 %	50 %	169825406
33	NC_010374	CGGG	2	8	10704	10711	0 %	0 %	75 %	25 %	169825407
34	NC_010374	CGGC	2	8	10739	10746	0 %	0 %	50 %	50 %	169825407
35	NC_010374	GCTC	2	8	10801	10808	0 %	25 %	25 %	50 %	169825407
36	NC_010374	ACGA	2	8	11840	11847	50 %	0 %	25 %	25 %	169825408
37	NC_010374	GCTG	2	8	11898	11905	0 %	25 %	50 %	25 %	169825408
38	NC_010374	CTCG	2	8	12095	12102	0 %	25 %	25 %	50 %	169825408
39	NC_010374	GAAG	2	8	12187	12194	50 %	0 %	50 %	0 %	169825408
40	NC_010374	CGGC	2	8	12263	12270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010374	GCCG	2	8	12280	12287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010374	AGCA	2	8	12541	12548	50 %	0 %	25 %	25 %	169825409
43	NC_010374	GTCG	2	8	12580	12587	0 %	25 %	50 %	25 %	169825409
44	NC_010374	GCTC	2	8	12642	12649	0 %	25 %	25 %	50 %	169825409
45	NC_010374	CCAT	2	8	12862	12869	25 %	25 %	0 %	50 %	169825409
46	NC_010374	AATC	2	8	12922	12929	50 %	25 %	0 %	25 %	169825409
47	NC_010374	TCAG	2	8	12956	12963	25 %	25 %	25 %	25 %	169825409
48	NC_010374	GAAT	2	8	13036	13043	50 %	25 %	25 %	0 %	169825409
49	NC_010374	GCCT	2	8	14204	14211	0 %	25 %	25 %	50 %	169825409
50	NC_010374	ATCG	2	8	16356	16363	25 %	25 %	25 %	25 %	169825410
51	NC_010374	CGGG	2	8	16670	16677	0 %	0 %	75 %	25 %	169825410
52	NC_010374	GGAT	2	8	16789	16796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010374	GATC	2	8	16970	16977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010374	CGAA	2	8	17205	17212	50 %	0 %	25 %	25 %	169825411
55	NC_010374	AGGG	2	8	17249	17256	25 %	0 %	75 %	0 %	169825411
56	NC_010374	GCAG	2	8	17377	17384	25 %	0 %	50 %	25 %	169825411
57	NC_010374	GGTT	2	8	17471	17478	0 %	50 %	50 %	0 %	169825411
58	NC_010374	CGGG	2	8	17511	17518	0 %	0 %	75 %	25 %	169825411
59	NC_010374	TCTG	2	8	17569	17576	0 %	50 %	25 %	25 %	169825411
60	NC_010374	TCAT	2	8	17771	17778	25 %	50 %	0 %	25 %	169825411
61	NC_010374	GAAG	2	8	17912	17919	50 %	0 %	50 %	0 %	169825411
62	NC_010374	TACC	2	8	18099	18106	25 %	25 %	0 %	50 %	169825411
63	NC_010374	TCGG	3	12	18213	18224	0 %	25 %	50 %	25 %	169825411
64	NC_010374	CAAC	2	8	19090	19097	50 %	0 %	0 %	50 %	169825412
65	NC_010374	ATTT	2	8	19148	19155	25 %	75 %	0 %	0 %	169825412
66	NC_010374	GGTG	2	8	19385	19392	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010374	CGGC	2	8	19821	19828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.