MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium sp. 4-46 plasmid pM44602

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010374	GGA	2	6	158	163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825393
2	NC_010374	CGC	2	6	209	214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825393
3	NC_010374	AAT	2	6	330	335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825393
4	NC_010374	CGA	2	6	362	367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
5	NC_010374	GCG	2	6	419	424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825393
6	NC_010374	CGA	2	6	535	540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
7	NC_010374	GGA	2	6	581	586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825393
8	NC_010374	CTG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825393
9	NC_010374	AGC	2	6	651	656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
10	NC_010374	AGC	2	6	673	678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
11	NC_010374	CTG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825393
12	NC_010374	AGC	2	6	954	959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825394
13	NC_010374	CGT	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825394
14	NC_010374	CAT	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825394
15	NC_010374	TGG	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825394
16	NC_010374	TTA	2	6	1213	1218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825394
17	NC_010374	GCC	2	6	1254	1259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825394
18	NC_010374	TCG	2	6	1339	1344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825394
19	NC_010374	TCA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825394
20	NC_010374	GGC	2	6	1427	1432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825394
21	NC_010374	GCT	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825394
22	NC_010374	CGC	2	6	1505	1510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825394
23	NC_010374	GAG	2	6	1563	1568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825394
24	NC_010374	GAG	2	6	1740	1745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825395
25	NC_010374	GCA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825395
26	NC_010374	GCG	2	6	2182	2187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825396
27	NC_010374	CCG	2	6	2224	2229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825396
28	NC_010374	CGC	2	6	2238	2243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825396
29	NC_010374	GCC	2	6	2369	2374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825397
30	NC_010374	GCG	2	6	2576	2581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825398
31	NC_010374	GGC	2	6	2775	2780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825398
32	NC_010374	CTC	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825398
33	NC_010374	CTC	2	6	2862	2867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825398
34	NC_010374	CGT	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825398
35	NC_010374	CGG	2	6	3579	3584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825399
36	NC_010374	GAG	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825399
37	NC_010374	GCT	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825399
38	NC_010374	TCG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825399
39	NC_010374	GGT	2	6	4199	4204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825400
40	NC_010374	TGC	3	9	4228	4236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825400
41	NC_010374	GCG	2	6	4376	4381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825400
42	NC_010374	CGG	2	6	4427	4432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825400
43	NC_010374	GCG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825400
44	NC_010374	AAG	2	6	4589	4594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
45	NC_010374	TAT	2	6	4800	4805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825401
46	NC_010374	AGA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
47	NC_010374	ACG	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825401
48	NC_010374	GGC	2	6	4926	4931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825401
49	NC_010374	TTG	2	6	4973	4978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825401
50	NC_010374	AGT	2	6	4987	4992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825401
51	NC_010374	AAG	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
52	NC_010374	AGA	2	6	5110	5115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
53	NC_010374	TGG	2	6	5224	5229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825401
54	NC_010374	CAT	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825401
55	NC_010374	CAG	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825401
56	NC_010374	AGA	2	6	5388	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
57	NC_010374	GAA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
58	NC_010374	TGA	2	6	5550	5555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825401
59	NC_010374	GAG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825401
60	NC_010374	TGA	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825402
61	NC_010374	CTG	2	6	5859	5864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825402
62	NC_010374	TCG	2	6	5887	5892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825402
63	NC_010374	GCC	2	6	5939	5944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825402
64	NC_010374	TGG	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825403
65	NC_010374	CCT	2	6	6553	6558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825403
66	NC_010374	CTC	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825403
67	NC_010374	CGG	2	6	6749	6754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825404
68	NC_010374	GCC	2	6	6800	6805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825404
69	NC_010374	CGC	2	6	6939	6944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825404
70	NC_010374	GCG	2	6	6970	6975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825404
71	NC_010374	AGT	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825404
72	NC_010374	GCG	2	6	7188	7193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
73	NC_010374	GGC	2	6	7345	7350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
74	NC_010374	GGC	2	6	7390	7395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
75	NC_010374	GCA	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825405
76	NC_010374	CCG	2	6	7458	7463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
77	NC_010374	CGT	2	6	7498	7503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825405
78	NC_010374	GCC	2	6	7547	7552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
79	NC_010374	GCC	2	6	7577	7582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
80	NC_010374	GCC	2	6	7600	7605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
81	NC_010374	TGC	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825405
82	NC_010374	GGC	2	6	7704	7709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
83	NC_010374	GCA	2	6	7748	7753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825405
84	NC_010374	ACC	2	6	7757	7762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169825405
85	NC_010374	CCG	2	6	7770	7775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
86	NC_010374	GCC	2	6	7800	7805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
87	NC_010374	CCT	2	6	7822	7827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825405
88	NC_010374	GAG	2	6	7838	7843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825405
89	NC_010374	GAA	2	6	7864	7869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825405
90	NC_010374	GGC	2	6	7917	7922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
91	NC_010374	GGA	2	6	8002	8007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825405
92	NC_010374	CCT	2	6	8017	8022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825405
93	NC_010374	TCA	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825405
94	NC_010374	GCT	2	6	8395	8400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825405
95	NC_010374	CGC	2	6	8439	8444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
96	NC_010374	GGC	2	6	8558	8563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
97	NC_010374	GCG	2	6	8719	8724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
98	NC_010374	CGC	2	6	8875	8880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
99	NC_010374	CAA	2	6	8965	8970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825405
100	NC_010374	GAT	2	6	8995	9000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825405
101	NC_010374	CGG	2	6	9089	9094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
102	NC_010374	TGG	2	6	9327	9332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825406
103	NC_010374	CCT	2	6	9391	9396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825406
104	NC_010374	CGG	2	6	9729	9734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825406
105	NC_010374	CGG	2	6	9758	9763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825406
106	NC_010374	ACG	2	6	9774	9779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825406
107	NC_010374	CGA	2	6	9802	9807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825406
108	NC_010374	TCG	2	6	9840	9845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825406
109	NC_010374	CCG	2	6	9846	9851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825406
110	NC_010374	AGG	2	6	9900	9905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825406
111	NC_010374	GAG	2	6	9989	9994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825406
112	NC_010374	GCG	2	6	10028	10033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825406
113	NC_010374	ATG	2	6	10038	10043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825406
114	NC_010374	CGA	2	6	10054	10059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825406
115	NC_010374	CAT	2	6	10070	10075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825406
116	NC_010374	GCC	2	6	10909	10914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825407
117	NC_010374	GTT	2	6	10974	10979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825407
118	NC_010374	TGC	2	6	10980	10985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825407
119	NC_010374	GTG	2	6	10990	10995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825407
120	NC_010374	GCG	2	6	11007	11012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825407
121	NC_010374	GGC	2	6	11091	11096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825407
122	NC_010374	TTA	2	6	11313	11318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825408
123	NC_010374	GCG	2	6	11328	11333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825408
124	NC_010374	GAC	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825408
125	NC_010374	CAG	2	6	11639	11644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825408
126	NC_010374	CAT	2	6	11674	11679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825408
127	NC_010374	GGC	2	6	11713	11718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825408
128	NC_010374	CGG	2	6	11804	11809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825408
129	NC_010374	CAG	2	6	11870	11875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825408
130	NC_010374	GCA	2	6	11889	11894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825408
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.