MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium sp. 4-46 plasmid pM44601

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010373	CGCCC	2	10	67	76	0 %	0 %	20 %	80 %	169825330
2	NC_010373	GCGCA	2	10	1032	1041	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010373	TCGGC	2	10	1769	1778	0 %	20 %	40 %	40 %	169825333
4	NC_010373	CTGAG	2	10	3501	3510	20 %	20 %	40 %	20 %	169825334
5	NC_010373	CGCTC	2	10	3630	3639	0 %	20 %	20 %	60 %	169825335
6	NC_010373	GGCCG	2	10	4298	4307	0 %	0 %	60 %	40 %	169825336
7	NC_010373	ACCGG	2	10	5127	5136	20 %	0 %	40 %	40 %	169825337
8	NC_010373	GCGAG	2	10	5448	5457	20 %	0 %	60 %	20 %	169825337
9	NC_010373	GCCCG	2	10	7380	7389	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_010373	CCTGC	2	10	8486	8495	0 %	20 %	20 %	60 %	169825343
11	NC_010373	CGGCC	2	10	10430	10439	0 %	0 %	40 %	60 %	169825346
12	NC_010373	TCGGC	2	10	11067	11076	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010373	AGCCG	2	10	11794	11803	20 %	0 %	40 %	40 %	169825348
14	NC_010373	CGCAT	2	10	12428	12437	20 %	20 %	20 %	40 %	169825349
15	NC_010373	GGGGA	2	10	13742	13751	20 %	0 %	80 %	0 %	169825351
16	NC_010373	GACGA	2	10	13912	13921	40 %	0 %	40 %	20 %	169825351
17	NC_010373	TTGGC	2	10	14734	14743	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010373	GACGC	2	10	15593	15602	20 %	0 %	40 %	40 %	169825353
19	NC_010373	CGGCT	2	10	15863	15872	0 %	20 %	40 %	40 %	169825353
20	NC_010373	GGTCC	2	10	17198	17207	0 %	20 %	40 %	40 %	169825354
21	NC_010373	TCAGG	2	10	21272	21281	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010373	CTTGC	2	10	22309	22318	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010373	CTATA	2	10	23063	23072	40 %	40 %	0 %	20 %	169825358
24	NC_010373	CTCGC	2	10	23248	23257	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_010373	CTGCC	2	10	24137	24146	0 %	20 %	20 %	60 %	169825359
26	NC_010373	GCCGA	2	10	25054	25063	20 %	0 %	40 %	40 %	169825359
27	NC_010373	AAATC	2	10	26938	26947	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010373	GCCGC	2	10	28906	28915	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_010373	AGCAG	2	10	29132	29141	40 %	0 %	40 %	20 %	169825366
30	NC_010373	GGAGC	2	10	29187	29196	20 %	0 %	60 %	20 %	169825366
31	NC_010373	CAGGG	2	10	29497	29506	20 %	0 %	60 %	20 %	169825366
32	NC_010373	GATCG	2	10	30273	30282	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010373	CGGCT	2	10	31089	31098	0 %	20 %	40 %	40 %	169825368
34	NC_010373	CCGTA	2	10	34268	34277	20 %	20 %	20 %	40 %	169825371
35	NC_010373	CGCGC	2	10	35199	35208	0 %	0 %	40 %	60 %	169825372
36	NC_010373	ACCGC	2	10	35274	35283	20 %	0 %	20 %	60 %	169825372
37	NC_010373	CTGCG	2	10	35381	35390	0 %	20 %	40 %	40 %	169825372
38	NC_010373	CCGCC	2	10	38912	38921	0 %	0 %	20 %	80 %	169825376
39	NC_010373	CGTGC	2	10	40074	40083	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010373	TCGGC	2	10	40397	40406	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_010373	CGGGT	2	10	40849	40858	0 %	20 %	60 %	20 %	169825377
42	NC_010373	TGGGG	2	10	44162	44171	0 %	20 %	80 %	0 %	169825379
43	NC_010373	GAACC	2	10	44853	44862	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010373	GCCCC	2	10	45739	45748	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
45	NC_010373	GAGGG	2	10	45975	45984	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010373	GCCAG	2	10	48413	48422	20 %	0 %	40 %	40 %	169825383
47	NC_010373	CGGCG	2	10	49857	49866	0 %	0 %	60 %	40 %	169825385
48	NC_010373	TCAAA	2	10	54220	54229	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010373	CGGCA	2	10	55908	55917	20 %	0 %	40 %	40 %	169825390
50	NC_010373	AAACA	2	10	57536	57545	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010373	TGGCA	2	10	57578	57587	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.