MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium sp. 4-46 plasmid pM44601

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010373	CACC	2	8	21	28	25 %	0 %	0 %	75 %	169825330
2	NC_010373	CCCG	2	8	487	494	0 %	0 %	25 %	75 %	169825330
3	NC_010373	GCGG	2	8	631	638	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010373	ATCG	2	8	822	829	25 %	25 %	25 %	25 %	169825331
5	NC_010373	GACC	2	8	1103	1110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010373	GGGC	2	8	1585	1592	0 %	0 %	75 %	25 %	169825332
7	NC_010373	TCGT	2	8	1951	1958	0 %	50 %	25 %	25 %	169825333
8	NC_010373	CCGT	2	8	2723	2730	0 %	25 %	25 %	50 %	169825333
9	NC_010373	CGCC	2	8	2737	2744	0 %	0 %	25 %	75 %	169825333
10	NC_010373	CCGC	2	8	2999	3006	0 %	0 %	25 %	75 %	169825333
11	NC_010373	GGCG	2	8	3007	3014	0 %	0 %	75 %	25 %	169825333
12	NC_010373	CTCG	2	8	3085	3092	0 %	25 %	25 %	50 %	169825333
13	NC_010373	CGTT	2	8	3295	3302	0 %	50 %	25 %	25 %	169825334
14	NC_010373	TCGG	2	8	3675	3682	0 %	25 %	50 %	25 %	169825335
15	NC_010373	GAAG	2	8	4084	4091	50 %	0 %	50 %	0 %	169825335
16	NC_010373	CCAT	2	8	4353	4360	25 %	25 %	0 %	50 %	169825336
17	NC_010373	TCGA	2	8	5333	5340	25 %	25 %	25 %	25 %	169825337
18	NC_010373	ATCG	2	8	6155	6162	25 %	25 %	25 %	25 %	169825338
19	NC_010373	GGGC	3	12	6750	6761	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010373	CGGC	2	8	6792	6799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010373	GCCC	2	8	6916	6923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_010373	CTTC	2	8	6944	6951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010373	GGCC	2	8	7052	7059	0 %	0 %	50 %	50 %	169825340
24	NC_010373	GCGG	2	8	7190	7197	0 %	0 %	75 %	25 %	169825340
25	NC_010373	GCTC	2	8	8144	8151	0 %	25 %	25 %	50 %	169825342
26	NC_010373	GCCA	2	8	8394	8401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010373	GGCG	2	8	8969	8976	0 %	0 %	75 %	25 %	169825344
28	NC_010373	GATC	2	8	9249	9256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010373	GAGG	2	8	9334	9341	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010373	TACA	2	8	9663	9670	50 %	25 %	0 %	25 %	169825345
31	NC_010373	CTTG	2	8	10390	10397	0 %	50 %	25 %	25 %	169825346
32	NC_010373	TGGT	2	8	10836	10843	0 %	50 %	50 %	0 %	169825347
33	NC_010373	AGCA	2	8	10848	10855	50 %	0 %	25 %	25 %	169825347
34	NC_010373	GCCC	2	8	11207	11214	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_010373	CGGG	2	8	11810	11817	0 %	0 %	75 %	25 %	169825348
36	NC_010373	GGCT	2	8	12154	12161	0 %	25 %	50 %	25 %	169825349
37	NC_010373	CGGC	2	8	12251	12258	0 %	0 %	50 %	50 %	169825349
38	NC_010373	CGTC	2	8	12723	12730	0 %	25 %	25 %	50 %	169825350
39	NC_010373	GTGG	2	8	12750	12757	0 %	25 %	75 %	0 %	169825350
40	NC_010373	GCCG	2	8	12767	12774	0 %	0 %	50 %	50 %	169825350
41	NC_010373	ATCG	2	8	12964	12971	25 %	25 %	25 %	25 %	169825351
42	NC_010373	TCGA	2	8	13510	13517	25 %	25 %	25 %	25 %	169825351
43	NC_010373	TCGC	2	8	14495	14502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010373	GCGA	2	8	14507	14514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010373	CCCT	2	8	14567	14574	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_010373	GGGT	2	8	16049	16056	0 %	25 %	75 %	0 %	169825353
47	NC_010373	CCCG	2	8	16406	16413	0 %	0 %	25 %	75 %	169825353
48	NC_010373	CGAT	2	8	17145	17152	25 %	25 %	25 %	25 %	169825354
49	NC_010373	TCTG	2	8	17520	17527	0 %	50 %	25 %	25 %	169825354
50	NC_010373	GTGG	2	8	17555	17562	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010373	ACGG	2	8	18457	18464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010373	CAGG	2	8	19029	19036	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010373	GTAG	2	8	20507	20514	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010373	GCCG	2	8	20674	20681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010373	CAAC	2	8	20883	20890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010373	TGCG	2	8	21651	21658	0 %	25 %	50 %	25 %	169825357
57	NC_010373	AGGG	2	8	21918	21925	25 %	0 %	75 %	0 %	169825357
58	NC_010373	GCCA	2	8	22390	22397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010373	CTTT	2	8	22408	22415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010373	TGCG	2	8	22418	22425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010373	CCTG	2	8	22910	22917	0 %	25 %	25 %	50 %	169825358
62	NC_010373	GGGT	2	8	23264	23271	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010373	TACC	2	8	23452	23459	25 %	25 %	0 %	50 %	169825359
64	NC_010373	TTGT	2	8	23911	23918	0 %	75 %	25 %	0 %	169825359
65	NC_010373	CGGC	2	8	24038	24045	0 %	0 %	50 %	50 %	169825359
66	NC_010373	CACG	2	8	24174	24181	25 %	0 %	25 %	50 %	169825359
67	NC_010373	CGGT	2	8	24342	24349	0 %	25 %	50 %	25 %	169825359
68	NC_010373	GGCG	2	8	24804	24811	0 %	0 %	75 %	25 %	169825359
69	NC_010373	ACCG	2	8	25024	25031	25 %	0 %	25 %	50 %	169825359
70	NC_010373	GTCC	2	8	25182	25189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010373	TGAG	2	8	25202	25209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010373	GCGG	2	8	25416	25423	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010373	AGGT	2	8	25670	25677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010373	CGCT	2	8	25739	25746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010373	TTCC	2	8	25917	25924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010373	CCTC	2	8	26056	26063	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_010373	CCAG	2	8	26638	26645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010373	TGGG	2	8	26883	26890	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010373	TGGT	2	8	27067	27074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010373	CGCT	2	8	27147	27154	0 %	25 %	25 %	50 %	169825361
81	NC_010373	TCCG	2	8	27460	27467	0 %	25 %	25 %	50 %	169825362
82	NC_010373	GCCA	2	8	27630	27637	25 %	0 %	25 %	50 %	169825362
83	NC_010373	GGTG	2	8	27825	27832	0 %	25 %	75 %	0 %	169825363
84	NC_010373	GCCG	2	8	28338	28345	0 %	0 %	50 %	50 %	169825364
85	NC_010373	CGAC	2	8	30112	30119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010373	CGGA	2	8	30540	30547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010373	CCTC	2	8	30979	30986	0 %	25 %	0 %	75 %	169825368
88	NC_010373	GGGC	2	8	31558	31565	0 %	0 %	75 %	25 %	169825369
89	NC_010373	GCCG	2	8	31889	31896	0 %	0 %	50 %	50 %	169825369
90	NC_010373	TTCC	2	8	31926	31933	0 %	50 %	0 %	50 %	169825369
91	NC_010373	CGAG	2	8	32127	32134	25 %	0 %	50 %	25 %	169825369
92	NC_010373	CGGT	2	8	32413	32420	0 %	25 %	50 %	25 %	169825370
93	NC_010373	CGGG	2	8	32540	32547	0 %	0 %	75 %	25 %	169825370
94	NC_010373	GGCA	2	8	32612	32619	25 %	0 %	50 %	25 %	169825370
95	NC_010373	GCTG	2	8	32801	32808	0 %	25 %	50 %	25 %	169825370
96	NC_010373	GACG	2	8	33446	33453	25 %	0 %	50 %	25 %	169825370
97	NC_010373	GGCG	2	8	33605	33612	0 %	0 %	75 %	25 %	169825370
98	NC_010373	CTCC	2	8	33688	33695	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_010373	GGGC	2	8	33931	33938	0 %	0 %	75 %	25 %	169825371
100	NC_010373	CCGG	2	8	34195	34202	0 %	0 %	50 %	50 %	169825371
101	NC_010373	GCGT	2	8	35138	35145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010373	CGAG	2	8	35163	35170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010373	GGCT	2	8	35249	35256	0 %	25 %	50 %	25 %	169825372
104	NC_010373	GAGG	2	8	35404	35411	25 %	0 %	75 %	0 %	169825372
105	NC_010373	CGGG	2	8	35566	35573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010373	CGGT	2	8	36455	36462	0 %	25 %	50 %	25 %	169825374
107	NC_010373	GTCG	2	8	36615	36622	0 %	25 %	50 %	25 %	169825374
108	NC_010373	GCGG	2	8	36698	36705	0 %	0 %	75 %	25 %	169825374
109	NC_010373	CCCG	2	8	37124	37131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_010373	CCGC	2	8	37542	37549	0 %	0 %	25 %	75 %	169825375
111	NC_010373	CGCA	2	8	38383	38390	25 %	0 %	25 %	50 %	169825376
112	NC_010373	CCGT	2	8	38680	38687	0 %	25 %	25 %	50 %	169825376
113	NC_010373	TCGT	2	8	39601	39608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010373	CGAG	2	8	40464	40471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010373	ATCC	2	8	41257	41264	25 %	25 %	0 %	50 %	169825377
116	NC_010373	GGCG	2	8	41751	41758	0 %	0 %	75 %	25 %	169825378
117	NC_010373	CTGC	2	8	41831	41838	0 %	25 %	25 %	50 %	169825378
118	NC_010373	GCCG	2	8	43843	43850	0 %	0 %	50 %	50 %	169825379
119	NC_010373	CGGC	2	8	44287	44294	0 %	0 %	50 %	50 %	169825379
120	NC_010373	CGTG	2	8	44307	44314	0 %	25 %	50 %	25 %	169825379
121	NC_010373	CCCG	2	8	44528	44535	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_010373	CGGC	2	8	45821	45828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010373	GAAG	2	8	46032	46039	50 %	0 %	50 %	0 %	169825381
124	NC_010373	GGCC	2	8	46133	46140	0 %	0 %	50 %	50 %	169825381
125	NC_010373	CCGC	2	8	46545	46552	0 %	0 %	25 %	75 %	169825381
126	NC_010373	CCCG	2	8	46738	46745	0 %	0 %	25 %	75 %	169825381
127	NC_010373	CAGC	2	8	47083	47090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010373	GCCG	2	8	47258	47265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010373	CGCC	2	8	49449	49456	0 %	0 %	25 %	75 %	169825385
130	NC_010373	GCCG	2	8	50424	50431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010373	ACCA	2	8	50454	50461	50 %	0 %	0 %	50 %	169825386
132	NC_010373	GCCC	2	8	51315	51322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_010373	GGAT	2	8	51699	51706	25 %	25 %	50 %	0 %	169825387
134	NC_010373	CGCC	2	8	52366	52373	0 %	0 %	25 %	75 %	169825388
135	NC_010373	ACCG	2	8	52494	52501	25 %	0 %	25 %	50 %	169825388
136	NC_010373	CTGC	2	8	52889	52896	0 %	25 %	25 %	50 %	169825388
137	NC_010373	TCGT	2	8	53031	53038	0 %	50 %	25 %	25 %	169825388
138	NC_010373	CCCG	2	8	53054	53061	0 %	0 %	25 %	75 %	169825388
139	NC_010373	GCCG	2	8	53135	53142	0 %	0 %	50 %	50 %	169825388
140	NC_010373	TCGA	2	8	53484	53491	25 %	25 %	25 %	25 %	169825388
141	NC_010373	TCGC	2	8	53649	53656	0 %	25 %	25 %	50 %	169825388
142	NC_010373	TTGG	2	8	54249	54256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010373	CTGC	2	8	54519	54526	0 %	25 %	25 %	50 %	169825389
144	NC_010373	GCCG	2	8	55115	55122	0 %	0 %	50 %	50 %	169825390
145	NC_010373	CGTT	2	8	55348	55355	0 %	50 %	25 %	25 %	169825390
146	NC_010373	AGCA	2	8	55359	55366	50 %	0 %	25 %	25 %	169825390
147	NC_010373	CGAC	2	8	55378	55385	25 %	0 %	25 %	50 %	169825390
148	NC_010373	TTCG	2	8	56086	56093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010373	CGAT	2	8	56114	56121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010373	GGAT	2	8	56430	56437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010373	CGAG	2	8	56843	56850	25 %	0 %	50 %	25 %	169825391
152	NC_010373	CGAC	2	8	57062	57069	25 %	0 %	25 %	50 %	169825391
153	NC_010373	GAGC	2	8	57339	57346	25 %	0 %	50 %	25 %	169825391
154	NC_010373	TGGC	2	8	57412	57419	0 %	25 %	50 %	25 %	169825391
155	NC_010373	TTCC	2	8	57595	57602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_010373	GCCA	2	8	57679	57686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.