MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010369	AGCG	2	8	507	514	25 %	0 %	50 %	25 %	169237603
2	NC_010369	TTTC	2	8	673	680	0 %	75 %	0 %	25 %	169237603
3	NC_010369	TCGA	2	8	746	753	25 %	25 %	25 %	25 %	169237603
4	NC_010369	CGTC	2	8	817	824	0 %	25 %	25 %	50 %	169237603
5	NC_010369	TGCG	2	8	2072	2079	0 %	25 %	50 %	25 %	169237604
6	NC_010369	GCAG	2	8	2687	2694	25 %	0 %	50 %	25 %	169237605
7	NC_010369	TGGC	2	8	3749	3756	0 %	25 %	50 %	25 %	169237607
8	NC_010369	GCCT	2	8	4143	4150	0 %	25 %	25 %	50 %	169237607
9	NC_010369	CATT	3	12	4215	4226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010369	ATGA	2	8	4285	4292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010369	AATG	2	8	4340	4347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010369	GAAG	2	8	4652	4659	50 %	0 %	50 %	0 %	169237608
13	NC_010369	AGTG	2	8	4661	4668	25 %	25 %	50 %	0 %	169237608
14	NC_010369	TTGA	2	8	4718	4725	25 %	50 %	25 %	0 %	169237609
15	NC_010369	AGCC	2	8	4876	4883	25 %	0 %	25 %	50 %	169237609
16	NC_010369	TTCC	2	8	5716	5723	0 %	50 %	0 %	50 %	169237610
17	NC_010369	AGAC	2	8	6790	6797	50 %	0 %	25 %	25 %	169237611
18	NC_010369	ACAA	2	8	6804	6811	75 %	0 %	0 %	25 %	169237611
19	NC_010369	AGGC	2	8	7177	7184	25 %	0 %	50 %	25 %	169237611
20	NC_010369	CGGA	2	8	7393	7400	25 %	0 %	50 %	25 %	169237611
21	NC_010369	CCGG	2	8	7454	7461	0 %	0 %	50 %	50 %	169237611
22	NC_010369	GGAT	2	8	7574	7581	25 %	25 %	50 %	0 %	169237611
23	NC_010369	CGCC	2	8	8200	8207	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_010369	GCTA	2	8	8315	8322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010369	GTAG	2	8	8341	8348	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010369	GAAG	2	8	8408	8415	50 %	0 %	50 %	0 %	169237612
27	NC_010369	ACCA	2	8	8505	8512	50 %	0 %	0 %	50 %	169237612
28	NC_010369	AGAT	2	8	10260	10267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010369	CGAC	3	12	10424	10435	25 %	0 %	25 %	50 %	169237614
30	NC_010369	CAGC	2	8	10464	10471	25 %	0 %	25 %	50 %	169237614
31	NC_010369	CCCA	2	8	11615	11622	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_010369	AAAC	2	8	11655	11662	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010369	ACTC	2	8	11678	11685	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010369	GGTC	2	8	11748	11755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010369	AATT	2	8	11957	11964	50 %	50 %	0 %	0 %	169237616
36	NC_010369	ACGT	2	8	12811	12818	25 %	25 %	25 %	25 %	169237617
37	NC_010369	GTGG	2	8	12983	12990	0 %	25 %	75 %	0 %	169237617
38	NC_010369	TCGC	2	8	14123	14130	0 %	25 %	25 %	50 %	169237618
39	NC_010369	CGTC	2	8	14203	14210	0 %	25 %	25 %	50 %	169237618
40	NC_010369	AGGC	2	8	14294	14301	25 %	0 %	50 %	25 %	169237618
41	NC_010369	CGAT	2	8	14417	14424	25 %	25 %	25 %	25 %	169237618
42	NC_010369	CGCC	2	8	14650	14657	0 %	0 %	25 %	75 %	169237618
43	NC_010369	TGCT	2	8	14788	14795	0 %	50 %	25 %	25 %	169237618
44	NC_010369	AGTA	2	8	14853	14860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010369	GCCA	2	8	14883	14890	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010369	GAGT	2	8	14985	14992	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010369	GGGC	2	8	15019	15026	0 %	0 %	75 %	25 %	169237619
48	NC_010369	GCCG	2	8	15573	15580	0 %	0 %	50 %	50 %	169237620
49	NC_010369	AGCC	2	8	15686	15693	25 %	0 %	25 %	50 %	169237620
50	NC_010369	GAAG	2	8	16827	16834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010369	TTGA	2	8	16986	16993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010369	GGAT	2	8	17465	17472	25 %	25 %	50 %	0 %	169237621
53	NC_010369	GCCG	2	8	17544	17551	0 %	0 %	50 %	50 %	169237621
54	NC_010369	CAGG	2	8	17610	17617	25 %	0 %	50 %	25 %	169237622
55	NC_010369	CGAC	2	8	17633	17640	25 %	0 %	25 %	50 %	169237622
56	NC_010369	ACGG	2	8	18742	18749	25 %	0 %	50 %	25 %	169237623
57	NC_010369	GATG	2	8	18849	18856	25 %	25 %	50 %	0 %	169237623
58	NC_010369	AGCG	2	8	20043	20050	25 %	0 %	50 %	25 %	169237625
59	NC_010369	GGTC	2	8	20194	20201	0 %	25 %	50 %	25 %	169237625
60	NC_010369	ATCG	2	8	21101	21108	25 %	25 %	25 %	25 %	169237626
61	NC_010369	AGCG	2	8	21235	21242	25 %	0 %	50 %	25 %	169237626
62	NC_010369	GACG	2	8	21442	21449	25 %	0 %	50 %	25 %	169237626
63	NC_010369	CCGG	2	8	21570	21577	0 %	0 %	50 %	50 %	169237626
64	NC_010369	ATCG	2	8	21685	21692	25 %	25 %	25 %	25 %	169237626
65	NC_010369	TCGC	2	8	22215	22222	0 %	25 %	25 %	50 %	169237626
66	NC_010369	GATC	2	8	23889	23896	25 %	25 %	25 %	25 %	169237627
67	NC_010369	CGAC	2	8	24254	24261	25 %	0 %	25 %	50 %	169237627
68	NC_010369	GGAG	2	8	24400	24407	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010369	AGTT	2	8	24814	24821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010369	CCAC	2	8	24953	24960	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_010369	CCAT	2	8	25030	25037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010369	GTAG	2	8	25361	25368	25 %	25 %	50 %	0 %	169237628
73	NC_010369	TCTG	2	8	25476	25483	0 %	50 %	25 %	25 %	169237628
74	NC_010369	ACGG	2	8	27387	27394	25 %	0 %	50 %	25 %	169237630
75	NC_010369	CTCG	2	8	28331	28338	0 %	25 %	25 %	50 %	169237631
76	NC_010369	ATAG	2	8	28790	28797	50 %	25 %	25 %	0 %	169237632
77	NC_010369	TGAG	2	8	28901	28908	25 %	25 %	50 %	0 %	169237632
78	NC_010369	ATCC	2	8	29084	29091	25 %	25 %	0 %	50 %	169237632
79	NC_010369	CAAT	2	8	30480	30487	50 %	25 %	0 %	25 %	169237634
80	NC_010369	TTCC	2	8	30498	30505	0 %	50 %	0 %	50 %	169237634
81	NC_010369	TGGC	2	8	30849	30856	0 %	25 %	50 %	25 %	169237634
82	NC_010369	GCCG	2	8	31712	31719	0 %	0 %	50 %	50 %	169237637
83	NC_010369	GGTC	2	8	31824	31831	0 %	25 %	50 %	25 %	169237637
84	NC_010369	CAGC	2	8	32235	32242	25 %	0 %	25 %	50 %	169237638
85	NC_010369	CGTC	2	8	32370	32377	0 %	25 %	25 %	50 %	169237638
86	NC_010369	CCCA	2	8	32825	32832	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_010369	CCAC	2	8	32881	32888	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_010369	CGGG	2	8	33055	33062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010369	GCTT	2	8	33117	33124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010369	CCGA	2	8	33231	33238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010369	GGCG	2	8	33811	33818	0 %	0 %	75 %	25 %	169237639
92	NC_010369	GCGG	2	8	33902	33909	0 %	0 %	75 %	25 %	169237639
93	NC_010369	CGAC	2	8	34028	34035	25 %	0 %	25 %	50 %	169237639
94	NC_010369	GTTC	2	8	34641	34648	0 %	50 %	25 %	25 %	169237639
95	NC_010369	GCAC	2	8	34815	34822	25 %	0 %	25 %	50 %	169237639
96	NC_010369	GGTC	2	8	35094	35101	0 %	25 %	50 %	25 %	169237639
97	NC_010369	CATC	2	8	35517	35524	25 %	25 %	0 %	50 %	169237640
98	NC_010369	TTTC	2	8	36052	36059	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010369	AAGT	2	8	36112	36119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010369	ATGG	2	8	36125	36132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010369	TGGT	2	8	36326	36333	0 %	50 %	50 %	0 %	169237641
102	NC_010369	ACGT	2	8	36770	36777	25 %	25 %	25 %	25 %	169237641
103	NC_010369	CTTC	2	8	37348	37355	0 %	50 %	0 %	50 %	169237641
104	NC_010369	ACGT	2	8	37850	37857	25 %	25 %	25 %	25 %	169237641
105	NC_010369	CGAC	2	8	38109	38116	25 %	0 %	25 %	50 %	169237642
106	NC_010369	GACA	2	8	38287	38294	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010369	GGTT	2	8	38337	38344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010369	CGAC	2	8	38793	38800	25 %	0 %	25 %	50 %	169237644
109	NC_010369	ACGA	2	8	38936	38943	50 %	0 %	25 %	25 %	169237644
110	NC_010369	CGAA	2	8	38964	38971	50 %	0 %	25 %	25 %	169237644
111	NC_010369	CCGG	2	8	38978	38985	0 %	0 %	50 %	50 %	169237644
112	NC_010369	CAGG	2	8	39275	39282	25 %	0 %	50 %	25 %	169237645
113	NC_010369	GGAT	2	8	39296	39303	25 %	25 %	50 %	0 %	169237645
114	NC_010369	TCGT	2	8	39602	39609	0 %	50 %	25 %	25 %	169237645
115	NC_010369	TCGA	2	8	39924	39931	25 %	25 %	25 %	25 %	169237645
116	NC_010369	TTCG	2	8	39981	39988	0 %	50 %	25 %	25 %	169237645
117	NC_010369	ACGC	2	8	40048	40055	25 %	0 %	25 %	50 %	169237645
118	NC_010369	ACGC	2	8	40156	40163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010369	CGAT	2	8	40165	40172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010369	TCAG	2	8	41133	41140	25 %	25 %	25 %	25 %	169237648
121	NC_010369	TTCC	2	8	42372	42379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010369	AAGC	2	8	42582	42589	50 %	0 %	25 %	25 %	169237649
123	NC_010369	TCAC	2	8	42720	42727	25 %	25 %	0 %	50 %	169237649
124	NC_010369	GAGT	2	8	42889	42896	25 %	25 %	50 %	0 %	169237650
125	NC_010369	CCGC	2	8	42903	42910	0 %	0 %	25 %	75 %	169237650
126	NC_010369	CGGT	2	8	42950	42957	0 %	25 %	50 %	25 %	169237650
127	NC_010369	ACGC	2	8	43636	43643	25 %	0 %	25 %	50 %	169237651
128	NC_010369	ATCG	2	8	43835	43842	25 %	25 %	25 %	25 %	169237651
129	NC_010369	CCGT	2	8	44824	44831	0 %	25 %	25 %	50 %	169237653
130	NC_010369	GCTC	2	8	45086	45093	0 %	25 %	25 %	50 %	169237653
131	NC_010369	TTCT	2	8	45284	45291	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010369	GAGC	2	8	45328	45335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010369	CTCG	2	8	45520	45527	0 %	25 %	25 %	50 %	169237654
134	NC_010369	GACC	2	8	45601	45608	25 %	0 %	25 %	50 %	169237654
135	NC_010369	CGAT	2	8	45675	45682	25 %	25 %	25 %	25 %	169237654
136	NC_010369	CCGC	2	8	45988	45995	0 %	0 %	25 %	75 %	169237654
137	NC_010369	CTCG	2	8	46115	46122	0 %	25 %	25 %	50 %	169237654
138	NC_010369	CCGC	2	8	46242	46249	0 %	0 %	25 %	75 %	169237654
139	NC_010369	CTCG	2	8	46415	46422	0 %	25 %	25 %	50 %	169237655
140	NC_010369	GCGA	2	8	46448	46455	25 %	0 %	50 %	25 %	169237655
141	NC_010369	AGCG	2	8	46541	46548	25 %	0 %	50 %	25 %	169237655
142	NC_010369	GAGT	2	8	46598	46605	25 %	25 %	50 %	0 %	169237655
143	NC_010369	CCCG	2	8	46616	46623	0 %	0 %	25 %	75 %	169237655
144	NC_010369	GGTC	2	8	46767	46774	0 %	25 %	50 %	25 %	169237655
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