MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 3275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010369	TCT	2	6	82	87	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237603
2	NC_010369	CGG	2	6	116	121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237603
3	NC_010369	GGA	2	6	154	159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237603
4	NC_010369	CGC	2	6	185	190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237603
5	NC_010369	CAG	2	6	263	268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237603
6	NC_010369	CGC	2	6	278	283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237603
7	NC_010369	CAG	2	6	287	292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237603
8	NC_010369	CAC	2	6	299	304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237603
9	NC_010369	TCC	2	6	405	410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237603
10	NC_010369	GAA	2	6	413	418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237603
11	NC_010369	GTC	2	6	455	460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237603
12	NC_010369	CGA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237603
13	NC_010369	ATC	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237603
14	NC_010369	TCC	2	6	648	653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237603
15	NC_010369	CGT	2	6	700	705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237603
16	NC_010369	GCG	2	6	725	730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237603
17	NC_010369	CTC	2	6	890	895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237603
18	NC_010369	TCA	2	6	912	917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237603
19	NC_010369	ATC	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237603
20	NC_010369	TCG	2	6	1014	1019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237603
21	NC_010369	TCA	2	6	1101	1106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237603
22	NC_010369	AGC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237603
23	NC_010369	GCG	2	6	1158	1163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237603
24	NC_010369	GAG	2	6	1299	1304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010369	TCC	2	6	1326	1331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010369	GCT	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010369	GTA	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010369	GTC	2	6	1441	1446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010369	CGT	2	6	1476	1481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010369	AGT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010369	TCA	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010369	AGC	2	6	1586	1591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010369	CAG	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010369	ACA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010369	CGG	2	6	1781	1786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010369	CAA	2	6	1891	1896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010369	TTG	2	6	1917	1922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010369	ATC	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010369	CTG	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237604
40	NC_010369	TCG	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237604
41	NC_010369	GAC	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237604
42	NC_010369	CAG	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237604
43	NC_010369	ACA	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237604
44	NC_010369	CTC	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237604
45	NC_010369	ACC	2	6	2227	2232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237604
46	NC_010369	CTG	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237604
47	NC_010369	GCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237604
48	NC_010369	GCA	2	6	2271	2276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237604
49	NC_010369	ATC	2	6	2355	2360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237604
50	NC_010369	CCG	2	6	2401	2406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237604
51	NC_010369	GAG	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010369	TAT	2	6	2586	2591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169237605
53	NC_010369	AAG	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237605
54	NC_010369	AGA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010369	TCG	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237606
56	NC_010369	TCG	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237606
57	NC_010369	GGT	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237606
58	NC_010369	TCA	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237606
59	NC_010369	CGT	3	9	3018	3026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237606
60	NC_010369	CCG	2	6	3127	3132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237606
61	NC_010369	GCT	2	6	3159	3164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237606
62	NC_010369	GAC	2	6	3170	3175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237606
63	NC_010369	TGT	2	6	3211	3216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237606
64	NC_010369	GTC	2	6	3224	3229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237606
65	NC_010369	GAC	2	6	3230	3235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237606
66	NC_010369	TCC	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237606
67	NC_010369	CTT	2	6	3285	3290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237606
68	NC_010369	CTC	2	6	3369	3374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237607
69	NC_010369	GGT	2	6	3440	3445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237607
70	NC_010369	TCG	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237607
71	NC_010369	CCG	2	6	3590	3595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237607
72	NC_010369	CGG	2	6	3662	3667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237607
73	NC_010369	CGT	2	6	3773	3778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237607
74	NC_010369	TCG	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237607
75	NC_010369	GGA	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237607
76	NC_010369	GCA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237607
77	NC_010369	TGT	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237607
78	NC_010369	GAT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237607
79	NC_010369	TCG	2	6	3949	3954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237607
80	NC_010369	TGT	2	6	3992	3997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237607
81	NC_010369	GAC	2	6	4068	4073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237607
82	NC_010369	TGT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237607
83	NC_010369	ACC	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010369	GTG	2	6	4242	4247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010369	AAT	2	6	4259	4264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010369	ACT	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010369	TGA	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010369	CGT	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010369	AGC	2	6	4455	4460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010369	GCC	2	6	4573	4578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237608
91	NC_010369	CGT	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237608
92	NC_010369	GAA	2	6	4616	4621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237608
93	NC_010369	CGA	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237608
94	NC_010369	GTT	2	6	4709	4714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237609
95	NC_010369	ATG	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237609
96	NC_010369	CGG	2	6	4781	4786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237609
97	NC_010369	TCA	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237609
98	NC_010369	CCG	2	6	4861	4866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237609
99	NC_010369	TAA	2	6	4931	4936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237609
100	NC_010369	CTA	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010369	CGA	3	9	5247	5255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
102	NC_010369	TCA	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237610
103	NC_010369	TTC	2	6	5315	5320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237610
104	NC_010369	TCG	2	6	5330	5335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237610
105	NC_010369	CCG	2	6	5447	5452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237610
106	NC_010369	CCG	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237610
107	NC_010369	ACG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
108	NC_010369	CAG	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
109	NC_010369	TGC	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237610
110	NC_010369	CCG	2	6	5679	5684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237610
111	NC_010369	GCA	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
112	NC_010369	GAC	3	9	5788	5796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
113	NC_010369	CAG	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
114	NC_010369	GAT	2	6	5908	5913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237610
115	NC_010369	GAC	2	6	5929	5934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
116	NC_010369	GTC	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237610
117	NC_010369	TGA	2	6	5955	5960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237610
118	NC_010369	CGA	2	6	5982	5987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
119	NC_010369	GAC	2	6	6049	6054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
120	NC_010369	CGA	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
121	NC_010369	GAA	2	6	6120	6125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237610
122	NC_010369	GAG	2	6	6151	6156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237610
123	NC_010369	CGG	2	6	6259	6264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237610
124	NC_010369	TAC	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237610
125	NC_010369	CGA	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
126	NC_010369	ACT	2	6	6643	6648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010369	GTG	3	9	6733	6741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010369	GGA	2	6	6867	6872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237611
129	NC_010369	TGG	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237611
130	NC_010369	TGA	2	6	7052	7057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237611
131	NC_010369	CAA	2	6	7253	7258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237611
132	NC_010369	GTG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237611
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496	NC_010369	TAC	2	6	29452	29457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
497	NC_010369	AGA	2	6	29472	29477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
498	NC_010369	GAC	2	6	29571	29576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237634
499	NC_010369	GGA	2	6	29606	29611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237634
500	NC_010369	CGA	2	6	29663	29668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237634

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