MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 2596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010369	TCT	2	6	82	87	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237603
2	NC_010369	CGG	2	6	116	121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237603
3	NC_010369	GGA	2	6	154	159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237603
4	NC_010369	CGC	2	6	185	190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237603
5	NC_010369	CAG	2	6	263	268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237603
6	NC_010369	CGC	2	6	278	283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237603
7	NC_010369	CAG	2	6	287	292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237603
8	NC_010369	CAC	2	6	299	304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237603
9	NC_010369	TCC	2	6	405	410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237603
10	NC_010369	GAA	2	6	413	418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237603
11	NC_010369	GTC	2	6	455	460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237603
12	NC_010369	CGA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237603
13	NC_010369	ATC	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237603
14	NC_010369	TCC	2	6	648	653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237603
15	NC_010369	CGT	2	6	700	705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237603
16	NC_010369	GCG	2	6	725	730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237603
17	NC_010369	CTC	2	6	890	895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237603
18	NC_010369	TCA	2	6	912	917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237603
19	NC_010369	ATC	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237603
20	NC_010369	TCG	2	6	1014	1019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237603
21	NC_010369	TCA	2	6	1101	1106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237603
22	NC_010369	AGC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237603
23	NC_010369	GCG	2	6	1158	1163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237603
24	NC_010369	CTG	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237604
25	NC_010369	TCG	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237604
26	NC_010369	GAC	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237604
27	NC_010369	CAG	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237604
28	NC_010369	ACA	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237604
29	NC_010369	CTC	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237604
30	NC_010369	ACC	2	6	2227	2232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237604
31	NC_010369	CTG	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237604
32	NC_010369	GCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237604
33	NC_010369	GCA	2	6	2271	2276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237604
34	NC_010369	ATC	2	6	2355	2360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237604
35	NC_010369	CCG	2	6	2401	2406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237604
36	NC_010369	TAT	2	6	2586	2591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169237605
37	NC_010369	AAG	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237605
38	NC_010369	TCG	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237606
39	NC_010369	TCG	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237606
40	NC_010369	GGT	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237606
41	NC_010369	TCA	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237606
42	NC_010369	CGT	3	9	3018	3026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237606
43	NC_010369	CCG	2	6	3127	3132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237606
44	NC_010369	GCT	2	6	3159	3164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237606
45	NC_010369	GAC	2	6	3170	3175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237606
46	NC_010369	TGT	2	6	3211	3216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237606
47	NC_010369	GTC	2	6	3224	3229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237606
48	NC_010369	GAC	2	6	3230	3235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237606
49	NC_010369	TCC	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237606
50	NC_010369	CTT	2	6	3285	3290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237606
51	NC_010369	CTC	2	6	3369	3374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237607
52	NC_010369	GGT	2	6	3440	3445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237607
53	NC_010369	TCG	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237607
54	NC_010369	CCG	2	6	3590	3595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237607
55	NC_010369	CGG	2	6	3662	3667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237607
56	NC_010369	CGT	2	6	3773	3778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237607
57	NC_010369	TCG	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237607
58	NC_010369	GGA	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237607
59	NC_010369	GCA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237607
60	NC_010369	TGT	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237607
61	NC_010369	GAT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237607
62	NC_010369	TCG	2	6	3949	3954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237607
63	NC_010369	TGT	2	6	3992	3997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237607
64	NC_010369	GAC	2	6	4068	4073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237607
65	NC_010369	TGT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237607
66	NC_010369	GCC	2	6	4573	4578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237608
67	NC_010369	CGT	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237608
68	NC_010369	GAA	2	6	4616	4621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237608
69	NC_010369	CGA	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237608
70	NC_010369	GTT	2	6	4709	4714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237609
71	NC_010369	ATG	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237609
72	NC_010369	CGG	2	6	4781	4786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237609
73	NC_010369	TCA	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237609
74	NC_010369	CCG	2	6	4861	4866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237609
75	NC_010369	TAA	2	6	4931	4936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237609
76	NC_010369	CGA	3	9	5247	5255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
77	NC_010369	TCA	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237610
78	NC_010369	TTC	2	6	5315	5320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237610
79	NC_010369	TCG	2	6	5330	5335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237610
80	NC_010369	CCG	2	6	5447	5452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237610
81	NC_010369	CCG	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237610
82	NC_010369	ACG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
83	NC_010369	CAG	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
84	NC_010369	TGC	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237610
85	NC_010369	CCG	2	6	5679	5684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237610
86	NC_010369	GCA	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
87	NC_010369	GAC	3	9	5788	5796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
88	NC_010369	CAG	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
89	NC_010369	GAT	2	6	5908	5913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237610
90	NC_010369	GAC	2	6	5929	5934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
91	NC_010369	GTC	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237610
92	NC_010369	TGA	2	6	5955	5960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237610
93	NC_010369	CGA	2	6	5982	5987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
94	NC_010369	GAC	2	6	6049	6054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
95	NC_010369	CGA	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
96	NC_010369	GAA	2	6	6120	6125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237610
97	NC_010369	GAG	2	6	6151	6156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237610
98	NC_010369	CGG	2	6	6259	6264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237610
99	NC_010369	TAC	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237610
100	NC_010369	CGA	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237610
101	NC_010369	GGA	2	6	6867	6872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237611
102	NC_010369	TGG	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237611
103	NC_010369	TGA	2	6	7052	7057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237611
104	NC_010369	CAA	2	6	7253	7258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237611
105	NC_010369	GTG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237611
106	NC_010369	AAC	2	6	7354	7359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237611
107	NC_010369	GAA	2	6	7407	7412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237611
108	NC_010369	ACC	2	6	7537	7542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237611
109	NC_010369	TGG	2	6	7644	7649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237611
110	NC_010369	GTG	2	6	7675	7680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237611
111	NC_010369	ACA	2	6	8395	8400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237612
112	NC_010369	CGA	2	6	8423	8428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237612
113	NC_010369	AAT	2	6	8451	8456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237612
114	NC_010369	GAT	2	6	8475	8480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237612
115	NC_010369	AAT	2	6	8586	8591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237612
116	NC_010369	CGG	2	6	8621	8626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237612
117	NC_010369	TAA	2	6	8696	8701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237612
118	NC_010369	CTT	2	6	9253	9258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237613
119	NC_010369	AGC	2	6	9279	9284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237613
120	NC_010369	CGC	2	6	9320	9325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237613
121	NC_010369	GTC	3	9	9332	9340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237613
122	NC_010369	ACC	2	6	9527	9532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237613
123	NC_010369	GAG	2	6	9572	9577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237613
124	NC_010369	GCG	2	6	9609	9614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237613
125	NC_010369	GCT	2	6	9682	9687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237613
126	NC_010369	CGA	2	6	9832	9837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237613
127	NC_010369	TCG	2	6	9846	9851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237613
128	NC_010369	ATA	2	6	9876	9881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237613
129	NC_010369	TAC	2	6	10027	10032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237613
130	NC_010369	TCA	2	6	10146	10151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237613
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254	NC_010369	ACC	2	6	19926	19931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237625
255	NC_010369	GAC	2	6	19988	19993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237625
256	NC_010369	CGC	3	9	20079	20087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237625
257	NC_010369	AAG	2	6	20098	20103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237625
258	NC_010369	CGG	2	6	20162	20167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237625
259	NC_010369	AAG	2	6	20238	20243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237625
260	NC_010369	ACG	2	6	20352	20357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237625
261	NC_010369	GAC	2	6	20490	20495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237625
262	NC_010369	CAC	2	6	20512	20517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237625
263	NC_010369	CAC	2	6	20565	20570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237625
264	NC_010369	GAC	2	6	20864	20869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
265	NC_010369	CGC	2	6	20950	20955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237626
266	NC_010369	GTC	2	6	21020	21025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237626
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270	NC_010369	GCC	2	6	21353	21358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237626
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273	NC_010369	CAG	2	6	21497	21502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
274	NC_010369	CGA	2	6	21586	21591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
275	NC_010369	TTC	2	6	21602	21607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237626
276	NC_010369	ACG	2	6	21798	21803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
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278	NC_010369	CAT	2	6	21889	21894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237626
279	NC_010369	CGA	2	6	21949	21954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
280	NC_010369	CGA	2	6	21982	21987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
281	NC_010369	ATC	2	6	22019	22024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237626
282	NC_010369	GGC	2	6	22045	22050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237626
283	NC_010369	GAC	2	6	22073	22078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
284	NC_010369	TCG	2	6	22137	22142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237626
285	NC_010369	CTG	2	6	22229	22234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237626
286	NC_010369	CGG	2	6	22258	22263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237626
287	NC_010369	GTC	2	6	22271	22276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237626
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291	NC_010369	CGA	3	9	22483	22491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
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369	NC_010369	GAC	2	6	29571	29576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237634
370	NC_010369	GGA	2	6	29606	29611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237634
371	NC_010369	CGA	2	6	29663	29668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237634
372	NC_010369	GTC	2	6	29694	29699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237634
373	NC_010369	TCG	3	9	29719	29727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237634
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375	NC_010369	CAG	2	6	29877	29882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237634
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497	NC_010369	CGG	2	6	36667	36672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237641
498	NC_010369	CGT	2	6	36754	36759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237641
499	NC_010369	TTC	2	6	36800	36805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237641
500	NC_010369	GCA	2	6	36840	36845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237641

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