MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 369

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010369	GA	3	6	1090	1095	50 %	0 %	50 %	0 %	169237603
2	NC_010369	TC	3	6	1621	1626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010369	GA	3	6	1639	1644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010369	AC	3	6	2383	2388	50 %	0 %	0 %	50 %	169237604
5	NC_010369	CT	3	6	3248	3253	0 %	50 %	0 %	50 %	169237606
6	NC_010369	CG	3	6	3563	3568	0 %	0 %	50 %	50 %	169237607
7	NC_010369	GA	3	6	4804	4809	50 %	0 %	50 %	0 %	169237609
8	NC_010369	CT	3	6	5853	5858	0 %	50 %	0 %	50 %	169237610
9	NC_010369	TC	3	6	5865	5870	0 %	50 %	0 %	50 %	169237610
10	NC_010369	CG	3	6	6180	6185	0 %	0 %	50 %	50 %	169237610
11	NC_010369	CA	3	6	7478	7483	50 %	0 %	0 %	50 %	169237611
12	NC_010369	CA	3	6	7708	7713	50 %	0 %	0 %	50 %	169237611
13	NC_010369	AC	3	6	8186	8191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010369	AG	3	6	9246	9251	50 %	0 %	50 %	0 %	169237613
15	NC_010369	TA	3	6	11856	11861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010369	TC	3	6	11903	11908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010369	CA	3	6	12194	12199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010369	AG	3	6	13396	13401	50 %	0 %	50 %	0 %	169237617
19	NC_010369	GT	3	6	13838	13843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010369	AG	3	6	14047	14052	50 %	0 %	50 %	0 %	169237618
21	NC_010369	GC	4	8	14349	14356	0 %	0 %	50 %	50 %	169237618
22	NC_010369	AG	3	6	14428	14433	50 %	0 %	50 %	0 %	169237618
23	NC_010369	GC	3	6	14607	14612	0 %	0 %	50 %	50 %	169237618
24	NC_010369	TA	5	10	14859	14868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010369	CG	3	6	17198	17203	0 %	0 %	50 %	50 %	169237621
26	NC_010369	CA	3	6	17431	17436	50 %	0 %	0 %	50 %	169237621
27	NC_010369	GT	3	6	18007	18012	0 %	50 %	50 %	0 %	169237622
28	NC_010369	GC	3	6	18023	18028	0 %	0 %	50 %	50 %	169237622
29	NC_010369	AC	3	6	18206	18211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010369	CG	3	6	18440	18445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010369	GA	3	6	19996	20001	50 %	0 %	50 %	0 %	169237625
32	NC_010369	AC	4	8	20185	20192	50 %	0 %	0 %	50 %	169237625
33	NC_010369	CA	3	6	20439	20444	50 %	0 %	0 %	50 %	169237625
34	NC_010369	GA	4	8	20761	20768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010369	AC	3	6	20931	20936	50 %	0 %	0 %	50 %	169237626
36	NC_010369	CG	4	8	22027	22034	0 %	0 %	50 %	50 %	169237626
37	NC_010369	GC	3	6	22449	22454	0 %	0 %	50 %	50 %	169237626
38	NC_010369	GC	3	6	23849	23854	0 %	0 %	50 %	50 %	169237627
39	NC_010369	GT	3	6	23981	23986	0 %	50 %	50 %	0 %	169237627
40	NC_010369	GA	3	6	24526	24531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010369	CA	3	6	24578	24583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010369	CG	3	6	27055	27060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010369	TA	3	6	27720	27725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010369	CT	3	6	27845	27850	0 %	50 %	0 %	50 %	169237631
45	NC_010369	TC	3	6	29466	29471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010369	TC	3	6	30461	30466	0 %	50 %	0 %	50 %	169237634
47	NC_010369	TC	3	6	31400	31405	0 %	50 %	0 %	50 %	169237636
48	NC_010369	CG	3	6	31802	31807	0 %	0 %	50 %	50 %	169237637
49	NC_010369	CG	3	6	33185	33190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010369	GC	3	6	33884	33889	0 %	0 %	50 %	50 %	169237639
51	NC_010369	GC	3	6	34135	34140	0 %	0 %	50 %	50 %	169237639
52	NC_010369	CA	3	6	34369	34374	50 %	0 %	0 %	50 %	169237639
53	NC_010369	TG	3	6	35049	35054	0 %	50 %	50 %	0 %	169237639
54	NC_010369	GC	3	6	35547	35552	0 %	0 %	50 %	50 %	169237640
55	NC_010369	GC	3	6	36351	36356	0 %	0 %	50 %	50 %	169237641
56	NC_010369	CA	3	6	36916	36921	50 %	0 %	0 %	50 %	169237641
57	NC_010369	CA	3	6	37369	37374	50 %	0 %	0 %	50 %	169237641
58	NC_010369	CG	3	6	37517	37522	0 %	0 %	50 %	50 %	169237641
59	NC_010369	CG	3	6	38262	38267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010369	AT	3	6	39113	39118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010369	CT	3	6	39151	39156	0 %	50 %	0 %	50 %	169237645
62	NC_010369	AC	3	6	39258	39263	50 %	0 %	0 %	50 %	169237645
63	NC_010369	CG	3	6	39762	39767	0 %	0 %	50 %	50 %	169237645
64	NC_010369	GC	3	6	40111	40116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010369	GA	3	6	41955	41960	50 %	0 %	50 %	0 %	169237648
66	NC_010369	GA	3	6	42127	42132	50 %	0 %	50 %	0 %	169237648
67	NC_010369	TC	3	6	43477	43482	0 %	50 %	0 %	50 %	169237651
68	NC_010369	CG	3	6	43943	43948	0 %	0 %	50 %	50 %	169237651
69	NC_010369	AC	3	6	44019	44024	50 %	0 %	0 %	50 %	169237651
70	NC_010369	GT	4	8	44449	44456	0 %	50 %	50 %	0 %	169237652
71	NC_010369	GC	4	8	45309	45316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010369	CA	3	6	45377	45382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010369	GC	3	6	46458	46463	0 %	0 %	50 %	50 %	169237655
74	NC_010369	CG	3	6	46488	46493	0 %	0 %	50 %	50 %	169237655
75	NC_010369	CA	3	6	46896	46901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010369	AG	3	6	48580	48585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010369	GC	3	6	49938	49943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010369	CG	3	6	50524	50529	0 %	0 %	50 %	50 %	169237660
79	NC_010369	TC	3	6	50557	50562	0 %	50 %	0 %	50 %	169237660
80	NC_010369	GC	3	6	51258	51263	0 %	0 %	50 %	50 %	169237662
81	NC_010369	GA	3	6	51589	51594	50 %	0 %	50 %	0 %	169237662
82	NC_010369	AG	3	6	51756	51761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010369	CG	3	6	52995	53000	0 %	0 %	50 %	50 %	169237664
84	NC_010369	CG	3	6	53607	53612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010369	CG	3	6	54855	54860	0 %	0 %	50 %	50 %	169237667
86	NC_010369	CT	3	6	55014	55019	0 %	50 %	0 %	50 %	169237667
87	NC_010369	TC	3	6	55269	55274	0 %	50 %	0 %	50 %	169237667
88	NC_010369	CG	3	6	56360	56365	0 %	0 %	50 %	50 %	169237668
89	NC_010369	GT	3	6	56521	56526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010369	GT	3	6	56555	56560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010369	TG	3	6	57370	57375	0 %	50 %	50 %	0 %	169237671
92	NC_010369	GT	3	6	57652	57657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010369	GA	3	6	58715	58720	50 %	0 %	50 %	0 %	169237673
94	NC_010369	GT	3	6	59061	59066	0 %	50 %	50 %	0 %	169237674
95	NC_010369	GT	3	6	59146	59151	0 %	50 %	50 %	0 %	169237674
96	NC_010369	AT	3	6	59338	59343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010369	GA	3	6	59489	59494	50 %	0 %	50 %	0 %	169237675
98	NC_010369	CT	3	6	59608	59613	0 %	50 %	0 %	50 %	169237675
99	NC_010369	AC	3	6	59748	59753	50 %	0 %	0 %	50 %	169237675
100	NC_010369	CA	3	6	59780	59785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010369	TC	3	6	62205	62210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010369	CG	3	6	62815	62820	0 %	0 %	50 %	50 %	169237680
103	NC_010369	GA	3	6	63276	63281	50 %	0 %	50 %	0 %	169237680
104	NC_010369	GT	4	8	63363	63370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010369	CA	3	6	63471	63476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010369	GT	3	6	63528	63533	0 %	50 %	50 %	0 %	169237681
107	NC_010369	GA	3	6	64787	64792	50 %	0 %	50 %	0 %	169237682
108	NC_010369	CT	3	6	64902	64907	0 %	50 %	0 %	50 %	169237682
109	NC_010369	CT	3	6	64931	64936	0 %	50 %	0 %	50 %	169237682
110	NC_010369	CT	4	8	65176	65183	0 %	50 %	0 %	50 %	169237682
111	NC_010369	TC	3	6	65291	65296	0 %	50 %	0 %	50 %	169237682
112	NC_010369	GC	4	8	65326	65333	0 %	0 %	50 %	50 %	169237682
113	NC_010369	GC	3	6	65335	65340	0 %	0 %	50 %	50 %	169237682
114	NC_010369	GA	3	6	65935	65940	50 %	0 %	50 %	0 %	169237682
115	NC_010369	AG	3	6	66755	66760	50 %	0 %	50 %	0 %	169237683
116	NC_010369	AC	3	6	67063	67068	50 %	0 %	0 %	50 %	169237684
117	NC_010369	TC	3	6	67200	67205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010369	GA	3	6	67298	67303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010369	GT	3	6	67456	67461	0 %	50 %	50 %	0 %	169237685
120	NC_010369	CG	3	6	67774	67779	0 %	0 %	50 %	50 %	169237685
121	NC_010369	TC	3	6	68395	68400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010369	CG	3	6	69294	69299	0 %	0 %	50 %	50 %	169237686
123	NC_010369	GC	3	6	69569	69574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010369	GC	3	6	69619	69624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010369	CG	3	6	69649	69654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010369	AC	3	6	70741	70746	50 %	0 %	0 %	50 %	169237687
127	NC_010369	GT	3	6	70840	70845	0 %	50 %	50 %	0 %	169237687
128	NC_010369	AG	3	6	71462	71467	50 %	0 %	50 %	0 %	169237687
129	NC_010369	GC	3	6	72076	72081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010369	TC	3	6	72126	72131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010369	TC	3	6	73006	73011	0 %	50 %	0 %	50 %	169237689
132	NC_010369	CG	3	6	73352	73357	0 %	0 %	50 %	50 %	169237690
133	NC_010369	TG	3	6	73842	73847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010369	GA	3	6	74447	74452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010369	GT	3	6	74580	74585	0 %	50 %	50 %	0 %	169237692
136	NC_010369	CA	3	6	75409	75414	50 %	0 %	0 %	50 %	169237693
137	NC_010369	AC	3	6	77020	77025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_010369	TC	3	6	77392	77397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010369	AC	3	6	78382	78387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010369	TC	3	6	78724	78729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010369	CA	3	6	80311	80316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010369	GA	3	6	80457	80462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_010369	GA	3	6	81751	81756	50 %	0 %	50 %	0 %	169237695
145	NC_010369	AC	3	6	81837	81842	50 %	0 %	0 %	50 %	169237695
146	NC_010369	CT	3	6	82670	82675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010369	CA	3	6	83026	83031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010369	GA	3	6	83360	83365	50 %	0 %	50 %	0 %	169237696
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.