MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010369	GA	3	6	1090	1095	50 %	0 %	50 %	0 %	169237603
2	NC_010369	AC	3	6	2383	2388	50 %	0 %	0 %	50 %	169237604
3	NC_010369	CT	3	6	3248	3253	0 %	50 %	0 %	50 %	169237606
4	NC_010369	CG	3	6	3563	3568	0 %	0 %	50 %	50 %	169237607
5	NC_010369	GA	3	6	4804	4809	50 %	0 %	50 %	0 %	169237609
6	NC_010369	CT	3	6	5853	5858	0 %	50 %	0 %	50 %	169237610
7	NC_010369	TC	3	6	5865	5870	0 %	50 %	0 %	50 %	169237610
8	NC_010369	CG	3	6	6180	6185	0 %	0 %	50 %	50 %	169237610
9	NC_010369	CA	3	6	7478	7483	50 %	0 %	0 %	50 %	169237611
10	NC_010369	CA	3	6	7708	7713	50 %	0 %	0 %	50 %	169237611
11	NC_010369	AG	3	6	9246	9251	50 %	0 %	50 %	0 %	169237613
12	NC_010369	AG	3	6	13396	13401	50 %	0 %	50 %	0 %	169237617
13	NC_010369	AG	3	6	14047	14052	50 %	0 %	50 %	0 %	169237618
14	NC_010369	GC	4	8	14349	14356	0 %	0 %	50 %	50 %	169237618
15	NC_010369	AG	3	6	14428	14433	50 %	0 %	50 %	0 %	169237618
16	NC_010369	GC	3	6	14607	14612	0 %	0 %	50 %	50 %	169237618
17	NC_010369	CG	3	6	17198	17203	0 %	0 %	50 %	50 %	169237621
18	NC_010369	CA	3	6	17431	17436	50 %	0 %	0 %	50 %	169237621
19	NC_010369	GT	3	6	18007	18012	0 %	50 %	50 %	0 %	169237622
20	NC_010369	GC	3	6	18023	18028	0 %	0 %	50 %	50 %	169237622
21	NC_010369	GA	3	6	19996	20001	50 %	0 %	50 %	0 %	169237625
22	NC_010369	AC	4	8	20185	20192	50 %	0 %	0 %	50 %	169237625
23	NC_010369	CA	3	6	20439	20444	50 %	0 %	0 %	50 %	169237625
24	NC_010369	AC	3	6	20931	20936	50 %	0 %	0 %	50 %	169237626
25	NC_010369	CG	4	8	22027	22034	0 %	0 %	50 %	50 %	169237626
26	NC_010369	GC	3	6	22449	22454	0 %	0 %	50 %	50 %	169237626
27	NC_010369	GC	3	6	23849	23854	0 %	0 %	50 %	50 %	169237627
28	NC_010369	GT	3	6	23981	23986	0 %	50 %	50 %	0 %	169237627
29	NC_010369	CT	3	6	27845	27850	0 %	50 %	0 %	50 %	169237631
30	NC_010369	TC	3	6	30461	30466	0 %	50 %	0 %	50 %	169237634
31	NC_010369	TC	3	6	31400	31405	0 %	50 %	0 %	50 %	169237636
32	NC_010369	CG	3	6	31802	31807	0 %	0 %	50 %	50 %	169237637
33	NC_010369	GC	3	6	33884	33889	0 %	0 %	50 %	50 %	169237639
34	NC_010369	GC	3	6	34135	34140	0 %	0 %	50 %	50 %	169237639
35	NC_010369	CA	3	6	34369	34374	50 %	0 %	0 %	50 %	169237639
36	NC_010369	TG	3	6	35049	35054	0 %	50 %	50 %	0 %	169237639
37	NC_010369	GC	3	6	35547	35552	0 %	0 %	50 %	50 %	169237640
38	NC_010369	GC	3	6	36351	36356	0 %	0 %	50 %	50 %	169237641
39	NC_010369	CA	3	6	36916	36921	50 %	0 %	0 %	50 %	169237641
40	NC_010369	CA	3	6	37369	37374	50 %	0 %	0 %	50 %	169237641
41	NC_010369	CG	3	6	37517	37522	0 %	0 %	50 %	50 %	169237641
42	NC_010369	CT	3	6	39151	39156	0 %	50 %	0 %	50 %	169237645
43	NC_010369	AC	3	6	39258	39263	50 %	0 %	0 %	50 %	169237645
44	NC_010369	CG	3	6	39762	39767	0 %	0 %	50 %	50 %	169237645
45	NC_010369	GA	3	6	41955	41960	50 %	0 %	50 %	0 %	169237648
46	NC_010369	GA	3	6	42127	42132	50 %	0 %	50 %	0 %	169237648
47	NC_010369	TC	3	6	43477	43482	0 %	50 %	0 %	50 %	169237651
48	NC_010369	CG	3	6	43943	43948	0 %	0 %	50 %	50 %	169237651
49	NC_010369	AC	3	6	44019	44024	50 %	0 %	0 %	50 %	169237651
50	NC_010369	GT	4	8	44449	44456	0 %	50 %	50 %	0 %	169237652
51	NC_010369	GC	3	6	46458	46463	0 %	0 %	50 %	50 %	169237655
52	NC_010369	CG	3	6	46488	46493	0 %	0 %	50 %	50 %	169237655
53	NC_010369	CG	3	6	50524	50529	0 %	0 %	50 %	50 %	169237660
54	NC_010369	TC	3	6	50557	50562	0 %	50 %	0 %	50 %	169237660
55	NC_010369	GC	3	6	51258	51263	0 %	0 %	50 %	50 %	169237662
56	NC_010369	GA	3	6	51589	51594	50 %	0 %	50 %	0 %	169237662
57	NC_010369	CG	3	6	52995	53000	0 %	0 %	50 %	50 %	169237664
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60	NC_010369	TC	3	6	55269	55274	0 %	50 %	0 %	50 %	169237667
61	NC_010369	CG	3	6	56360	56365	0 %	0 %	50 %	50 %	169237668
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65	NC_010369	GT	3	6	59146	59151	0 %	50 %	50 %	0 %	169237674
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68	NC_010369	AC	3	6	59748	59753	50 %	0 %	0 %	50 %	169237675
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70	NC_010369	GA	3	6	63276	63281	50 %	0 %	50 %	0 %	169237680
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73	NC_010369	CT	3	6	64902	64907	0 %	50 %	0 %	50 %	169237682
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108	NC_010369	GA	3	6	86914	86919	50 %	0 %	50 %	0 %	169237699
109	NC_010369	GC	3	6	87538	87543	0 %	0 %	50 %	50 %	169237699
110	NC_010369	GC	3	6	87567	87572	0 %	0 %	50 %	50 %	169237699
111	NC_010369	GA	3	6	88640	88645	50 %	0 %	50 %	0 %	169237701
112	NC_010369	CA	3	6	89470	89475	50 %	0 %	0 %	50 %	169237703
113	NC_010369	GA	3	6	89487	89492	50 %	0 %	50 %	0 %	169237703
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124	NC_010369	CG	4	8	95606	95613	0 %	0 %	50 %	50 %	169237710
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.