MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010368	TCTG	2	8	696	703	0 %	50 %	25 %	25 %	169237354
2	NC_010368	CTCG	2	8	1011	1018	0 %	25 %	25 %	50 %	169237355
3	NC_010368	CGTC	2	8	1680	1687	0 %	25 %	25 %	50 %	169237355
4	NC_010368	GGTC	2	8	2136	2143	0 %	25 %	50 %	25 %	169237355
5	NC_010368	TCGA	2	8	2186	2193	25 %	25 %	25 %	25 %	169237355
6	NC_010368	TCGC	2	8	2469	2476	0 %	25 %	25 %	50 %	169237355
7	NC_010368	CGTT	2	8	3987	3994	0 %	50 %	25 %	25 %	169237355
8	NC_010368	CTGG	2	8	4392	4399	0 %	25 %	50 %	25 %	169237355
9	NC_010368	CGTC	2	8	6152	6159	0 %	25 %	25 %	50 %	169237356
10	NC_010368	GTTC	2	8	6466	6473	0 %	50 %	25 %	25 %	169237356
11	NC_010368	TTCC	2	8	6798	6805	0 %	50 %	0 %	50 %	169237356
12	NC_010368	CGGC	2	8	7232	7239	0 %	0 %	50 %	50 %	169237357
13	NC_010368	CGTT	2	8	7656	7663	0 %	50 %	25 %	25 %	169237357
14	NC_010368	GCCC	2	8	7694	7701	0 %	0 %	25 %	75 %	169237357
15	NC_010368	GGGT	2	8	8727	8734	0 %	25 %	75 %	0 %	169237358
16	NC_010368	GCAA	2	8	9206	9213	50 %	0 %	25 %	25 %	169237358
17	NC_010368	CGCT	2	8	9764	9771	0 %	25 %	25 %	50 %	169237358
18	NC_010368	AACG	2	8	10964	10971	50 %	0 %	25 %	25 %	169237359
19	NC_010368	TGAA	2	8	11855	11862	50 %	25 %	25 %	0 %	169237360
20	NC_010368	TCAA	2	8	12251	12258	50 %	25 %	0 %	25 %	169237360
21	NC_010368	GGCT	2	8	12763	12770	0 %	25 %	50 %	25 %	169237360
22	NC_010368	GCTT	2	8	13219	13226	0 %	50 %	25 %	25 %	169237360
23	NC_010368	TTTG	2	8	13612	13619	0 %	75 %	25 %	0 %	169237360
24	NC_010368	GAGG	2	8	13729	13736	25 %	0 %	75 %	0 %	169237360
25	NC_010368	CCAG	2	8	14185	14192	25 %	0 %	25 %	50 %	169237361
26	NC_010368	CACG	2	8	15045	15052	25 %	0 %	25 %	50 %	169237361
27	NC_010368	ACCT	2	8	15146	15153	25 %	25 %	0 %	50 %	169237362
28	NC_010368	CCCT	2	8	15215	15222	0 %	25 %	0 %	75 %	169237362
29	NC_010368	GACC	2	8	15255	15262	25 %	0 %	25 %	50 %	169237362
30	NC_010368	CTCG	2	8	15870	15877	0 %	25 %	25 %	50 %	169237363
31	NC_010368	TCCG	2	8	16370	16377	0 %	25 %	25 %	50 %	169237363
32	NC_010368	CGCC	2	8	18544	18551	0 %	0 %	25 %	75 %	169237365
33	NC_010368	CCGT	2	8	18801	18808	0 %	25 %	25 %	50 %	169237365
34	NC_010368	GTAC	2	8	18813	18820	25 %	25 %	25 %	25 %	169237365
35	NC_010368	TGCT	2	8	19566	19573	0 %	50 %	25 %	25 %	169237365
36	NC_010368	CCGT	2	8	19802	19809	0 %	25 %	25 %	50 %	169237366
37	NC_010368	TCAC	2	8	20883	20890	25 %	25 %	0 %	50 %	169237368
38	NC_010368	ACGA	2	8	20989	20996	50 %	0 %	25 %	25 %	169237368
39	NC_010368	AACG	2	8	21793	21800	50 %	0 %	25 %	25 %	169237370
40	NC_010368	TTTG	2	8	22404	22411	0 %	75 %	25 %	0 %	169237370
41	NC_010368	CGAG	2	8	26171	26178	25 %	0 %	50 %	25 %	169237374
42	NC_010368	CTGC	2	8	27631	27638	0 %	25 %	25 %	50 %	169237375
43	NC_010368	GGAC	2	8	27639	27646	25 %	0 %	50 %	25 %	169237375
44	NC_010368	ACGG	2	8	27783	27790	25 %	0 %	50 %	25 %	169237376
45	NC_010368	GTTT	2	8	28086	28093	0 %	75 %	25 %	0 %	169237376
46	NC_010368	AGCG	2	8	28206	28213	25 %	0 %	50 %	25 %	169237376
47	NC_010368	GTGA	2	8	28296	28303	25 %	25 %	50 %	0 %	169237376
48	NC_010368	CGAA	2	8	28760	28767	50 %	0 %	25 %	25 %	169237376
49	NC_010368	ACGA	2	8	29167	29174	50 %	0 %	25 %	25 %	169237376
50	NC_010368	GGAA	2	8	29955	29962	50 %	0 %	50 %	0 %	169237377
51	NC_010368	GCTC	2	8	30375	30382	0 %	25 %	25 %	50 %	169237377
52	NC_010368	ACGT	2	8	30784	30791	25 %	25 %	25 %	25 %	169237378
53	NC_010368	GTTC	2	8	31192	31199	0 %	50 %	25 %	25 %	169237379
54	NC_010368	GAAC	2	8	31558	31565	50 %	0 %	25 %	25 %	169237379
55	NC_010368	GCAG	2	8	32177	32184	25 %	0 %	50 %	25 %	169237379
56	NC_010368	CGAT	2	8	32206	32213	25 %	25 %	25 %	25 %	169237379
57	NC_010368	TTCG	2	8	32625	32632	0 %	50 %	25 %	25 %	169237380
58	NC_010368	GCAG	2	8	32841	32848	25 %	0 %	50 %	25 %	169237380
59	NC_010368	CAAC	2	8	34095	34102	50 %	0 %	0 %	50 %	169237380
60	NC_010368	ACGA	2	8	34234	34241	50 %	0 %	25 %	25 %	169237380
61	NC_010368	GAAG	2	8	34302	34309	50 %	0 %	50 %	0 %	169237380
62	NC_010368	AGCG	2	8	34515	34522	25 %	0 %	50 %	25 %	169237380
63	NC_010368	TGAG	2	8	35026	35033	25 %	25 %	50 %	0 %	169237381
64	NC_010368	GACA	2	8	35704	35711	50 %	0 %	25 %	25 %	169237382
65	NC_010368	ACGT	2	8	35900	35907	25 %	25 %	25 %	25 %	169237382
66	NC_010368	AGAC	2	8	36117	36124	50 %	0 %	25 %	25 %	169237382
67	NC_010368	TCGC	2	8	36613	36620	0 %	25 %	25 %	50 %	169237383
68	NC_010368	TCAA	2	8	37405	37412	50 %	25 %	0 %	25 %	169237384
69	NC_010368	ATCC	2	8	37583	37590	25 %	25 %	0 %	50 %	169237384
70	NC_010368	CGCT	2	8	38251	38258	0 %	25 %	25 %	50 %	169237385
71	NC_010368	GTTC	2	8	39124	39131	0 %	50 %	25 %	25 %	169237386
72	NC_010368	TGGG	2	8	39133	39140	0 %	25 %	75 %	0 %	169237386
73	NC_010368	ATCC	2	8	39982	39989	25 %	25 %	0 %	50 %	169237387
74	NC_010368	AACG	2	8	40395	40402	50 %	0 %	25 %	25 %	169237387
75	NC_010368	CGAC	2	8	44211	44218	25 %	0 %	25 %	50 %	169237392
76	NC_010368	GCCA	2	8	44425	44432	25 %	0 %	25 %	50 %	169237392
77	NC_010368	CGGA	2	8	44558	44565	25 %	0 %	50 %	25 %	169237392
78	NC_010368	CGAC	2	8	45645	45652	25 %	0 %	25 %	50 %	169237396
79	NC_010368	CGTT	2	8	45729	45736	0 %	50 %	25 %	25 %	169237396
80	NC_010368	CAGC	2	8	45850	45857	25 %	0 %	25 %	50 %	169237396
81	NC_010368	AGAC	2	8	47207	47214	50 %	0 %	25 %	25 %	169237398
82	NC_010368	ACCG	2	8	48695	48702	25 %	0 %	25 %	50 %	169237400
83	NC_010368	GACC	2	8	49330	49337	25 %	0 %	25 %	50 %	169237400
84	NC_010368	ATGT	2	8	50256	50263	25 %	50 %	25 %	0 %	169237402
85	NC_010368	CTCG	2	8	50701	50708	0 %	25 %	25 %	50 %	169237402
86	NC_010368	GCTG	2	8	50854	50861	0 %	25 %	50 %	25 %	169237403
87	NC_010368	GCCA	2	8	50895	50902	25 %	0 %	25 %	50 %	169237403
88	NC_010368	AACG	2	8	52295	52302	50 %	0 %	25 %	25 %	169237405
89	NC_010368	CGAA	2	8	53024	53031	50 %	0 %	25 %	25 %	169237406
90	NC_010368	ACGA	2	8	53077	53084	50 %	0 %	25 %	25 %	169237406
91	NC_010368	CGGA	2	8	53221	53228	25 %	0 %	50 %	25 %	169237406
92	NC_010368	TCCA	2	8	53440	53447	25 %	25 %	0 %	50 %	169237406
93	NC_010368	AGCG	2	8	53745	53752	25 %	0 %	50 %	25 %	169237407
94	NC_010368	TGAC	2	8	54099	54106	25 %	25 %	25 %	25 %	169237408
95	NC_010368	ACGC	2	8	54162	54169	25 %	0 %	25 %	50 %	169237408
96	NC_010368	CGCT	2	8	54179	54186	0 %	25 %	25 %	50 %	169237408
97	NC_010368	CCGC	2	8	54337	54344	0 %	0 %	25 %	75 %	169237408
98	NC_010368	GCCG	2	8	54451	54458	0 %	0 %	50 %	50 %	169237408
99	NC_010368	ATCC	2	8	54685	54692	25 %	25 %	0 %	50 %	169237408
100	NC_010368	CGCC	2	8	55247	55254	0 %	0 %	25 %	75 %	169237408
101	NC_010368	GACG	2	8	56157	56164	25 %	0 %	50 %	25 %	169237409
102	NC_010368	CGAC	2	8	56261	56268	25 %	0 %	25 %	50 %	169237409
103	NC_010368	AGCG	2	8	56380	56387	25 %	0 %	50 %	25 %	169237409
104	NC_010368	TCGG	2	8	56621	56628	0 %	25 %	50 %	25 %	169237409
105	NC_010368	CCGG	2	8	56754	56761	0 %	0 %	50 %	50 %	169237409
106	NC_010368	GCCG	2	8	57053	57060	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
107	NC_010368	GCCG	2	8	57161	57168	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
108	NC_010368	CGCC	2	8	57290	57297	0 %	0 %	25 %	75 %	169237410
109	NC_010368	GCCG	2	8	57314	57321	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
110	NC_010368	CGGT	2	8	57714	57721	0 %	25 %	50 %	25 %	169237410
111	NC_010368	GCAC	2	8	57800	57807	25 %	0 %	25 %	50 %	169237410
112	NC_010368	CCGG	2	8	58322	58329	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
113	NC_010368	GCGG	2	8	58602	58609	0 %	0 %	75 %	25 %	169237410
114	NC_010368	ACCG	2	8	59273	59280	25 %	0 %	25 %	50 %	169237411
115	NC_010368	GTCC	2	8	59508	59515	0 %	25 %	25 %	50 %	169237411
116	NC_010368	GCTG	2	8	59886	59893	0 %	25 %	50 %	25 %	169237412
117	NC_010368	GCCG	2	8	59979	59986	0 %	0 %	50 %	50 %	169237412
118	NC_010368	ACCG	2	8	60522	60529	25 %	0 %	25 %	50 %	169237412
119	NC_010368	GACG	2	8	60591	60598	25 %	0 %	50 %	25 %	169237412
120	NC_010368	GCCA	2	8	60898	60905	25 %	0 %	25 %	50 %	169237412
121	NC_010368	ACCG	2	8	61145	61152	25 %	0 %	25 %	50 %	169237413
122	NC_010368	GGCT	2	8	61583	61590	0 %	25 %	50 %	25 %	169237413
123	NC_010368	ACCG	2	8	61601	61608	25 %	0 %	25 %	50 %	169237413
124	NC_010368	CGAG	2	8	61785	61792	25 %	0 %	50 %	25 %	169237413
125	NC_010368	CGCC	2	8	63292	63299	0 %	0 %	25 %	75 %	169237414
126	NC_010368	CGCC	2	8	63450	63457	0 %	0 %	25 %	75 %	169237414
127	NC_010368	CGAC	2	8	63839	63846	25 %	0 %	25 %	50 %	169237415
128	NC_010368	GCCG	2	8	64101	64108	0 %	0 %	50 %	50 %	169237415
129	NC_010368	CGGC	2	8	64808	64815	0 %	0 %	50 %	50 %	169237415
130	NC_010368	CGCC	2	8	65256	65263	0 %	0 %	25 %	75 %	169237416
131	NC_010368	CACC	2	8	66067	66074	25 %	0 %	0 %	75 %	169237416
132	NC_010368	TTGG	2	8	66121	66128	0 %	50 %	50 %	0 %	169237416
133	NC_010368	GGTA	2	8	66306	66313	25 %	25 %	50 %	0 %	169237416
134	NC_010368	GCCG	2	8	67457	67464	0 %	0 %	50 %	50 %	169237417
135	NC_010368	CTGG	2	8	67529	67536	0 %	25 %	50 %	25 %	169237417
136	NC_010368	ACAG	2	8	67783	67790	50 %	0 %	25 %	25 %	169237418
137	NC_010368	GACA	2	8	67834	67841	50 %	0 %	25 %	25 %	169237418
138	NC_010368	ACGC	2	8	68498	68505	25 %	0 %	25 %	50 %	169237419
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