MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010368	GA	3	6	11351	11356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010368	CT	3	6	17606	17611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010368	GA	3	6	18001	18006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010368	TG	3	6	19649	19654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010368	CG	3	6	21169	21174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010368	AT	3	6	22441	22446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010368	GC	3	6	23460	23465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010368	GA	3	6	23759	23764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010368	CA	3	6	24191	24196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010368	CT	3	6	24883	24888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010368	CT	3	6	24908	24913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010368	GT	3	6	25953	25958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010368	TC	3	6	27029	27034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010368	CA	3	6	36567	36572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010368	GT	3	6	37151	37156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010368	GT	3	6	39416	39421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010368	AG	3	6	43476	43481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010368	CT	4	8	43901	43908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010368	CT	3	6	43926	43931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010368	CA	3	6	51164	51169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010368	GA	3	6	53935	53940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010368	GT	3	6	53941	53946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010368	CA	3	6	53950	53955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010368	AC	3	6	65000	65005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010368	TG	3	6	66761	66766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010368	TC	3	6	66922	66927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010368	AT	3	6	68024	68029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010368	AC	3	6	68050	68055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010368	TG	3	6	74948	74953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010368	AC	5	10	79938	79947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010368	GA	3	6	88441	88446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010368	CA	3	6	88506	88511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010368	GA	4	8	89452	89459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010368	AC	3	6	89616	89621	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010368	TG	4	8	92120	92127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010368	CT	5	10	95474	95483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010368	GC	3	6	96471	96476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010368	CA	3	6	108227	108232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010368	CT	4	8	110669	110676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010368	CT	3	6	113278	113283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010368	GC	3	6	118956	118961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010368	TC	3	6	124158	124163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010368	AT	3	6	127968	127973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010368	CA	3	6	128122	128127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010368	AC	3	6	130206	130211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010368	TA	3	6	136174	136179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010368	GT	3	6	137472	137477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010368	AT	3	6	137685	137690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010368	AG	3	6	137824	137829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010368	GA	3	6	138335	138340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010368	TG	3	6	139725	139730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010368	TG	3	6	140730	140735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010368	GC	3	6	140794	140799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010368	CT	3	6	142935	142940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010368	GC	3	6	144926	144931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010368	CA	4	8	145820	145827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010368	AG	3	6	147428	147433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010368	CA	3	6	147584	147589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010368	CA	3	6	147625	147630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010368	AC	3	6	147946	147951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010368	AT	3	6	148422	148427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010368	AT	4	8	150371	150378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010368	CG	3	6	150817	150822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010368	CA	3	6	155963	155968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010368	AT	3	6	156037	156042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010368	TC	3	6	160550	160555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010368	TG	5	10	160581	160590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010368	CA	3	6	160592	160597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010368	GC	3	6	160790	160795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010368	CG	3	6	160819	160824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010368	TG	3	6	160955	160960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010368	GT	4	8	172667	172674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010368	GC	3	6	173294	173299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010368	CA	3	6	183582	183587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010368	CT	3	6	188100	188105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010368	GT	3	6	190165	190170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010368	CT	3	6	190381	190386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010368	CT	3	6	190399	190404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010368	AG	3	6	190766	190771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010368	GA	3	6	191610	191615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010368	GA	3	6	195138	195143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010368	TC	4	8	198027	198034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010368	TC	3	6	198692	198697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010368	GC	3	6	200132	200137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010368	AC	3	6	200298	200303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010368	AC	4	8	200306	200313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010368	TA	3	6	200315	200320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010368	GA	3	6	202708	202713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010368	TA	3	6	202759	202764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010368	GT	3	6	202871	202876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010368	TA	4	8	210421	210428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010368	GT	3	6	211249	211254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010368	GA	3	6	212997	213002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010368	TG	3	6	215448	215453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010368	GA	3	6	216153	216158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010368	TG	4	8	216185	216192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010368	GA	3	6	217525	217530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010368	TC	3	6	220301	220306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010368	AG	3	6	224609	224614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010368	CA	3	6	225312	225317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010368	CT	3	6	225416	225421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010368	AC	4	8	225633	225640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010368	GC	3	6	228125	228130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010368	GT	3	6	228410	228415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010368	TG	4	8	234292	234299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010368	AT	4	8	239403	239410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010368	AG	3	6	239629	239634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010368	TC	3	6	239788	239793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010368	AC	3	6	240346	240351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010368	AG	3	6	242067	242072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010368	GA	3	6	242107	242112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010368	CT	4	8	242184	242191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010368	AC	3	6	244141	244146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010368	GA	3	6	247879	247884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010368	GT	3	6	251215	251220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010368	CA	3	6	257553	257558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010368	AC	3	6	257796	257801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010368	CT	3	6	259966	259971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010368	TC	3	6	260484	260489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010368	TC	4	8	260491	260498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010368	TG	3	6	264396	264401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010368	TA	3	6	264419	264424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010368	AT	3	6	267817	267822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010368	AT	3	6	268212	268217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010368	GC	4	8	268922	268929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010368	GC	3	6	270009	270014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010368	GC	3	6	270059	270064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010368	CG	3	6	270092	270097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010368	AC	3	6	270374	270379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010368	GC	3	6	270536	270541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010368	CG	3	6	270591	270596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010368	CG	3	6	272529	272534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010368	GA	3	6	275278	275283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010368	TA	4	8	276173	276180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010368	AT	4	8	281271	281278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.