MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010368	C	6	6	7857	7862	0 %	0 %	0 %	100 %	169237357
2	NC_010368	A	6	6	15641	15646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010368	T	6	6	18019	18024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010368	C	6	6	18187	18192	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_010368	T	7	7	20458	20464	0 %	100 %	0 %	0 %	169237367
6	NC_010368	C	6	6	20795	20800	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_010368	T	6	6	22757	22762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010368	A	6	6	26405	26410	100 %	0 %	0 %	0 %	169237374
9	NC_010368	C	6	6	26772	26777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_010368	G	6	6	27322	27327	0 %	0 %	100 %	0 %	169237375
11	NC_010368	A	6	6	27502	27507	100 %	0 %	0 %	0 %	169237375
12	NC_010368	C	6	6	31615	31620	0 %	0 %	0 %	100 %	169237379
13	NC_010368	C	6	6	37785	37790	0 %	0 %	0 %	100 %	169237385
14	NC_010368	G	6	6	43508	43513	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010368	G	6	6	45192	45197	0 %	0 %	100 %	0 %	169237394
16	NC_010368	T	6	6	45782	45787	0 %	100 %	0 %	0 %	169237396
17	NC_010368	A	6	6	50230	50235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010368	C	6	6	57744	57749	0 %	0 %	0 %	100 %	169237410
19	NC_010368	C	6	6	72235	72240	0 %	0 %	0 %	100 %	169237428
20	NC_010368	C	6	6	72587	72592	0 %	0 %	0 %	100 %	169237428
21	NC_010368	G	7	7	73982	73988	0 %	0 %	100 %	0 %	169237430
22	NC_010368	C	7	7	74111	74117	0 %	0 %	0 %	100 %	169237430
23	NC_010368	G	6	6	77964	77969	0 %	0 %	100 %	0 %	169237435
24	NC_010368	G	6	6	80024	80029	0 %	0 %	100 %	0 %	169237437
25	NC_010368	G	6	6	80040	80045	0 %	0 %	100 %	0 %	169237437
26	NC_010368	G	6	6	93417	93422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010368	C	6	6	93430	93435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_010368	G	6	6	93469	93474	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010368	G	6	6	93887	93892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010368	C	6	6	95518	95523	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_010368	G	6	6	104166	104171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010368	G	6	6	113411	113416	0 %	0 %	100 %	0 %	169237471
33	NC_010368	A	6	6	116022	116027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010368	C	6	6	116854	116859	0 %	0 %	0 %	100 %	169237473
35	NC_010368	A	6	6	126266	126271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010368	A	6	6	128142	128147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010368	A	6	6	132912	132917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010368	C	6	6	136574	136579	0 %	0 %	0 %	100 %	169237490
39	NC_010368	T	6	6	138065	138070	0 %	100 %	0 %	0 %	169237491
40	NC_010368	G	6	6	138158	138163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010368	A	6	6	138383	138388	100 %	0 %	0 %	0 %	169237492
42	NC_010368	G	6	6	140310	140315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010368	C	6	6	141193	141198	0 %	0 %	0 %	100 %	169237493
44	NC_010368	G	6	6	142029	142034	0 %	0 %	100 %	0 %	169237493
45	NC_010368	A	6	6	145002	145007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010368	A	6	6	149133	149138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010368	G	6	6	157293	157298	0 %	0 %	100 %	0 %	169237503
48	NC_010368	A	6	6	172616	172621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010368	C	6	6	182147	182152	0 %	0 %	0 %	100 %	169237524
50	NC_010368	G	6	6	186200	186205	0 %	0 %	100 %	0 %	169237530
51	NC_010368	C	6	6	188129	188134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_010368	A	6	6	190226	190231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010368	C	6	6	191550	191555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_010368	T	6	6	197677	197682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010368	C	6	6	198589	198594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_010368	G	7	7	204781	204787	0 %	0 %	100 %	0 %	169237545
57	NC_010368	A	6	6	224773	224778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010368	C	6	6	228583	228588	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_010368	T	6	6	234546	234551	0 %	100 %	0 %	0 %	169237556
60	NC_010368	C	6	6	240150	240155	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_010368	T	6	6	249581	249586	0 %	100 %	0 %	0 %	169237565
62	NC_010368	C	6	6	261045	261050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_010368	G	6	6	261062	261067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010368	G	6	6	261521	261526	0 %	0 %	100 %	0 %	169237576
65	NC_010368	C	6	6	268894	268899	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_010368	A	6	6	268991	268996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010368	G	6	6	275149	275154	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.