MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS4

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010367	GCGCTC	2	12	1300	1311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	169237315
2	NC_010367	CGAGTA	2	12	2042	2053	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169237316
3	NC_010367	CGACAG	2	12	3343	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010367	TCGCAT	2	12	3871	3882	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169237321
5	NC_010367	CCGTGA	2	12	3919	3930	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169237321
6	NC_010367	CGAACG	2	12	9056	9067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010367	GATATC	2	12	13128	13139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169237328
8	NC_010367	TCGAAG	2	12	13462	13473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169237329
9	NC_010367	GGACGA	2	12	14354	14365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	169237329
10	NC_010367	AAGAGA	2	12	15571	15582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237329
11	NC_010367	CGAGAA	2	12	18991	19002	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	169237330
12	NC_010367	GCGTGA	2	12	20233	20244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169237330
13	NC_010367	CATTCC	2	12	21995	22006	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	169237332
14	NC_010367	GTTGAC	2	12	31329	31340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169237338
15	NC_010367	GAAGTC	2	12	31767	31778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169237338
16	NC_010367	CCAGAC	2	12	35226	35237	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	169237342
17	NC_010367	GTTCAG	2	12	38326	38337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169237349

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.