MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS4

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010367	GTGAG	2	10	870	879	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010367	TCAGG	2	10	3418	3427	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010367	CAGTC	2	10	5362	5371	20 %	20 %	20 %	40 %	169237323
4	NC_010367	CCACT	2	10	6027	6036	20 %	20 %	0 %	60 %	169237323
5	NC_010367	TGACG	2	10	6802	6811	20 %	20 %	40 %	20 %	169237324
6	NC_010367	GTGAG	2	10	8150	8159	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010367	ACACC	2	10	9137	9146	40 %	0 %	0 %	60 %	169237326
8	NC_010367	TCTCC	2	10	9467	9476	0 %	40 %	0 %	60 %	169237326
9	NC_010367	CGGAG	2	10	11702	11711	20 %	0 %	60 %	20 %	169237326
10	NC_010367	CAGAA	2	10	15917	15926	60 %	0 %	20 %	20 %	169237329
11	NC_010367	CAATA	2	10	16356	16365	60 %	20 %	0 %	20 %	169237329
12	NC_010367	GGGCG	2	10	17450	17459	0 %	0 %	80 %	20 %	169237330
13	NC_010367	TGGAG	2	10	20385	20394	20 %	20 %	60 %	0 %	169237331
14	NC_010367	CGACG	2	10	22373	22382	20 %	0 %	40 %	40 %	169237332
15	NC_010367	GGGGT	2	10	23249	23258	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010367	GTACC	2	10	25679	25688	20 %	20 %	20 %	40 %	169237336
17	NC_010367	CGGCA	2	10	33312	33321	20 %	0 %	40 %	40 %	169237339
18	NC_010367	CGACG	2	10	33891	33900	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010367	CGCTG	2	10	34504	34513	0 %	20 %	40 %	40 %	169237341
20	NC_010367	ACTGA	2	10	35778	35787	40 %	20 %	20 %	20 %	169237342
21	NC_010367	ACGAA	2	10	37807	37816	60 %	0 %	20 %	20 %	169237347
22	NC_010367	CAAAT	2	10	39514	39523	60 %	20 %	0 %	20 %	169237350

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.