MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS4

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010367	CAGTC	2	10	5362	5371	20 %	20 %	20 %	40 %	169237323
2	NC_010367	CCACT	2	10	6027	6036	20 %	20 %	0 %	60 %	169237323
3	NC_010367	TGACG	2	10	6802	6811	20 %	20 %	40 %	20 %	169237324
4	NC_010367	ACACC	2	10	9137	9146	40 %	0 %	0 %	60 %	169237326
5	NC_010367	TCTCC	2	10	9467	9476	0 %	40 %	0 %	60 %	169237326
6	NC_010367	CGGAG	2	10	11702	11711	20 %	0 %	60 %	20 %	169237326
7	NC_010367	CAGAA	2	10	15917	15926	60 %	0 %	20 %	20 %	169237329
8	NC_010367	CAATA	2	10	16356	16365	60 %	20 %	0 %	20 %	169237329
9	NC_010367	GGGCG	2	10	17450	17459	0 %	0 %	80 %	20 %	169237330
10	NC_010367	TGGAG	2	10	20385	20394	20 %	20 %	60 %	0 %	169237331
11	NC_010367	CGACG	2	10	22373	22382	20 %	0 %	40 %	40 %	169237332
12	NC_010367	GTACC	2	10	25679	25688	20 %	20 %	20 %	40 %	169237336
13	NC_010367	CGGCA	2	10	33312	33321	20 %	0 %	40 %	40 %	169237339
14	NC_010367	CGCTG	2	10	34504	34513	0 %	20 %	40 %	40 %	169237341
15	NC_010367	ACTGA	2	10	35778	35787	40 %	20 %	20 %	20 %	169237342
16	NC_010367	ACGAA	2	10	37807	37816	60 %	0 %	20 %	20 %	169237347
17	NC_010367	CAAAT	2	10	39514	39523	60 %	20 %	0 %	20 %	169237350

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.