MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS4

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010367	GA	3	6	42	47	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010367	AG	3	6	475	480	50 %	0 %	50 %	0 %	169237314
3	NC_010367	AG	3	6	540	545	50 %	0 %	50 %	0 %	169237314
4	NC_010367	AG	3	6	559	564	50 %	0 %	50 %	0 %	169237314
5	NC_010367	TC	3	6	655	660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010367	GC	3	6	1440	1445	0 %	0 %	50 %	50 %	169237315
7	NC_010367	GC	3	6	1629	1634	0 %	0 %	50 %	50 %	169237315
8	NC_010367	GA	3	6	3130	3135	50 %	0 %	50 %	0 %	169237319
9	NC_010367	GA	3	6	3815	3820	50 %	0 %	50 %	0 %	169237321
10	NC_010367	GC	3	6	4380	4385	0 %	0 %	50 %	50 %	169237321
11	NC_010367	TC	3	6	4715	4720	0 %	50 %	0 %	50 %	169237321
12	NC_010367	CG	3	6	4864	4869	0 %	0 %	50 %	50 %	169237322
13	NC_010367	TC	3	6	5687	5692	0 %	50 %	0 %	50 %	169237323
14	NC_010367	TC	3	6	6323	6328	0 %	50 %	0 %	50 %	169237323
15	NC_010367	TC	3	6	6503	6508	0 %	50 %	0 %	50 %	169237323
16	NC_010367	AG	3	6	6745	6750	50 %	0 %	50 %	0 %	169237324
17	NC_010367	GA	3	6	6906	6911	50 %	0 %	50 %	0 %	169237324
18	NC_010367	GT	3	6	7811	7816	0 %	50 %	50 %	0 %	169237324
19	NC_010367	CT	3	6	8070	8075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010367	CT	3	6	8402	8407	0 %	50 %	0 %	50 %	169237325
21	NC_010367	GA	3	6	8797	8802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010367	CT	3	6	9023	9028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010367	CT	3	6	9386	9391	0 %	50 %	0 %	50 %	169237326
24	NC_010367	TC	3	6	9635	9640	0 %	50 %	0 %	50 %	169237326
25	NC_010367	CG	3	6	9876	9881	0 %	0 %	50 %	50 %	169237326
26	NC_010367	CG	3	6	10108	10113	0 %	0 %	50 %	50 %	169237326
27	NC_010367	TC	3	6	10119	10124	0 %	50 %	0 %	50 %	169237326
28	NC_010367	GC	3	6	10126	10131	0 %	0 %	50 %	50 %	169237326
29	NC_010367	TC	3	6	10433	10438	0 %	50 %	0 %	50 %	169237326
30	NC_010367	GA	3	6	10792	10797	50 %	0 %	50 %	0 %	169237326
31	NC_010367	GC	3	6	11119	11124	0 %	0 %	50 %	50 %	169237326
32	NC_010367	GC	3	6	11608	11613	0 %	0 %	50 %	50 %	169237326
33	NC_010367	GA	3	6	12214	12219	50 %	0 %	50 %	0 %	169237326
34	NC_010367	CT	3	6	12551	12556	0 %	50 %	0 %	50 %	169237327
35	NC_010367	TG	3	6	12660	12665	0 %	50 %	50 %	0 %	169237327
36	NC_010367	TC	3	6	13048	13053	0 %	50 %	0 %	50 %	169237328
37	NC_010367	AG	3	6	13472	13477	50 %	0 %	50 %	0 %	169237329
38	NC_010367	TC	3	6	13985	13990	0 %	50 %	0 %	50 %	169237329
39	NC_010367	AG	3	6	14912	14917	50 %	0 %	50 %	0 %	169237329
40	NC_010367	GA	3	6	17211	17216	50 %	0 %	50 %	0 %	169237329
41	NC_010367	TC	3	6	17363	17368	0 %	50 %	0 %	50 %	169237329
42	NC_010367	CA	3	6	17953	17958	50 %	0 %	0 %	50 %	169237330
43	NC_010367	CA	3	6	18145	18150	50 %	0 %	0 %	50 %	169237330
44	NC_010367	GC	3	6	18577	18582	0 %	0 %	50 %	50 %	169237330
45	NC_010367	AG	3	6	20149	20154	50 %	0 %	50 %	0 %	169237330
46	NC_010367	GA	4	8	20337	20344	50 %	0 %	50 %	0 %	169237330
47	NC_010367	CA	3	6	21030	21035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010367	TC	3	6	22124	22129	0 %	50 %	0 %	50 %	169237332
49	NC_010367	CA	3	6	22341	22346	50 %	0 %	0 %	50 %	169237332
50	NC_010367	AG	3	6	22660	22665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010367	AT	3	6	23405	23410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010367	CT	3	6	23741	23746	0 %	50 %	0 %	50 %	169237334
53	NC_010367	AT	3	6	23947	23952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010367	GA	3	6	23956	23961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010367	TG	3	6	24047	24052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010367	CT	3	6	24121	24126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010367	TC	3	6	24638	24643	0 %	50 %	0 %	50 %	169237335
58	NC_010367	GT	3	6	25096	25101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010367	GT	3	6	25119	25124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010367	CT	3	6	25355	25360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010367	CA	3	6	25435	25440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010367	TC	3	6	25964	25969	0 %	50 %	0 %	50 %	169237336
63	NC_010367	CG	3	6	26205	26210	0 %	0 %	50 %	50 %	169237336
64	NC_010367	CG	3	6	26639	26644	0 %	0 %	50 %	50 %	169237336
65	NC_010367	TC	3	6	26711	26716	0 %	50 %	0 %	50 %	169237336
66	NC_010367	AG	3	6	26961	26966	50 %	0 %	50 %	0 %	169237336
67	NC_010367	AC	3	6	27082	27087	50 %	0 %	0 %	50 %	169237336
68	NC_010367	GA	3	6	27124	27129	50 %	0 %	50 %	0 %	169237336
69	NC_010367	GC	3	6	27812	27817	0 %	0 %	50 %	50 %	169237336
70	NC_010367	GC	3	6	28240	28245	0 %	0 %	50 %	50 %	169237336
71	NC_010367	GA	3	6	28546	28551	50 %	0 %	50 %	0 %	169237336
72	NC_010367	GA	3	6	29500	29505	50 %	0 %	50 %	0 %	169237337
73	NC_010367	GC	4	8	30046	30053	0 %	0 %	50 %	50 %	169237337
74	NC_010367	GA	3	6	30382	30387	50 %	0 %	50 %	0 %	169237337
75	NC_010367	CG	3	6	32952	32957	0 %	0 %	50 %	50 %	169237339
76	NC_010367	TC	3	6	33721	33726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010367	AC	3	6	33756	33761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010367	AT	3	6	33904	33909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010367	GT	3	6	34564	34569	0 %	50 %	50 %	0 %	169237341
80	NC_010367	GC	3	6	34719	34724	0 %	0 %	50 %	50 %	169237341
81	NC_010367	CT	3	6	34940	34945	0 %	50 %	0 %	50 %	169237341
82	NC_010367	CT	3	6	36820	36825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010367	AC	3	6	37195	37200	50 %	0 %	0 %	50 %	169237346
84	NC_010367	GT	4	8	37315	37322	0 %	50 %	50 %	0 %	169237346
85	NC_010367	GC	3	6	40789	40794	0 %	0 %	50 %	50 %	169237352

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.