MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS1

Total Repeats: 2453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010366	GTG	2	6	37	42	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010366	ACC	2	6	71	76	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010366	CGA	2	6	208	213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010366	AAC	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010366	TGA	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237161
6	NC_010366	TCG	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237161
7	NC_010366	GAC	2	6	435	440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237161
8	NC_010366	TCT	2	6	460	465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237161
9	NC_010366	GAA	2	6	468	473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237161
10	NC_010366	CTC	2	6	504	509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237161
11	NC_010366	TTC	2	6	567	572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237161
12	NC_010366	TCG	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237161
13	NC_010366	GTC	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237161
14	NC_010366	GGC	2	6	793	798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237161
15	NC_010366	GAT	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237162
16	NC_010366	GAC	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237162
17	NC_010366	CTT	2	6	1122	1127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237162
18	NC_010366	GTC	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237162
19	NC_010366	TTC	2	6	1238	1243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010366	TGA	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010366	GTC	2	6	1382	1387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010366	GTT	2	6	1422	1427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010366	GAG	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010366	ATA	2	6	1527	1532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010366	CGA	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010366	CGC	2	6	1635	1640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010366	TGC	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010366	ATG	2	6	1740	1745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010366	CAG	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237163
30	NC_010366	GGT	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237163
31	NC_010366	CGC	2	6	2146	2151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237163
32	NC_010366	CTG	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
33	NC_010366	CGG	2	6	2201	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237163
34	NC_010366	TCG	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
35	NC_010366	TCC	2	6	2281	2286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237163
36	NC_010366	GCG	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237163
37	NC_010366	TCC	2	6	2338	2343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237163
38	NC_010366	GCG	2	6	2348	2353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237163
39	NC_010366	CGT	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
40	NC_010366	TGA	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237163
41	NC_010366	GCT	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
42	NC_010366	GAC	2	6	2571	2576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237163
43	NC_010366	CGT	2	6	2597	2602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
44	NC_010366	CAT	2	6	2649	2654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237163
45	NC_010366	GAG	2	6	2694	2699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237163
46	NC_010366	AAC	2	6	2733	2738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237163
47	NC_010366	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
48	NC_010366	CGA	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237163
49	NC_010366	TGA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237163
50	NC_010366	GAA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237163
51	NC_010366	ACT	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237163
52	NC_010366	CGT	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
53	NC_010366	CGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237163
54	NC_010366	GGA	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237163
55	NC_010366	ACG	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237163
56	NC_010366	CGG	2	6	3356	3361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237163
57	NC_010366	CGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
58	NC_010366	GTC	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
59	NC_010366	GCT	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
60	NC_010366	TTC	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237163
61	NC_010366	GGA	2	6	3524	3529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237163
62	NC_010366	TCG	2	6	3586	3591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237163
63	NC_010366	TTG	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237163
64	NC_010366	CCA	2	6	3698	3703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237163
65	NC_010366	CGT	2	6	3749	3754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010366	TTC	2	6	3820	3825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010366	ACT	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010366	TCC	2	6	4047	4052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010366	AAG	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237164
70	NC_010366	TCG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237165
71	NC_010366	CTG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237165
72	NC_010366	TAC	2	6	4317	4322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237165
73	NC_010366	TGG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237165
74	NC_010366	CGA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237165
75	NC_010366	CAG	2	6	4440	4445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237165
76	NC_010366	TAA	2	6	4492	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237165
77	NC_010366	CTA	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237165
78	NC_010366	AGA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237166
79	NC_010366	TCG	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010366	ATT	2	6	4994	4999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010366	GAC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010366	GTC	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010366	GTC	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010366	CTC	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010366	ACC	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_010366	ATG	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010366	GAT	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237167
88	NC_010366	ACA	2	6	5573	5578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237167
89	NC_010366	TGG	2	6	5581	5586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237167
90	NC_010366	GGT	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237167
91	NC_010366	TCT	2	6	5639	5644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237167
92	NC_010366	AAG	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237167
93	NC_010366	CGC	2	6	5808	5813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237167
94	NC_010366	TTG	2	6	5814	5819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237167
95	NC_010366	CAA	2	6	5857	5862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237167
96	NC_010366	GTC	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237167
97	NC_010366	CTG	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237167
98	NC_010366	GTT	2	6	6035	6040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237167
99	NC_010366	TAC	2	6	6175	6180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237167
100	NC_010366	TCT	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237167
101	NC_010366	TAC	2	6	6406	6411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237167
102	NC_010366	TCA	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237167
103	NC_010366	TGG	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237167
104	NC_010366	TTC	2	6	6502	6507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237167
105	NC_010366	GGA	2	6	6530	6535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237167
106	NC_010366	TGT	2	6	6772	6777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237167
107	NC_010366	TTG	2	6	6836	6841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237167
108	NC_010366	CGG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237167
109	NC_010366	TCT	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237167
110	NC_010366	CTT	2	6	6899	6904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237167
111	NC_010366	AGT	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237167
112	NC_010366	GAG	2	6	7234	7239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237167
113	NC_010366	TCC	2	6	7289	7294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237167
114	NC_010366	TAG	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237167
115	NC_010366	TAT	2	6	7408	7413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169237167
116	NC_010366	TCG	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237167
117	NC_010366	GTA	2	6	7458	7463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237167
118	NC_010366	CAT	2	6	7521	7526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237167
119	NC_010366	TAG	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237167
120	NC_010366	GCG	2	6	7706	7711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237167
121	NC_010366	TTG	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237167
122	NC_010366	TTC	2	6	7834	7839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237167
123	NC_010366	CTT	2	6	7878	7883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237168
124	NC_010366	GCA	2	6	7901	7906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237168
125	NC_010366	TCG	2	6	8054	8059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237168
126	NC_010366	TTC	2	6	8078	8083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237168
127	NC_010366	TCT	2	6	8090	8095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237168
128	NC_010366	GGC	2	6	8164	8169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237168
129	NC_010366	TTC	2	6	8258	8263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237168
130	NC_010366	TTC	3	9	8311	8319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237168
131	NC_010366	CCA	2	6	8402	8407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237168
132	NC_010366	AGA	2	6	8499	8504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237168
133	NC_010366	GTT	2	6	8533	8538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237168
134	NC_010366	TCA	2	6	8582	8587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237168
135	NC_010366	CAT	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010366	TGG	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010366	GAA	2	6	8973	8978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010366	CTT	2	6	9026	9031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010366	TCA	2	6	9089	9094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010366	TGC	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237169
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148	NC_010366	ACT	2	6	9530	9535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237169
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255	NC_010366	CCT	2	6	15655	15660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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257	NC_010366	GAA	2	6	15777	15782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237172
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