MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 1329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010364	GCGGT	2	10	351	360	0 %	20 %	60 %	20 %	169235050
2	NC_010364	GCAGC	2	10	649	658	20 %	0 %	40 %	40 %	169235050
3	NC_010364	TGGCG	2	10	2146	2155	0 %	20 %	60 %	20 %	169235052
4	NC_010364	TCGGC	2	10	5327	5336	0 %	20 %	40 %	40 %	169235053
5	NC_010364	CGTCC	2	10	7263	7272	0 %	20 %	20 %	60 %	169235054
6	NC_010364	CGAAC	2	10	7597	7606	40 %	0 %	20 %	40 %	169235055
7	NC_010364	CCGTT	2	10	9143	9152	0 %	40 %	20 %	40 %	169235056
8	NC_010364	CCGTC	2	10	9497	9506	0 %	20 %	20 %	60 %	169235056
9	NC_010364	CGCCC	2	10	9952	9961	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_010364	CCCAT	2	10	19161	19170	20 %	20 %	0 %	60 %	169235067
11	NC_010364	ACCAC	2	10	19197	19206	40 %	0 %	0 %	60 %	169235067
12	NC_010364	CGCCC	2	10	20024	20033	0 %	0 %	20 %	80 %	169235068
13	NC_010364	TGGGG	2	10	22213	22222	0 %	20 %	80 %	0 %	169235071
14	NC_010364	CGAAT	2	10	22225	22234	40 %	20 %	20 %	20 %	169235071
15	NC_010364	ACCCC	2	10	24445	24454	20 %	0 %	0 %	80 %	169235074
16	NC_010364	CACCG	2	10	24825	24834	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_010364	TTCGG	2	10	27360	27369	0 %	40 %	40 %	20 %	169235077
18	NC_010364	CGGCG	2	10	31088	31097	0 %	0 %	60 %	40 %	169235080
19	NC_010364	TCAGT	2	10	33451	33460	20 %	40 %	20 %	20 %	169235084
20	NC_010364	TCGCG	2	10	34042	34051	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_010364	CCCAC	2	10	34320	34329	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
22	NC_010364	TGACT	2	10	35705	35714	20 %	40 %	20 %	20 %	169235086
23	NC_010364	TGCCG	2	10	36142	36151	0 %	20 %	40 %	40 %	169235087
24	NC_010364	TGGGT	2	10	37107	37116	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010364	ACCAA	2	10	37540	37549	60 %	0 %	0 %	40 %	169235088
26	NC_010364	GGTCG	2	10	38956	38965	0 %	20 %	60 %	20 %	169235089
27	NC_010364	CTAGT	2	10	43424	43433	20 %	40 %	20 %	20 %	169235093
28	NC_010364	CATAT	2	10	44268	44277	40 %	40 %	0 %	20 %	169235094
29	NC_010364	ACTCT	2	10	44394	44403	20 %	40 %	0 %	40 %	169235094
30	NC_010364	TCTGT	2	10	46737	46746	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010364	CGGCG	2	10	47003	47012	0 %	0 %	60 %	40 %	169235096
32	NC_010364	CTCGA	2	10	47141	47150	20 %	20 %	20 %	40 %	169235096
33	NC_010364	CTACG	2	10	53503	53512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_010364	CACAA	2	10	54365	54374	60 %	0 %	0 %	40 %	169235102
35	NC_010364	CAGCG	2	10	62401	62410	20 %	0 %	40 %	40 %	169235108
36	NC_010364	GAGCG	2	10	64358	64367	20 %	0 %	60 %	20 %	169235110
37	NC_010364	GTCGA	2	10	65295	65304	20 %	20 %	40 %	20 %	169235111
38	NC_010364	CGATG	2	10	65984	65993	20 %	20 %	40 %	20 %	169235112
39	NC_010364	GTCGA	2	10	68090	68099	20 %	20 %	40 %	20 %	169235117
40	NC_010364	ACGCG	2	10	71235	71244	20 %	0 %	40 %	40 %	169235121
41	NC_010364	GCCGG	2	10	74989	74998	0 %	0 %	60 %	40 %	169235126
42	NC_010364	GCCGG	2	10	76251	76260	0 %	0 %	60 %	40 %	169235127
43	NC_010364	CCGAC	2	10	77119	77128	20 %	0 %	20 %	60 %	169235127
44	NC_010364	CGCCA	2	10	80019	80028	20 %	0 %	20 %	60 %	169235130
45	NC_010364	GCCGC	2	10	82060	82069	0 %	0 %	40 %	60 %	169235132
46	NC_010364	ACGCC	2	10	82717	82726	20 %	0 %	20 %	60 %	169235133
47	NC_010364	ACTGT	2	10	85831	85840	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010364	CACCG	2	10	87884	87893	20 %	0 %	20 %	60 %	169235140
49	NC_010364	CGACG	2	10	88324	88333	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010364	GACGC	2	10	91600	91609	20 %	0 %	40 %	40 %	169235142
51	NC_010364	AGGCC	2	10	92070	92079	20 %	0 %	40 %	40 %	169235142
52	NC_010364	CTCTA	2	10	92083	92092	20 %	40 %	0 %	40 %	169235142
53	NC_010364	CGAAT	2	10	92304	92313	40 %	20 %	20 %	20 %	169235142
54	NC_010364	ATCGT	2	10	92843	92852	20 %	40 %	20 %	20 %	169235142
55	NC_010364	GGGCT	2	10	93151	93160	0 %	20 %	60 %	20 %	169235143
56	NC_010364	ATGGA	2	10	94531	94540	40 %	20 %	40 %	0 %	169235143
57	NC_010364	TCGCT	2	10	97559	97568	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_010364	TATCC	2	10	100526	100535	20 %	40 %	0 %	40 %	169235150
59	NC_010364	CTCCC	2	10	100840	100849	0 %	20 %	0 %	80 %	169235150
60	NC_010364	ACCTC	2	10	101862	101871	20 %	20 %	0 %	60 %	169235152
61	NC_010364	GCATC	2	10	102644	102653	20 %	20 %	20 %	40 %	169235154
62	NC_010364	ATCAC	2	10	105791	105800	40 %	20 %	0 %	40 %	169235158
63	NC_010364	CCCCG	2	10	107505	107514	0 %	0 %	20 %	80 %	169235161
64	NC_010364	GGGCA	2	10	108757	108766	20 %	0 %	60 %	20 %	169235162
65	NC_010364	GTCGC	2	10	109527	109536	0 %	20 %	40 %	40 %	169235164
66	NC_010364	GCGCC	2	10	110109	110118	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_010364	GTCGA	2	10	110469	110478	20 %	20 %	40 %	20 %	169235165
68	NC_010364	AGCGC	2	10	113849	113858	20 %	0 %	40 %	40 %	169235168
69	NC_010364	CTTAG	2	10	114950	114959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010364	AGTGG	2	10	116264	116273	20 %	20 %	60 %	0 %	169235171
71	NC_010364	GGACC	2	10	116992	117001	20 %	0 %	40 %	40 %	169235172
72	NC_010364	GCAGC	2	10	117472	117481	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_010364	GAAGA	2	10	117713	117722	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010364	AGTTC	2	10	117982	117991	20 %	40 %	20 %	20 %	169235173
75	NC_010364	TCGCT	2	10	119591	119600	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_010364	TGCGG	2	10	121516	121525	0 %	20 %	60 %	20 %	169235179
77	NC_010364	CGCGC	3	15	126537	126551	0 %	0 %	40 %	60 %	169235184
78	NC_010364	ACGTG	2	10	127399	127408	20 %	20 %	40 %	20 %	169235184
79	NC_010364	CGTGA	2	10	127857	127866	20 %	20 %	40 %	20 %	169235185
80	NC_010364	CAGCC	2	10	128618	128627	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_010364	CGTCG	2	10	132823	132832	0 %	20 %	40 %	40 %	169235188
82	NC_010364	ACGCA	2	10	133241	133250	40 %	0 %	20 %	40 %	169235189
83	NC_010364	ATCGA	2	10	135380	135389	40 %	20 %	20 %	20 %	169235189
84	NC_010364	GCCGC	2	10	138030	138039	0 %	0 %	40 %	60 %	169235192
85	NC_010364	GGCGT	2	10	141758	141767	0 %	20 %	60 %	20 %	169235194
86	NC_010364	GCGCC	2	10	142375	142384	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_010364	CCGCG	2	10	144557	144566	0 %	0 %	40 %	60 %	169235198
88	NC_010364	TCACG	2	10	146109	146118	20 %	20 %	20 %	40 %	169235200
89	NC_010364	GTCGT	2	10	146792	146801	0 %	40 %	40 %	20 %	169235200
90	NC_010364	GCCGT	2	10	147731	147740	0 %	20 %	40 %	40 %	169235200
91	NC_010364	CGCTG	2	10	147753	147762	0 %	20 %	40 %	40 %	169235200
92	NC_010364	CACAC	2	10	148845	148854	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_010364	CGGCG	2	10	150181	150190	0 %	0 %	60 %	40 %	169235201
94	NC_010364	GCCGC	2	10	151436	151445	0 %	0 %	40 %	60 %	169235202
95	NC_010364	CGGCG	2	10	152096	152105	0 %	0 %	60 %	40 %	169235203
96	NC_010364	GCCGT	2	10	153788	153797	0 %	20 %	40 %	40 %	169235205
97	NC_010364	CGTCT	2	10	153898	153907	0 %	40 %	20 %	40 %	169235205
98	NC_010364	CACCG	2	10	154019	154028	20 %	0 %	20 %	60 %	169235205
99	NC_010364	TTCCG	2	10	154459	154468	0 %	40 %	20 %	40 %	169235205
100	NC_010364	CACGT	2	10	154811	154820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_010364	TGGCG	2	10	155215	155224	0 %	20 %	60 %	20 %	169235206
102	NC_010364	TCGCG	2	10	161632	161641	0 %	20 %	40 %	40 %	169235213
103	NC_010364	TCGCC	2	10	163183	163192	0 %	20 %	20 %	60 %	169235214
104	NC_010364	TGGGT	2	10	165832	165841	0 %	40 %	60 %	0 %	169235216
105	NC_010364	GTCGT	2	10	167717	167726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010364	GTCGC	2	10	171205	171214	0 %	20 %	40 %	40 %	169235224
107	NC_010364	TGTCG	2	10	171305	171314	0 %	40 %	40 %	20 %	169235224
108	NC_010364	CCGGC	2	10	171620	171629	0 %	0 %	40 %	60 %	169235225
109	NC_010364	ACGCG	2	10	172607	172616	20 %	0 %	40 %	40 %	169235226
110	NC_010364	GCGCG	2	10	173290	173299	0 %	0 %	60 %	40 %	169235227
111	NC_010364	GCCAG	2	10	174310	174319	20 %	0 %	40 %	40 %	169235228
112	NC_010364	GACGC	2	10	174435	174444	20 %	0 %	40 %	40 %	169235228
113	NC_010364	CTGCC	2	10	175484	175493	0 %	20 %	20 %	60 %	169235229
114	NC_010364	GCGTC	2	10	176562	176571	0 %	20 %	40 %	40 %	169235229
115	NC_010364	GCGCC	2	10	176988	176997	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_010364	CCCCA	2	10	178992	179001	20 %	0 %	0 %	80 %	169235232
117	NC_010364	GGCGT	2	10	179020	179029	0 %	20 %	60 %	20 %	169235232
118	NC_010364	TGGAC	2	10	179075	179084	20 %	20 %	40 %	20 %	169235232
119	NC_010364	GGCGT	2	10	179275	179284	0 %	20 %	60 %	20 %	169235232
120	NC_010364	CGGCG	2	10	179915	179924	0 %	0 %	60 %	40 %	169235233
121	NC_010364	CCGGG	2	10	180859	180868	0 %	0 %	60 %	40 %	169235234
122	NC_010364	TAGCC	2	10	181266	181275	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_010364	CGACG	2	10	181466	181475	20 %	0 %	40 %	40 %	169235235
124	NC_010364	ACGAC	2	10	181695	181704	40 %	0 %	20 %	40 %	169235235
125	NC_010364	ACGTC	2	10	184039	184048	20 %	20 %	20 %	40 %	169235238
126	NC_010364	GCAGC	2	10	184211	184220	20 %	0 %	40 %	40 %	169235238
127	NC_010364	TGGCG	2	10	186157	186166	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010364	ACCAC	2	10	189187	189196	40 %	0 %	0 %	60 %	169235247
129	NC_010364	GTGGG	2	10	190758	190767	0 %	20 %	80 %	0 %	169235249
130	NC_010364	GTGGG	2	10	190848	190857	0 %	20 %	80 %	0 %	169235249
131	NC_010364	CCACG	2	10	191516	191525	20 %	0 %	20 %	60 %	169235250
132	NC_010364	CGGGT	2	10	192300	192309	0 %	20 %	60 %	20 %	169235251
133	NC_010364	GGCGT	2	10	192897	192906	0 %	20 %	60 %	20 %	169235252
134	NC_010364	CGTTC	2	10	197380	197389	0 %	40 %	20 %	40 %	169235255
135	NC_010364	AGAAC	2	10	198676	198685	60 %	0 %	20 %	20 %	169235257
136	NC_010364	CGACG	2	10	200330	200339	20 %	0 %	40 %	40 %	169235259
137	NC_010364	GTGTG	2	10	200744	200753	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010364	GGTCA	2	10	201089	201098	20 %	20 %	40 %	20 %	169235260
139	NC_010364	TGAAG	2	10	201140	201149	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010364	GCGGA	2	10	203193	203202	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_010364	CGGGT	2	10	214590	214599	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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255	NC_010364	TCGAA	2	10	398179	398188	40 %	20 %	20 %	20 %	169235464
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265	NC_010364	ACGGA	2	10	422909	422918	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_010364	CCGGT	2	10	423734	423743	0 %	20 %	40 %	40 %	169235492
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