MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 1157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010364	GCGGT	2	10	351	360	0 %	20 %	60 %	20 %	169235050
2	NC_010364	GCAGC	2	10	649	658	20 %	0 %	40 %	40 %	169235050
3	NC_010364	TGGCG	2	10	2146	2155	0 %	20 %	60 %	20 %	169235052
4	NC_010364	TCGGC	2	10	5327	5336	0 %	20 %	40 %	40 %	169235053
5	NC_010364	CGTCC	2	10	7263	7272	0 %	20 %	20 %	60 %	169235054
6	NC_010364	CGAAC	2	10	7597	7606	40 %	0 %	20 %	40 %	169235055
7	NC_010364	CCGTT	2	10	9143	9152	0 %	40 %	20 %	40 %	169235056
8	NC_010364	CCGTC	2	10	9497	9506	0 %	20 %	20 %	60 %	169235056
9	NC_010364	CCCAT	2	10	19161	19170	20 %	20 %	0 %	60 %	169235067
10	NC_010364	ACCAC	2	10	19197	19206	40 %	0 %	0 %	60 %	169235067
11	NC_010364	CGCCC	2	10	20024	20033	0 %	0 %	20 %	80 %	169235068
12	NC_010364	TGGGG	2	10	22213	22222	0 %	20 %	80 %	0 %	169235071
13	NC_010364	CGAAT	2	10	22225	22234	40 %	20 %	20 %	20 %	169235071
14	NC_010364	ACCCC	2	10	24445	24454	20 %	0 %	0 %	80 %	169235074
15	NC_010364	TTCGG	2	10	27360	27369	0 %	40 %	40 %	20 %	169235077
16	NC_010364	CGGCG	2	10	31088	31097	0 %	0 %	60 %	40 %	169235080
17	NC_010364	TCAGT	2	10	33451	33460	20 %	40 %	20 %	20 %	169235084
18	NC_010364	TGACT	2	10	35705	35714	20 %	40 %	20 %	20 %	169235086
19	NC_010364	TGCCG	2	10	36142	36151	0 %	20 %	40 %	40 %	169235087
20	NC_010364	ACCAA	2	10	37540	37549	60 %	0 %	0 %	40 %	169235088
21	NC_010364	GGTCG	2	10	38956	38965	0 %	20 %	60 %	20 %	169235089
22	NC_010364	CTAGT	2	10	43424	43433	20 %	40 %	20 %	20 %	169235093
23	NC_010364	CATAT	2	10	44268	44277	40 %	40 %	0 %	20 %	169235094
24	NC_010364	ACTCT	2	10	44394	44403	20 %	40 %	0 %	40 %	169235094
25	NC_010364	CGGCG	2	10	47003	47012	0 %	0 %	60 %	40 %	169235096
26	NC_010364	CTCGA	2	10	47141	47150	20 %	20 %	20 %	40 %	169235096
27	NC_010364	CACAA	2	10	54365	54374	60 %	0 %	0 %	40 %	169235102
28	NC_010364	CAGCG	2	10	62401	62410	20 %	0 %	40 %	40 %	169235108
29	NC_010364	GAGCG	2	10	64358	64367	20 %	0 %	60 %	20 %	169235110
30	NC_010364	GTCGA	2	10	65295	65304	20 %	20 %	40 %	20 %	169235111
31	NC_010364	CGATG	2	10	65984	65993	20 %	20 %	40 %	20 %	169235112
32	NC_010364	GTCGA	2	10	68090	68099	20 %	20 %	40 %	20 %	169235117
33	NC_010364	ACGCG	2	10	71235	71244	20 %	0 %	40 %	40 %	169235121
34	NC_010364	GCCGG	2	10	74989	74998	0 %	0 %	60 %	40 %	169235126
35	NC_010364	GCCGG	2	10	76251	76260	0 %	0 %	60 %	40 %	169235127
36	NC_010364	CCGAC	2	10	77119	77128	20 %	0 %	20 %	60 %	169235127
37	NC_010364	CGCCA	2	10	80019	80028	20 %	0 %	20 %	60 %	169235130
38	NC_010364	GCCGC	2	10	82060	82069	0 %	0 %	40 %	60 %	169235132
39	NC_010364	ACGCC	2	10	82717	82726	20 %	0 %	20 %	60 %	169235133
40	NC_010364	CACCG	2	10	87884	87893	20 %	0 %	20 %	60 %	169235140
41	NC_010364	GACGC	2	10	91600	91609	20 %	0 %	40 %	40 %	169235142
42	NC_010364	AGGCC	2	10	92070	92079	20 %	0 %	40 %	40 %	169235142
43	NC_010364	CTCTA	2	10	92083	92092	20 %	40 %	0 %	40 %	169235142
44	NC_010364	CGAAT	2	10	92304	92313	40 %	20 %	20 %	20 %	169235142
45	NC_010364	ATCGT	2	10	92843	92852	20 %	40 %	20 %	20 %	169235142
46	NC_010364	GGGCT	2	10	93151	93160	0 %	20 %	60 %	20 %	169235143
47	NC_010364	ATGGA	2	10	94531	94540	40 %	20 %	40 %	0 %	169235143
48	NC_010364	TATCC	2	10	100526	100535	20 %	40 %	0 %	40 %	169235150
49	NC_010364	CTCCC	2	10	100840	100849	0 %	20 %	0 %	80 %	169235150
50	NC_010364	ACCTC	2	10	101862	101871	20 %	20 %	0 %	60 %	169235152
51	NC_010364	GCATC	2	10	102644	102653	20 %	20 %	20 %	40 %	169235154
52	NC_010364	ATCAC	2	10	105791	105800	40 %	20 %	0 %	40 %	169235158
53	NC_010364	CCCCG	2	10	107505	107514	0 %	0 %	20 %	80 %	169235161
54	NC_010364	GGGCA	2	10	108757	108766	20 %	0 %	60 %	20 %	169235162
55	NC_010364	GTCGC	2	10	109527	109536	0 %	20 %	40 %	40 %	169235164
56	NC_010364	GTCGA	2	10	110469	110478	20 %	20 %	40 %	20 %	169235165
57	NC_010364	AGCGC	2	10	113849	113858	20 %	0 %	40 %	40 %	169235168
58	NC_010364	AGTGG	2	10	116264	116273	20 %	20 %	60 %	0 %	169235171
59	NC_010364	GGACC	2	10	116992	117001	20 %	0 %	40 %	40 %	169235172
60	NC_010364	AGTTC	2	10	117982	117991	20 %	40 %	20 %	20 %	169235173
61	NC_010364	TGCGG	2	10	121516	121525	0 %	20 %	60 %	20 %	169235179
62	NC_010364	CGCGC	3	15	126537	126551	0 %	0 %	40 %	60 %	169235184
63	NC_010364	ACGTG	2	10	127399	127408	20 %	20 %	40 %	20 %	169235184
64	NC_010364	CGTGA	2	10	127857	127866	20 %	20 %	40 %	20 %	169235185
65	NC_010364	CGTCG	2	10	132823	132832	0 %	20 %	40 %	40 %	169235188
66	NC_010364	ACGCA	2	10	133241	133250	40 %	0 %	20 %	40 %	169235189
67	NC_010364	ATCGA	2	10	135380	135389	40 %	20 %	20 %	20 %	169235189
68	NC_010364	GCCGC	2	10	138030	138039	0 %	0 %	40 %	60 %	169235192
69	NC_010364	GGCGT	2	10	141758	141767	0 %	20 %	60 %	20 %	169235194
70	NC_010364	CCGCG	2	10	144557	144566	0 %	0 %	40 %	60 %	169235198
71	NC_010364	TCACG	2	10	146109	146118	20 %	20 %	20 %	40 %	169235200
72	NC_010364	GTCGT	2	10	146792	146801	0 %	40 %	40 %	20 %	169235200
73	NC_010364	GCCGT	2	10	147731	147740	0 %	20 %	40 %	40 %	169235200
74	NC_010364	CGCTG	2	10	147753	147762	0 %	20 %	40 %	40 %	169235200
75	NC_010364	CGGCG	2	10	150181	150190	0 %	0 %	60 %	40 %	169235201
76	NC_010364	GCCGC	2	10	151436	151445	0 %	0 %	40 %	60 %	169235202
77	NC_010364	CGGCG	2	10	152096	152105	0 %	0 %	60 %	40 %	169235203
78	NC_010364	GCCGT	2	10	153788	153797	0 %	20 %	40 %	40 %	169235205
79	NC_010364	CGTCT	2	10	153898	153907	0 %	40 %	20 %	40 %	169235205
80	NC_010364	CACCG	2	10	154019	154028	20 %	0 %	20 %	60 %	169235205
81	NC_010364	TTCCG	2	10	154459	154468	0 %	40 %	20 %	40 %	169235205
82	NC_010364	TGGCG	2	10	155215	155224	0 %	20 %	60 %	20 %	169235206
83	NC_010364	TCGCG	2	10	161632	161641	0 %	20 %	40 %	40 %	169235213
84	NC_010364	TCGCC	2	10	163183	163192	0 %	20 %	20 %	60 %	169235214
85	NC_010364	TGGGT	2	10	165832	165841	0 %	40 %	60 %	0 %	169235216
86	NC_010364	GTCGC	2	10	171205	171214	0 %	20 %	40 %	40 %	169235224
87	NC_010364	TGTCG	2	10	171305	171314	0 %	40 %	40 %	20 %	169235224
88	NC_010364	CCGGC	2	10	171620	171629	0 %	0 %	40 %	60 %	169235225
89	NC_010364	ACGCG	2	10	172607	172616	20 %	0 %	40 %	40 %	169235226
90	NC_010364	GCGCG	2	10	173290	173299	0 %	0 %	60 %	40 %	169235227
91	NC_010364	GCCAG	2	10	174310	174319	20 %	0 %	40 %	40 %	169235228
92	NC_010364	GACGC	2	10	174435	174444	20 %	0 %	40 %	40 %	169235228
93	NC_010364	CTGCC	2	10	175484	175493	0 %	20 %	20 %	60 %	169235229
94	NC_010364	GCGTC	2	10	176562	176571	0 %	20 %	40 %	40 %	169235229
95	NC_010364	CCCCA	2	10	178992	179001	20 %	0 %	0 %	80 %	169235232
96	NC_010364	GGCGT	2	10	179020	179029	0 %	20 %	60 %	20 %	169235232
97	NC_010364	TGGAC	2	10	179075	179084	20 %	20 %	40 %	20 %	169235232
98	NC_010364	GGCGT	2	10	179275	179284	0 %	20 %	60 %	20 %	169235232
99	NC_010364	CGGCG	2	10	179915	179924	0 %	0 %	60 %	40 %	169235233
100	NC_010364	CCGGG	2	10	180859	180868	0 %	0 %	60 %	40 %	169235234
101	NC_010364	CGACG	2	10	181466	181475	20 %	0 %	40 %	40 %	169235235
102	NC_010364	ACGAC	2	10	181695	181704	40 %	0 %	20 %	40 %	169235235
103	NC_010364	ACGTC	2	10	184039	184048	20 %	20 %	20 %	40 %	169235238
104	NC_010364	GCAGC	2	10	184211	184220	20 %	0 %	40 %	40 %	169235238
105	NC_010364	ACCAC	2	10	189187	189196	40 %	0 %	0 %	60 %	169235247
106	NC_010364	GTGGG	2	10	190758	190767	0 %	20 %	80 %	0 %	169235249
107	NC_010364	GTGGG	2	10	190848	190857	0 %	20 %	80 %	0 %	169235249
108	NC_010364	CCACG	2	10	191516	191525	20 %	0 %	20 %	60 %	169235250
109	NC_010364	CGGGT	2	10	192300	192309	0 %	20 %	60 %	20 %	169235251
110	NC_010364	GGCGT	2	10	192897	192906	0 %	20 %	60 %	20 %	169235252
111	NC_010364	CGTTC	2	10	197380	197389	0 %	40 %	20 %	40 %	169235255
112	NC_010364	AGAAC	2	10	198676	198685	60 %	0 %	20 %	20 %	169235257
113	NC_010364	CGACG	2	10	200330	200339	20 %	0 %	40 %	40 %	169235259
114	NC_010364	GGTCA	2	10	201089	201098	20 %	20 %	40 %	20 %	169235260
115	NC_010364	GATCA	2	10	204587	204596	40 %	20 %	20 %	20 %	169235265
116	NC_010364	GCGCC	2	10	204864	204873	0 %	0 %	40 %	60 %	169235265
117	NC_010364	GCGAC	2	10	207172	207181	20 %	0 %	40 %	40 %	169235268
118	NC_010364	CACGG	2	10	208700	208709	20 %	0 %	40 %	40 %	169235269
119	NC_010364	GGGCG	2	10	209448	209457	0 %	0 %	80 %	20 %	169235269
120	NC_010364	GGCGC	2	10	210308	210317	0 %	0 %	60 %	40 %	169235270
121	NC_010364	GGCGG	2	10	213223	213232	0 %	0 %	80 %	20 %	169235273
122	NC_010364	GTGTA	2	10	216256	216265	20 %	40 %	40 %	0 %	169235277
123	NC_010364	CTCGT	2	10	216608	216617	0 %	40 %	20 %	40 %	169235278
124	NC_010364	CGTTC	2	10	216931	216940	0 %	40 %	20 %	40 %	169235278
125	NC_010364	CGACC	2	10	219373	219382	20 %	0 %	20 %	60 %	169235280
126	NC_010364	ACTTC	2	10	220838	220847	20 %	40 %	0 %	40 %	169235282
127	NC_010364	GCGCG	2	10	223475	223484	0 %	0 %	60 %	40 %	169235286
128	NC_010364	GACGT	2	10	224440	224449	20 %	20 %	40 %	20 %	169235287
129	NC_010364	CCGAC	2	10	226306	226315	20 %	0 %	20 %	60 %	169235289
130	NC_010364	GCGTT	2	10	227575	227584	0 %	40 %	40 %	20 %	169235291
131	NC_010364	GCGCT	2	10	229058	229067	0 %	20 %	40 %	40 %	169235292
132	NC_010364	GCGCC	2	10	229234	229243	0 %	0 %	40 %	60 %	169235292
133	NC_010364	CTCGG	2	10	234924	234933	0 %	20 %	40 %	40 %	169235299
134	NC_010364	GGCGC	2	10	237039	237048	0 %	0 %	60 %	40 %	169235301
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