MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 5246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010364	CAAC	2	8	717	724	50 %	0 %	0 %	50 %	169235050
2	NC_010364	GACA	2	8	730	737	50 %	0 %	25 %	25 %	169235050
3	NC_010364	GCAC	2	8	939	946	25 %	0 %	25 %	50 %	169235050
4	NC_010364	ACCA	2	8	969	976	50 %	0 %	0 %	50 %	169235050
5	NC_010364	GCTT	2	8	1610	1617	0 %	50 %	25 %	25 %	169235051
6	NC_010364	TCAC	2	8	2042	2049	25 %	25 %	0 %	50 %	169235051
7	NC_010364	GCTC	2	8	2120	2127	0 %	25 %	25 %	50 %	169235052
8	NC_010364	ATCA	2	8	2253	2260	50 %	25 %	0 %	25 %	169235052
9	NC_010364	CGAA	2	8	2354	2361	50 %	0 %	25 %	25 %	169235052
10	NC_010364	ACCA	2	8	2538	2545	50 %	0 %	0 %	50 %	169235052
11	NC_010364	CCGT	2	8	4103	4110	0 %	25 %	25 %	50 %	169235053
12	NC_010364	GTTC	2	8	4236	4243	0 %	50 %	25 %	25 %	169235053
13	NC_010364	CGGC	2	8	4445	4452	0 %	0 %	50 %	50 %	169235053
14	NC_010364	CACG	2	8	5073	5080	25 %	0 %	25 %	50 %	169235053
15	NC_010364	TCGA	2	8	5202	5209	25 %	25 %	25 %	25 %	169235053
16	NC_010364	TCGC	2	8	5818	5825	0 %	25 %	25 %	50 %	169235054
17	NC_010364	CGGC	2	8	6037	6044	0 %	0 %	50 %	50 %	169235054
18	NC_010364	CGTC	2	8	6632	6639	0 %	25 %	25 %	50 %	169235054
19	NC_010364	CTGC	2	8	7816	7823	0 %	25 %	25 %	50 %	169235055
20	NC_010364	CGCC	2	8	8506	8513	0 %	0 %	25 %	75 %	169235055
21	NC_010364	CGTC	2	8	9290	9297	0 %	25 %	25 %	50 %	169235056
22	NC_010364	CGCC	2	8	9770	9777	0 %	0 %	25 %	75 %	169235056
23	NC_010364	CTGC	2	8	10024	10031	0 %	25 %	25 %	50 %	169235057
24	NC_010364	GCCT	2	8	10181	10188	0 %	25 %	25 %	50 %	169235057
25	NC_010364	CGCT	2	8	10269	10276	0 %	25 %	25 %	50 %	169235057
26	NC_010364	ACCG	2	8	10664	10671	25 %	0 %	25 %	50 %	169235057
27	NC_010364	CGGC	2	8	10857	10864	0 %	0 %	50 %	50 %	169235057
28	NC_010364	CCCG	2	8	12101	12108	0 %	0 %	25 %	75 %	169235058
29	NC_010364	TCGG	2	8	12209	12216	0 %	25 %	50 %	25 %	169235058
30	NC_010364	CGAT	2	8	13551	13558	25 %	25 %	25 %	25 %	169235059
31	NC_010364	TCCA	2	8	13640	13647	25 %	25 %	0 %	50 %	169235059
32	NC_010364	ACGG	2	8	13692	13699	25 %	0 %	50 %	25 %	169235059
33	NC_010364	TCGC	2	8	13907	13914	0 %	25 %	25 %	50 %	169235060
34	NC_010364	TCGT	2	8	14143	14150	0 %	50 %	25 %	25 %	169235060
35	NC_010364	TTTA	2	8	15977	15984	25 %	75 %	0 %	0 %	169235064
36	NC_010364	ACGA	2	8	16388	16395	50 %	0 %	25 %	25 %	169235065
37	NC_010364	GCAG	2	8	17238	17245	25 %	0 %	50 %	25 %	169235065
38	NC_010364	ACAA	2	8	17479	17486	75 %	0 %	0 %	25 %	169235065
39	NC_010364	GTTC	2	8	17562	17569	0 %	50 %	25 %	25 %	169235065
40	NC_010364	ACTG	2	8	18506	18513	25 %	25 %	25 %	25 %	169235066
41	NC_010364	CCAG	2	8	18622	18629	25 %	0 %	25 %	50 %	169235066
42	NC_010364	AGTC	2	8	18780	18787	25 %	25 %	25 %	25 %	169235066
43	NC_010364	CAAG	2	8	18860	18867	50 %	0 %	25 %	25 %	169235066
44	NC_010364	TGAG	2	8	18896	18903	25 %	25 %	50 %	0 %	169235066
45	NC_010364	CCGG	2	8	19175	19182	0 %	0 %	50 %	50 %	169235067
46	NC_010364	TGCC	2	8	19322	19329	0 %	25 %	25 %	50 %	169235067
47	NC_010364	GACC	2	8	19365	19372	25 %	0 %	25 %	50 %	169235067
48	NC_010364	TCGC	2	8	19441	19448	0 %	25 %	25 %	50 %	169235067
49	NC_010364	CGAT	2	8	19469	19476	25 %	25 %	25 %	25 %	169235067
50	NC_010364	CTCC	2	8	20092	20099	0 %	25 %	0 %	75 %	169235068
51	NC_010364	AGCT	2	8	21148	21155	25 %	25 %	25 %	25 %	169235070
52	NC_010364	CGGT	2	8	21477	21484	0 %	25 %	50 %	25 %	169235070
53	NC_010364	GGTG	2	8	21561	21568	0 %	25 %	75 %	0 %	169235070
54	NC_010364	TTGG	2	8	22300	22307	0 %	50 %	50 %	0 %	169235071
55	NC_010364	CTGG	2	8	22341	22348	0 %	25 %	50 %	25 %	169235071
56	NC_010364	CACT	2	8	22566	22573	25 %	25 %	0 %	50 %	169235071
57	NC_010364	TGGC	2	8	22651	22658	0 %	25 %	50 %	25 %	169235071
58	NC_010364	CTTC	2	8	23555	23562	0 %	50 %	0 %	50 %	169235073
59	NC_010364	CGGC	2	8	23744	23751	0 %	0 %	50 %	50 %	169235073
60	NC_010364	GGGC	2	8	23846	23853	0 %	0 %	75 %	25 %	169235073
61	NC_010364	GCTG	2	8	23867	23874	0 %	25 %	50 %	25 %	169235073
62	NC_010364	CGAC	2	8	24171	24178	25 %	0 %	25 %	50 %	169235074
63	NC_010364	ACCC	2	8	24206	24213	25 %	0 %	0 %	75 %	169235074
64	NC_010364	CACC	2	8	24407	24414	25 %	0 %	0 %	75 %	169235074
65	NC_010364	CAAG	2	8	24458	24465	50 %	0 %	25 %	25 %	169235074
66	NC_010364	CAGT	2	8	24997	25004	25 %	25 %	25 %	25 %	169235075
67	NC_010364	TTCG	2	8	25163	25170	0 %	50 %	25 %	25 %	169235075
68	NC_010364	ACCA	2	8	26211	26218	50 %	0 %	0 %	50 %	169235076
69	NC_010364	ATCA	2	8	26249	26256	50 %	25 %	0 %	25 %	169235076
70	NC_010364	TGCC	2	8	26793	26800	0 %	25 %	25 %	50 %	169235077
71	NC_010364	GTCA	2	8	27252	27259	25 %	25 %	25 %	25 %	169235077
72	NC_010364	GAGT	2	8	27340	27347	25 %	25 %	50 %	0 %	169235077
73	NC_010364	TTCA	2	8	27520	27527	25 %	50 %	0 %	25 %	169235077
74	NC_010364	GGCA	2	8	28029	28036	25 %	0 %	50 %	25 %	169235077
75	NC_010364	CCGT	2	8	28672	28679	0 %	25 %	25 %	50 %	169235077
76	NC_010364	CTTC	2	8	30454	30461	0 %	50 %	0 %	50 %	169235080
77	NC_010364	GTTG	2	8	30493	30500	0 %	50 %	50 %	0 %	169235080
78	NC_010364	CCCG	2	8	31073	31080	0 %	0 %	25 %	75 %	169235080
79	NC_010364	CAAG	2	8	31146	31153	50 %	0 %	25 %	25 %	169235080
80	NC_010364	CGAA	2	8	31940	31947	50 %	0 %	25 %	25 %	169235081
81	NC_010364	CCGG	2	8	32123	32130	0 %	0 %	50 %	50 %	169235082
82	NC_010364	CGAA	2	8	32176	32183	50 %	0 %	25 %	25 %	169235082
83	NC_010364	TTGA	2	8	32687	32694	25 %	50 %	25 %	0 %	169235083
84	NC_010364	TCGT	2	8	32853	32860	0 %	50 %	25 %	25 %	169235083
85	NC_010364	TTGT	2	8	33344	33351	0 %	75 %	25 %	0 %	169235084
86	NC_010364	GTGG	2	8	35592	35599	0 %	25 %	75 %	0 %	169235086
87	NC_010364	TGTT	2	8	36545	36552	0 %	75 %	25 %	0 %	169235087
88	NC_010364	CCGA	2	8	36632	36639	25 %	0 %	25 %	50 %	169235087
89	NC_010364	AGAC	2	8	36834	36841	50 %	0 %	25 %	25 %	169235087
90	NC_010364	ACTC	2	8	37574	37581	25 %	25 %	0 %	50 %	169235088
91	NC_010364	ACCA	2	8	38000	38007	50 %	0 %	0 %	50 %	169235089
92	NC_010364	CCGA	2	8	38246	38253	25 %	0 %	25 %	50 %	169235089
93	NC_010364	GCAA	2	8	38497	38504	50 %	0 %	25 %	25 %	169235089
94	NC_010364	TCGC	2	8	38619	38626	0 %	25 %	25 %	50 %	169235089
95	NC_010364	CCAG	2	8	39334	39341	25 %	0 %	25 %	50 %	169235090
96	NC_010364	ATCT	2	8	39476	39483	25 %	50 %	0 %	25 %	169235090
97	NC_010364	CGGA	2	8	39872	39879	25 %	0 %	50 %	25 %	169235090
98	NC_010364	CAGT	2	8	40744	40751	25 %	25 %	25 %	25 %	169235091
99	NC_010364	GTGC	2	8	40821	40828	0 %	25 %	50 %	25 %	169235091
100	NC_010364	CGCT	2	8	40966	40973	0 %	25 %	25 %	50 %	169235091
101	NC_010364	CTGG	2	8	41015	41022	0 %	25 %	50 %	25 %	169235091
102	NC_010364	CGTC	2	8	41690	41697	0 %	25 %	25 %	50 %	169235091
103	NC_010364	ACTC	2	8	41907	41914	25 %	25 %	0 %	50 %	169235091
104	NC_010364	GGCT	2	8	42703	42710	0 %	25 %	50 %	25 %	169235092
105	NC_010364	GGGA	2	8	43222	43229	25 %	0 %	75 %	0 %	169235093
106	NC_010364	ACGA	2	8	43441	43448	50 %	0 %	25 %	25 %	169235093
107	NC_010364	TTCT	2	8	43461	43468	0 %	75 %	0 %	25 %	169235093
108	NC_010364	CATG	2	8	43901	43908	25 %	25 %	25 %	25 %	169235094
109	NC_010364	GCCA	2	8	43941	43948	25 %	0 %	25 %	50 %	169235094
110	NC_010364	AATC	2	8	44039	44046	50 %	25 %	0 %	25 %	169235094
111	NC_010364	CCTC	2	8	44101	44108	0 %	25 %	0 %	75 %	169235094
112	NC_010364	TGTT	2	8	44293	44300	0 %	75 %	25 %	0 %	169235094
113	NC_010364	AGTT	2	8	44465	44472	25 %	50 %	25 %	0 %	169235094
114	NC_010364	CTTC	2	8	44591	44598	0 %	50 %	0 %	50 %	169235094
115	NC_010364	ATGA	2	8	45542	45549	50 %	25 %	25 %	0 %	169235095
116	NC_010364	ATCG	2	8	45957	45964	25 %	25 %	25 %	25 %	169235095
117	NC_010364	CGCC	2	8	46994	47001	0 %	0 %	25 %	75 %	169235096
118	NC_010364	CCGT	2	8	47251	47258	0 %	25 %	25 %	50 %	169235096
119	NC_010364	GTAC	2	8	47263	47270	25 %	25 %	25 %	25 %	169235096
120	NC_010364	TGCT	2	8	48016	48023	0 %	50 %	25 %	25 %	169235096
121	NC_010364	TCAG	2	8	48296	48303	25 %	25 %	25 %	25 %	169235097
122	NC_010364	GGAA	2	8	50695	50702	50 %	0 %	50 %	0 %	169235098
123	NC_010364	CGAG	2	8	50764	50771	25 %	0 %	50 %	25 %	169235098
124	NC_010364	GAAC	2	8	51716	51723	50 %	0 %	25 %	25 %	169235100
125	NC_010364	GGTC	2	8	51971	51978	0 %	25 %	50 %	25 %	169235100
126	NC_010364	CGTC	2	8	52226	52233	0 %	25 %	25 %	50 %	169235100
127	NC_010364	CGTT	2	8	52912	52919	0 %	50 %	25 %	25 %	169235100
128	NC_010364	GGCA	2	8	54015	54022	25 %	0 %	50 %	25 %	169235101
129	NC_010364	GTGG	2	8	54795	54802	0 %	25 %	75 %	0 %	169235102
130	NC_010364	ATCC	2	8	55970	55977	25 %	25 %	0 %	50 %	169235103
131	NC_010364	TTGC	2	8	57396	57403	0 %	50 %	25 %	25 %	169235104
132	NC_010364	ACCC	2	8	57875	57882	25 %	0 %	0 %	75 %	169235104
133	NC_010364	GAAC	2	8	58260	58267	50 %	0 %	25 %	25 %	169235105
134	NC_010364	CAGT	2	8	58609	58616	25 %	25 %	25 %	25 %	169235105
135	NC_010364	TCGC	2	8	58898	58905	0 %	25 %	25 %	50 %	169235106
136	NC_010364	AAAT	2	8	58976	58983	75 %	25 %	0 %	0 %	169235106
137	NC_010364	TCGC	2	8	59068	59075	0 %	25 %	25 %	50 %	169235106
138	NC_010364	CCGA	2	8	59285	59292	25 %	0 %	25 %	50 %	169235106
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