MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 2703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010364	CGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010364	CCA	2	6	103	108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010364	CCT	2	6	182	187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_010364	CGC	2	6	210	215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010364	CGC	2	6	9874	9879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010364	GTG	2	6	11430	11435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010364	CTC	2	6	12797	12802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010364	AAC	2	6	13100	13105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010364	ACG	2	6	13202	13207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010364	TCG	2	6	13226	13231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010364	GAC	2	6	13393	13398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010364	TAA	2	6	14249	14254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010364	TCC	2	6	14336	14341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010364	TCT	2	6	14363	14368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010364	CGA	2	6	14460	14465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010364	CGG	2	6	14783	14788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010364	CCA	2	6	15193	15198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010364	GGC	2	6	15205	15210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010364	GAT	2	6	15251	15256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010364	TTA	2	6	15280	15285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010364	TCT	2	6	16053	16058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010364	CTT	2	6	16220	16225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010364	CTG	2	6	16263	16268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010364	GAA	2	6	17853	17858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010364	GCA	2	6	17943	17948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010364	TTA	2	6	17951	17956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010364	CTG	2	6	17999	18004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010364	GGA	2	6	18077	18082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010364	TAC	2	6	18276	18281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010364	GGA	2	6	18311	18316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010364	CGA	2	6	18336	18341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010364	TCC	2	6	19533	19538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010364	AGA	2	6	20165	20170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010364	GTA	2	6	21799	21804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010364	ACT	2	6	21810	21815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010364	CTC	2	6	21849	21854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010364	GAG	2	6	21887	21892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010364	GCA	2	6	21929	21934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010364	CTG	2	6	22019	22024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010364	GAC	2	6	22043	22048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010364	ACC	2	6	22806	22811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010364	TTC	2	6	22848	22853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010364	TTC	2	6	22859	22864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010364	TGG	2	6	22938	22943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010364	GTG	2	6	22950	22955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010364	TCG	2	6	22956	22961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010364	GCA	2	6	22994	22999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010364	ATA	2	6	23072	23077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010364	AGT	2	6	23952	23957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010364	CAA	2	6	24095	24100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010364	ACC	3	9	24600	24608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010364	GGT	2	6	24776	24781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010364	CCT	2	6	24794	24799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010364	GTT	2	6	24806	24811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010364	TAT	2	6	24852	24857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010364	TGC	2	6	24885	24890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010364	CAC	2	6	25309	25314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010364	TCG	2	6	25349	25354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010364	CAG	2	6	25381	25386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010364	TCT	2	6	25395	25400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010364	ACT	2	6	25639	25644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010364	TGG	2	6	25669	25674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010364	CCA	2	6	25698	25703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010364	CAC	2	6	25874	25879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010364	GTA	2	6	25884	25889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010364	ACG	2	6	25939	25944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010364	ACG	2	6	25977	25982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010364	ATA	2	6	26004	26009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010364	CGA	2	6	26030	26035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010364	GGC	2	6	26043	26048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010364	AAC	2	6	26049	26054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010364	ATT	2	6	26119	26124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010364	CCG	2	6	29431	29436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010364	CGT	2	6	29933	29938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010364	GTG	2	6	29983	29988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010364	GGT	2	6	30039	30044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010364	GCT	2	6	30086	30091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010364	TGT	2	6	30100	30105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010364	GAT	2	6	30132	30137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010364	AGA	2	6	30224	30229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010364	GTT	2	6	30288	30293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010364	GAC	2	6	30299	30304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010364	GGC	2	6	30344	30349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010364	GAC	2	6	31370	31375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010364	CGT	2	6	31454	31459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010364	GTG	2	6	31464	31469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010364	GAC	2	6	31478	31483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010364	CGT	2	6	31534	31539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010364	AAC	2	6	31694	31699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010364	GGT	2	6	31722	31727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010364	TAC	2	6	31794	31799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010364	GTG	2	6	32402	32407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010364	CCG	2	6	32490	32495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_010364	CTC	2	6	33007	33012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010364	TCC	2	6	33030	33035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010364	AGG	2	6	33038	33043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010364	CTA	2	6	33048	33053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010364	CGA	2	6	33099	33104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010364	CCG	2	6	33113	33118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_010364	GCG	2	6	33173	33178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010364	CCA	2	6	33922	33927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010364	AGT	2	6	34124	34129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010364	TGG	2	6	34176	34181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010364	TCG	2	6	34221	34226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010364	CTG	2	6	34227	34232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010364	TTC	2	6	34233	34238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010364	TTC	2	6	34264	34269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010364	TGA	2	6	34398	34403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010364	TCG	2	6	34538	34543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010364	GCA	2	6	34590	34595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010364	TCC	2	6	34602	34607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010364	TTG	2	6	35978	35983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010364	CAG	2	6	35993	35998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010364	CAG	2	6	36012	36017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010364	CGA	2	6	36043	36048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010364	CAA	2	6	36942	36947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010364	AAC	2	6	37087	37092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010364	GAG	2	6	37210	37215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010364	CAA	2	6	37251	37256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010364	CTG	2	6	37273	37278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010364	GGA	2	6	39027	39032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010364	AGG	2	6	39064	39069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010364	TGG	2	6	39093	39098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010364	TGT	2	6	39101	39106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010364	TCT	2	6	39107	39112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010364	GTG	2	6	39143	39148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010364	GGT	2	6	39178	39183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010364	TAT	2	6	39186	39191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010364	ACT	2	6	40527	40532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010364	ATT	2	6	40587	40592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010364	CGC	2	6	41938	41943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010364	TAC	2	6	42778	42783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010364	ATT	3	9	42861	42869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010364	CTG	2	6	42871	42876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010364	TAA	2	6	42883	42888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010364	TCG	2	6	43685	43690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010364	ATT	2	6	45202	45207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010364	TCT	2	6	46504	46509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010364	ATG	2	6	46559	46564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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