MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caulobacter sp. K31 chromosome

Total Repeats: 5066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010338	GCCGA	2	10	734	743	20 %	0 %	40 %	40 %	167643974
2	NC_010338	CCTGG	2	10	982	991	0 %	20 %	40 %	40 %	167643974
3	NC_010338	ACCAC	2	10	1746	1755	40 %	0 %	0 %	60 %	167643974
4	NC_010338	GCCCG	2	10	4896	4905	0 %	0 %	40 %	60 %	167643976
5	NC_010338	GAAGT	2	10	6436	6445	40 %	20 %	40 %	0 %	167643977
6	NC_010338	CGGTT	2	10	7960	7969	0 %	40 %	40 %	20 %	167643978
7	NC_010338	CGCGC	3	15	11454	11468	0 %	0 %	40 %	60 %	167643981
8	NC_010338	GCCGA	2	10	12355	12364	20 %	0 %	40 %	40 %	167643981
9	NC_010338	GCGCG	2	10	12573	12582	0 %	0 %	60 %	40 %	167643981
10	NC_010338	CCGGG	2	10	14104	14113	0 %	0 %	60 %	40 %	167643982
11	NC_010338	CCTTG	2	10	16722	16731	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010338	GGTTC	2	10	16937	16946	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010338	CCGAC	2	10	20942	20951	20 %	0 %	20 %	60 %	167643985
14	NC_010338	CGGGC	2	10	22050	22059	0 %	0 %	60 %	40 %	167643988
15	NC_010338	CGGCG	2	10	23247	23256	0 %	0 %	60 %	40 %	167643989
16	NC_010338	CCGGC	2	10	23465	23474	0 %	0 %	40 %	60 %	167643990
17	NC_010338	GGAGC	2	10	23898	23907	20 %	0 %	60 %	20 %	167643990
18	NC_010338	ACGAC	2	10	26315	26324	40 %	0 %	20 %	40 %	167643993
19	NC_010338	GTCCT	2	10	29467	29476	0 %	40 %	20 %	40 %	167643996
20	NC_010338	GGGAG	2	10	31239	31248	20 %	0 %	80 %	0 %	167643998
21	NC_010338	CGCCC	2	10	34772	34781	0 %	0 %	20 %	80 %	167644001
22	NC_010338	TGGTC	2	10	35805	35814	0 %	40 %	40 %	20 %	167644003
23	NC_010338	CGATC	2	10	35988	35997	20 %	20 %	20 %	40 %	167644003
24	NC_010338	TGGGT	2	10	37924	37933	0 %	40 %	60 %	0 %	167644004
25	NC_010338	GCGCG	2	10	38472	38481	0 %	0 %	60 %	40 %	167644005
26	NC_010338	GCGCC	2	10	39362	39371	0 %	0 %	40 %	60 %	167644006
27	NC_010338	CCCCG	3	15	39612	39626	0 %	0 %	20 %	80 %	167644006
28	NC_010338	CCCCG	2	10	40131	40140	0 %	0 %	20 %	80 %	167644006
29	NC_010338	ACCGC	2	10	41149	41158	20 %	0 %	20 %	60 %	167644006
30	NC_010338	CGGCG	2	10	43102	43111	0 %	0 %	60 %	40 %	167644008
31	NC_010338	CGGCG	2	10	44905	44914	0 %	0 %	60 %	40 %	167644009
32	NC_010338	GCCTG	2	10	45572	45581	0 %	20 %	40 %	40 %	167644010
33	NC_010338	CGGGC	2	10	45998	46007	0 %	0 %	60 %	40 %	167644010
34	NC_010338	GACCT	2	10	46794	46803	20 %	20 %	20 %	40 %	167644012
35	NC_010338	GGCGA	2	10	46908	46917	20 %	0 %	60 %	20 %	167644012
36	NC_010338	CTGGC	2	10	49419	49428	0 %	20 %	40 %	40 %	167644014
37	NC_010338	CCAGG	2	10	50446	50455	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_010338	CCGCG	2	10	50733	50742	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_010338	CGCCA	2	10	51786	51795	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_010338	GCCGG	2	10	52237	52246	0 %	0 %	60 %	40 %	167644016
41	NC_010338	CGATA	2	10	53231	53240	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010338	CGGCG	2	10	54408	54417	0 %	0 %	60 %	40 %	167644017
43	NC_010338	CGGCC	2	10	54744	54753	0 %	0 %	40 %	60 %	167644017
44	NC_010338	GCGCG	2	10	55338	55347	0 %	0 %	60 %	40 %	167644017
45	NC_010338	GACCT	2	10	57527	57536	20 %	20 %	20 %	40 %	167644019
46	NC_010338	GGCCC	2	10	57655	57664	0 %	0 %	40 %	60 %	167644019
47	NC_010338	GGCGG	2	10	59781	59790	0 %	0 %	80 %	20 %	167644020
48	NC_010338	TCGTC	2	10	60490	60499	0 %	40 %	20 %	40 %	167644020
49	NC_010338	GGCCT	2	10	62523	62532	0 %	20 %	40 %	40 %	167644022
50	NC_010338	ACGGC	2	10	63288	63297	20 %	0 %	40 %	40 %	167644023
51	NC_010338	TTCGG	2	10	64436	64445	0 %	40 %	40 %	20 %	167644023
52	NC_010338	GTCGC	2	10	66719	66728	0 %	20 %	40 %	40 %	167644027
53	NC_010338	GCCAT	2	10	67493	67502	20 %	20 %	20 %	40 %	167644028
54	NC_010338	AGGGC	2	10	70511	70520	20 %	0 %	60 %	20 %	167644034
55	NC_010338	GGCGC	2	10	70830	70839	0 %	0 %	60 %	40 %	167644034
56	NC_010338	CCGGC	2	10	71080	71089	0 %	0 %	40 %	60 %	167644034
57	NC_010338	GCGCG	2	10	73347	73356	0 %	0 %	60 %	40 %	167644037
58	NC_010338	TCGGC	2	10	73409	73418	0 %	20 %	40 %	40 %	167644037
59	NC_010338	CCTGG	2	10	75001	75010	0 %	20 %	40 %	40 %	167644039
60	NC_010338	CGGCG	2	10	75502	75511	0 %	0 %	60 %	40 %	167644039
61	NC_010338	CGGCG	2	10	76270	76279	0 %	0 %	60 %	40 %	167644040
62	NC_010338	GAGCC	2	10	76951	76960	20 %	0 %	40 %	40 %	167644040
63	NC_010338	CTGGG	2	10	79453	79462	0 %	20 %	60 %	20 %	167644040
64	NC_010338	CGCGC	2	10	80481	80490	0 %	0 %	40 %	60 %	167644040
65	NC_010338	CGCTG	2	10	80871	80880	0 %	20 %	40 %	40 %	167644040
66	NC_010338	TCGGC	2	10	82162	82171	0 %	20 %	40 %	40 %	167644041
67	NC_010338	GGGCG	2	10	82526	82535	0 %	0 %	80 %	20 %	167644041
68	NC_010338	GACCT	2	10	83106	83115	20 %	20 %	20 %	40 %	167644041
69	NC_010338	GCCTC	2	10	83277	83286	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_010338	GCCGC	2	10	84771	84780	0 %	0 %	40 %	60 %	167644043
71	NC_010338	CCAGG	2	10	85071	85080	20 %	0 %	40 %	40 %	167644043
72	NC_010338	TAGGC	2	10	85658	85667	20 %	20 %	40 %	20 %	167644044
73	NC_010338	GCCGC	2	10	89236	89245	0 %	0 %	40 %	60 %	167644047
74	NC_010338	CGTCG	2	10	89869	89878	0 %	20 %	40 %	40 %	167644047
75	NC_010338	GAGAT	2	10	91175	91184	40 %	20 %	40 %	0 %	167644047
76	NC_010338	CCGGG	2	10	91318	91327	0 %	0 %	60 %	40 %	167644048
77	NC_010338	GCGCT	2	10	92369	92378	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_010338	CCGGC	2	10	92739	92748	0 %	0 %	40 %	60 %	167644050
79	NC_010338	GGCGA	2	10	92875	92884	20 %	0 %	60 %	20 %	167644050
80	NC_010338	CACCG	2	10	93010	93019	20 %	0 %	20 %	60 %	167644050
81	NC_010338	CCTGG	2	10	93547	93556	0 %	20 %	40 %	40 %	167644050
82	NC_010338	GACGA	2	10	93601	93610	40 %	0 %	40 %	20 %	167644050
83	NC_010338	GCGAG	2	10	93704	93713	20 %	0 %	60 %	20 %	167644051
84	NC_010338	CGATC	2	10	95918	95927	20 %	20 %	20 %	40 %	167644052
85	NC_010338	CGGCC	2	10	98983	98992	0 %	0 %	40 %	60 %	167644057
86	NC_010338	AACGC	2	10	99650	99659	40 %	0 %	20 %	40 %	167644058
87	NC_010338	ACGCG	2	10	101995	102004	20 %	0 %	40 %	40 %	167644062
88	NC_010338	GGCTC	2	10	102461	102470	0 %	20 %	40 %	40 %	167644063
89	NC_010338	GGTCG	2	10	103898	103907	0 %	20 %	60 %	20 %	167644065
90	NC_010338	CGAGG	2	10	105933	105942	20 %	0 %	60 %	20 %	167644067
91	NC_010338	CCGGC	2	10	106029	106038	0 %	0 %	40 %	60 %	167644067
92	NC_010338	GTCCT	2	10	106068	106077	0 %	40 %	20 %	40 %	167644067
93	NC_010338	CCGAA	2	10	106868	106877	40 %	0 %	20 %	40 %	167644068
94	NC_010338	CCAGG	2	10	107528	107537	20 %	0 %	40 %	40 %	167644069
95	NC_010338	CGACG	2	10	108638	108647	20 %	0 %	40 %	40 %	167644071
96	NC_010338	AGGCC	2	10	109166	109175	20 %	0 %	40 %	40 %	167644072
97	NC_010338	GGGGC	2	10	109506	109515	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010338	CATGC	2	10	109665	109674	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_010338	ACGCG	2	10	110236	110245	20 %	0 %	40 %	40 %	167644073
100	NC_010338	CATCG	2	10	111667	111676	20 %	20 %	20 %	40 %	167644074
101	NC_010338	TCGCG	2	10	113130	113139	0 %	20 %	40 %	40 %	167644076
102	NC_010338	CGCCC	2	10	114771	114780	0 %	0 %	20 %	80 %	167644077
103	NC_010338	GGCTT	2	10	119165	119174	0 %	40 %	40 %	20 %	167644080
104	NC_010338	GGGGC	2	10	119524	119533	0 %	0 %	80 %	20 %	167644081
105	NC_010338	GCGCG	2	10	120209	120218	0 %	0 %	60 %	40 %	167644081
106	NC_010338	TCGCG	2	10	120279	120288	0 %	20 %	40 %	40 %	167644081
107	NC_010338	CGGGG	3	15	121833	121847	0 %	0 %	80 %	20 %	167644083
108	NC_010338	GCGTG	2	10	122173	122182	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010338	CGGCG	2	10	122354	122363	0 %	0 %	60 %	40 %	167644084
110	NC_010338	CCGGG	2	10	123110	123119	0 %	0 %	60 %	40 %	167644084
111	NC_010338	ACCCA	2	10	123204	123213	40 %	0 %	0 %	60 %	167644084
112	NC_010338	CCAGG	2	10	123281	123290	20 %	0 %	40 %	40 %	167644084
113	NC_010338	TCCAG	2	10	123982	123991	20 %	20 %	20 %	40 %	167644084
114	NC_010338	GGGGC	2	10	124173	124182	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010338	GGGCG	2	10	124988	124997	0 %	0 %	80 %	20 %	167644085
116	NC_010338	GCCCG	2	10	125324	125333	0 %	0 %	40 %	60 %	167644086
117	NC_010338	CGGAG	2	10	125978	125987	20 %	0 %	60 %	20 %	167644086
118	NC_010338	GGCGA	2	10	126387	126396	20 %	0 %	60 %	20 %	167644087
119	NC_010338	GCGGG	2	10	126429	126438	0 %	0 %	80 %	20 %	167644087
120	NC_010338	TCAGC	2	10	127302	127311	20 %	20 %	20 %	40 %	167644089
121	NC_010338	CCGCC	2	10	127401	127410	0 %	0 %	20 %	80 %	167644089
122	NC_010338	AGCAC	2	10	127650	127659	40 %	0 %	20 %	40 %	167644089
123	NC_010338	GGCCC	2	10	128780	128789	0 %	0 %	40 %	60 %	167644090
124	NC_010338	GCGCG	2	10	130460	130469	0 %	0 %	60 %	40 %	167644092
125	NC_010338	GCGCG	2	10	130844	130853	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_010338	CGGCC	2	10	131277	131286	0 %	0 %	40 %	60 %	167644093
127	NC_010338	TGTCT	2	10	133794	133803	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010338	CTCGG	2	10	135886	135895	0 %	20 %	40 %	40 %	167644096
129	NC_010338	CGCGG	2	10	137080	137089	0 %	0 %	60 %	40 %	167644097
130	NC_010338	CCAGC	2	10	137232	137241	20 %	0 %	20 %	60 %	167644097
131	NC_010338	CCCAG	2	10	137721	137730	20 %	0 %	20 %	60 %	167644098
132	NC_010338	CGGCG	2	10	139207	139216	0 %	0 %	60 %	40 %	167644098
133	NC_010338	CGCGG	2	10	142028	142037	0 %	0 %	60 %	40 %	167644100
134	NC_010338	AGGCC	2	10	142323	142332	20 %	0 %	40 %	40 %	167644101
135	NC_010338	CCGCC	2	10	143997	144006	0 %	0 %	20 %	80 %	167644103
136	NC_010338	CCGGC	2	10	144038	144047	0 %	0 %	40 %	60 %	167644103
137	NC_010338	AGGCC	2	10	144404	144413	20 %	0 %	40 %	40 %	167644104
138	NC_010338	CGCGG	2	10	147217	147226	0 %	0 %	60 %	40 %	167644106
139	NC_010338	CGGGG	2	10	148344	148353	0 %	0 %	80 %	20 %	167644108
140	NC_010338	CCAGC	2	10	149085	149094	20 %	0 %	20 %	60 %	167644109
141	NC_010338	CGAGG	2	10	151642	151651	20 %	0 %	60 %	20 %	167644110
142	NC_010338	CGAGT	2	10	152873	152882	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010338	CGGCC	2	10	154035	154044	0 %	0 %	40 %	60 %	167644112
144	NC_010338	CAAAA	2	10	155340	155349	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010338	GCGTC	2	10	156188	156197	0 %	20 %	40 %	40 %	167644115
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151	NC_010338	CGGCG	2	10	164306	164315	0 %	0 %	60 %	40 %	167644121
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158	NC_010338	CGCCC	2	10	169653	169662	0 %	0 %	20 %	80 %	167644124
159	NC_010338	GCCAG	2	10	170028	170037	20 %	0 %	40 %	40 %	167644124
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161	NC_010338	CCGCC	2	10	172877	172886	0 %	0 %	20 %	80 %	167644126
162	NC_010338	CGCGT	2	10	173662	173671	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_010338	CCAAC	2	10	173841	173850	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
164	NC_010338	TCGCC	2	10	173926	173935	0 %	20 %	20 %	60 %	167644127
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166	NC_010338	GATGG	2	10	180965	180974	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010338	ATCAG	2	10	181978	181987	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_010338	GATCG	2	10	194712	194721	20 %	20 %	40 %	20 %	167644150
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189	NC_010338	GGCCG	2	10	196175	196184	0 %	0 %	60 %	40 %	167644151
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234	NC_010338	CGCGC	2	10	237450	237459	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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236	NC_010338	GCCGC	2	10	239580	239589	0 %	0 %	40 %	60 %	167644194
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239	NC_010338	TTCAT	2	10	241997	242006	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
240	NC_010338	AGGGG	2	10	242140	242149	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_010338	TGGCG	2	10	245220	245229	0 %	20 %	60 %	20 %	167644199
245	NC_010338	CCTGG	2	10	245529	245538	0 %	20 %	40 %	40 %	167644199
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249	NC_010338	TGGCG	2	10	256568	256577	0 %	20 %	60 %	20 %	167644206
250	NC_010338	CTCGG	2	10	257632	257641	0 %	20 %	40 %	40 %	167644207
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256	NC_010338	GCGCG	2	10	263537	263546	0 %	0 %	60 %	40 %	167644210
257	NC_010338	GCTTC	2	10	263999	264008	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
258	NC_010338	GCCGA	2	10	264166	264175	20 %	0 %	40 %	40 %	167644211
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263	NC_010338	GGCCA	2	10	269431	269440	20 %	0 %	40 %	40 %	167644214
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266	NC_010338	CCAGC	2	10	272078	272087	20 %	0 %	20 %	60 %	167644217
267	NC_010338	GGGCC	2	10	272249	272258	0 %	0 %	60 %	40 %	167644217
268	NC_010338	CGGCC	2	10	277534	277543	0 %	0 %	40 %	60 %	167644222
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401	NC_010338	TGGCC	2	10	414101	414110	0 %	20 %	40 %	40 %	167644345
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