MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Heliobacterium modesticaldum Ice1 chromosome

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010337	GCCTCT	2	12	54935	54946	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010337	ATTATA	2	12	112802	112813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010337	TTTCCG	2	12	119294	119305	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010337	GAGGCG	2	12	183459	183470	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010337	GAAAAA	2	12	197573	197584	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010337	TCGCTT	2	12	223508	223519	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010337	CGGCTT	2	12	223520	223531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010337	TCAGCG	2	12	226722	226733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010337	CAAGGG	2	12	263537	263548	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010337	CCCTTC	2	12	289440	289451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010337	ATTTTC	2	12	307031	307042	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010337	GAAAAT	2	12	328656	328667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010337	CCTAAG	2	12	333576	333587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010337	TCAATG	2	12	363137	363148	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010337	CATAAA	2	12	369233	369244	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010337	GAATTT	2	12	370817	370828	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010337	CAGGCC	2	12	372605	372616	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010337	AGAAAA	2	12	398512	398523	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010337	GTCCCT	2	12	430818	430829	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010337	CAAAAG	2	12	473527	473538	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010337	TCATTC	2	12	523308	523319	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010337	TATTTG	2	12	537439	537450	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010337	AATATG	2	12	561063	561074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010337	ATTCGT	2	12	580959	580970	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010337	TGGCCA	2	12	602490	602501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010337	TCCCTG	2	12	623314	623325	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010337	GCCCTT	2	12	626118	626129	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010337	GCATCA	2	12	627450	627461	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010337	CAAGGG	2	12	631787	631798	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010337	CAGCGG	2	12	687081	687092	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010337	TAAGAT	2	12	718502	718513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010337	CAAGGG	2	12	756383	756394	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010337	CGGCTT	2	12	775942	775953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010337	GAAAGA	2	12	800378	800389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010337	TCTATG	2	12	881030	881041	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010337	CGATGA	2	12	909746	909757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010337	TCAGCG	2	12	934356	934367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010337	CCTGTC	2	12	939179	939190	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010337	ATCTGT	2	12	977016	977027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010337	TCGCTT	2	12	981186	981197	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010337	CGGCTT	2	12	981198	981209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010337	TCAGCG	2	12	984383	984394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010337	CCGTCG	2	12	1009849	1009860	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010337	CGATGG	2	12	1009948	1009959	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010337	GCGGCA	2	12	1027169	1027180	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010337	GCCCTT	2	12	1059785	1059796	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010337	GTTCCC	2	12	1061643	1061654	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010337	AGCCGA	2	12	1126469	1126480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010337	GGTCCC	2	12	1166063	1166074	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010337	CGGTCG	2	12	1166086	1166097	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010337	TAGACC	2	12	1255600	1255611	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010337	TCTTTA	2	12	1319482	1319493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010337	CATATC	2	12	1319625	1319636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010337	GTCGAG	2	12	1354835	1354846	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010337	AGCCGA	2	12	1356143	1356154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010337	TTGTCC	2	12	1374506	1374517	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010337	TAATGT	2	12	1375999	1376010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010337	GCTACA	2	12	1424187	1424198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010337	CTTCGC	2	12	1424238	1424249	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010337	ACAAAG	2	12	1454384	1454395	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010337	TCCCTG	2	12	1460178	1460189	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010337	GCCCTT	2	12	1462719	1462730	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010337	AAGATT	2	12	1465331	1465342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010337	TGACTT	2	12	1478639	1478650	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010337	GATGGG	2	12	1513237	1513248	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010337	CAAGGG	2	12	1565824	1565835	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010337	ACAAAG	2	12	1567414	1567425	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010337	TGTAGA	2	12	1569682	1569693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010337	ATTACT	2	12	1571870	1571881	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010337	TCCCTG	2	12	1578350	1578361	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010337	TTTAAA	2	12	1596359	1596370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010337	GAAAAA	2	12	1611692	1611703	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010337	TCGACA	2	12	1671485	1671496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010337	CGGGAG	2	12	1708811	1708822	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010337	GCTTCG	2	12	1770764	1770775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010337	TCCGCG	2	12	1790414	1790425	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010337	TTTCGA	2	12	1804798	1804809	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010337	CGCTGA	2	12	1818575	1818586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010337	GTCGAG	2	12	1820386	1820397	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010337	AGCCGA	2	12	1821811	1821822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010337	CAAAAA	2	12	1835732	1835743	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010337	GAAGGC	2	12	1837681	1837692	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010337	AGCAGA	2	12	1876141	1876152	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010337	GTCATC	2	12	1902187	1902198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010337	GGTTTT	2	12	2049933	2049944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010337	GTAATG	2	12	2052176	2052187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010337	GCGCGG	2	12	2069472	2069483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010337	CATCCT	2	12	2078032	2078043	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010337	GGCCTC	2	12	2140200	2140211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010337	CGCTGA	2	12	2280325	2280336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010337	GTCGAG	2	12	2282119	2282130	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010337	AGCCGA	2	12	2283467	2283478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010337	GAAGGT	2	12	2329903	2329914	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010337	GTCGAG	2	12	2329992	2330003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010337	AGCCGA	2	12	2331267	2331278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010337	TGAGGC	2	12	2338367	2338378	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010337	AGCCGA	2	12	2347329	2347340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010337	TGTTTT	2	12	2349882	2349893	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010337	GGATCA	2	12	2459586	2459597	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010337	TTTTTA	2	12	2528674	2528685	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010337	TCCTTA	2	12	2578618	2578629	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010337	AATATT	2	12	2675640	2675651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010337	CAAAAA	2	12	2719116	2719127	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010337	CGGCTT	2	12	2731122	2731133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010337	CAATTT	2	12	2777199	2777210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010337	CCTTTT	2	12	2786281	2786292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010337	TCGCTT	2	12	2795909	2795920	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010337	CGGCTT	2	12	2795921	2795932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010337	AATCCT	2	12	2802097	2802108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010337	GAAAAA	2	12	2804652	2804663	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010337	GATTGA	2	12	2900149	2900160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010337	CGTCGG	2	12	2922684	2922695	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010337	GGTGCG	2	12	2937137	2937148	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010337	TGTTTC	2	12	2952132	2952143	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010337	CCCGTC	2	12	2953770	2953781	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_010337	TGAGGA	2	12	2985913	2985924	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010337	GTTAAT	2	12	3027373	3027384	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010337	AATAGA	2	12	3027641	3027652	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010337	CTCCCT	2	12	3032076	3032087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_010337	TCGCTT	2	12	3035083	3035094	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010337	CGGCTT	2	12	3035095	3035106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010337	TCAGCG	2	12	3038201	3038212	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.