MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Heliobacterium modesticaldum Ice1 chromosome

Total Repeats: 2045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010337	TCCGC	2	10	1082	1091	0 %	20 %	20 %	60 %	167628138
2	NC_010337	CCAGA	2	10	1176	1185	40 %	0 %	20 %	40 %	167628138
3	NC_010337	ATCGG	2	10	3594	3603	20 %	20 %	40 %	20 %	167628143
4	NC_010337	ACTGC	2	10	3706	3715	20 %	20 %	20 %	40 %	167628143
5	NC_010337	ATTCC	2	10	4262	4271	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010337	GTCAC	2	10	7358	7367	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010337	CCAGC	2	10	7547	7556	20 %	0 %	20 %	60 %	167628149
8	NC_010337	TCGAT	2	10	7841	7850	20 %	40 %	20 %	20 %	167628150
9	NC_010337	AAAGA	2	10	9135	9144	80 %	0 %	20 %	0 %	167628150
10	NC_010337	GCCGC	2	10	10234	10243	0 %	0 %	40 %	60 %	167628152
11	NC_010337	GGAAG	2	10	16239	16248	40 %	0 %	60 %	0 %	167628158
12	NC_010337	GCCGA	2	10	16394	16403	20 %	0 %	40 %	40 %	167628159
13	NC_010337	TGTCA	2	10	18966	18975	20 %	40 %	20 %	20 %	167628164
14	NC_010337	TGAAT	2	10	19077	19086	40 %	40 %	20 %	0 %	167628164
15	NC_010337	GTTCA	2	10	19101	19110	20 %	40 %	20 %	20 %	167628164
16	NC_010337	TTTCT	2	10	20068	20077	0 %	80 %	0 %	20 %	167628165
17	NC_010337	GCAAA	2	10	20626	20635	60 %	0 %	20 %	20 %	167628165
18	NC_010337	ATCGA	2	10	21364	21373	40 %	20 %	20 %	20 %	167628165
19	NC_010337	GGGCA	2	10	23035	23044	20 %	0 %	60 %	20 %	167628167
20	NC_010337	GCTTT	2	10	27703	27712	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010337	AATCC	2	10	29834	29843	40 %	20 %	0 %	40 %	167628175
22	NC_010337	GAACC	2	10	31183	31192	40 %	0 %	20 %	40 %	167628177
23	NC_010337	TGTTC	2	10	32022	32031	0 %	60 %	20 %	20 %	167628178
24	NC_010337	TATAA	2	10	32375	32384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010337	CCTGC	2	10	35950	35959	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_010337	CCGCT	2	10	37830	37839	0 %	20 %	20 %	60 %	167628185
27	NC_010337	GTATC	2	10	40482	40491	20 %	40 %	20 %	20 %	167628186
28	NC_010337	AAATA	2	10	41922	41931	80 %	20 %	0 %	0 %	167628188
29	NC_010337	AGCGG	2	10	44598	44607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010337	AAAGC	2	10	46843	46852	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010337	CCCCG	2	10	48863	48872	0 %	0 %	20 %	80 %	167628195
32	NC_010337	ACCCG	2	10	50497	50506	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_010337	ATCGC	2	10	51210	51219	20 %	20 %	20 %	40 %	167628199
34	NC_010337	CGAAG	2	10	53102	53111	40 %	0 %	40 %	20 %	167628201
35	NC_010337	CGAAC	2	10	54568	54577	40 %	0 %	20 %	40 %	167628204
36	NC_010337	CCTCA	2	10	56543	56552	20 %	20 %	0 %	60 %	167628207
37	NC_010337	GTTTT	2	10	57167	57176	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010337	CCGAT	2	10	58156	58165	20 %	20 %	20 %	40 %	167628208
39	NC_010337	CGTTC	2	10	58445	58454	0 %	40 %	20 %	40 %	167628208
40	NC_010337	AGCGA	2	10	59696	59705	40 %	0 %	40 %	20 %	167628209
41	NC_010337	CTTTC	2	10	60241	60250	0 %	60 %	0 %	40 %	167628210
42	NC_010337	CATCG	2	10	61439	61448	20 %	20 %	20 %	40 %	167628210
43	NC_010337	GATCT	2	10	63065	63074	20 %	40 %	20 %	20 %	167628211
44	NC_010337	CTCGT	2	10	63773	63782	0 %	40 %	20 %	40 %	167628212
45	NC_010337	TCGGC	2	10	65930	65939	0 %	20 %	40 %	40 %	167628213
46	NC_010337	GCCGG	2	10	66825	66834	0 %	0 %	60 %	40 %	167628213
47	NC_010337	CGTCC	2	10	68625	68634	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_010337	AAGGC	2	10	73874	73883	40 %	0 %	40 %	20 %	167628221
49	NC_010337	CGTCG	2	10	79554	79563	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010337	CGATC	2	10	80180	80189	20 %	20 %	20 %	40 %	167628229
51	NC_010337	CGCCC	2	10	80274	80283	0 %	0 %	20 %	80 %	167628229
52	NC_010337	TCGGG	2	10	84495	84504	0 %	20 %	60 %	20 %	167628233
53	NC_010337	CGAGG	2	10	84849	84858	20 %	0 %	60 %	20 %	167628233
54	NC_010337	TCCCG	2	10	85586	85595	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_010337	GAACG	2	10	86267	86276	40 %	0 %	40 %	20 %	167628234
56	NC_010337	AGCAG	2	10	86689	86698	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_010337	CGGTC	2	10	86906	86915	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_010337	GCCTC	2	10	87581	87590	0 %	20 %	20 %	60 %	167628236
59	NC_010337	GGCAA	2	10	89155	89164	40 %	0 %	40 %	20 %	167628239
60	NC_010337	AGTCC	2	10	90827	90836	20 %	20 %	20 %	40 %	167628241
61	NC_010337	CTGAC	2	10	93140	93149	20 %	20 %	20 %	40 %	167628242
62	NC_010337	TCACT	2	10	93612	93621	20 %	40 %	0 %	40 %	167628243
63	NC_010337	CGCTG	2	10	94165	94174	0 %	20 %	40 %	40 %	167628244
64	NC_010337	CGGGA	2	10	100976	100985	20 %	0 %	60 %	20 %	167628250
65	NC_010337	GAACG	2	10	102875	102884	40 %	0 %	40 %	20 %	167628252
66	NC_010337	TCGGA	2	10	104277	104286	20 %	20 %	40 %	20 %	167628254
67	NC_010337	GAAAA	2	10	104911	104920	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010337	TATCA	2	10	112260	112269	40 %	40 %	0 %	20 %	167628259
69	NC_010337	AATGC	2	10	112442	112451	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010337	CTGTT	2	10	113325	113334	0 %	60 %	20 %	20 %	167628261
71	NC_010337	GAAAA	2	10	113713	113722	80 %	0 %	20 %	0 %	167628261
72	NC_010337	GATTT	2	10	114324	114333	20 %	60 %	20 %	0 %	167628262
73	NC_010337	CCGGT	2	10	116207	116216	0 %	20 %	40 %	40 %	167628263
74	NC_010337	GGATG	2	10	121477	121486	20 %	20 %	60 %	0 %	167628268
75	NC_010337	TCCGC	2	10	122816	122825	0 %	20 %	20 %	60 %	167628268
76	NC_010337	GTCGC	2	10	123188	123197	0 %	20 %	40 %	40 %	167628268
77	NC_010337	CCGTC	2	10	123279	123288	0 %	20 %	20 %	60 %	167628268
78	NC_010337	CCGCC	2	10	124518	124527	0 %	0 %	20 %	80 %	167628268
79	NC_010337	GCGCA	2	10	127838	127847	20 %	0 %	40 %	40 %	167628268
80	NC_010337	GCTTC	2	10	129840	129849	0 %	40 %	20 %	40 %	167628269
81	NC_010337	TCCGC	2	10	131873	131882	0 %	20 %	20 %	60 %	167628269
82	NC_010337	GTTGC	2	10	134813	134822	0 %	40 %	40 %	20 %	167628269
83	NC_010337	GTGCC	2	10	135561	135570	0 %	20 %	40 %	40 %	167628269
84	NC_010337	GCTTC	2	10	139787	139796	0 %	40 %	20 %	40 %	167628271
85	NC_010337	GCTGC	2	10	141376	141385	0 %	20 %	40 %	40 %	167628271
86	NC_010337	TTCCA	2	10	141612	141621	20 %	40 %	0 %	40 %	167628271
87	NC_010337	GTACT	2	10	142359	142368	20 %	40 %	20 %	20 %	167628271
88	NC_010337	CGTAA	2	10	142998	143007	40 %	20 %	20 %	20 %	167628271
89	NC_010337	GTCAT	2	10	146119	146128	20 %	40 %	20 %	20 %	167628271
90	NC_010337	GCTGC	2	10	146429	146438	0 %	20 %	40 %	40 %	167628271
91	NC_010337	AAGAA	2	10	146670	146679	80 %	0 %	20 %	0 %	167628271
92	NC_010337	TCCTT	2	10	147435	147444	0 %	60 %	0 %	40 %	167628272
93	NC_010337	GCTTC	2	10	148098	148107	0 %	40 %	20 %	40 %	167628273
94	NC_010337	TGGCA	2	10	148843	148852	20 %	20 %	40 %	20 %	167628273
95	NC_010337	TACGC	2	10	149042	149051	20 %	20 %	20 %	40 %	167628273
96	NC_010337	TCCGC	2	10	149924	149933	0 %	20 %	20 %	60 %	167628273
97	NC_010337	CCGTC	2	10	150387	150396	0 %	20 %	20 %	60 %	167628273
98	NC_010337	GCTTC	2	10	154686	154695	0 %	40 %	20 %	40 %	167628276
99	NC_010337	TCCGC	2	10	156719	156728	0 %	20 %	20 %	60 %	167628276
100	NC_010337	CCGTC	2	10	157182	157191	0 %	20 %	20 %	60 %	167628276
101	NC_010337	GCTGT	2	10	157686	157695	0 %	40 %	40 %	20 %	167628276
102	NC_010337	TCCCA	2	10	158277	158286	20 %	20 %	0 %	60 %	167628276
103	NC_010337	TTCCA	2	10	159201	159210	20 %	40 %	0 %	40 %	167628276
104	NC_010337	ATTGA	2	10	159473	159482	40 %	40 %	20 %	0 %	167628276
105	NC_010337	CCGTC	2	10	159852	159861	0 %	20 %	20 %	60 %	167628276
106	NC_010337	AAAAG	2	10	160976	160985	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010337	TTTTG	2	10	161494	161503	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010337	CCATT	2	10	161654	161663	20 %	40 %	0 %	40 %	255961477
109	NC_010337	AACTT	2	10	161770	161779	40 %	40 %	0 %	20 %	255961477
110	NC_010337	TCCCA	2	10	162480	162489	20 %	20 %	0 %	60 %	255961477
111	NC_010337	CATTC	2	10	162705	162714	20 %	40 %	0 %	40 %	255961477
112	NC_010337	TCCTT	2	10	163720	163729	0 %	60 %	0 %	40 %	167628755
113	NC_010337	AGCAG	2	10	165442	165451	40 %	0 %	40 %	20 %	167628755
114	NC_010337	TCCGG	2	10	165944	165953	0 %	20 %	40 %	40 %	167628755
115	NC_010337	ACCGT	2	10	166765	166774	20 %	20 %	20 %	40 %	167628753
116	NC_010337	TTTTC	2	10	167689	167698	0 %	80 %	0 %	20 %	167628752
117	NC_010337	AAAGT	2	10	168331	168340	60 %	20 %	20 %	0 %	167628751
118	NC_010337	GTTTT	2	10	168718	168727	0 %	80 %	20 %	0 %	167628750
119	NC_010337	CTTTT	2	10	169274	169283	0 %	80 %	0 %	20 %	167628750
120	NC_010337	ACGAG	2	10	169802	169811	40 %	0 %	40 %	20 %	167628750
121	NC_010337	TTTTC	2	10	171683	171692	0 %	80 %	0 %	20 %	167628748
122	NC_010337	CAGAA	2	10	174192	174201	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010337	AACTC	2	10	175906	175915	40 %	20 %	0 %	40 %	167628744
124	NC_010337	TTTCT	2	10	177142	177151	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010337	ATTCC	2	10	180652	180661	20 %	40 %	0 %	40 %	167628738
126	NC_010337	GTTTT	2	10	182041	182050	0 %	80 %	20 %	0 %	167628736
127	NC_010337	AGCCG	3	15	182390	182404	20 %	0 %	40 %	40 %	167628736
128	NC_010337	TTTCC	2	10	185254	185263	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_010337	CAGCG	2	10	185901	185910	20 %	0 %	40 %	40 %	167628730
130	NC_010337	CTTTT	2	10	187364	187373	0 %	80 %	0 %	20 %	167628728
131	NC_010337	GCATT	2	10	189027	189036	20 %	40 %	20 %	20 %	167628727
132	NC_010337	CAGAA	2	10	190737	190746	60 %	0 %	20 %	20 %	167628725
133	NC_010337	GCCTT	2	10	191895	191904	0 %	40 %	20 %	40 %	167628722
134	NC_010337	GCGAG	2	10	192138	192147	20 %	0 %	60 %	20 %	167628722
135	NC_010337	GGAGT	2	10	192427	192436	20 %	20 %	60 %	0 %	167628722
136	NC_010337	AGGTC	2	10	195058	195067	20 %	20 %	40 %	20 %	167628719
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252	NC_010337	CAAAA	2	10	367335	367344	80 %	0 %	0 %	20 %	167628547
253	NC_010337	TCGAT	2	10	367838	367847	20 %	40 %	20 %	20 %	167628546
254	NC_010337	GTTTT	2	10	370168	370177	0 %	80 %	20 %	0 %	167628543
255	NC_010337	TTCCT	2	10	372716	372725	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
256	NC_010337	GGTCA	2	10	375545	375554	20 %	20 %	40 %	20 %	167628538
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260	NC_010337	CAGGG	2	10	378637	378646	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_010337	CGGTT	2	10	386365	386374	0 %	40 %	40 %	20 %	167628529
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