MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 chromosome

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010336	ATATTA	2	12	1165	1176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010336	TTATAT	2	12	31120	31131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010336	AGCCAT	2	12	64529	64540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010336	CAAATA	2	12	64720	64731	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010336	ACTATA	2	12	71361	71372	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010336	TAAAAA	2	12	105484	105495	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010336	AGATTA	2	12	115672	115683	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010336	AATTAA	2	12	125303	125314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010336	AATATA	2	12	154050	154061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010336	ATTAAA	2	12	164869	164880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010336	ATTCTT	2	12	192101	192112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010336	TTGCTA	2	12	196281	196292	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010336	ATAACT	2	12	217384	217395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010336	ATAACT	2	12	221061	221072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010336	TAAACT	2	12	221109	221120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010336	TCCTAC	2	12	221352	221363	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010336	CCTACT	2	12	221371	221382	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010336	CTATTA	2	12	221847	221858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010336	ACTCTA	2	12	222231	222242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010336	ACTCTT	2	12	337758	337769	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010336	ATAATT	2	12	345273	345284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010336	TCCTCT	2	12	345818	345829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010336	CAAGAT	2	12	380954	380965	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010336	ATTTCA	2	12	419175	419186	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010336	TTTACT	2	12	423531	423542	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010336	TTAGAT	2	12	424887	424898	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010336	TAAAGC	2	12	441864	441875	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010336	AATTAA	2	12	475229	475240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010336	ATTAAT	2	12	475322	475333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010336	ATAAAA	2	12	575663	575674	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010336	CAATAA	2	12	579807	579818	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010336	ACGATT	2	12	623317	623328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010336	ATTTTT	2	12	637034	637045	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010336	ATTAAT	2	12	680201	680212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010336	ATTTTA	2	12	682441	682452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010336	AATCTA	2	12	703392	703403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010336	AAAATA	2	12	721975	721986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010336	AATATT	2	12	723637	723648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010336	ATATAA	2	12	775304	775315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010336	TTTTAT	2	12	794073	794084	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010336	AACTTA	2	12	834551	834562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010336	AAATAA	2	12	851180	851191	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010336	TATACT	2	12	880644	880655	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010336	TTATAT	2	12	893708	893719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010336	TTTCTT	2	12	895700	895711	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010336	TATACT	2	12	901702	901713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010336	TATATT	2	12	904692	904703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010336	AAAAAG	2	12	927718	927729	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010336	TGAAAT	2	12	942204	942215	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010336	ATATTT	2	12	943392	943403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010336	TATAAG	2	12	955321	955332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010336	ATGCTG	2	12	965527	965538	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010336	TATACA	2	12	965875	965886	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010336	AGATAA	2	12	976045	976056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010336	GATAAT	2	12	991369	991380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010336	TATAAT	2	12	1038826	1038837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010336	AATAAA	2	12	1042788	1042799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010336	ATTTAT	2	12	1058146	1058157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010336	AAATGA	2	12	1062300	1062311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010336	CTTTCT	2	12	1062922	1062933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010336	TCTGGT	2	12	1113429	1113440	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010336	CACTTT	2	12	1142095	1142106	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010336	GAATAA	2	12	1149320	1149331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010336	TAATTG	2	12	1179270	1179281	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010336	ATTTGA	2	12	1224376	1224387	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010336	AAATAT	2	12	1283075	1283086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010336	TAATCA	2	12	1285171	1285182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010336	GTTATA	2	12	1317275	1317286	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010336	TTTGTA	2	12	1354728	1354739	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010336	AAACAT	2	12	1398717	1398728	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010336	AAAATA	2	12	1428046	1428057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010336	AAAACA	2	12	1436666	1436677	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010336	AATATA	2	12	1443392	1443403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010336	TGAAAT	2	12	1511419	1511430	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010336	TAAAAT	2	12	1531968	1531979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010336	TTTGAA	2	12	1597035	1597046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010336	TGTCTG	2	12	1619875	1619886	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010336	AACTAT	2	12	1629153	1629164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010336	TTATAG	2	12	1711466	1711477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010336	ATATAG	2	12	1745029	1745040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010336	TATAAT	2	12	1754452	1754463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010336	ATTAGT	2	12	1824078	1824089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010336	ATTTAA	2	12	1912971	1912982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010336	ATAAAA	2	12	1964548	1964559	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010336	TAATGA	2	12	1984945	1984956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010336	TTATCT	2	12	2022256	2022267	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010336	TCTAAA	2	12	2022292	2022303	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.