MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 chromosome

Total Repeats: 5550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010336	TTTG	2	8	2029129	2029136	0 %	75 %	25 %	0 %	167628122
5502	NC_010336	CAGA	2	8	2029207	2029214	50 %	0 %	25 %	25 %	167628122
5503	NC_010336	ATTT	2	8	2029712	2029719	25 %	75 %	0 %	0 %	167628122
5504	NC_010336	CTAT	2	8	2029767	2029774	25 %	50 %	0 %	25 %	167628122
5505	NC_010336	TTAA	2	8	2030523	2030530	50 %	50 %	0 %	0 %	167628123
5506	NC_010336	TAAT	2	8	2030665	2030672	50 %	50 %	0 %	0 %	167628124
5507	NC_010336	ATTA	2	8	2030963	2030970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_010336	AGTT	2	8	2030982	2030989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_010336	GTTT	2	8	2031977	2031984	0 %	75 %	25 %	0 %	167628125
5510	NC_010336	AGTT	2	8	2032848	2032855	25 %	50 %	25 %	0 %	167628126
5511	NC_010336	GCAA	2	8	2033327	2033334	50 %	0 %	25 %	25 %	167628126
5512	NC_010336	ATTG	2	8	2033767	2033774	25 %	50 %	25 %	0 %	167628127
5513	NC_010336	AGGC	2	8	2034216	2034223	25 %	0 %	50 %	25 %	167628127
5514	NC_010336	ATTA	2	8	2034544	2034551	50 %	50 %	0 %	0 %	167628127
5515	NC_010336	ATGG	2	8	2034686	2034693	25 %	25 %	50 %	0 %	167628127
5516	NC_010336	ATTT	2	8	2036129	2036136	25 %	75 %	0 %	0 %	167628129
5517	NC_010336	GATA	2	8	2036368	2036375	50 %	25 %	25 %	0 %	167628129
5518	NC_010336	CAAA	2	8	2036462	2036469	75 %	0 %	0 %	25 %	167628129
5519	NC_010336	CATT	2	8	2037077	2037084	25 %	50 %	0 %	25 %	167628130
5520	NC_010336	CCTA	2	8	2037147	2037154	25 %	25 %	0 %	50 %	167628130
5521	NC_010336	GAAC	2	8	2037181	2037188	50 %	0 %	25 %	25 %	167628130
5522	NC_010336	TATT	2	8	2037332	2037339	25 %	75 %	0 %	0 %	167628130
5523	NC_010336	AAAC	2	8	2037683	2037690	75 %	0 %	0 %	25 %	167628130
5524	NC_010336	ACTC	2	8	2037827	2037834	25 %	25 %	0 %	50 %	167628130
5525	NC_010336	ACCA	2	8	2038002	2038009	50 %	0 %	0 %	50 %	167628130
5526	NC_010336	AGAT	2	8	2038216	2038223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_010336	AAAC	2	8	2038383	2038390	75 %	0 %	0 %	25 %	167628131
5528	NC_010336	ATTT	2	8	2038496	2038503	25 %	75 %	0 %	0 %	167628131
5529	NC_010336	CAAC	2	8	2038639	2038646	50 %	0 %	0 %	50 %	167628131
5530	NC_010336	CTGC	2	8	2038969	2038976	0 %	25 %	25 %	50 %	167628131
5531	NC_010336	AGAT	2	8	2039420	2039427	50 %	25 %	25 %	0 %	167628131
5532	NC_010336	AGCC	2	8	2039676	2039683	25 %	0 %	25 %	50 %	167628131
5533	NC_010336	TAAT	2	8	2039774	2039781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_010336	TGAC	2	8	2039848	2039855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_010336	ACTA	2	8	2040380	2040387	50 %	25 %	0 %	25 %	167628132
5536	NC_010336	GTTT	2	8	2040820	2040827	0 %	75 %	25 %	0 %	167628132
5537	NC_010336	ATAC	2	8	2041887	2041894	50 %	25 %	0 %	25 %	167628132
5538	NC_010336	AAGT	2	8	2042582	2042589	50 %	25 %	25 %	0 %	167628132
5539	NC_010336	ATTC	2	8	2043113	2043120	25 %	50 %	0 %	25 %	167628132
5540	NC_010336	TAGC	2	8	2043280	2043287	25 %	25 %	25 %	25 %	167628132
5541	NC_010336	AACA	2	8	2043596	2043603	75 %	0 %	0 %	25 %	167628132
5542	NC_010336	TACT	2	8	2043994	2044001	25 %	50 %	0 %	25 %	167628133
5543	NC_010336	TATC	2	8	2044061	2044068	25 %	50 %	0 %	25 %	167628133
5544	NC_010336	ACAA	2	8	2044133	2044140	75 %	0 %	0 %	25 %	167628133
5545	NC_010336	TTTA	2	8	2044382	2044389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_010336	TATT	2	8	2044440	2044447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_010336	ATTT	2	8	2044555	2044562	25 %	75 %	0 %	0 %	167628134
5548	NC_010336	GAAA	2	8	2044748	2044755	75 %	0 %	25 %	0 %	167628134
5549	NC_010336	GATA	2	8	2044868	2044875	50 %	25 %	25 %	0 %	167628134
5550	NC_010336	ATGT	2	8	2045574	2045581	25 %	50 %	25 %	0 %	167628136

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.