MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL01

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010335	GCGCCA	2	12	1289	1300	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621729
2	NC_010335	GGGCCA	2	12	2064	2075	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621730
3	NC_010335	CTGGAC	2	12	5937	5948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010335	CGCTCG	2	12	6072	6083	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010335	GGCCGA	2	12	6411	6422	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621734
6	NC_010335	CAAGGC	2	12	7567	7578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621735
7	NC_010335	TCCAGC	2	12	11233	11244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167621741
8	NC_010335	CCCGAT	2	12	11935	11946	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167621741
9	NC_010335	TCGGCC	2	12	12526	12537	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621742
10	NC_010335	TGCCCC	2	12	19172	19183	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	167621752
11	NC_010335	GGTCTG	2	12	20008	20019	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167621752
12	NC_010335	CCAGGT	2	12	20394	20405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621752
13	NC_010335	GGCGCG	2	12	20495	20506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621752
14	NC_010335	GCTACG	2	12	20830	20841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621753
15	NC_010335	GCCGAC	2	12	21908	21919	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621754
16	NC_010335	CGCCGT	2	12	22485	22496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621755
17	NC_010335	CATGGG	2	12	24084	24095	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621755
18	NC_010335	CCGAGA	2	12	24230	24241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621755
19	NC_010335	TGCTGA	2	12	25070	25081	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167621755
20	NC_010335	CTGGTG	2	12	26243	26254	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167621756
21	NC_010335	CAGGTC	2	12	27531	27542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621758
22	NC_010335	CCAAGA	4	24	28680	28703	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167621759
23	NC_010335	AGGCGG	2	12	30318	30329	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	167621762
24	NC_010335	GCGATC	2	12	30806	30817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621762
25	NC_010335	CGGCCT	2	12	32071	32082	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621764
26	NC_010335	GGCCAA	2	12	33506	33517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621765
27	NC_010335	TCGCGC	2	12	34781	34792	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010335	CCCACG	2	12	35237	35248	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	167621767
29	NC_010335	TGGCGG	2	12	35561	35572	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	167621767
30	NC_010335	GACGGT	2	12	37592	37603	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621769
31	NC_010335	CGATGT	2	12	38810	38821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167621770
32	NC_010335	GGCCGG	2	12	39206	39217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621770
33	NC_010335	ACGTCA	2	12	40515	40526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167621771
34	NC_010335	CCCTGA	2	12	41154	41165	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167621771
35	NC_010335	TCTGGG	2	12	41854	41865	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167621771
36	NC_010335	GGCGCG	2	12	42818	42829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621771
37	NC_010335	CCACAC	2	12	42964	42975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621771
38	NC_010335	CGCGCC	2	12	43522	43533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621772
39	NC_010335	CGCTGC	2	12	44120	44131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621772
40	NC_010335	AGGCCG	2	12	44285	44296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621772
41	NC_010335	ACAGCA	2	12	45901	45912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167621774
42	NC_010335	GCCTGG	2	12	46808	46819	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621775
43	NC_010335	CACCGC	2	12	50680	50691	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	167621780
44	NC_010335	GCGATC	2	12	53474	53485	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010335	GGCCAA	2	12	53760	53771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621783
46	NC_010335	GTCGCC	2	12	54879	54890	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621784
47	NC_010335	CTCGAC	2	12	57374	57385	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010335	GCGCCA	2	12	57854	57865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621786
49	NC_010335	CACCGA	2	12	60408	60419	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167621789
50	NC_010335	GGCCGA	2	12	61626	61637	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621790
51	NC_010335	GGCCAG	2	12	64193	64204	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621793
52	NC_010335	CGCCGA	2	12	68392	68403	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621797
53	NC_010335	CCACGC	2	12	69447	69458	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	167621799
54	NC_010335	GTGACG	2	12	69937	69948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621800
55	NC_010335	CCACCG	2	12	73294	73305	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	167621804
56	NC_010335	GGCCAG	2	12	74056	74067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621805
57	NC_010335	CGGCGA	2	12	74669	74680	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621807
58	NC_010335	CCCGTC	2	12	74702	74713	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	167621807
59	NC_010335	GGGCCA	2	12	78392	78403	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621811
60	NC_010335	GGTGCG	2	12	78564	78575	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	167621811
61	NC_010335	TCGCGA	2	12	79654	79665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621811
62	NC_010335	TGGGCC	3	18	82722	82739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621815
63	NC_010335	TGGTCG	2	12	84762	84773	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167621817
64	NC_010335	GGCCTT	2	12	85247	85258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621818
65	NC_010335	GGCTTG	2	12	85632	85643	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167621818
66	NC_010335	GTCCAG	2	12	85655	85666	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621818
67	NC_010335	CGCTGG	2	12	85977	85988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621819
68	NC_010335	TGCCGC	2	12	86463	86474	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621819
69	NC_010335	CGAAGA	2	12	87843	87854	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010335	GACGCA	2	12	87887	87898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010335	CAAAAC	2	12	87953	87964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010335	GCTCCA	2	12	88495	88506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167621821
73	NC_010335	CCAGGC	2	12	89889	89900	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621822
74	NC_010335	CTGGCC	2	12	89968	89979	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621822
75	NC_010335	CTGACC	2	12	93733	93744	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010335	GTCGGG	2	12	94474	94485	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	167621828
77	NC_010335	CCTGGC	2	12	94818	94829	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621828
78	NC_010335	CGCGGC	2	12	97694	97705	0 %	0 %	50 %	50 %	167621832
79	NC_010335	GCGCCC	2	12	101029	101040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621833
80	NC_010335	CCGCGG	2	12	101465	101476	0 %	0 %	50 %	50 %	167621833
81	NC_010335	GGCTTG	2	12	103093	103104	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167621835
82	NC_010335	GACGTT	2	12	103329	103340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167621835
83	NC_010335	GCGAAC	2	12	104089	104100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621835
84	NC_010335	CCTGAC	2	12	106200	106211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167621837
85	NC_010335	CTGGCC	2	12	106405	106416	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621837
86	NC_010335	GCACCA	2	12	118200	118211	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167621850
87	NC_010335	TCGGCC	2	12	118511	118522	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621850
88	NC_010335	TGGGCG	2	12	120704	120715	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	167621850
89	NC_010335	TCGCCG	2	12	121126	121137	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621851
90	NC_010335	GATGGC	2	12	122208	122219	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621851
91	NC_010335	GATGGC	2	12	122785	122796	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621852
92	NC_010335	TGCAGC	2	12	124264	124275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621853
93	NC_010335	TGGATC	2	12	124407	124418	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167621854
94	NC_010335	GGGCCA	2	12	125398	125409	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621855
95	NC_010335	TGAGGG	2	12	130253	130264	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	167621856
96	NC_010335	GATATC	2	12	130446	130457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167621856
97	NC_010335	GACCGC	2	12	130719	130730	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621856
98	NC_010335	ACTTGA	2	12	131680	131691	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167621856
99	NC_010335	GGCCAC	2	12	136196	136207	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621861
100	NC_010335	GCGGCC	2	12	138544	138555	0 %	0 %	50 %	50 %	167621863
101	NC_010335	GCTGTC	2	12	138623	138634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621863
102	NC_010335	CGCGGG	2	12	139855	139866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621864
103	NC_010335	TGGTCG	2	12	139903	139914	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167621864
104	NC_010335	GCGCCC	2	12	140040	140051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621864
105	NC_010335	CTGGGC	2	12	141292	141303	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621866
106	NC_010335	TCGGGC	2	12	141377	141388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621866
107	NC_010335	GGCCGG	2	12	142226	142237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621867
108	NC_010335	GCCCAG	2	12	143464	143475	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621870
109	NC_010335	GGCGAT	2	12	146169	146180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621872
110	NC_010335	CCAGGG	2	12	149354	149365	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621875
111	NC_010335	TCAGCT	2	12	153167	153178	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167621878
112	NC_010335	CGATCG	2	12	153814	153825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621878
113	NC_010335	TGGCGG	2	12	154108	154119	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	167621879
114	NC_010335	GCCTTG	2	12	157542	157553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621879
115	NC_010335	AGGTTC	2	12	158700	158711	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167621880
116	NC_010335	GAGATC	2	12	159002	159013	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167621880
117	NC_010335	CAGCGG	2	12	162099	162110	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621881
118	NC_010335	AGGCGC	2	12	164302	164313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621882
119	NC_010335	CGGCGC	2	12	165996	166007	0 %	0 %	50 %	50 %	167621882
120	NC_010335	GGTCTT	2	12	167169	167180	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167621882
121	NC_010335	GACCCG	2	12	167993	168004	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621883
122	NC_010335	CTTGGC	2	12	168184	168195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621884
123	NC_010335	CTGATC	2	12	168595	168606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167621884
124	NC_010335	TGGTGC	2	12	169655	169666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167621886
125	NC_010335	CTGGAT	2	12	172327	172338	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_010335	ATCGCG	2	12	174598	174609	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010335	GATCGA	2	12	176426	176437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167621893
128	NC_010335	GATCGA	2	12	177492	177503	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167621894
129	NC_010335	GTCGAG	2	12	177748	177759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621894
130	NC_010335	GCGCAC	2	12	178720	178731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621895
131	NC_010335	TCTCGC	2	12	180612	180623	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	167621896
132	NC_010335	GCGGCC	2	12	181594	181605	0 %	0 %	50 %	50 %	167621897
133	NC_010335	GCGTCG	2	12	182265	182276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621898
134	NC_010335	ACGATC	2	12	182295	182306	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167621898
135	NC_010335	CGGCGC	2	12	182839	182850	0 %	0 %	50 %	50 %	167621899
136	NC_010335	TCAGGG	2	12	188549	188560	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621903
137	NC_010335	CAGCCG	2	12	190551	190562	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621905
138	NC_010335	GCCGAG	2	12	192109	192120	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621905
139	NC_010335	GGCCTC	2	12	193493	193504	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621907
140	NC_010335	CAGGCC	2	12	195235	195246	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621909
141	NC_010335	CTCGCG	2	12	197408	197419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621911
142	NC_010335	GGATCG	2	12	197706	197717	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621911
143	NC_010335	GCCCTG	2	12	197930	197941	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621911
144	NC_010335	GCTGGA	2	12	200433	200444	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621913
145	NC_010335	TGGCCT	2	12	205214	205225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621918
146	NC_010335	GGCGCG	2	12	209821	209832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621918
147	NC_010335	GCCGGC	2	12	209886	209897	0 %	0 %	50 %	50 %	167621918
148	NC_010335	CGTTGA	2	12	213031	213042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167621922
149	NC_010335	CGCCAA	2	12	215826	215837	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167621925
150	NC_010335	CGCGCC	2	12	215838	215849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621925
151	NC_010335	ACACCC	2	12	219305	219316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621926
152	NC_010335	CATCGC	2	12	221504	221515	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167621929
153	NC_010335	CGGCGA	2	12	224946	224957	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621932
154	NC_010335	GGTCGC	2	12	227509	227520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621935
155	NC_010335	GCGGTC	2	12	228151	228162	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621936
156	NC_010335	ACCTCG	2	12	232298	232309	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167621939
157	NC_010335	CTTGGC	2	12	232730	232741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.