MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL01

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010335	CTGG	2	8	1	8	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010335	GGGC	2	8	6165	6172	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010335	CGGC	2	8	7072	7079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010335	CGAG	2	8	10020	10027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010335	ACTC	2	8	10070	10077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010335	ACCC	2	8	10560	10567	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_010335	ACCA	2	8	13413	13420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010335	TCCT	2	8	15539	15546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010335	CAGG	2	8	21408	21415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010335	CCGA	2	8	27974	27981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010335	GAGC	2	8	28043	28050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010335	GCCG	2	8	29059	29066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010335	CGGG	2	8	29111	29118	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010335	TAGA	2	8	32999	33006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010335	TTGG	2	8	33202	33209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010335	TCTA	2	8	33951	33958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010335	CTGG	2	8	38421	38428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010335	GGCC	2	8	49251	49258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010335	CGGC	2	8	49270	49277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010335	ACCG	2	8	56059	56066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010335	GACC	2	8	56070	56077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010335	ATCT	2	8	63928	63935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010335	CCGC	2	8	63966	63973	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_010335	CTTC	2	8	65208	65215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010335	CGTC	2	8	80082	80089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010335	GGTG	2	8	83747	83754	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010335	GCGT	2	8	83773	83780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010335	GGTG	2	8	83843	83850	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010335	GGTG	2	8	84087	84094	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010335	TAAC	2	8	84140	84147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010335	CCGC	2	8	87061	87068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_010335	GAAG	2	8	87138	87145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010335	GGGC	2	8	87196	87203	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010335	TGAT	2	8	87799	87806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010335	GGCC	2	8	87869	87876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010335	GGCC	2	8	87937	87944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010335	AGCC	2	8	92251	92258	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010335	CCCG	2	8	92973	92980	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_010335	GTCG	2	8	95304	95311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010335	ATAG	2	8	95911	95918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010335	GACC	2	8	104901	104908	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010335	CTCA	2	8	104975	104982	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010335	GATC	2	8	114185	114192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010335	GCCG	2	8	116218	116225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010335	CGGC	2	8	116713	116720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010335	TCGC	2	8	123497	123504	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010335	CGCC	2	8	129529	129536	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_010335	CCCG	2	8	129557	129564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_010335	GCCG	2	8	131782	131789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010335	TAGA	2	8	136020	136027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010335	CGGG	2	8	137383	137390	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010335	CCGA	2	8	147600	147607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010335	CTAT	2	8	169059	169066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010335	GCGA	2	8	169105	169112	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010335	CCCG	2	8	172339	172346	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_010335	CGCC	2	8	173282	173289	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_010335	GCCG	2	8	173346	173353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010335	CGCC	3	12	173379	173390	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_010335	GCCC	2	8	173391	173398	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_010335	GACT	2	8	174452	174459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010335	AAAC	2	8	174765	174772	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010335	ATCC	2	8	186296	186303	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010335	CCGG	2	8	186399	186406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010335	ATGG	2	8	187421	187428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010335	TCCC	2	8	192192	192199	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_010335	GTTC	2	8	192224	192231	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010335	ATGA	2	8	204162	204169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010335	CAAT	2	8	211688	211695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010335	CGTC	2	8	211770	211777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010335	CTTC	2	8	211913	211920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010335	AGGG	2	8	223850	223857	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010335	GCGA	2	8	227326	227333	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010335	CAAT	2	8	227385	227392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010335	GTCC	2	8	229403	229410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.