MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 2534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010334	AAATC	2	10	495	504	60 %	20 %	0 %	20 %	167621942
2	NC_010334	CGACG	2	10	1902	1911	20 %	0 %	40 %	40 %	167621943
3	NC_010334	ATGGT	2	10	6000	6009	20 %	40 %	40 %	0 %	167621945
4	NC_010334	TTGAA	2	10	9853	9862	40 %	40 %	20 %	0 %	167621948
5	NC_010334	TCACT	2	10	11022	11031	20 %	40 %	0 %	40 %	167621949
6	NC_010334	GGTTA	2	10	12775	12784	20 %	40 %	40 %	0 %	167621951
7	NC_010334	TAGAG	2	10	13116	13125	40 %	20 %	40 %	0 %	167621951
8	NC_010334	TTGGC	2	10	13413	13422	0 %	40 %	40 %	20 %	167621951
9	NC_010334	GCTAA	2	10	14015	14024	40 %	20 %	20 %	20 %	167621951
10	NC_010334	TGGCT	2	10	15064	15073	0 %	40 %	40 %	20 %	167621951
11	NC_010334	CACAT	2	10	18651	18660	40 %	20 %	0 %	40 %	167621956
12	NC_010334	AACAT	2	10	19260	19269	60 %	20 %	0 %	20 %	167621957
13	NC_010334	CATGG	2	10	27590	27599	20 %	20 %	40 %	20 %	167621964
14	NC_010334	CGAAA	2	10	34373	34382	60 %	0 %	20 %	20 %	167621970
15	NC_010334	ATCTT	2	10	35278	35287	20 %	60 %	0 %	20 %	167621971
16	NC_010334	TAGAG	2	10	39749	39758	40 %	20 %	40 %	0 %	167621976
17	NC_010334	TTAGC	2	10	40717	40726	20 %	40 %	20 %	20 %	167621977
18	NC_010334	TTTGG	2	10	55066	55075	0 %	60 %	40 %	0 %	167621987
19	NC_010334	AGCCA	2	10	55081	55090	40 %	0 %	20 %	40 %	167621987
20	NC_010334	AGTTG	2	10	55473	55482	20 %	40 %	40 %	0 %	167621987
21	NC_010334	ACTCG	2	10	55483	55492	20 %	20 %	20 %	40 %	167621987
22	NC_010334	GGCGA	2	10	56830	56839	20 %	0 %	60 %	20 %	167621988
23	NC_010334	TTTTA	2	10	57938	57947	20 %	80 %	0 %	0 %	167621989
24	NC_010334	TTCGC	2	10	58804	58813	0 %	40 %	20 %	40 %	167621990
25	NC_010334	AAGGT	2	10	59080	59089	40 %	20 %	40 %	0 %	167621990
26	NC_010334	TGCCA	2	10	60615	60624	20 %	20 %	20 %	40 %	167621992
27	NC_010334	AGGTA	2	10	63150	63159	40 %	20 %	40 %	0 %	167621995
28	NC_010334	AGGCA	2	10	65815	65824	40 %	0 %	40 %	20 %	167621999
29	NC_010334	TTGTT	2	10	66943	66952	0 %	80 %	20 %	0 %	167622000
30	NC_010334	TGGCT	2	10	67337	67346	0 %	40 %	40 %	20 %	167622000
31	NC_010334	GGATT	2	10	71085	71094	20 %	40 %	40 %	0 %	167622003
32	NC_010334	ACAAG	2	10	72889	72898	60 %	0 %	20 %	20 %	167622004
33	NC_010334	GGTTT	2	10	74159	74168	0 %	60 %	40 %	0 %	167622005
34	NC_010334	CTTCT	2	10	78837	78846	0 %	60 %	0 %	40 %	167622010
35	NC_010334	GATTT	2	10	81231	81240	20 %	60 %	20 %	0 %	167622012
36	NC_010334	AAGCT	2	10	82753	82762	40 %	20 %	20 %	20 %	167622014
37	NC_010334	ATAGG	2	10	89198	89207	40 %	20 %	40 %	0 %	167622019
38	NC_010334	ACCAA	2	10	89316	89325	60 %	0 %	0 %	40 %	167622019
39	NC_010334	GATCT	2	10	91097	91106	20 %	40 %	20 %	20 %	167622021
40	NC_010334	GTTTG	2	10	92348	92357	0 %	60 %	40 %	0 %	167622022
41	NC_010334	TGCCG	2	10	93317	93326	0 %	20 %	40 %	40 %	167622024
42	NC_010334	ATTGC	2	10	93595	93604	20 %	40 %	20 %	20 %	167622024
43	NC_010334	ACGTA	2	10	94789	94798	40 %	20 %	20 %	20 %	167622025
44	NC_010334	TAAAT	2	10	99331	99340	60 %	40 %	0 %	0 %	167622030
45	NC_010334	CAATC	2	10	102947	102956	40 %	20 %	0 %	40 %	167622033
46	NC_010334	CTAGC	2	10	103417	103426	20 %	20 %	20 %	40 %	167622033
47	NC_010334	AAATT	2	10	105001	105010	60 %	40 %	0 %	0 %	167622035
48	NC_010334	GCTTA	2	10	106376	106385	20 %	40 %	20 %	20 %	167622035
49	NC_010334	TGAGC	2	10	107531	107540	20 %	20 %	40 %	20 %	167622035
50	NC_010334	AATAA	2	10	108568	108577	80 %	20 %	0 %	0 %	167622037
51	NC_010334	TGCAC	2	10	111582	111591	20 %	20 %	20 %	40 %	167622040
52	NC_010334	AGATG	2	10	113356	113365	40 %	20 %	40 %	0 %	167622042
53	NC_010334	GTCAG	2	10	119239	119248	20 %	20 %	40 %	20 %	167622046
54	NC_010334	TGGGC	2	10	120421	120430	0 %	20 %	60 %	20 %	167622048
55	NC_010334	AAAGT	2	10	121754	121763	60 %	20 %	20 %	0 %	167622049
56	NC_010334	GCTAA	2	10	122860	122869	40 %	20 %	20 %	20 %	167622050
57	NC_010334	AAAGT	2	10	127505	127514	60 %	20 %	20 %	0 %	167622053
58	NC_010334	GCGCG	2	10	128349	128358	0 %	0 %	60 %	40 %	167622054
59	NC_010334	ACTTG	2	10	131360	131369	20 %	40 %	20 %	20 %	167622056
60	NC_010334	AGAAC	2	10	135249	135258	60 %	0 %	20 %	20 %	167622059
61	NC_010334	TTGGC	2	10	135548	135557	0 %	40 %	40 %	20 %	167622059
62	NC_010334	AGGCA	2	10	135628	135637	40 %	0 %	40 %	20 %	167622059
63	NC_010334	AGCGC	2	10	137906	137915	20 %	0 %	40 %	40 %	167622062
64	NC_010334	GCGTG	2	10	140191	140200	0 %	20 %	60 %	20 %	167622063
65	NC_010334	GCAGT	2	10	142283	142292	20 %	20 %	40 %	20 %	167622067
66	NC_010334	CCTAA	2	10	144367	144376	40 %	20 %	0 %	40 %	167622070
67	NC_010334	GCTAA	2	10	146830	146839	40 %	20 %	20 %	20 %	167622073
68	NC_010334	GTACA	2	10	147452	147461	40 %	20 %	20 %	20 %	167622074
69	NC_010334	CTTGG	2	10	150299	150308	0 %	40 %	40 %	20 %	167622077
70	NC_010334	TGCCG	2	10	150508	150517	0 %	20 %	40 %	40 %	167622077
71	NC_010334	GCTCA	2	10	150940	150949	20 %	20 %	20 %	40 %	167622077
72	NC_010334	CGTTA	2	10	153738	153747	20 %	40 %	20 %	20 %	167622080
73	NC_010334	TAAGG	2	10	156697	156706	40 %	20 %	40 %	0 %	167622081
74	NC_010334	GTATT	2	10	159201	159210	20 %	60 %	20 %	0 %	167622083
75	NC_010334	AGTGT	2	10	159711	159720	20 %	40 %	40 %	0 %	167622083
76	NC_010334	GGTTG	2	10	162099	162108	0 %	40 %	60 %	0 %	167622084
77	NC_010334	TGCGC	2	10	163850	163859	0 %	20 %	40 %	40 %	167622086
78	NC_010334	TCGGT	2	10	166188	166197	0 %	40 %	40 %	20 %	167622088
79	NC_010334	TAAGT	2	10	166239	166248	40 %	40 %	20 %	0 %	167622088
80	NC_010334	TGAAA	2	10	167661	167670	60 %	20 %	20 %	0 %	167622090
81	NC_010334	GCGAT	2	10	168834	168843	20 %	20 %	40 %	20 %	167622091
82	NC_010334	ATCTT	2	10	173150	173159	20 %	60 %	0 %	20 %	167622094
83	NC_010334	GGAAG	2	10	173670	173679	40 %	0 %	60 %	0 %	167622094
84	NC_010334	AAATT	2	10	175290	175299	60 %	40 %	0 %	0 %	167622095
85	NC_010334	ATAGG	2	10	177963	177972	40 %	20 %	40 %	0 %	167622095
86	NC_010334	CTTAC	2	10	178251	178260	20 %	40 %	0 %	40 %	167622095
87	NC_010334	GATTT	2	10	181320	181329	20 %	60 %	20 %	0 %	167622096
88	NC_010334	AGTTT	2	10	184863	184872	20 %	60 %	20 %	0 %	167622098
89	NC_010334	GTTTA	2	10	186220	186229	20 %	60 %	20 %	0 %	167622100
90	NC_010334	TGAAG	2	10	186877	186886	40 %	20 %	40 %	0 %	167622101
91	NC_010334	GCTTA	2	10	192690	192699	20 %	40 %	20 %	20 %	167622106
92	NC_010334	TAGTT	2	10	193471	193480	20 %	60 %	20 %	0 %	167622107
93	NC_010334	ATGCA	2	10	196451	196460	40 %	20 %	20 %	20 %	167622110
94	NC_010334	TCAGC	2	10	197210	197219	20 %	20 %	20 %	40 %	167622111
95	NC_010334	ACGGT	2	10	198336	198345	20 %	20 %	40 %	20 %	167622112
96	NC_010334	TGCAC	2	10	198403	198412	20 %	20 %	20 %	40 %	167622112
97	NC_010334	ATCTT	2	10	204055	204064	20 %	60 %	0 %	20 %	167622116
98	NC_010334	GTTCC	2	10	206652	206661	0 %	40 %	20 %	40 %	167622117
99	NC_010334	GAAGA	2	10	210040	210049	60 %	0 %	40 %	0 %	167622118
100	NC_010334	CGTTA	2	10	212199	212208	20 %	40 %	20 %	20 %	167622119
101	NC_010334	CCGCT	2	10	214284	214293	0 %	20 %	20 %	60 %	167622122
102	NC_010334	CACCG	2	10	217976	217985	20 %	0 %	20 %	60 %	167622126
103	NC_010334	ATTGA	2	10	218466	218475	40 %	40 %	20 %	0 %	167622126
104	NC_010334	CTTGA	2	10	219119	219128	20 %	40 %	20 %	20 %	167622126
105	NC_010334	ACCAC	2	10	219184	219193	40 %	0 %	0 %	60 %	167622126
106	NC_010334	TTTTA	2	10	219233	219242	20 %	80 %	0 %	0 %	167622126
107	NC_010334	GAGGT	2	10	220230	220239	20 %	20 %	60 %	0 %	167622127
108	NC_010334	CTTGG	2	10	231050	231059	0 %	40 %	40 %	20 %	167622136
109	NC_010334	CTGTT	2	10	231932	231941	0 %	60 %	20 %	20 %	167622137
110	NC_010334	TAGCC	2	10	232437	232446	20 %	20 %	20 %	40 %	167622137
111	NC_010334	ATAGG	2	10	234000	234009	40 %	20 %	40 %	0 %	167622138
112	NC_010334	ACACC	2	10	234995	235004	40 %	0 %	0 %	60 %	167622139
113	NC_010334	GATCA	2	10	235318	235327	40 %	20 %	20 %	20 %	167622139
114	NC_010334	TTATC	2	10	237907	237916	20 %	60 %	0 %	20 %	167622140
115	NC_010334	GTGCG	2	10	238827	238836	0 %	20 %	60 %	20 %	167622141
116	NC_010334	TTGAT	2	10	239582	239591	20 %	60 %	20 %	0 %	167622141
117	NC_010334	GCGAC	2	10	240189	240198	20 %	0 %	40 %	40 %	167622142
118	NC_010334	CGATA	2	10	243369	243378	40 %	20 %	20 %	20 %	167622143
119	NC_010334	GGCCA	2	10	248320	248329	20 %	0 %	40 %	40 %	167622147
120	NC_010334	CGTGG	2	10	252144	252153	0 %	20 %	60 %	20 %	167622151
121	NC_010334	GAGGC	2	10	256458	256467	20 %	0 %	60 %	20 %	167622154
122	NC_010334	CACTC	2	10	257479	257488	20 %	20 %	0 %	60 %	167622154
123	NC_010334	AAACC	2	10	258928	258937	60 %	0 %	0 %	40 %	167622155
124	NC_010334	TTGAG	2	10	259972	259981	20 %	40 %	40 %	0 %	167622156
125	NC_010334	TTGAG	2	10	262436	262445	20 %	40 %	40 %	0 %	167622158
126	NC_010334	CTTGG	2	10	266188	266197	0 %	40 %	40 %	20 %	167622161
127	NC_010334	CTTAG	2	10	269940	269949	20 %	40 %	20 %	20 %	167622164
128	NC_010334	GGTTA	2	10	270814	270823	20 %	40 %	40 %	0 %	167622164
129	NC_010334	TTATT	2	10	271014	271023	20 %	80 %	0 %	0 %	167622164
130	NC_010334	TCCCA	2	10	274426	274435	20 %	20 %	0 %	60 %	167622168
131	NC_010334	CACTT	2	10	278119	278128	20 %	40 %	0 %	40 %	167622172
132	NC_010334	AGTGC	2	10	279906	279915	20 %	20 %	40 %	20 %	167622173
133	NC_010334	TGCAG	2	10	280786	280795	20 %	20 %	40 %	20 %	167622174
134	NC_010334	GGTGC	2	10	283207	283216	0 %	20 %	60 %	20 %	167622177
135	NC_010334	GGTCA	2	10	283616	283625	20 %	20 %	40 %	20 %	167622177
136	NC_010334	AACAT	2	10	283925	283934	60 %	20 %	0 %	20 %	167622177
137	NC_010334	GAAGT	2	10	284323	284332	40 %	20 %	40 %	0 %	167622177
138	NC_010334	GTTGA	2	10	291116	291125	20 %	40 %	40 %	0 %	167622183
139	NC_010334	CGCGG	2	10	291305	291314	0 %	0 %	60 %	40 %	167622183
140	NC_010334	GTTCG	2	10	292424	292433	0 %	40 %	40 %	20 %	167622184
141	NC_010334	AGCTT	2	10	292693	292702	20 %	40 %	20 %	20 %	167622184
142	NC_010334	CTTAT	2	10	292989	292998	20 %	60 %	0 %	20 %	167622185
143	NC_010334	TTGGG	2	10	294100	294109	0 %	40 %	60 %	0 %	167622186
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145	NC_010334	CGTAT	2	10	297469	297478	20 %	40 %	20 %	20 %	167622188
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147	NC_010334	TGCCA	2	10	302078	302087	20 %	20 %	20 %	40 %	167622192
148	NC_010334	CAAGC	2	10	303038	303047	40 %	0 %	20 %	40 %	167622193
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151	NC_010334	GTCCA	2	10	305344	305353	20 %	20 %	20 %	40 %	167622196
152	NC_010334	AGGCC	2	10	305391	305400	20 %	0 %	40 %	40 %	167622196
153	NC_010334	TGGCT	2	10	306596	306605	0 %	40 %	40 %	20 %	167622198
154	NC_010334	TGAGC	2	10	307703	307712	20 %	20 %	40 %	20 %	167622198
155	NC_010334	GCACT	2	10	308233	308242	20 %	20 %	20 %	40 %	167622199
156	NC_010334	GATGA	2	10	313896	313905	40 %	20 %	40 %	0 %	167622203
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163	NC_010334	GCCTA	2	10	323101	323110	20 %	20 %	20 %	40 %	167622211
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168	NC_010334	GCAAA	2	10	331933	331942	60 %	0 %	20 %	20 %	167622217
169	NC_010334	CGGTG	2	10	333397	333406	0 %	20 %	60 %	20 %	167622219
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173	NC_010334	AGCGC	2	10	347295	347304	20 %	0 %	40 %	40 %	167622231
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197	NC_010334	GCATA	2	10	393877	393886	40 %	20 %	20 %	20 %	167622271
198	NC_010334	CGGTA	2	10	398827	398836	20 %	20 %	40 %	20 %	167622275
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234	NC_010334	TCGAG	2	10	457867	457876	20 %	20 %	40 %	20 %	167622330
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239	NC_010334	GAGCA	2	10	464176	464185	40 %	0 %	40 %	20 %	167622336
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247	NC_010334	AGGCT	2	10	487223	487232	20 %	20 %	40 %	20 %	167622355
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249	NC_010334	GCCCT	2	10	490743	490752	0 %	20 %	20 %	60 %	167622358
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252	NC_010334	TTAAG	2	10	491531	491540	40 %	40 %	20 %	0 %	167622358
253	NC_010334	CTTTG	2	10	492848	492857	0 %	60 %	20 %	20 %	167622358
254	NC_010334	TAGCT	2	10	493090	493099	20 %	40 %	20 %	20 %	167622358
255	NC_010334	TGTGA	2	10	497595	497604	20 %	40 %	40 %	0 %	167622362
256	NC_010334	GGTTA	2	10	499381	499390	20 %	40 %	40 %	0 %	167622364
257	NC_010334	GGCTA	2	10	499522	499531	20 %	20 %	40 %	20 %	167622364
258	NC_010334	AGGTA	2	10	500658	500667	40 %	20 %	40 %	0 %	167622365
259	NC_010334	ACCTA	2	10	505434	505443	40 %	20 %	0 %	40 %	167622370
260	NC_010334	TTGCT	2	10	507707	507716	0 %	60 %	20 %	20 %	167622373
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262	NC_010334	CTTAG	2	10	513065	513074	20 %	40 %	20 %	20 %	167622377
263	NC_010334	TGATG	2	10	514502	514511	20 %	40 %	40 %	0 %	167622378
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382	NC_010334	AGCGA	2	10	749208	749217	40 %	0 %	40 %	20 %	167622560
383	NC_010334	TAGTG	2	10	749222	749231	20 %	40 %	40 %	0 %	167622560
384	NC_010334	TCAGC	2	10	750422	750431	20 %	20 %	20 %	40 %	167622562
385	NC_010334	ACCTT	2	10	754004	754013	20 %	40 %	0 %	40 %	167622564
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387	NC_010334	TGCAG	2	10	756408	756417	20 %	20 %	40 %	20 %	167622567
388	NC_010334	TGCTT	2	10	760365	760374	0 %	60 %	20 %	20 %	167622571
389	NC_010334	TTTTA	2	10	764134	764143	20 %	80 %	0 %	0 %	167622572
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