MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 9056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010334	TAT	2	6	6326	6331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010334	TAC	2	6	7520	7525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010334	TAT	2	6	15324	15329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010334	TCT	2	6	15366	15371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010334	TTA	2	6	15431	15436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010334	GAA	2	6	15485	15490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010334	AAG	2	6	15555	15560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010334	GTT	2	6	15634	15639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010334	GAG	2	6	15870	15875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010334	GTG	2	6	16501	16506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010334	TTA	2	6	17560	17565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010334	TAT	2	6	21036	21041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010334	TCA	2	6	21076	21081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010334	ACA	2	6	21125	21130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010334	ATA	2	6	21326	21331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010334	TGA	2	6	22698	22703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010334	ATT	2	6	23392	23397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010334	TTA	2	6	24955	24960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010334	TAG	2	6	25062	25067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010334	TTG	2	6	26040	26045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010334	ATA	2	6	26087	26092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010334	TAA	2	6	26157	26162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010334	TAA	2	6	26731	26736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010334	TAA	2	6	32550	32555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010334	ATG	2	6	33709	33714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010334	GTT	2	6	33766	33771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010334	TAA	2	6	33812	33817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010334	AGG	2	6	35340	35345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010334	CCT	2	6	35352	35357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010334	ACT	2	6	39730	39735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010334	TAA	2	6	41575	41580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010334	CAG	2	6	41655	41660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010334	GCA	2	6	41700	41705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010334	CTT	2	6	41840	41845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010334	CGC	2	6	41861	41866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010334	CCT	2	6	41888	41893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010334	GCT	2	6	41918	41923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010334	GAA	2	6	42124	42129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010334	GGC	2	6	42179	42184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010334	GCG	2	6	42243	42248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010334	AGG	2	6	42338	42343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010334	TGG	2	6	42394	42399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010334	CGA	2	6	42418	42423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010334	GAT	2	6	42443	42448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010334	GCA	2	6	42492	42497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010334	GAA	2	6	42551	42556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010334	GAG	2	6	42585	42590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010334	AGA	2	6	42634	42639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010334	CAG	2	6	42660	42665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010334	GGC	2	6	42871	42876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010334	GAA	2	6	43114	43119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010334	TGC	2	6	43190	43195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010334	GTC	2	6	43202	43207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010334	TGG	2	6	43280	43285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010334	GGA	2	6	43316	43321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010334	GAC	2	6	43329	43334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010334	TCA	2	6	43341	43346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010334	CCT	2	6	43677	43682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010334	GTT	2	6	43705	43710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010334	GTT	2	6	43857	43862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010334	TTG	2	6	43929	43934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010334	TTG	2	6	43947	43952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010334	TGG	2	6	44095	44100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010334	GTA	2	6	44131	44136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010334	GGA	2	6	44282	44287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010334	TAG	2	6	44311	44316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010334	TCC	2	6	44478	44483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010334	GGA	2	6	44788	44793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010334	TGA	2	6	44822	44827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010334	AAC	2	6	45042	45047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010334	AGC	2	6	45132	45137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010334	CAT	2	6	45138	45143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010334	GCG	2	6	45510	45515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010334	TGA	2	6	45585	45590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010334	TGA	2	6	45604	45609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010334	AGT	2	6	45610	45615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010334	TCT	2	6	45638	45643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010334	TAG	2	6	45655	45660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010334	GGT	2	6	45684	45689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010334	GTG	2	6	45779	45784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010334	CGG	2	6	45965	45970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010334	ATG	2	6	46041	46046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010334	TCG	2	6	46202	46207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010334	ACC	2	6	46236	46241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010334	TGG	2	6	46297	46302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010334	TCC	2	6	46323	46328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010334	GGA	2	6	46340	46345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010334	GGT	2	6	46460	46465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010334	CGG	2	6	46547	46552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010334	TCA	2	6	46575	46580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010334	CGT	2	6	46655	46660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010334	GAT	2	6	46695	46700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010334	AAT	2	6	47055	47060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010334	CAC	2	6	47133	47138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010334	CTT	2	6	47472	47477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010334	TAA	2	6	47517	47522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010334	CTT	2	6	47544	47549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010334	AAT	2	6	49199	49204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010334	CTG	2	6	51759	51764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010334	TTC	2	6	51794	51799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010334	GTA	2	6	53416	53421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010334	TAC	2	6	53468	53473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010334	TAG	2	6	53637	53642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010334	TTA	2	6	54148	54153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010334	AAC	2	6	55847	55852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010334	AAT	2	6	57367	57372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010334	ATT	2	6	57429	57434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010334	AGA	2	6	57481	57486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010334	TAT	2	6	57495	57500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010334	TAT	2	6	58140	58145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010334	TAT	2	6	58174	58179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010334	CTC	3	9	58180	58188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010334	TCT	2	6	61353	61358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010334	TTC	2	6	61361	61366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010334	AGT	2	6	61453	61458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010334	TAT	2	6	61559	61564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010334	TCG	2	6	64486	64491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010334	ATT	2	6	64521	64526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010334	ATC	2	6	64655	64660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010334	GAA	2	6	65359	65364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010334	GAA	2	6	65508	65513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010334	CTT	2	6	66010	66015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010334	ATT	2	6	66119	66124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010334	GAT	2	6	66278	66283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010334	AGT	2	6	66291	66296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010334	ACT	2	6	71599	71604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010334	GAA	2	6	71637	71642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010334	AAT	2	6	71672	71677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010334	CTG	2	6	71720	71725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010334	TTG	2	6	71804	71809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010334	GTT	3	9	71886	71894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010334	TGG	2	6	74011	74016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010334	CAA	2	6	74055	74060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010334	ATC	2	6	74863	74868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010334	GCA	2	6	75384	75389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010334	ATG	2	6	76315	76320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010334	GTT	2	6	76413	76418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010334	TAC	2	6	76426	76431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010334	GTT	2	6	77571	77576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_010334	CCT	2	6	273145	273150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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