MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL02

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010333	TCCGGC	2	12	3821	3832	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621566
2	NC_010333	GCGGTC	2	12	6979	6990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621568
3	NC_010333	GGTCCA	2	12	7102	7113	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621568
4	NC_010333	AGCCGA	2	12	7960	7971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621569
5	NC_010333	ACCCCG	2	12	9665	9676	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	167621570
6	NC_010333	GTTCAT	2	12	12546	12557	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167621573
7	NC_010333	CGTTCT	2	12	13384	13395	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	167621574
8	NC_010333	GCCCGG	2	12	18496	18507	0 %	0 %	50 %	50 %	167621578
9	NC_010333	ACATGG	2	12	21559	21570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167621582
10	NC_010333	AGCTTT	2	12	23753	23764	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010333	CCGCGC	2	12	24448	24459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621587
12	NC_010333	GGTCGG	2	12	25024	25035	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	167621587
13	NC_010333	CCTCGG	2	12	25387	25398	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621587
14	NC_010333	GTCGAG	2	12	26039	26050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621587
15	NC_010333	CAGTTC	2	12	26990	27001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167621587
16	NC_010333	TTGGCC	2	12	28454	28465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621588
17	NC_010333	CAACGA	2	12	29353	29364	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167621589
18	NC_010333	CGGCTT	2	12	31089	31100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621591
19	NC_010333	GGCGAC	2	12	32857	32868	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010333	CGGTCG	2	12	33069	33080	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621592
21	NC_010333	CAGAGC	2	12	35761	35772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621595
22	NC_010333	GGCGTC	2	12	40113	40124	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010333	CAGAAG	2	12	43950	43961	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	167621603
24	NC_010333	CCCCTT	2	12	44379	44390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621603
25	NC_010333	CTCGCC	2	12	45598	45609	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	167621605
26	NC_010333	CCAGGG	2	12	45924	45935	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621605
27	NC_010333	TCGGCC	2	12	48350	48361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621607
28	NC_010333	TGGCGA	2	12	51855	51866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010333	GGGCCT	2	12	53032	53043	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621611
30	NC_010333	GGCATC	2	12	54347	54358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621613
31	NC_010333	GAGCAG	2	12	58095	58106	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	167621618
32	NC_010333	CTTGCC	2	12	59878	59889	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	167621620
33	NC_010333	GGTCGC	2	12	60124	60135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621620
34	NC_010333	CGCAGG	2	12	63230	63241	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621622
35	NC_010333	ACCAGC	2	12	64463	64474	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167621622
36	NC_010333	GGGCGC	2	12	64818	64829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621622
37	NC_010333	CCTGGT	2	12	66884	66895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621625
38	NC_010333	GTCGCC	2	12	69714	69725	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621626
39	NC_010333	TGGCGC	2	12	70850	70861	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621628
40	NC_010333	GGTTTT	2	12	75720	75731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621634
41	NC_010333	GCCAGC	2	12	76257	76268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621634
42	NC_010333	TAGGGG	2	12	77676	77687	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	167621637
43	NC_010333	CGGGTG	2	12	78948	78959	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	167621638
44	NC_010333	CGCGCC	2	12	79454	79465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621638
45	NC_010333	CAGCGC	2	12	80482	80493	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621639
46	NC_010333	GATGCC	2	12	81324	81335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621640
47	NC_010333	CGGCGA	2	12	83155	83166	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010333	CGATGC	2	12	86220	86231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621644
49	NC_010333	GCCGAC	2	12	86413	86424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621644
50	NC_010333	GCTTCG	2	12	88699	88710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621647
51	NC_010333	GGTGCA	2	12	91982	91993	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621650
52	NC_010333	CTGGCC	2	12	93357	93368	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621650
53	NC_010333	CAACGC	2	12	97816	97827	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167621654
54	NC_010333	CGCAAG	2	12	98364	98375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621656
55	NC_010333	TCCAGA	2	12	98481	98492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167621656
56	NC_010333	CGCCTG	2	12	98722	98733	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621656
57	NC_010333	CGCCAG	2	12	101439	101450	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621658
58	NC_010333	GCGGTC	2	12	104222	104233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621662
59	NC_010333	CTGGTC	3	18	108740	108757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621664
60	NC_010333	CCGCCC	2	12	110338	110349	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
61	NC_010333	GATGGC	2	12	113483	113494	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621667
62	NC_010333	TGCCGG	2	12	113506	113517	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621667
63	NC_010333	CCGGCC	2	12	114213	114224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621668
64	NC_010333	AATTCC	2	12	116389	116400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010333	GGCCCA	2	12	116477	116488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010333	TTCCAG	2	12	122785	122796	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010333	TCGGGC	2	12	126112	126123	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621679
68	NC_010333	CATAGC	2	12	126869	126880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167621679
69	NC_010333	GGCCAA	2	12	128117	128128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621680
70	NC_010333	GTCGAA	2	12	128824	128835	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167621681
71	NC_010333	GGGCCA	3	18	129263	129280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	167621682
72	NC_010333	GTAGGC	2	12	129642	129653	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010333	TCGCGC	2	12	131941	131952	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621685
74	NC_010333	CCGGCC	2	12	138005	138016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621691
75	NC_010333	CCGGCG	2	12	142491	142502	0 %	0 %	50 %	50 %	167621695
76	NC_010333	ATGGCG	2	12	143288	143299	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621696
77	NC_010333	CGGTGA	2	12	145456	145467	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621698
78	NC_010333	CTGGAA	2	12	146346	146357	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010333	CCGATC	2	12	146881	146892	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010333	CCCCAA	2	12	153470	153481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621704
81	NC_010333	ATGACT	2	12	156387	156398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167621708
82	NC_010333	CCAAGG	2	12	156693	156704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621708
83	NC_010333	AGGCTC	2	12	160404	160415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010333	TGATCA	2	12	161052	161063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167621711
85	NC_010333	TCCCCC	2	12	165509	165520	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	167621715
86	NC_010333	GGCTAT	2	12	167131	167142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167621717
87	NC_010333	GTCGAG	2	12	167821	167832	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621717
88	NC_010333	ATGCGG	2	12	169844	169855	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167621720
89	NC_010333	TCGGCT	2	12	171510	171521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621721
90	NC_010333	GGCCCG	2	12	175313	175324	0 %	0 %	50 %	50 %	167621726

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.