MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL02

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010333	CGCTG	2	10	3446	3455	0 %	20 %	40 %	40 %	167621565
2	NC_010333	ACCAG	2	10	9237	9246	40 %	0 %	20 %	40 %	167621570
3	NC_010333	CAAGG	2	10	10497	10506	40 %	0 %	40 %	20 %	167621571
4	NC_010333	GACCA	2	10	11820	11829	40 %	0 %	20 %	40 %	167621573
5	NC_010333	CCGGC	2	10	12573	12582	0 %	0 %	40 %	60 %	167621573
6	NC_010333	CACGC	2	10	15237	15246	20 %	0 %	20 %	60 %	167621576
7	NC_010333	CGCGG	2	10	15255	15264	0 %	0 %	60 %	40 %	167621576
8	NC_010333	GCGCC	2	10	15304	15313	0 %	0 %	40 %	60 %	167621576
9	NC_010333	CGGGC	2	10	16670	16679	0 %	0 %	60 %	40 %	167621577
10	NC_010333	TGCGG	2	10	17686	17695	0 %	20 %	60 %	20 %	167621577
11	NC_010333	TGGCC	2	10	18419	18428	0 %	20 %	40 %	40 %	167621578
12	NC_010333	CAGAA	2	10	20813	20822	60 %	0 %	20 %	20 %	167621581
13	NC_010333	ACCGT	2	10	21181	21190	20 %	20 %	20 %	40 %	167621582
14	NC_010333	ACAGG	2	10	23555	23564	40 %	0 %	40 %	20 %	167621585
15	NC_010333	GCCAA	2	10	24795	24804	40 %	0 %	20 %	40 %	167621587
16	NC_010333	GTCGC	2	10	26235	26244	0 %	20 %	40 %	40 %	167621587
17	NC_010333	CTGAG	2	10	26432	26441	20 %	20 %	40 %	20 %	167621587
18	NC_010333	TCGCC	2	10	26644	26653	0 %	20 %	20 %	60 %	167621587
19	NC_010333	GCGCA	2	10	27540	27549	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010333	GACGC	2	10	27835	27844	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_010333	GCCCA	2	10	30154	30163	20 %	0 %	20 %	60 %	167621591
22	NC_010333	TCCGG	2	10	30723	30732	0 %	20 %	40 %	40 %	167621591
23	NC_010333	GAGGC	2	10	31376	31385	20 %	0 %	60 %	20 %	167621591
24	NC_010333	AACAG	2	10	32691	32700	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010333	CCCGC	2	10	34056	34065	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26	NC_010333	GCCTG	2	10	35413	35422	0 %	20 %	40 %	40 %	167621595
27	NC_010333	CGATC	2	10	35783	35792	20 %	20 %	20 %	40 %	167621595
28	NC_010333	GCCAT	2	10	37911	37920	20 %	20 %	20 %	40 %	167621599
29	NC_010333	CGCCT	2	10	38364	38373	0 %	20 %	20 %	60 %	167621599
30	NC_010333	CGGTG	2	10	38803	38812	0 %	20 %	60 %	20 %	167621599
31	NC_010333	CCTCC	2	10	39925	39934	0 %	20 %	0 %	80 %	167621600
32	NC_010333	CAATT	2	10	40092	40101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010333	AGGCG	2	10	40940	40949	20 %	0 %	60 %	20 %	167621601
34	NC_010333	GCCGG	2	10	43241	43250	0 %	0 %	60 %	40 %	167621602
35	NC_010333	CGATG	2	10	44462	44471	20 %	20 %	40 %	20 %	167621603
36	NC_010333	TCGCC	2	10	46506	46515	0 %	20 %	20 %	60 %	167621606
37	NC_010333	GCGCC	2	10	46990	46999	0 %	0 %	40 %	60 %	167621606
38	NC_010333	CCCTA	2	10	47360	47369	20 %	20 %	0 %	60 %	167621607
39	NC_010333	GATCA	2	10	47962	47971	40 %	20 %	20 %	20 %	167621607
40	NC_010333	GCGCG	2	10	48650	48659	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_010333	GGGCG	2	10	49876	49885	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010333	GAGCC	2	10	50263	50272	20 %	0 %	40 %	40 %	167621609
43	NC_010333	CCGGT	2	10	50555	50564	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010333	AGGGG	2	10	50829	50838	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010333	GCAGC	2	10	51617	51626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010333	CCGTC	2	10	51685	51694	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_010333	AGCGC	2	10	52086	52095	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_010333	TCACG	2	10	54297	54306	20 %	20 %	20 %	40 %	167621613
49	NC_010333	CGGCG	2	10	54573	54582	0 %	0 %	60 %	40 %	167621614
50	NC_010333	AACCG	2	10	56756	56765	40 %	0 %	20 %	40 %	167621616
51	NC_010333	CGGGC	2	10	57091	57100	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_010333	GATCG	2	10	58285	58294	20 %	20 %	40 %	20 %	167621618
53	NC_010333	TCGAG	2	10	59306	59315	20 %	20 %	40 %	20 %	167621619
54	NC_010333	GTATT	2	10	60480	60489	20 %	60 %	20 %	0 %	167621620
55	NC_010333	GCCGC	2	10	64423	64432	0 %	0 %	40 %	60 %	167621622
56	NC_010333	AGGTC	2	10	65514	65523	20 %	20 %	40 %	20 %	167621622
57	NC_010333	GGCTC	2	10	66476	66485	0 %	20 %	40 %	40 %	167621624
58	NC_010333	CGGCG	2	10	67713	67722	0 %	0 %	60 %	40 %	167621625
59	NC_010333	CGGGG	2	10	69795	69804	0 %	0 %	80 %	20 %	167621626
60	NC_010333	GGCCA	2	10	69919	69928	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010333	ACAAG	2	10	71917	71926	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010333	GGGGC	2	10	71968	71977	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010333	CCGGC	2	10	72613	72622	0 %	0 %	40 %	60 %	167621629
64	NC_010333	GGCGT	2	10	73947	73956	0 %	20 %	60 %	20 %	167621632
65	NC_010333	GCCGC	2	10	74377	74386	0 %	0 %	40 %	60 %	167621633
66	NC_010333	GCGCC	2	10	74801	74810	0 %	0 %	40 %	60 %	167621633
67	NC_010333	ACCCG	2	10	75102	75111	20 %	0 %	20 %	60 %	167621634
68	NC_010333	TCGGG	2	10	76363	76372	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010333	AAACG	2	10	76763	76772	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010333	CCCGG	2	10	77729	77738	0 %	0 %	40 %	60 %	167621637
71	NC_010333	GCCGG	2	10	80249	80258	0 %	0 %	60 %	40 %	167621639
72	NC_010333	GGCCG	2	10	80403	80412	0 %	0 %	60 %	40 %	167621639
73	NC_010333	TGGGC	2	10	81287	81296	0 %	20 %	60 %	20 %	167621640
74	NC_010333	GCGCC	2	10	83395	83404	0 %	0 %	40 %	60 %	167621642
75	NC_010333	GCCAG	2	10	84539	84548	20 %	0 %	40 %	40 %	167621642
76	NC_010333	GGCCC	2	10	85693	85702	0 %	0 %	40 %	60 %	167621642
77	NC_010333	TCGGC	2	10	86711	86720	0 %	20 %	40 %	40 %	167621645
78	NC_010333	AGCCC	2	10	87987	87996	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_010333	TGAGC	2	10	88082	88091	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010333	CTTTG	2	10	89840	89849	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010333	TTCGG	2	10	89899	89908	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010333	GCCCG	2	10	91156	91165	0 %	0 %	40 %	60 %	167621649
83	NC_010333	GGCGC	2	10	91215	91224	0 %	0 %	60 %	40 %	167621649
84	NC_010333	GTCGC	2	10	91538	91547	0 %	20 %	40 %	40 %	167621649
85	NC_010333	GGCGG	2	10	91712	91721	0 %	0 %	80 %	20 %	167621650
86	NC_010333	GCGCG	2	10	92399	92408	0 %	0 %	60 %	40 %	167621650
87	NC_010333	GCCCG	2	10	96937	96946	0 %	0 %	40 %	60 %	167621653
88	NC_010333	CGCGG	2	10	99434	99443	0 %	0 %	60 %	40 %	167621656
89	NC_010333	TTAAT	2	10	100402	100411	40 %	60 %	0 %	0 %	167621657
90	NC_010333	GCCAA	2	10	100698	100707	40 %	0 %	20 %	40 %	167621657
91	NC_010333	CTGGC	2	10	101966	101975	0 %	20 %	40 %	40 %	167621659
92	NC_010333	CGCGG	2	10	103822	103831	0 %	0 %	60 %	40 %	167621662
93	NC_010333	GCGCG	2	10	106949	106958	0 %	0 %	60 %	40 %	167621664
94	NC_010333	CTGGC	2	10	108107	108116	0 %	20 %	40 %	40 %	167621664
95	NC_010333	CCATT	2	10	111499	111508	20 %	40 %	0 %	40 %	167621666
96	NC_010333	TGGGG	2	10	112126	112135	0 %	20 %	80 %	0 %	167621666
97	NC_010333	GTCGC	2	10	112352	112361	0 %	20 %	40 %	40 %	167621666
98	NC_010333	CCGGG	2	10	112409	112418	0 %	0 %	60 %	40 %	167621666
99	NC_010333	ACGCG	2	10	114849	114858	20 %	0 %	40 %	40 %	167621668
100	NC_010333	TCCGG	2	10	115956	115965	0 %	20 %	40 %	40 %	167621669
101	NC_010333	CCGGC	2	10	116987	116996	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102	NC_010333	ATTTT	2	10	118326	118335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010333	TTGGG	2	10	119450	119459	0 %	40 %	60 %	0 %	167621671
104	NC_010333	CCAGT	2	10	119753	119762	20 %	20 %	20 %	40 %	167621671
105	NC_010333	GCCGC	2	10	119946	119955	0 %	0 %	40 %	60 %	167621671
106	NC_010333	TCAGC	2	10	121028	121037	20 %	20 %	20 %	40 %	167621672
107	NC_010333	GTGAT	2	10	121600	121609	20 %	40 %	40 %	0 %	167621673
108	NC_010333	TGGCT	2	10	122680	122689	0 %	40 %	40 %	20 %	167621674
109	NC_010333	TGGGC	2	10	124669	124678	0 %	20 %	60 %	20 %	167621675
110	NC_010333	TCGGC	2	10	124875	124884	0 %	20 %	40 %	40 %	167621676
111	NC_010333	TGATC	2	10	126188	126197	20 %	40 %	20 %	20 %	167621679
112	NC_010333	GGCCG	2	10	126330	126339	0 %	0 %	60 %	40 %	167621679
113	NC_010333	GGGCC	2	10	126471	126480	0 %	0 %	60 %	40 %	167621679
114	NC_010333	CGGCC	2	10	129596	129605	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_010333	GCGTG	2	10	129923	129932	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010333	CGTCC	2	10	131876	131885	0 %	20 %	20 %	60 %	167621685
117	NC_010333	GAATA	2	10	133332	133341	60 %	20 %	20 %	0 %	167621686
118	NC_010333	CATGC	2	10	133590	133599	20 %	20 %	20 %	40 %	167621686
119	NC_010333	GATGC	2	10	136162	136171	20 %	20 %	40 %	20 %	167621689
120	NC_010333	GGCCA	2	10	136174	136183	20 %	0 %	40 %	40 %	167621689
121	NC_010333	TGGGC	2	10	137118	137127	0 %	20 %	60 %	20 %	167621690
122	NC_010333	TCCCG	2	10	137908	137917	0 %	20 %	20 %	60 %	167621691
123	NC_010333	GGCGC	2	10	137941	137950	0 %	0 %	60 %	40 %	167621691
124	NC_010333	GGGCC	2	10	138058	138067	0 %	0 %	60 %	40 %	167621691
125	NC_010333	CGTGA	2	10	141903	141912	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010333	CGGCG	2	10	142053	142062	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010333	GGCGC	2	10	142946	142955	0 %	0 %	60 %	40 %	167621695
128	NC_010333	CGGCG	2	10	145950	145959	0 %	0 %	60 %	40 %	167621699
129	NC_010333	TTGAG	2	10	145965	145974	20 %	40 %	40 %	0 %	167621699
130	NC_010333	GCAAC	2	10	146402	146411	40 %	0 %	20 %	40 %	167621700
131	NC_010333	CGCGC	2	10	146642	146651	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_010333	GACGT	2	10	147051	147060	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010333	ATTCT	2	10	147404	147413	20 %	60 %	0 %	20 %	167621701
134	NC_010333	TTTGA	2	10	148312	148321	20 %	60 %	20 %	0 %	167621701
135	NC_010333	CAGGC	2	10	148763	148772	20 %	0 %	40 %	40 %	167621701
136	NC_010333	CTGAC	2	10	152060	152069	20 %	20 %	20 %	40 %	167621703
137	NC_010333	GATCC	2	10	152131	152140	20 %	20 %	20 %	40 %	167621703
138	NC_010333	ACCCG	2	10	153688	153697	20 %	0 %	20 %	60 %	167621704
139	NC_010333	CGATC	2	10	154644	154653	20 %	20 %	20 %	40 %	167621707
140	NC_010333	GCCGG	2	10	155480	155489	0 %	0 %	60 %	40 %	167621707
141	NC_010333	CCGAT	2	10	156414	156423	20 %	20 %	20 %	40 %	167621708
142	NC_010333	GCGTG	2	10	157558	157567	0 %	20 %	60 %	20 %	167621708
143	NC_010333	CGGCC	2	10	160341	160350	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_010333	GGGCG	2	10	161175	161184	0 %	0 %	80 %	20 %	167621711
145	NC_010333	CGGCC	2	10	161292	161301	0 %	0 %	40 %	60 %	167621711
146	NC_010333	ACGAT	2	10	163930	163939	40 %	20 %	20 %	20 %	167621714
147	NC_010333	GCAAT	2	10	165783	165792	40 %	20 %	20 %	20 %	167621716
148	NC_010333	GCCGT	2	10	166002	166011	0 %	20 %	40 %	40 %	167621716
149	NC_010333	CCGGC	2	10	167530	167539	0 %	0 %	40 %	60 %	167621717
150	NC_010333	CACCC	2	10	168158	168167	20 %	0 %	0 %	80 %	167621717
151	NC_010333	GCGAC	2	10	170024	170033	20 %	0 %	40 %	40 %	167621721
152	NC_010333	GCGCG	2	10	170751	170760	0 %	0 %	60 %	40 %	167621721
153	NC_010333	TGGCG	2	10	170927	170936	0 %	20 %	60 %	20 %	167621721
154	NC_010333	TGCAT	2	10	172327	172336	20 %	40 %	20 %	20 %	167621722
155	NC_010333	CAGGA	2	10	174469	174478	40 %	0 %	40 %	20 %	167621725
156	NC_010333	GCGCG	2	10	175281	175290	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
157	NC_010333	TTCGC	2	10	176378	176387	0 %	40 %	20 %	40 %	167621727
158	NC_010333	CCGAT	2	10	176940	176949	20 %	20 %	20 %	40 %	167621727

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.