MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL02

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010333	GCGCA	2	10	27540	27549	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010333	GACGC	2	10	27835	27844	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010333	AACAG	2	10	32691	32700	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010333	CCCGC	2	10	34056	34065	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5	NC_010333	CAATT	2	10	40092	40101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010333	GCGCG	2	10	48650	48659	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010333	GGGCG	2	10	49876	49885	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010333	CCGGT	2	10	50555	50564	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010333	AGGGG	2	10	50829	50838	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010333	GCAGC	2	10	51617	51626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_010333	CCGTC	2	10	51685	51694	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_010333	AGCGC	2	10	52086	52095	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010333	CGGGC	2	10	57091	57100	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_010333	GGCCA	2	10	69919	69928	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010333	ACAAG	2	10	71917	71926	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010333	GGGGC	2	10	71968	71977	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010333	TCGGG	2	10	76363	76372	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010333	AAACG	2	10	76763	76772	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010333	AGCCC	2	10	87987	87996	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_010333	TGAGC	2	10	88082	88091	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010333	CTTTG	2	10	89840	89849	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010333	TTCGG	2	10	89899	89908	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010333	CCGGC	2	10	116987	116996	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_010333	ATTTT	2	10	118326	118335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010333	CGGCC	2	10	129596	129605	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_010333	GCGTG	2	10	129923	129932	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010333	CGTGA	2	10	141903	141912	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010333	CGGCG	2	10	142053	142062	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_010333	CGCGC	2	10	146642	146651	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_010333	GACGT	2	10	147051	147060	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010333	CGGCC	2	10	160341	160350	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_010333	GCGCG	2	10	175281	175290	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.