MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL02

Total Repeats: 423

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010333	CGG	2	6	253	258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010333	AGC	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010333	GCA	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010333	GTG	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010333	CGC	2	6	2327	2332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010333	CGC	2	6	2364	2369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010333	GAC	2	6	2382	2387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010333	TCT	2	6	2443	2448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010333	CTT	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010333	GGC	2	6	2472	2477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010333	TCG	3	9	2506	2514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010333	GCG	2	6	2561	2566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010333	CGG	2	6	2619	2624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010333	GCG	2	6	4103	4108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010333	GCT	2	6	4128	4133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010333	CCG	2	6	4193	4198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_010333	ACG	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010333	CGC	2	6	4324	4329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010333	GTG	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010333	GCA	2	6	14106	14111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010333	TGA	3	9	20162	20170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010333	GCG	2	6	21088	21093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010333	CGG	2	6	21099	21104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010333	GTC	2	6	21127	21132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010333	AGC	2	6	22035	22040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010333	GCC	2	6	22062	22067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010333	CCT	2	6	22254	22259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010333	CCG	2	6	22379	22384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010333	GGA	2	6	22418	22423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010333	GAA	2	6	23323	23328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010333	TCG	2	6	23348	23353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010333	TCG	2	6	27594	27599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010333	TCG	2	6	27604	27609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010333	CGG	2	6	27738	27743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010333	CGC	2	6	27772	27777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010333	AGC	2	6	28812	28817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010333	CGC	2	6	28826	28831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010333	CAG	2	6	28853	28858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010333	TCC	2	6	28881	28886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010333	GCC	2	6	28922	28927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010333	ATC	2	6	32799	32804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010333	GAT	2	6	32931	32936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010333	ACC	2	6	32973	32978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010333	CAT	2	6	33306	33311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010333	GCG	3	9	33317	33325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010333	AGT	2	6	33327	33332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010333	GCG	2	6	33404	33409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010333	GCA	2	6	33417	33422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010333	AGC	2	6	34105	34110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010333	GGC	2	6	34196	34201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010333	TGG	2	6	34249	34254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010333	CGC	2	6	34289	34294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010333	CCG	2	6	34365	34370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010333	GGC	2	6	34507	34512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010333	TTC	2	6	34607	34612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010333	GCA	2	6	34720	34725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010333	CGG	2	6	35252	35257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010333	TAT	2	6	35917	35922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010333	CGG	2	6	36914	36919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010333	CCG	2	6	37013	37018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010333	CAT	2	6	37056	37061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010333	CGG	2	6	43653	43658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010333	CCA	3	9	43806	43814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010333	TCA	2	6	43866	43871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010333	GTG	2	6	46153	46158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010333	CGA	2	6	46220	46225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010333	CCG	2	6	46227	46232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010333	GAA	2	6	48634	48639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010333	CCT	2	6	48667	48672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010333	CCG	2	6	48701	48706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010333	CAC	2	6	49851	49856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010333	ATC	2	6	50005	50010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010333	GCC	2	6	50054	50059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010333	CGG	2	6	50488	50493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010333	GGA	2	6	50592	50597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010333	CCG	2	6	50619	50624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010333	GAT	2	6	50722	50727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010333	CCG	2	6	50792	50797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010333	GAC	2	6	50810	50815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010333	GCC	2	6	50857	50862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010333	AGA	2	6	50940	50945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010333	CCA	2	6	50984	50989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010333	GCC	2	6	51163	51168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010333	CCG	2	6	51212	51217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010333	GCT	2	6	51521	51526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010333	GAC	2	6	51751	51756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010333	CAC	2	6	51789	51794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010333	GCC	2	6	51900	51905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010333	TGG	2	6	51967	51972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010333	GCG	2	6	52128	52133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010333	GCC	2	6	52142	52147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010333	TGG	2	6	53200	53205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010333	CAA	2	6	53228	53233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010333	GAT	2	6	53332	53337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010333	CGC	2	6	53341	53346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010333	ACG	2	6	53381	53386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010333	GGA	2	6	53426	53431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010333	ATA	2	6	53560	53565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010333	CCG	2	6	53624	53629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_010333	CCG	2	6	54063	54068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010333	TCC	2	6	54102	54107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010333	CTG	2	6	55777	55782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010333	GCC	2	6	55844	55849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010333	CCA	2	6	56123	56128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010333	GGC	2	6	56161	56166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010333	CTG	2	6	56176	56181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010333	TCC	2	6	57074	57079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010333	TGT	2	6	60718	60723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010333	CGA	2	6	60729	60734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010333	TCC	2	6	61429	61434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010333	TCC	2	6	61484	61489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010333	GCC	2	6	61505	61510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010333	TGA	2	6	61564	61569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010333	CTC	2	6	65872	65877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010333	CCG	2	6	66728	66733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_010333	GCC	2	6	66766	66771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_010333	GCT	2	6	69942	69947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010333	ACA	2	6	70145	70150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010333	CCG	2	6	70241	70246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_010333	GAC	2	6	70253	70258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010333	GGA	2	6	70668	70673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010333	GCG	2	6	70752	70757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010333	AGG	2	6	71933	71938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010333	CGT	2	6	72108	72113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010333	GGC	2	6	72177	72182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010333	TGA	2	6	72297	72302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010333	GTC	2	6	73758	73763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010333	GCG	2	6	73775	73780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010333	CGT	2	6	76440	76445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010333	TCT	2	6	76472	76477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010333	GCC	2	6	76478	76483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010333	GGC	2	6	76528	76533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010333	TGG	2	6	76677	76682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010333	AGG	2	6	76736	76741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010333	CGC	2	6	76793	76798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_010333	AGC	2	6	76804	76809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010333	TCA	2	6	76881	76886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010333	GGA	2	6	76931	76936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010333	GCC	3	9	76957	76965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_010333	GGC	2	6	82040	82045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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408	NC_010333	TGT	2	6	165719	165724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
409	NC_010333	CGA	2	6	165730	165735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_010333	CAT	2	6	166678	166683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_010333	GCC	2	6	168915	168920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
412	NC_010333	CCA	2	6	168965	168970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
413	NC_010333	GAT	2	6	169055	169060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_010333	CAG	2	6	171651	171656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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417	NC_010333	GAG	2	6	172804	172809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_010333	TCG	2	6	175174	175179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_010333	CGC	2	6	175233	175238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_010333	GCT	2	6	177867	177872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.